New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 655539 = | 62 (1.030) | 4 (0.070) | 3/248 | NT | 6.6% | coding (804/1356 nt) | PP_0563 | two‑component system response regulator |
? | NC_002947 | 655583 = | 55 (0.970) | coding (760/1356 nt) | PP_0563 | two‑component system response regulator |
ATATGAGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGG > NC_002947/655435‑655731 | cggcccggagctggccaaggtaatccgccacagtgaccgttatgtgagtgtgccgatcatctacctgtctgccgaggacgacctggacaagcaactggatgccaTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCAt > 4:362966‑M1/105‑149 (MQ=255) atatGAGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCAt < 1:264296/149‑1 (MQ=255) ggcccggagctggccaaggtaatccgccacagtgaccgttatgtgagtgtgccgatcatctacctgtctgccgaggacgacctggacaagcaactggatgccaTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATg > 5:134617‑M1/104‑149 (MQ=255) gcccggagctggccaaggtaatccgccacagtgaccgttatgtgagtgtgccgatcatctacctgtctgccgaggacgacctggacaagcaactggatgccaTGAGCGAAAACGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATg > 1:67968‑M1/103‑149 (MQ=255) atGAGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATgg > 1:139189/1‑149 (MQ=255) aGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCAt < 6:329959/149‑1 (MQ=255) gTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGtt < 3:105519/149‑1 (MQ=255) gTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGt < 7:332005/148‑1 (MQ=255) gTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGc < 4:112684/148‑1 (MQ=255) aCAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTg > 3:262343/1‑149 (MQ=255) gCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGtt < 4:91812/141‑1 (MQ=255) gCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGtt > 3:91812/1‑141 (MQ=255) gCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTc > 3:10847/1‑148 (MQ=255) cGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAgg < 8:83696/149‑1 (MQ=255) cGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAgg < 7:303083/149‑1 (MQ=255) gTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGgtc < 1:161693/149‑1 (MQ=255) gTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGgtc > 5:120136/1‑149 (MQ=255) tCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGc < 6:11538/149‑1 (MQ=255) gcgGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCa < 2:139189/148‑1 (MQ=255) gcgGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCa < 7:168702/148‑1 (MQ=255) ccATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGcaggcagg < 1:25710/149‑1 (MQ=255) aTGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCATGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTa < 5:341762/149‑1 (MQ=255) cTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCg > 1:80753/1‑149 (MQ=255) ttCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGt > 7:148387/1‑139 (MQ=255) ttCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGt < 8:148387/139‑1 (MQ=255) aaTGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGcac > 2:179255/1‑148 (MQ=255) tGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACt > 6:284261/1‑149 (MQ=255) gcgggcgcgggcGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTc < 4:204964/148‑1 (MQ=255) cgggcgcgggcgGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGACATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTcac < 4:308797/149‑1 (MQ=255) gcgggcggCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAAc < 3:45737/149‑1 (MQ=255) ggcgCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCAc > 3:15457/1‑149 (MQ=255) cgGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACtgtg < 3:293159/149‑1 (MQ=255) cgcACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGa < 5:243663/148‑1 (MQ=255) aggTAGTGAGCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CTGATTGGTGAAAATGTCATCACCGACTTCGCTCATGTCATCCAGTTGCTTGTCCATGTCGTCCTCGGCAGAGAGGTATATGATCGGCACACTCACATAACTTTCACTGTGGCTGATTAcc < 3:136420/148‑1 (MQ=255) gTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCtt < 6:9194/149‑1 (MQ=255) tAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTg < 5:284261/149‑1 (MQ=255) aGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTc < 4:15457/149‑1 (MQ=255) ggTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAGAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTcc > 6:322441/1‑149 (MQ=255) ggTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTcc > 3:89755/1‑149 (MQ=255) gCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGc < 6:120136/149‑1 (MQ=255) gCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGc > 3:154826/1‑149 (MQ=255) catgagcgaaggcggtgatgactttttgaccaagccgttttcgctcaTGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGc > 1:67968‑M2/48‑149 (MQ=255) catgagcgaaggcggtgatgactttttgaccaagccgtttcgctcaTGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGcc > 5:134617‑M2/47‑149 (MQ=255) atgagcgaaggcggtgatgactttttgaccaagccgtttcgctcaTGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCg > 4:362966‑M2/46‑149 (MQ=255) CGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACAt < 3:57428‑M1/103‑1 (MQ=255) CGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACAt > 4:57428‑M1/1‑103 (MQ=255) GAAA‑CGGCTTGGTCAAAGAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAg > 5:322441‑M1/1‑149 (MQ=255) gaaggcggtgatgactttttgaccaagccgtttcgctcaTGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAg < 6:134617‑M2/110‑1 (MQ=255) AAA‑CGGCTTCGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCTGCACcggcccggagctgg > 2:85640‑M1/1‑143 (MQ=255) AA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGc < 2:42431‑M1/149‑1 (MQ=255) a‑CGGCTTGGTCAAAAAGGCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGGCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCTGCACCGGCCCGGAGCTGGcc < 4:262343/149‑1 (MQ=255) gTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTa > 4:92941/1‑149 (MQ=255) cAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCCGCAGACAGGTAGATCATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGCCGCATAACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGTTGCAGTCCGGCAAGTACa > 3:101347/1‑149 (MQ=255) cAAAAAGTCAACACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTa > 4:276105/1‑147 (MQ=255) aaaaaGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCa < 8:295870/142‑1 (MQ=255) aaaaaGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACa < 4:10847/148‑1 (MQ=255) aaaaaGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACa < 1:42431/148‑1 (MQ=255) aaaaaGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAg > 3:127877/1‑149 (MQ=255) aaaaaGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAg > 8:101222/1‑149 (MQ=255) aaaaaGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGACAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCa > 7:295870/1‑142 (MQ=255) aaaaaGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTACTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAg > 8:279723/1‑149 (MQ=255) tcatcaCCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAg < 7:279723/149‑1 (MQ=255) atcaCCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACtgtg > 2:270389/1‑93 (MQ=255) atcaCCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAgg < 6:283805/148‑1 (MQ=255) atcaCCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAgg > 5:283805/1‑148 (MQ=255) tcaCCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGc > 6:156322/1‑107 (MQ=255) tcaCCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGc < 5:156322/107‑1 (MQ=255) tcaCCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGgat > 5:70886/1‑149 (MQ=255) aCCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCATGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATTATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGgatga < 4:312300/149‑1 (MQ=255) cGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGgatgat > 6:212034/1‑148 (MQ=255) cGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGgatgat > 1:203241/1‑148 (MQ=255) cGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGgatgat > 6:33149/1‑148 (MQ=255) ccTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAg < 7:18766/149‑1 (MQ=255) cTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAgg < 7:101222/149‑1 (MQ=255) ctcaTGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCCGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCggg > 5:284618‑M2/5‑149 (MQ=255) tcaTGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGc > 7:222001‑M2/4‑149 (MQ=255) tcaTGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGc > 4:53630‑M2/4‑149 (MQ=255) tGGCATCCAGTTGCTTGTCGAGGTCTTCCTCGGCAGACAGGTAGTTGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTgg < 5:316786/149‑1 (MQ=255) tGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTgg < 8:222001/149‑1 (MQ=255) | ATATGAGTGTGGTTGTACAGCCCGGTCAGGCTGTCGCGGACCATGCGTGCCTTCAAATGGCGGGCGCGGGCGGCGCGGTTGCGCACGGTAGTGATCAGGTGGCGTGAGCGAAA‑CGGCTTGGTCAAAAAGTCATCACCGCCTTCGCTCATGGCATCCAGTTGCTTGTCCAGGTCGTCCTCGGCAGACAGGTAGATGATCGGCACACTCACATAACGGTCACTGTGGCGGATTACCTTGGCCAGCTCCGGGCCGGTGCAGGCCGGCATGTACAGGTCGAGGATGATCAGGTCGGGCTGG > NC_002947/655435‑655731 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |