New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1042220 | 83 (1.380) | 6 (0.110) | 4/250 | NT | 7.1% | coding (30/1311 nt) | colS | integral membrane sensor signal transduction histidine kinase |
? | NC_002947 | = 1042247 | 79 (1.390) | coding (57/1311 nt) | colS | integral membrane sensor signal transduction histidine kinase |
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
GCGACAGCCTGCGCAGCCATGTGCATCAGCTGCGCCAGGTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCGGTGACCTGCAGCGCCTGCTGCGTATGGACAGCGTCA > NC_002947/1042077‑1042368 | gCGACAGCCTTCGCAGCCATGTGCATCAGGTGCGCCAGGTTATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCTTGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGcatc‑a < 1:284386/148‑1 (MQ=255) cGACAGCCTGCGCAGCCATGTGCATCAGCTGCGCCAGGTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGcatc‑atc < 1:51118/149‑1 (MQ=255) cGACAGCCTGCGCAGCCATGTGCATCAGCTGCGCCAGGTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGcatc‑at > 2:51118/1‑148 (MQ=255) aGCCTGCGCAGCCATGTGCATCAGCTGCGCCAGGTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCg > 7:246679/1‑149 (MQ=255) gCCTGCGCAGCCATGTGCATCAGCTGCGCCAGGTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGc < 6:149285/149‑1 (MQ=255) ccTGCGCAGCCATGTGCATCAGCTGCGCCAGGTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGcc > 3:301735/1‑149 (MQ=255) ccTGCGCAGCCATGTGCATCAGCTGCGCCAGGTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGc > 8:311060/1‑148 (MQ=255) ccTGCGCAGCCATGTGCATCAGCTGCGCCAGGTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGc > 8:299513/1‑148 (MQ=255) cgcAGCCATGTGCATCAGCTGCGCCAGGTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTg > 4:284582/1‑149 (MQ=255) ccATGTGCATCAGCTGCGCCAGGTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCt > 8:312052/1‑148 (MQ=255) aTGTGCATCAGCTGCGCCAGGTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCtgat < 7:311060/149‑1 (MQ=255) aTGTGCATCAGCTGCGCCAGGTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCtgat < 3:143157/149‑1 (MQ=255) aTGTGCATCAGCTGCGCCAGGTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCtgat < 3:100895/149‑1 (MQ=255) ctgCATCCGCTGCGCCAGGTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTGGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCtgatga < 4:301735/148‑1 (MQ=255) gCATCAGCTGCGCCAGGTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGATATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCtgatgatc > 2:211165/1‑147 (MQ=255) gCTGCGCCAGGTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCgcgctg < 5:137689‑M2/149‑7 (MQ=255) cTGCGCCAGGTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCgctcatcagggcaaaggcgatgatgatgtgctgg < 7:68321‑M1/149‑35 (MQ=255) cTGCGCCAGGTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCgctcatcagggcaaaggcgatgatgatgcgctgg < 6:150922‑M1/149‑35 (MQ=255) cTGCGCCAGGTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCgctcatcagggcaaaggcgatgatgatgcgctgg < 5:310343‑M1/149‑35 (MQ=255) cTGCGCCAGGTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCgcgctgg < 5:189376‑M2/149‑8 (MQ=255) cTGCGCCAGGTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCgcgctgg < 4:90563‑M2/149‑8 (MQ=255) cgcCAGGTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCtggt < 6:189376/147‑1 (MQ=255) ggTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCggg < 6:270503/149‑1 (MQ=255) gTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCgggg < 3:284582/149‑1 (MQ=255) gTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCATGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCgggg > 8:66023/1‑149 (MQ=255) gATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGCCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCgcgct > 3:243846‑M2/1‑131 (MQ=255) aTCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCt < 7:312052/149‑1 (MQ=255) tCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTG‑CCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTc < 4:262629/149‑1 (MQ=255) cGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTc > 2:220335/1‑149 (MQ=255) gACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTc < 4:49045/148‑1 (MQ=255) gACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTc < 3:90563/148‑1 (MQ=255) aCAAACCGTTTGAGCAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGGTATCGCCTCGCCGGGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATG‑ATCCTCGCCGTTGGCGGGCTGAGCGCGCTGGTGGCCTGGGCCTGCgg > 6:267216/1‑148 (MQ=255) aCAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCg > 8:244488/1‑148 (MQ=255) aaCCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATTCCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGACTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCAtt > 1:202393/1‑149 (MQ=255) aCCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTc > 2:69857/1‑149 (MQ=255) tttGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTa < 1:341336/149‑1 (MQ=255) gagaAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTAtcg > 4:362187/1‑149 (MQ=255) agaAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTAtcgt < 1:220335/149‑1 (MQ=255) agaAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTAtcgt > 8:39668/1‑149 (MQ=255) gaAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCg > 6:230731/1‑141 (MQ=255) gaAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTAtcgtc > 5:141234/1‑149 (MQ=255) aCCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGc > 4:114472/1‑149 (MQ=255) cGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCgctcatcagggcaaaggcgatgatgatgcgctgggcaag < 1:121905‑M1/120‑40 (MQ=255) cGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCgctcatcagggcaaaggcgatgatgatgcgctgggcaag > 2:121905‑M1/1‑81 (MQ=255) 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tATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGAttt > 2:213679/1‑149 (MQ=255) cctcgccGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGGTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCg > 1:121617/1‑149 (MQ=255) cctcgccGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCg < 6:7249/149‑1 (MQ=255) ctcgccGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGcc > 2:66761/1‑91 (MQ=255) ctcgccGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGcc < 1:66761/91‑1 (MQ=255) ggCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCTCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGTCTGATTTCCTCGGTACTGGGCg < 8:246679/149‑1 (MQ=255) 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8:293455/1‑147 (MQ=255) aaaGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTATGGCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCGTTCGCATTCGGTATAGTCGGGACGGTGCACCTGGTCGAAGAGAGACTGATTTCCTCGGAACTGGGCGGTGACATGCAGCGCctgctg > 8:196354/1‑149 (MQ=255) aaGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCGGTGACCTGCAGCGCCtgctgc > 1:60543/1‑149 (MQ=255) aaGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCGGTGACCTGCAGCGCCtgctgc < 3:114472/149‑1 (MQ=255) cTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCgcgctgggcaaggctttgcttaaactccatcgcggccctcggcgaggcgatagccgacgccatggacggtatgcagcaacg > 2:121905‑M2/1‑39 (MQ=255) cTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCgcgctgggcaaggctttgcttaaactccatcgcggccctcggcgaggcgatagccgacgccatggacggtatgcagcaacg < 1:121905‑M2/120‑82 (MQ=255) cTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCGGTGACCTGCAGCGCCTGCTGCGTAt < 6:137689/149‑1 (MQ=255) ttGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCGGTGACCTGCAGCGCCTGCTGCGTATg > 7:24182/1‑149 (MQ=255) gCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCGGTGACCTGCAGCGCCTGCTGCGTATg < 7:336732/147‑1 (MQ=255) gCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCGGTGACCTGCAGCGCCTGCTGCGTATg < 3:325915/147‑1 (MQ=255) cccAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCGGTGACCTGCAGCGCCTGCTGCGTATGGa > 5:76481/1‑148 (MQ=255) cccAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCGGTGACCTGCAGCGCCTGCTGCGTATGGa < 3:347876/148‑1 (MQ=255) cccAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCGGTGACCTGCAGCGCCTGCTGCGTATGGAc < 3:362187/149‑1 (MQ=255) ccAGCGCgctcatcagggcaaaggcgatgatgatgcgctgggcaaggctttgcttaaactccatcgcggccctcggcgaggcgatagccgacgccatggacggtatgcagcaacggtttctcaaacggtttgtcgatcacctggcgcag < 5:189376‑M1/149‑143 (MQ=255) ccAGCGCgctcatcagggcaaaggcgatgatgatgcgctgggcaaggctttgcttaaactccatcgcggccctcggcgaggcgatagccgacgccatggacggtatgcagcaacggtttctcaaacggtttgtcgatcacctggcgcag < 4:90563‑M1/149‑143 (MQ=255) ccAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCgcgctgggcaaggctttgcttaaactccatcgcggccctcggcgaggcgatagccgacgccatggacggtatgcagcaacggtttctcaaacggtttgtcgatcacctggcgcag < 5:310343‑M2/149‑116 (MQ=255) ccAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCgcgctgggcaaggctttgcttaaactccatcgcggccctcggcgaggcgatagccgacgccatggacggtatgcagcaacggtttctcaaacggtttgtcgatcacctggcgcag < 6:150922‑M2/149‑116 (MQ=255) ccAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCGGTGACCTGCAGCGCCTGCTGCGTATGGa > 4:194215/1‑147 (MQ=255) ccAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCGGTGACCTGCAGCGCCTGCTGCGTATGGACa < 8:24182/149‑1 (MQ=255) ccAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCATTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTAGAAGAGCGACTGCTTTCATCGGTACTGGGCGGTGACCTGCAGCGCCTGCTGCGTATGGa > 5:335787/1‑147 (MQ=255) cAGCGCgctcatcagggcaaaggcgatgatgatgcgctgggcaaggctttgcttaaactccatcgcggccctcggcgaggcgatagccgacgccatggacggtatgcagcaacggtttctcaaacggtttgtcgatcacctggcgcagc < 5:137689‑M1/149‑144 (MQ=255) cAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCGGTGACCTGCAGCGCCTGCTGCGTATGGACAg > 2:368853/1‑149 (MQ=255) aGCGCgctcatcagggcaaaggcgatgatgatgcgctgggcaaggctttgcttaaactccatcgcggccctcggcgaggcgatagccgacgccatgggcggtatgcagcaacggtttctcaaacggtttgtcgatc > 3:243846‑M1/1‑5 (MQ=255) aGCGCgctcatcagggcaaaggcgatgatgatgcgctgggcaaggctttgcttaaactccatcgcggccctcggcgaggcgatagccgacgccatgggcggtatgcagcaacggtttctcaaacggtttgtcgatc < 4:243846‑M1/136‑132 (MQ=255) catc‑atcatCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACATGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCGGTGACCTGCAGCGCCTGCTGCGTATGGACAGCGTCa > 5:134732/1‑149 (MQ=255) | GCGACAGCCTGCGCAGCCATGTGCATCAGCTGCGCCAGGTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCGGTGACCTGCAGCGCCTGCTGCGTATGGACAGCGTCA > NC_002947/1042077‑1042368 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |