| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 229096 | 73 (1.210) | 6 (0.110) | 4/248 | NT | 7.3% | coding (1922/2088 nt) | PP_0176 | putative efflux transporter |
| ? | NC_002947 | = 229123 | 83 (1.470) | coding (1949/2088 nt) | PP_0176 | putative efflux transporter | |||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
TGGCGTACATGCCGCGCGCCGGCCAGCAGGCTCGCGAGCGCCTGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGAACCCGCCGAACAACCGCAACTGCCCCCCGGGCTC > NC_002947/228949‑229244 | tgGCGTACATGCCGCGCGCCGGCCAGCAGGCTCGCGAGCGCCTGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGc > 2:357376/1‑149 (MQ=255)tgGCGTACATGCCGCGCGCCGGCCAGCAGGCTCGCGAGCGCCTGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGc > 6:8032/1‑149 (MQ=255) gCGTACATGCCGCGCGCCGGCCAGCAGGCTCGCGAGCGCCTGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCt > 8:199668/1‑149 (MQ=255) gTACATGCCGCGCGCCGGCCAGCAGGCTCGCGAGCGCCTGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTgg > 6:254299/1‑149 (MQ=255) gTACATGCCGCGCGCCGGCCAGCAGGCTCGCGAGCGCCTGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTgg > 4:191194/1‑149 (MQ=255) cATGCCGCGCGCCGGCCAGCAGGCTCGCGAGCGCCTGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGgcgc < 7:199668/149‑1 (MQ=255) cATGCCGCGCGCCGGCCAGCAGGCTCGCCAGCGCCTGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGgcgc > 1:215506/1‑149 (MQ=255) gCCGCGCGCCGGCCAGCAGGCTCGCGAGCGCCTGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTg > 2:254370/1‑148 (MQ=255) gCCGCGCGCCGGCCAGCAGGCTCGCGAGCGCCTGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTg > 2:338111/1‑148 (MQ=255) cgcgcgCCGGCCAGCAGGCTCGCGAGCGCCTGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAAc < 6:206665/149‑1 (MQ=255) gcgcgcCGGCCAGCAGGCTCGCGAGCGCCTGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAAcc < 6:143989/149‑1 (MQ=255) cgcgcCGGCCAGCAGGCTCGCGAGCGCCTGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTTCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACATCGGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAAcc < 1:3277/149‑1 (MQ=255) ccGGCCAGCAGGCTCGCGAGCGCCTGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGAt < 8:196864/149‑1 (MQ=255) gCCAGCAGGCTCGCGAGCGCCTGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCCTGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAg > 7:123735/1‑149 (MQ=255) gCCAGCAGGCTCGCGAGCGCCTGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAg < 3:191194/149‑1 (MQ=255) ccAGCAGGCTCGCGAGCGCCTGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGc < 4:258230/149‑1 (MQ=255) ggCTCGCGAGCGCCTGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTAc < 2:222859‑M2/148‑2 (MQ=255) gCTCGCGAGCGCCTGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTAc < 8:196278‑M2/147‑2 (MQ=255) aGCGCCTGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGtacagctcatccaggttcagcgccaggcgagcgcgtt < 4:203595‑M1/149‑38 (MQ=255) gcgcCTGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCgcggc > 6:382184/1‑148 (MQ=255) gcCTGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGtacagctcatccaggttcagcgccaggcgagcgcgt > 3:243000‑M1/1‑109 (MQ=255) gcCTGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGtacagctcatccaggttcagcgccaggcgagcgcgt < 4:243000‑M1/145‑37 (MQ=255) gcCTGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGtacagctcatccaggttcagcgccaggcgagcgcgt < 8:344581‑M1/145‑37 (MQ=255) gcCTGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGtacagctcatccaggttcagcgccaggcgagcgcgt > 7:344581‑M1/1‑109 (MQ=255) gcCTGAACACTCTGGGCGAGGAAGGCGGAGCGCACGACACCGCCTGCCTGCGTGCAGGCGAACGCCTGCAAGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGtacagctcatccaggttcaccgccaggcgagcgcgttcca < 8:142163‑M1/149‑41 (MQ=255) ccTGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATg > 3:234806/1‑149 (MQ=255) cggAACACGGGGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCCCTACGCCGCCTGCCAGCGTGCTGGCGCACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGGGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCGGGCGGTGAACCGGGATGAGCTGTTCGAGCGCGGCGCTGc > 2:355805/3‑149 (MQ=255) tGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGcc > 6:264828/1‑149 (MQ=255) gAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGccc > 5:164709/1‑149 (MQ=255) aaCACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGccc < 8:125186/148‑1 (MQ=255) aaCACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGcc < 3:209989/147‑1 (MQ=255) acTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTAc < 5:27001‑M2/129‑2 (MQ=255) acTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTAc > 6:27001‑M2/1‑128 (MQ=255) gTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACct > 2:238656/1‑149 (MQ=255) gTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACct > 6:376328/1‑149 (MQ=255) ggAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCtgctgc < 5:254299/149‑1 (MQ=255) aaGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCAt < 8:174851/149‑1 (MQ=255) ggTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCt < 2:215506/149‑1 (MQ=255) ggTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCt < 1:338111/149‑1 (MQ=255) ggTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCt > 1:198024/1‑149 (MQ=255) gTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCt > 8:20127/1‑148 (MQ=255) gTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCt < 7:20127/148‑1 (MQ=255) tGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGa < 1:238656/149‑1 (MQ=255) gcACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCGGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGTTGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTg < 6:341962/149‑1 (MQ=255) gcACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTg < 7:196278/149‑1 (MQ=255) gcACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTACATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTg < 1:91159/149‑1 (MQ=255) aCTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGc < 1:357376/149‑1 (MQ=255) tACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCt > 2:6781/1‑149 (MQ=255) cgccTGCCTACGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGcc < 1:16433/149‑1 (MQ=255) gcctgcctGCGTGCTTGAGAACGCCTGCATGCCCCGTCCGCACTGCTGCGGAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGTATGATCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGATGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCt < 8:200266/149‑1 (MQ=255) gcctgcctGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCt > 6:234448/1‑149 (MQ=255) ctgcctgcGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTgg < 5:8032/149‑1 (MQ=255) tgcGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGAGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTa > 4:44299/1‑149 (MQ=255) gcGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACctg < 4:67372/115‑1 (MQ=255) gcGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACctg > 3:67372/1‑115 (MQ=255) cGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTAc < 1:355805/148‑1 (MQ=255) tgtcGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCAGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGAAGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTCGCCTGCCCCTGGCGCTACTGCCgg > 2:334412/4‑149 (MQ=255) tGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCgg > 7:143319/1‑149 (MQ=255) gAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGt > 2:91528/1‑149 (MQ=255) gCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAg < 5:127994/149‑1 (MQ=255) gCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAg < 1:222859/149‑1 (MQ=255) ccTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTTAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAgg < 5:376328/149‑1 (MQ=255) ccTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAgg < 5:264828/149‑1 (MQ=255) cTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGt > 6:275178/1‑149 (MQ=255) cTGCATG‑CCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGt > 1:161634/1‑148 (MQ=255) tGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGt > 7:43259/1‑148 (MQ=255) cATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTg < 1:254370/147‑1 (MQ=255) aTGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGGGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATg > 7:17976/1‑149 (MQ=255) tGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTCGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGc < 2:198024/149‑1 (MQ=255) ccccGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCt < 4:234806/148‑1 (MQ=255) ccccGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTc > 2:370263/1‑149 (MQ=255) ccccGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTc > 1:333651/1‑149 (MQ=255) ccGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGa > 3:323582/1‑149 (MQ=255) gCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGAACccgc < 2:161634/149‑1 (MQ=255) tgctgcGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGAACCCGCCGaa > 6:188510/1‑149 (MQ=255) ctgcGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGAACCCGCCGaac < 1:91528/148‑1 (MQ=255) gcAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGAACAAACCTGCTGCATGCCATGAGTGGCCTCCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGTTGGAGTTGATGCTCGAACCCTCCGaacaacaa > 3:228196/1‑147 (MQ=255) cAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGACCCCGCCGAACAACCg > 7:281337/1‑148 (MQ=255) aCAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGAACCCGCCGAACAACCGCaa < 8:164690/149‑1 (MQ=255) t‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGGTGAACCTGGATGAGCTGTAcgagcgcgttccatgttgcgcagcagtgcggccggggcttgcaggcgttcgcctgcacgcaggcaggcggtgtcgtgcgctccgccttcctcgcccagagtgttcaggc < 8:142163‑M2/149‑110 (MQ=255) ggAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAg > 7:4075/1‑115 (MQ=255) ggAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGAACCCGCCGAACAACCGCAACTGc > 3:79330/1‑149 (MQ=255) ggAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGACGCTCGAACCCGCCGAACAACCGCAACTGc > 1:52690/1‑149 (MQ=255) gAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTTTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGAACCCGCCGAACAACCGCAACTGc < 8:123735/148‑1 (MQ=255) aaCGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTAcgagcgcgttccatgttgcgcagcagtgcggccggggcatgcaggcgttcgccagcacgcaggcaggcggcgtagtgcgcaccgacttcctcgaccacagtgttcaggcgct < 4:203595‑M2/149‑113 (MQ=255) aaCGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGAACCCGCCGAACAACCGCAACTGccc > 8:195331/1‑149 (MQ=255) aCGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTAcgagcgcgttccatgttgcgcagcagtgcggccggggcatgcaggcgttcgccagcacgcaggcaggcggcgtagtgcgcaccgacttcctcgaccacagtgttcaggc < 8:344581‑M2/145‑110 (MQ=255) aCGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTAcgagcgcgttccatgttgcgcagcagtgcggccggggcatgcaggcgttcgccagcacgcaggcaggcggcgtagtgcgcaccgacttcctcgaccacagtgttcaggc > 7:344581‑M2/1‑36 (MQ=255) aCGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTAcgagcgcgttccatgttgcgcagcagtgcggccggggcatgcaggcgttcgccagcacgcaggcaggcggcgtagtgcgcaccgacttcctcgaccacagtgttcaggc > 3:243000‑M2/1‑36 (MQ=255) aCGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTAcgagcgcgttccatgttgcgcagcagtgcggccggggcatgcaggcgttcgccagcacgcaggcaggcggcgtagtgcgcaccgacttcctcgaccacagtgttcaggc < 4:243000‑M2/145‑110 (MQ=255) aCGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGACCCCGCCGAACACCCGCAACTGcccc > 8:127597/1‑149 (MQ=255) aCGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGAACCCTCCGAACAACCGCAACTGcccc > 2:84316/1‑149 (MQ=255) aCGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCAGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGCGGAGGTGATGCTCGAACCCGCCGAACAACCGCAACTGcccc > 7:321980/1‑149 (MQ=255) gcTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGAGATGCCCGAACCCACCTCCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCAGCGGGTGGAGGAGATGCTAGAACCCGCCGAACAACCGCAACTCaccccctg > 8:17173/1‑147 (MQ=255) tCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGAGATGCTCGAACCCGCCGCACAACCGCAACTGCCCCCCGGGc > 5:352433/1‑149 (MQ=255) gtacagctcatccaggttcagcgccaggcgagcgcgttccatgttgcgcagcagtgcggccggggcatgcaggcgttcgccagcacgcaggcaggcggcgtagtgcgcaccgacttcctcgaccacagtgttcaggcgctcgcgagcc < 2:222859‑M1/148‑148 (MQ=255) gtacagctcatccaggttcagcgccaggcgagcgcgttccatgttgcgcagcagtgcggccggggcatgcaggcgttcgccagcacgcaggcaggcggcgtagtgcgcaccgacttcctcgaccacagtgttcaggcgctcgcgagc < 8:196278‑M1/147‑147 (MQ=255) gtacagctcatccaggttcagcgccaggcgagcgcgttccatgttgcgcagcagtgcggccggggcatgcaggcgttcgccagcacgcaggcaggcggcgtagtgcgcaccgacttcctcgaccacagt < 5:27001‑M1/129‑129 (MQ=255) gtacagctcatccaggttcagcgccaggcgagcgcgttccatgttgcgcagcagtgcggccggggcatgcaggcgttcgccagcacgcaggcaggcggcgtagtgcgcaccgacttcctcgaccacagt > 6:27001‑M1/1‑1 (MQ=255) gCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGAACCCGCCGAACAACCGCAACTGCCCCCCGGGCTc > 2:223842/1‑149 (MQ=255) | TGGCGTACATGCCGCGCGCCGGCCAGCAGGCTCGCGAGCGCCTGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACAT‑GGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGAACCCGCCGAACAACCGCAACTGCCCCCCGGGCTC > NC_002947/228949‑229244 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |