New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5780398 = | 66 (1.100) | 4 (0.070) | 3/256 | NT | 6.0% | coding (702/1794 nt) | cvrA | K(+)/H(+) antiporter NhaP |
? | NC_002947 | 5780439 = | 62 (1.070) | coding (743/1794 nt) | cvrA | K(+)/H(+) antiporter NhaP |
TGCACTGGAGCCTGCTGGGCCACTTGCTGCGTGAGTTCGGTATCGGCACGCTGCTGGGCCTGGGCGGCGGCTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATGGCATCCTGCACATGCTCGACGGCATGGCCTGGCTGGCCCAGATCGG > NC_002947/5780292‑5780586 | tGCACTGGAGCCTGCTGGGCCACTTGCTGCGTGAGTTCGGTATCGGCACGCTGCTGGGCCTGGGCGGCGGCTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTg > 5:317591/1‑149 (MQ=255) atgccatggcggctgcggataggcttgttgccaagcaccaggccgcacaggtaaacggcgaggaagccgctaccatgcagggcgttggtcagcgagaacattaccaGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTg > 2:273182‑M1/107‑149 (MQ=255) cACTGGAGCCTGCTGGGCCACTTGCTGCGTGAGTTCGGTATCGGCACGCTGCTGGGCCTGGGCGGCGGCTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTgg < 4:28948/148‑1 (MQ=255) gAGCCTGCTGGGCCACTTGCTGCGTGAGTTCGGTATCGGCACGCTGCTGGGCCTGGGCGGCGGCTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAAt < 6:259264/147‑1 (MQ=255) aGCCTGCTGGGCCACTTGCTGCGTGAGTTCGGTATCGGCACGCTGCTGGGCCTGGGCGGCGGCTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGtt < 5:319688/149‑1 (MQ=255) ggCCACTTGCTGCGTGAGTTCGGTATCGGCACGCTGCTGGGCCTGGGCGGCGGCTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGa < 2:206525/148‑1 (MQ=255) ggCCACTTGCTGCGTGAGTTCGGTATCGGCACGCTGCTGGGCCTGGGCGGCGGCTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGAc < 6:280449/149‑1 (MQ=255) ggCCACTTGCTGCGTGAGTTCGGGATCGGCACGCTGCTGGGCCTGGGCGGCGGCTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGa < 7:326148/148‑1 (MQ=255) cACTTGCTGCGTGAGTTCGGTATCGGCACGCTGCTGGGCCTGGGCGGCGGCTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCaa > 1:320101/1‑149 (MQ=255) gTGAGTTCGGTATCGGCATGCTGCTGGGCCTGGGCGGCGGCTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCAt > 2:205951/1‑149 (MQ=255) tGAGTTCGGTATCGGCACGCTGCTGGGCCTGGGCGGCGGCTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATg > 7:184427/1‑149 (MQ=255) tGAGTTCGGTATCGGCACGCTGCTGGGCCTGGGCGGCGGCTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATg < 3:166970/149‑1 (MQ=255) caagcaccaggccgcacaggtaaacggcgaggaagccgctaccatgcagggcgttggtcagcgagaacattaccaGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTg < 7:129853‑M1/43‑1 (MQ=255) caagcaccaggccgcacaggtaaacggcgaggaagccgctaccatgcagggcgttggtcagcgagaacattaccaGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTg > 8:129853‑M1/76‑118 (MQ=255) gAGTTCGGTATCGGCACGCTGCTGGGCCTGGGCGGCGGCTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATgg < 2:25871/149‑1 (MQ=255) ttCGGTATCGGCACGCTGCTGGGCCTGGGCGGCGGCTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTATTGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAg > 1:276772/1‑149 (MQ=255) tCGGTATCGGCACGCTGCTGGGCCTGGGCGGCGGCTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGc > 3:240197/1‑149 (MQ=255) ggTATCGGCACGCTGCTGGGCCTGGGCGGCGGCTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCg < 5:178344/148‑1 (MQ=255) ggCACGCTGCTGGGCCTGGGCGGCGGCTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTcc < 5:243901/148‑1 (MQ=255) gCACGCTGCTGGGCCTGGGCGGCGGCTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTc > 2:159680/1‑149 (MQ=255) aCGCTGCTGGGCCTGGGCGGCGGCTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGc > 5:223512/1‑149 (MQ=255) ctgggcctgggcGGCGGCTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGttt < 2:320101/148‑1 (MQ=255) ctgggcctgggcGGCGGCTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGttt < 1:205951/148‑1 (MQ=255) tgggcctgggcGGCGGCTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTAc > 1:154956/1‑149 (MQ=255) tgggcctgggcGGCGGCTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTAc < 6:61223/149‑1 (MQ=255) gggcctgggcGGCGGCTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATACTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATCTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTATAcc > 2:91460/1‑149 (MQ=255) ggcctgggcGGCGGCTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTAc < 1:159680/147‑1 (MQ=255) ggcctgggcGGCGGCTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCt > 5:148409/1‑149 (MQ=255) ctgggcGGCGGCTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCtgtg > 2:143797/1‑149 (MQ=255) tgggcGGCGGCTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTTGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGc < 7:122377/149‑1 (MQ=255) ggcggcggcTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGc < 2:181435/147‑1 (MQ=255) ggcggcggcTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCg < 7:114676/148‑1 (MQ=255) cggcggcTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCTGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATTGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGcc < 3:261514/149‑1 (MQ=255) cggcggcTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGcc > 5:153316/1‑149 (MQ=255) ggcggcTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCt < 8:184427/149‑1 (MQ=255) gcggcTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTg < 6:317591/149‑1 (MQ=255) ggctggctGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCAGTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCtttacc > 8:236725/1‑137 (MQ=255) tggctgATGCTGCGACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCt > 2:103685/1‑149 (MQ=255) ctgATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTgg < 4:101565/149‑1 (MQ=255) tgATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTgg > 1:28479/1‑148 (MQ=255) tgATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGGAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTgg > 6:70867/1‑148 (MQ=255) aTGCTGCTACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGc < 1:103685/147‑1 (MQ=255) gctgcAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGcaac > 1:244076/1‑148 (MQ=255) aCCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAgc > 5:300520/1‑149 (MQ=255) 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aaTCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATg < 4:240197/148‑1 (MQ=255) aaTCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATg < 5:70867/148‑1 (MQ=255) aTCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTAc < 5:371924/101‑1 (MQ=255) aTCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTAc > 6:371924/1‑101 (MQ=255) aTCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCAGGGc > 1:135010/1‑149 (MQ=255) tCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATGGCa > 4:366667/1‑149 (MQ=255) tCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATGGCa > 5:358420/1‑149 (MQ=255) caggccgccggccactaccagaatggggtacaggccgccggccTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTg < 7:129853‑M2/75‑1 (MQ=255) caggccgccggccactaccagaatggggtacaggccgccggccTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTg > 8:129853‑M2/44‑118 (MQ=255) caggccgccggccactaccagaatggggtacaggccgccggccTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATGGCAt > 2:273182‑M2/44‑149 (MQ=255) ggccgccggccactaccagaatggggtacaggccgccggccTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATGGCATcc > 3:159005‑M2/42‑149 (MQ=255) GCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATGGCATCCt > 6:351101‑M1/1‑149 (MQ=255) CCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTCCGGCCTGGTGCTTGCCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATGGCATCCTg < 6:339392‑M1/149‑1 (MQ=255) CGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATGGCATCCTGc > 6:148409‑M1/1‑149 (MQ=255) gcggcCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGCCCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATGGCATCCTGcac < 8:311182/149‑1 (MQ=255) gcggcCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATGGCATCCTGcac < 7:131406/149‑1 (MQ=255) ggcCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATGGCATCCTGCACAt > 1:278594/1‑149 (MQ=255) ggcCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATGGCATCCTGCACAt < 8:234995/149‑1 (MQ=255) tGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATGGCATCCTGCACATGCTc > 6:321200/1‑149 (MQ=255) tGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATGGCATCCTGCACATGCTc > 7:69680/1‑149 (MQ=255) cccATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATGGCATCCTGCACATGCTCGACgg > 7:6883/1‑149 (MQ=255) cccATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATGGCATCCTGCACATGCTCGACgg > 6:361406/1‑149 (MQ=255) ccATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATGGCATCCTGCACATGCTc < 7:190293/143‑1 (MQ=255) ccATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATGGCATCCTGCACATGCTc > 8:190293/1‑143 (MQ=255) cATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATGGCATCCTGCACATGCTCGACGGCa > 8:50099/1‑149 (MQ=255) gCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATGGCATCCTGCACATGCTCGACGGCATGGCCtggctggc < 8:69680/149‑1 (MQ=255) cggcggCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATGGCATCCTGCACATGCTCGACGGCATGGCCTGGCTGGccc < 2:80674/149‑1 (MQ=255) cgccggccTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATGGCATCCTGCACATGCTCGACGGCATGGCCTGGCTGGccc < 4:159005‑M2/141‑1 (MQ=255) gcggcCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATGGCATCCTGCACATGCTCGACGGCATGGCCTGGCTGGCCCAg < 7:50099/149‑1 (MQ=255) gcggcCTGGTAATGTTCTCGCTGACAAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATGGAATCCTGCACATGCTCGACGGCATGGCCTGGCTGGcc > 4:104003/1‑146 (MQ=255) cggccTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATGGCATCCTGCACATGCTCGACGGCATGGCCTGGCTGGCCCAGa < 6:223512‑M2/144‑1 (MQ=255) gccTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATGGCATCCTGCACATGCTCGACGGCATGGCCTGGCTGGcc > 5:155194‑M2/4‑143 (MQ=255) ccTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATGGCATCCTGCACATGCTCGACGGCATGGCCTGGCTGGCCCAGATCg < 6:358420‑M2/147‑1 (MQ=255) cTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATGGCATCCTGCACATGCTCGACGGCATGGCCTGGCTGGCCCAGATCgg > 8:59035‑M2/2‑149 (MQ=255) tGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATGGCATCCTGCACATGCTCGACGGCATg > 2:257424/1‑128 (MQ=255) tGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATGGCATCCTGCACATGCTCGACGGCATg < 1:257424/128‑1 (MQ=255) tGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATGGCATCCTGCACATGCTCGACGGCATGGCCTGGCTGGCCCAGATCgg > 8:1194/1‑148 (MQ=255) | TGCACTGGAGCCTGCTGGGCCACTTGCTGCGTGAGTTCGGTATCGGCACGCTGCTGGGCCTGGGCGGCGGCTGGCTGATGCTGCAACTGGTAAACCGTATCAATCTGGCCGGCGGCCTGTACCCCATTCTGGTAGTGGCCGGCGGCCTGGTAATGTTCTCGCTGACCAACGCCCTGCATGGTAGCGGCTTCCTCGCCGTTTACCTGTGCGGCCTGGTGCTTGGCAACAAGCCTATCCGCAGCCGCCATGGCATCCTGCACATGCTCGACGGCATGGCCTGGCTGGCCCAGATCGG > NC_002947/5780292‑5780586 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
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