| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1042220 | 83 (1.380) | 6 (0.110) | 4/250 | NT | 7.1% | coding (30/1311 nt) | colS | integral membrane sensor signal transduction histidine kinase |
| ? | NC_002947 | = 1042247 | 79 (1.390) | coding (57/1311 nt) | colS | integral membrane sensor signal transduction histidine kinase | |||||
GCTGCGCCAGGTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCGGTGACCTGCAGCGCCTGCTGCGTATGGACAGCGTCAGTGACTGGAGTCATCGGCCTCG > NC_002947/1042105‑1042390 | gCTGCGCCAGGTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCgcgctg < 5:137689‑M2/149‑7 (MQ=255) cTGCGCCAGGTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCgcgctgg < 5:189376‑M2/149‑8 (MQ=255) cTGCGCCAGGTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCgcgctgg < 4:90563‑M2/149‑8 (MQ=255) cgcCAGGTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCtggt < 6:189376/147‑1 (MQ=255) ggTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCggg < 6:270503/149‑1 (MQ=255) gTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCgggg < 3:284582/149‑1 (MQ=255) gTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCATGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCgggg > 8:66023/1‑149 (MQ=255) gATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGCCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCgcgct > 3:243846‑M2/1‑131 (MQ=255) gATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGCCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCgcgct < 4:243846‑M2/136‑6 (MQ=255) aTCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCt < 7:312052/149‑1 (MQ=255) tCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTG‑CCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTc < 4:262629/149‑1 (MQ=255) cGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTc > 2:220335/1‑149 (MQ=255) gACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTc < 4:49045/148‑1 (MQ=255) gACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTc < 3:90563/148‑1 (MQ=255) aCAAACCGTTTGAGCAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGGTATCGCCTCGCCGGGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATG‑ATCCTCGCCGTTGGCGGGCTGAGCGCGCTGGTGGCCTGGGCCTGCgg > 6:267216/1‑148 (MQ=255) aCAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCg > 8:244488/1‑148 (MQ=255) aaCCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATTCCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGACTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCAtt > 1:202393/1‑149 (MQ=255) aCCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTc < 2:10456/149‑1 (MQ=255) aCCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTc > 2:69857/1‑149 (MQ=255) tttGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTa < 1:341336/149‑1 (MQ=255) gagaAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTAtcg > 4:362187/1‑149 (MQ=255) agaAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTAtcgt > 8:39668/1‑149 (MQ=255) agaAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTAtcgt < 1:220335/149‑1 (MQ=255) gaAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCg > 6:230731/1‑141 (MQ=255) gaAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCg < 5:230731/141‑1 (MQ=255) gaAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTAtcgtc > 5:141234/1‑149 (MQ=255) aCCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGc > 4:114472/1‑149 (MQ=255) gTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACg > 5:7249/1‑149 (MQ=255) ttGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACgg < 7:203735/149‑1 (MQ=255) ttGCTGCATACAGTCCATGGCTTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAATCAAAGCCTTTCCCAGCGCATC‑ATCATCTACTTTGCCCTTATGAGCGCGCTTGTGGCCGGCGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGTCACgg < 1:211165/149‑1 (MQ=255) gctgcATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGt < 7:299513/148‑1 (MQ=255) tACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTg > 1:280616/1‑149 (MQ=255) aCCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTgg > 7:298641/1‑149 (MQ=255) cGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTGGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTc > 6:50173/1‑149 (MQ=255) cGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTTTCGTCGGCACGGTGCACCTGGTc > 5:222669/1‑149 (MQ=255) cGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTc < 2:280616/149‑1 (MQ=255) gTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCGTTCGCATTCGGTATCGTCGGCCCGGTGCGCCTGGTCg > 3:293034/1‑149 (MQ=255) cATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGaa < 7:244488/148‑1 (MQ=255) 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ggCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCg > 6:281929/1‑149 (MQ=255) gCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCgg < 3:153207/149‑1 (MQ=255) ccGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCg > 8:48181/1‑147 (MQ=255) ccGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCg < 7:48181/147‑1 (MQ=255) gAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCGGTGACCTGCa < 4:289/149‑1 (MQ=255) 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ccAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCGGTGACCTGCAGCGCCTGCTGCGTATGGa > 4:194215/1‑147 (MQ=255) ccAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCGGTGACCTGCAGCGCCTGCTGCGTATGGACa < 8:24182/149‑1 (MQ=255) ccAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCATTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTAGAAGAGCGACTGCTTTCATCGGTACTGGGCGGTGACCTGCAGCGCCTGCTGCGTATGGa > 5:335787/1‑147 (MQ=255) ccAGCACATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCgcgctgggcaaggctttgcttaaactccatcgcggccctcggcgaggcgatagccgacgccatggacggtatgcagcaacggtttctcaaacggtttgtcgatcacctggcgcag < 7:68321‑M2/149‑116 (MQ=255) cAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCGGTGACCTGCAGCGCCTGCTGCGTATGGACAg > 2:368853/1‑149 (MQ=255) catc‑atcatCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACATGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCGGTGACCTGCAGCGCCTGCTGCGTATGGACAGCGTCa > 5:134732/1‑149 (MQ=255) atc‑atcatcGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCGGTGACCTGCAGCGCCTGCTGCGTATGGACAGCGTCAg > 7:82198/1‑149 (MQ=255) atc‑atcatcGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCGGTGACCTGCAGCGCCTGCTGCGTATGGACAGCGTCAg > 6:364630/1‑149 (MQ=255) tc‑atcatcGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCGGTGACCTGCAGCGCCTGCTGCGTATGGACAGCGTCAGt > 7:83695/1‑149 (MQ=255) c‑atcatcGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCGGTGACCTGCAGCGCCTGCTGCGTATGGACAGCGTCAGt < 8:82198/148‑1 (MQ=255) atcGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGCATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCGGTGACCTGCAGCGCCTGCTGCGTATGGACAGCGTCAGTGACTg < 2:202393/149‑1 (MQ=255) gCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCGGTGACCTGCAGCGCCTGCTGCGTATGGACAGCGTCAGTGACTGGa < 1:21507/148‑1 (MQ=255) gCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCGGTGACCTGCAGCGCCTGCTGCGTATGGACAGCGTCAGTGACTGGAg < 6:163580/149‑1 (MQ=255) cTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCGGTGACCTGCAGCGCCTGCTGCGTATGGACAGCGTCAGTGACTGGAGTc < 6:141234/149‑1 (MQ=255) tgatgaGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCGGTGACCTGCAGCGCCTGCTGCGTATGGACAGCGTCAGTGACTGGAGTCATCGGCCt > 2:371326/1‑149 (MQ=255) atgaGCgcgctgggcaaggctttgcttaaactccatcgcggccctcggcgaggcgatagccgacgccatggacggtatgcagcaacggtttctcaaacggtttgtcgatcacctggcgcagctgatgcacatggctgcgcaggctgtcg > 8:68321‑M2/1‑6 (MQ=255) | GCTGCGCCAGGTGATCGACAAACCGTTTGAGAAACCGTTGCTGCATACCGTCCATGGCGTCGGCTATCGCCTCGCCGAGGGCCGCGATGGAGTTTAAGCAAAGCCTTGCCCAGCGCATC‑ATCATCGCCTTTGCCCTGATGAGCGCGCTGGTGGCCGGGGCCTTCGCATTCGGTATCGTCGGCACGGTGCACCTGGTCGAAGAGCGACTGATTTCCTCGGTACTGGGCGGTGACCTGCAGCGCCTGCTGCGTATGGACAGCGTCAGTGACTGGAGTCATCGGCCTCG > NC_002947/1042105‑1042390 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |