New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 229096 | 73 (1.210) | 6 (0.110) | 4/248 | NT | 7.3% | coding (1922/2088 nt) | PP_0176 | putative efflux transporter |
? | NC_002947 | = 229123 | 83 (1.470) | coding (1949/2088 nt) | PP_0176 | putative efflux transporter |
GGCTCGCGAGCGCCTGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACATGGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGAACCCGCCGAACAACCGCAACTGCCCCCCGGGCTCGACGGAGCGCCCTTGTGATTGGTG > NC_002947/228977‑229268 | ggCTCGCGAGCGCCTGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACATGGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTAc < 2:222859‑M2/148‑2 (MQ=255) gCTCGCGAGCGCCTGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACATGGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTAc < 8:196278‑M2/147‑2 (MQ=255) gcgcCTGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACATGGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCgcggc > 6:382184/1‑148 (MQ=255) ccTGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACATGGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATg > 3:234806/1‑149 (MQ=255) cggAACACGGGGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCCCTACGCCGCCTGCCAGCGTGCTGGCGCACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGGGCAACATGGAACGCGCTCGCCGGGCGGTGAACCGGGATGAGCTGTTCGAGCGCGGCGCTGc > 2:355805/3‑149 (MQ=255) tGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACATGGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGcc > 6:264828/1‑149 (MQ=255) gAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACATGGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGccc > 5:164709/1‑149 (MQ=255) aaCACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACATGGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGccc < 8:125186/148‑1 (MQ=255) aaCACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACATGGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGcc < 3:209989/147‑1 (MQ=255) acTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACATGGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTAc < 5:27001‑M2/129‑2 (MQ=255) acTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACATGGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTAc > 6:27001‑M2/1‑128 (MQ=255) gTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACATGGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACct > 2:238656/1‑149 (MQ=255) gTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACATGGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACct > 6:376328/1‑149 (MQ=255) ggAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACATGGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCtgctgc < 5:254299/149‑1 (MQ=255) aaGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACATGGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCAt < 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tGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACATGGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGa < 1:238656/149‑1 (MQ=255) gcACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCGGGCCGCACTGCTGCGCAACATGGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGTTGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTg < 6:341962/149‑1 (MQ=255) gcACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACATGGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTg < 7:196278/149‑1 (MQ=255) gcACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTACATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACATGGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTg < 1:91159/149‑1 (MQ=255) aCTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACATGGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGc < 1:357376/149‑1 (MQ=255) 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tgcGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACATGGAACGAGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTa > 4:44299/1‑149 (MQ=255) gcGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACATGGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACctg < 4:67372/115‑1 (MQ=255) gcGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACATGGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACctg > 3:67372/1‑115 (MQ=255) cGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACATGGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTAc < 1:355805/148‑1 (MQ=255) tgtcGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACATGGAACGCGCTCGCCAGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGAAGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTCGCCTGCCCCTGGCGCTACTGCCgg > 2:334412/4‑149 (MQ=255) tGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACATGGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCgg > 7:143319/1‑149 (MQ=255) 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gCACTGCTGCGCAACATGGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGAACccgc < 2:161634/149‑1 (MQ=255) tgctgcGCAACATGGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGAACCCGCCGaa > 6:188510/1‑149 (MQ=255) ctgcGCAACATGGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGAACCCGCCGaac < 1:91528/148‑1 (MQ=255) gcAACATGGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGAACAAACCTGCTGCATGCCATGAGTGGCCTCCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGTTGGAGTTGATGCTCGAACCCTCCGaacaacaa > 3:228196/1‑147 (MQ=255) cAACATGGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGACCCCGCCGAACAACCg > 7:281337/1‑148 (MQ=255) 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gcTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGAACCCGCCGAACAACCGCAACTGCCCCCCGGGCTCGACGGAg > 1:372770/1‑149 (MQ=255) cTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGAACCCGCCGAACAACCGCAACTGCCCCCCGGGCTCGACGGAgc < 8:281337/149‑1 (MQ=255) ggATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAg < 1:25643/88‑1 (MQ=255) ggATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAg > 2:25643/1‑88 (MQ=255) ggATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGGGGAGGTGATGCTCGAACCCGCCGAACAACCGCAACTGCCCCCCGGGCTCGACGGAGCGCCCTtgt > 1:295692/1‑149 (MQ=255) gATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGAACCCGCCGAACAACCGCAACTGCCCCCCGGGCTCGACGGAGCGCCCTtgt < 1:6781/148‑1 (MQ=255) aTGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGAACCCGCCGAACAACCGCAACTGCCCCCCGGGCTCGACGGAGCGCCCTTGTGa < 5:382184/149‑1 (MQ=255) tGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGAACCCGCCGAACAACCGCAACTCCCCCCCGGGCTCGACGGAGCGCCCTTGTGAt > 4:179945/1‑149 (MQ=255) tGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGACGCTCGAACCCGCCGAACAACCGCAACTGCCCCCCGGGCTCGACGGAGCGCCCTTGTGAt < 2:52690/149‑1 (MQ=255) gAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGAACCCGCCGAACAACCGCAACTGCCCCCCGGGCTCGACGGAGCGCCCTTGTGAtt > 4:284833/1‑149 (MQ=255) aGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGAACCCGCCGAACAACCGCAACTGCCCCCCGGGCTCGACGGAGCGCCCTtgt > 7:327331/1‑144 (MQ=255) aGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGAACCCGCCGAACAACCGCAACTGCCCCCCGGGCTCGACGGAGCGCCCTtgt < 8:327331/144‑1 (MQ=255) aGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGAACCCGCCGAACAACCGCAACTGCCCCCCGGGCTCGACGGAGCGCCCTTGTGATTg < 2:333651/149‑1 (MQ=255) aGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGAACCCGCCGAACAACCGCAACTGCCCCCCGGGCTCGACGGAGCGCCCTTGTGATTg < 7:195331/149‑1 (MQ=255) aGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGAACCCGCCGAACAACCGCAACTGCCCCCCGGGCTCGACGGAGCGCCCTTGTGATTg < 4:13610/149‑1 (MQ=255) aGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGAACCCGCCGAACAACCGCAACTGCCCCCCGGGCTCGACGGAGCGCCCTTGTGATTg < 5:234448/149‑1 (MQ=255) gCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGAACCCGCCGAACAACCGCAACTGCCCCCCGGGCTCGACGGAGCGCCCTTGTGATTgg < 3:179945/149‑1 (MQ=255) tACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGAACCCGCCGAACAACCGCAACTGCCCCCCGGGCTCGACGGAGCGCCCTTGTGATTGGTg < 3:44299/147‑1 (MQ=255) | GGCTCGCGAGCGCCTGAACACTGTGGTCGAGGAAGTCGGTGCGCACTACGCCGCCTGCCTGCGTGCTGGCGAACGCCTGCATGCCCCGGCCGCACTGCTGCGCAACATGGAACGCGCTCGCCTGGCGCTGAACCTGGATGAGCTGTACGAGCGCGGCGATGCCCGCACCCACCTGCTGCATGCCCTGAGTGGCCTGCGCCTGGCGCTACTGCCGGGGGTGGAGGTGATGCTCGAACCCGCCGAACAACCGCAACTGCCCCCCGGGCTCGACGGAGCGCCCTTGTGATTGGTG > NC_002947/228977‑229268 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |