New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 655539 = | 62 (1.030) | 4 (0.070) | 3/248 | NT | 6.6% | coding (804/1356 nt) | PP_0563 | two‑component system response regulator |
? | NC_002947 | 655583 = | 55 (0.970) | coding (760/1356 nt) | PP_0563 | two‑component system response regulator |
GCTCACGGCGGGCGCGGAAGCTGCAGTCTTCCAGCAGCTGCAGGATATGAGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGC > NC_002947/655391‑655684 | gctCACGGCGGGCGCGGAAGCTGCAGTCTTCCAGCAGCTGCAGGATATGAGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGt < 1:186523/149‑1 (MQ=255) tCACGGCGGGCGCGGAAGCTGCAGTCTTCCAGCAGCTGCAGGATATGAGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGt > 3:204964/1‑147 (MQ=255) tCACGGCGGGCGCGGAAGCTGCAGTCTTCCAGCAGCTGCAGGATATGAGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGt > 4:105519/1‑147 (MQ=255) gcccgacctgatcatcctcgacctgtacatgccggcctgcaccggcccggagctggccaaggtaatccgccacagtgaccgttatgtgagtgtgccgatcatctacctgtctgccgaggacgacctggacaagcaactggatgccaTGa > 7:222001‑M1/147‑149 (MQ=255) gcccgacctgatcatcctcgacctgtacatgccggcctgcaccggcccggagctggccaaggtaatccgccacagtgaccgttatgtgagtgtgccgatcatctacctgtctgccgaggacgacctggacaagcaactggatgccaTGa > 4:53630‑M1/147‑149 (MQ=255) cccgacctgatcatcctcgacctgtacatgcgggcctgcaccggcccggagctggccaaggtaatccgccacagtgaccgttatgtgagtgtgccgatcatctacctgtctgccgaggacgacctggacaagcaactggatgccaTGAg > 5:284618‑M1/146‑149 (MQ=255) aCGGCGGGCGCGGAAGCTGCAGTCTTCCAGCAGCTGCAGGATATGAGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTTGCGTGAg < 6:51340/148‑1 (MQ=255) aCGGCGGGCGCGGAAGCTGCAGTCTTCCAGCAGCTGCAGGATATGAGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGc < 6:209414/149‑1 (MQ=255) cggcggGCGCGGAAGCTGCAGTCTTCCAGCAGCTGCAGGATATGAGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCg < 4:286485/149‑1 (MQ=255) cgGAAGCTGCAGTCTTCCAGCAGCTGCAGGATATGAGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCtt < 4:333900/149‑1 (MQ=255) ggAAGCTGCAGTCTTCCAGCAGCTGCAGGATATGAGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTg > 8:332005/1‑149 (MQ=255) gAAGCTGCAGTCTTCCAGCAGCTGCAGGATATGAGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTgg > 8:303083/1‑149 (MQ=255) aaGCTGCAGGCTTCCAGCAGCTGCAGGATATGAGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGt < 8:190658/149‑1 (MQ=255) aGCTGCAGTCTTCCAGCAGCTGCAGGATATGAGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGt > 2:161693/1‑148 (MQ=255) tGCAGTCTTCCAGCAGCTGCAGGATATGAGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCaa > 3:308797/1‑148 (MQ=255) gCAGTCTTCCAGCAGCTGCAGGATATGAGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCaaa > 3:312300/1‑148 (MQ=255) cAGTCTTCCAGCAGCTGCAGGATATGAGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCaaaaa < 5:29186/149‑1 (MQ=255) cAGTCTTCCAGCAGCTGCAGGATATGAGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCaaa > 4:45737/1‑147 (MQ=255) cAGTCTCCCAGCCGCTGCAGGTTATGAGTTGGGTTGGCCACCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTGCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGCCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCaaaaa < 8:263813/149‑1 (MQ=255) aGTCTGCCAGCAGCGGCAGGATATGAGGGTGGGTGGCCAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAg < 4:227907/149‑1 (MQ=255) tcccAGCAGCTGCAGGATATGAGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGtca > 4:293159/3‑148 (MQ=255) ccAGCAGCTGCAGGATATGAGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGtcatc < 3:8968/148‑1 (MQ=255) ccAGCAGCTGCAGGATATGAGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGtcatc > 4:8968/1‑148 (MQ=255) ccAGCAGCTGCAGGATATGAGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGtcat < 4:83782/147‑1 (MQ=255) cagcagCTGCAGGATATGAGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCAc > 1:85640/1‑149 (MQ=255) agcagcTGCAGGATATGAGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCAcc < 7:261383/149‑1 (MQ=255) gcagcTGCAGGATATGAGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCg > 5:11538/1‑149 (MQ=255) ctgcaccggcccggagctggccaaggtaatccgccacagtgaccgttatgtgagtgtgccgatcatctacctgtctgccgaggacgacctggacaagcaactggatgccaTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTc < 6:134617‑M1/39‑1 (MQ=255) gCAGGATATGAGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCg > 2:25710/1‑149 (MQ=255) cAGGATATGAGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTc < 5:20932/147‑1 (MQ=255) cAGGATATGAGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTc > 6:20932/1‑147 (MQ=255) cggcccggagctggccaaggtaatccgccacagtgaccgttatgtgagtgtgccgatcatctacctgtctgccgaggacgacctggacaagcaactggatgccaTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCAt > 4:362966‑M1/105‑149 (MQ=255) atatGAGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCAt < 1:264296/149‑1 (MQ=255) ggcccggagctggccaaggtaatccgccacagtgaccgttatgtgagtgtgccgatcatctacctgtctgccgaggacgacctggacaagcaactggatgccaTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATg > 5:134617‑M1/104‑149 (MQ=255) gcccggagctggccaaggtaatccgccacagtgaccgttatgtgagtgtgccgatcatctacctgtctgccgaggacgacctggacaagcaactggatgccaTGAGCGAAAACGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATg > 1:67968‑M1/103‑149 (MQ=255) atGAGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATgg > 1:139189/1‑149 (MQ=255) aGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCAt < 6:329959/149‑1 (MQ=255) gTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGtt < 3:105519/149‑1 (MQ=255) gTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGt < 7:332005/148‑1 (MQ=255) ttGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTg > 8:237604/1‑108 (MQ=255) ttGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTg < 7:237604/108‑1 (MQ=255) gTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGc < 4:112684/148‑1 (MQ=255) aCAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTg > 3:262343/1‑149 (MQ=255) gCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGtt < 4:91812/141‑1 (MQ=255) gCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGtt > 3:91812/1‑141 (MQ=255) gCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTc > 3:10847/1‑148 (MQ=255) cGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAgg < 7:303083/149‑1 (MQ=255) cGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAgg < 8:83696/149‑1 (MQ=255) gTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGgtc < 1:161693/149‑1 (MQ=255) gTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGgtc > 5:120136/1‑149 (MQ=255) tCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGc < 6:11538/149‑1 (MQ=255) gcgGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCa < 2:139189/148‑1 (MQ=255) gcgGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCa < 7:168702/148‑1 (MQ=255) ccATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGcaggcagg < 1:25710/149‑1 (MQ=255) aTGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCATGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTa < 5:341762/149‑1 (MQ=255) cTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCg > 1:80753/1‑149 (MQ=255) ttCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTc > 3:15355/1‑96 (MQ=255) ttCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTc < 4:15355/96‑1 (MQ=255) ttCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGt > 7:148387/1‑139 (MQ=255) ttCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGt < 8:148387/139‑1 (MQ=255) aaTGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGcac > 2:179255/1‑148 (MQ=255) tGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACt > 6:284261/1‑149 (MQ=255) gcgggcgcgggcGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTc < 4:204964/148‑1 (MQ=255) cgggcgcgggcgGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGACATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTcac < 4:308797/149‑1 (MQ=255) gcgggcggCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAAc < 3:45737/149‑1 (MQ=255) ggcgCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCAc > 3:15457/1‑149 (MQ=255) cgGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACtgtg < 3:293159/149‑1 (MQ=255) cgcACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGa < 5:243663/148‑1 (MQ=255) aggTAGTGAGCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CTGATTGGTGAAAATGTCATCACCGACTTCGCTCATGTCATCCAGTTGCTTGTCCATGTCGTCCTCGGCAGAGAGGTATATGATCGGCACACTCACATAACTTTCACTGTGGCTGATTAcc < 3:136420/148‑1 (MQ=255) gTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCtt < 6:9194/149‑1 (MQ=255) tAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTg < 5:284261/149‑1 (MQ=255) aGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTc < 4:15457/149‑1 (MQ=255) ggTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAGAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTcc > 6:322441/1‑149 (MQ=255) ggTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTcc > 3:89755/1‑149 (MQ=255) gCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGc > 3:154826/1‑149 (MQ=255) gCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGc < 6:120136/149‑1 (MQ=255) | GCTCACGGCGGGCGCGGAAGCTGCAGTCTTCCAGCAGCTGCAGGATATGAGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGC > NC_002947/655391‑655684 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |