| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1404578 | 73 (1.210) | 4 (0.070) | 4/254 | NT | 5.5% | coding (1104/2067 nt) | PP_1228 | methyl‑accepting chemotaxis transducer |
| ? | NC_002947 | = 1404605 | 67 (1.160) | coding (1077/2067 nt) | PP_1228 | methyl‑accepting chemotaxis transducer | |||||
CGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAGGCCTATCAGCAGGCTGGTGAGGTTGGCGTTCTGGTTATGGGCATCAAGGCGCTGGTTGAGGGCGACA > NC_002947/1404434‑1404725 | cGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAg > 7:48802/1‑149 (MQ=255) cTTTGACCTGGGCAGTGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGATGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACg > 7:320712/1‑149 (MQ=255) cTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACg > 4:133545/1‑149 (MQ=255) tttGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACgg > 7:60714/1‑149 (MQ=255) ccTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCTTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAg > 3:99774/1‑148 (MQ=255) cTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGa > 6:33768/1‑149 (MQ=255) cTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTACCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGa < 7:234167/149‑1 (MQ=255) ggCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTg < 6:160805/149‑1 (MQ=255) aaTGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGcc < 5:33768/149‑1 (MQ=255) tGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGTTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCgg < 8:340061/149‑1 (MQ=255) tGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCTTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCgg < 4:99774/149‑1 (MQ=255) tGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCgg < 8:339454/149‑1 (MQ=255) acgggTTGCAACTGGTGCAGCAACCGGTTGACCCAGCCGGGCCGCTGGCCCCGTCCACCCTGGGGGCCGACGCCCTGCCCACGGGAACGGTCGCCTTTCCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGt < 1:283603/146‑1 (MQ=255) aCCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGt < 6:58487/149‑1 (MQ=255) ccGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTgcagcccggccaatcctggccgtggct < 5:139468‑M1/149‑28 (MQ=255) ccGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGt > 6:342732/1‑148 (MQ=255) gTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCAACGGCCAGGATTGTCCGGGTAaag < 6:185821‑M2/149‑4 (MQ=255) gCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAAcgccg > 7:80408/1‑149 (MQ=255) aaCTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTtacccggccaatcctggccgtggctgcacgcctgg < 6:364270‑M1/149‑36 (MQ=255) aCTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTg > 8:158316/1‑132 (MQ=255) aCTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTg < 7:158316/132‑1 (MQ=255) aCTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCcgcgc > 5:275976/1‑149 (MQ=255) gTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCcgcgcgcg < 1:29246/148‑1 (MQ=255) gAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGt > 7:91087/1‑147 (MQ=255) gAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGt > 4:132106/1‑147 (MQ=255) gAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGcc < 8:60714/149‑1 (MQ=255) gAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGc > 5:288085/1‑148 (MQ=255) aaCGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTtacccggccaatcctggccgtggctgcacgcctg > 4:213945‑M1/1‑101 (MQ=255) aaCGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTtacccggccaatcctggccgtggctgcacgcctg < 3:213945‑M1/135‑35 (MQ=255) gTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACca > 3:125604/1‑149 (MQ=255) ttGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACcag > 8:86387/1‑149 (MQ=255) ttGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACcag < 3:133545/149‑1 (MQ=255) aCCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACcagcag > 7:260777/1‑148 (MQ=255) cAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAgcagca > 1:97625/1‑148 (MQ=255) aGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCaa‑a < 8:320712/149‑1 (MQ=255) aGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCaa‑a > 1:364353/1‑149 (MQ=255) gCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑Ac > 7:203738/1‑149 (MQ=255) gTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCCGCAGCAC‑ACCGGc > 2:298498/1‑149 (MQ=255) gTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGc < 8:80408/149‑1 (MQ=255) gCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCg > 7:189549/1‑149 (MQ=255) ccAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGt > 4:242653/1‑100 (MQ=255) ccAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGt < 3:242653/100‑1 (MQ=255) cAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAg < 1:21728/143‑1 (MQ=255) cAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAg > 2:21728/1‑143 (MQ=255) aGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGcc < 8:220346/149‑1 (MQ=255) tCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACTGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCTATAGCCGTGCCaa < 4:125604/148‑1 (MQ=255) cctCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAg < 6:210629/146‑1 (MQ=255) aTCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAGGc < 8:260777/149‑1 (MQ=255) aTCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAGGc > 8:265005/1‑149 (MQ=255) tCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCcgcgcgc < 8:333611/104‑1 (MQ=255) ctgtggggCGTAGGCCAGGCGACGGGTAAGGTCGGCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGGGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAGGCCt < 5:122837/143‑1 (MQ=255) gtggGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAGGCCTAt < 8:91087/147‑1 (MQ=255) gtggGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAGGCCTATc < 4:294817/148‑1 (MQ=255) gCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAGGCCTATcagcag > 1:321959/1‑149 (MQ=255) gTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAGGCCTATCAGCAGGCTg < 7:239352/148‑1 (MQ=255) gACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAGGCCTATCAGCAGGCTGGTGAGGTTg < 5:342732/149‑1 (MQ=255) gTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCATGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCTGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAGGCCTATCAGCAGGCTGGTGAGGTTGGCGtt < 5:185821/149‑1 (MQ=255) aGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAGGCCTATCAGCAGGCTGGTGAGTTTGGCGTTCTg > 6:260063/1‑149 (MQ=255) aGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAGGCCTATCAGCAGGCTGGTGAGGTTGGCGTTCTg < 8:48802/149‑1 (MQ=255) aGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAGGCCTATCAGCAGGCTGGTGAGGTTGGCGTTCTg < 2:97625/149‑1 (MQ=255) gTCGCCTTCTCCACTTGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGACGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGc < 3:355357/99‑1 (MQ=255) gTCGCCTTCGCCAATCGCAAAGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACCGCCAGGATTGCCCGGGTAACGCCGCGCGCCGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCCGc > 4:355357/1‑99 (MQ=255) cGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCGTGGGGGGGGACAACGGGGGCGATAGCCGTGCCAAGGCCTATAAGCAGGCTGGTGAGGTTGGCGTTGTgggt > 1:123496/1‑147 (MQ=255) ccTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAGGCCTATCAGCAGGCTGGTGAGGTTGGCGTTCTGGTTATg > 7:32882/1‑149 (MQ=255) cTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAGGCCTATCAGCAGGCTGGTGAGGTTGGCGTTCTGGTTATgg < 7:265005/149‑1 (MQ=255) gCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAGGCCTATCAGCAGGCTGGTGAGGTTGGCGTTCTGGTTATGGGCAt < 6:136059/149‑1 (MQ=255) ccACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGGCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAAGGCCGGGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAGGCCTATCAGCAGGGTGGTGAGGTTGGCGTTCTGGTTATGGGCATc < 6:122284/149‑1 (MQ=255) gCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAGGCCTATCAGCAGGCTGGTGAGGTTGGCGTTCTgg > 6:220639/1‑132 (MQ=255) gCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAGGCCTATCAGCAGGCTGGTGAGGTTGGCGTTCTgg < 5:220639/132‑1 (MQ=255) cAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAGGCCTATCAGCAGGCTGGTGAGGTTGGCGTTCTGGTTATGGGCATCAAGgcgc < 7:86387/149‑1 (MQ=255) aTGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAGGCCTATCAGCAGGCTGGTGAGGTTGGCGTTCTGGTTATGGGCATCAAGGCGCTg > 4:118620/1‑149 (MQ=255) aTGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAGGCCTATCAGCAGGCTGGTGAGGTTGGCGTTCTGGTTATGGGCATCAAGGCGCTg > 6:13331/1‑149 (MQ=255) tGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAGGCCTATCAGCAGGCTGGTGAGGTTGGCGTTCTGGTTATGGGCATCAAGGCGCTgg < 8:192452/149‑1 (MQ=255) tCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAGGCCTATCAGCAGGCTGGTGAGGTTGGCGTTCTGGTTATGGGCATCa > 3:57297/1‑138 (MQ=255) tCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAGGCCTATCAGCAGGCTGGTGAGGTTGGCGTTCTGGTTATGGGCATCa < 4:57297/138‑1 (MQ=255) ttCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAGGCCTATCAGCAGGCTGGTGAGGTTGGCGTTCTGGTTATGGGCATCAAGGCGCTGGtt > 1:207069/1‑147 (MQ=255) tCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAGGCCTATCAGCAGGCTGGTGAGGTTGGCGTTCTGGTTATGGGCATCAAGGCGCTGGTTGAg > 5:371990/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAacgcctggaagacattgccagtggcgaaggcgaccttacccgtcgcctggactacgcccaccaggatgaactgggccagctcaccggctggttcaaccgtttcctcgacaagtt < 6:364270‑M2/149‑115 (MQ=255) ccAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAGGCCTATCAGCAGGCTGGTGAGGTTGGCGTTCTGGTTATGGGCATCAAGGCGCTGGTTGa < 8:189549/147‑1 (MQ=255) cAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAacgcctggaagacattgccagtggcgaaggcgaccttacccgtcgcctggactacgcccaccaggatgaactgggccagctcaccggctggttcaaccgtt > 4:213945‑M2/1‑34 (MQ=255) cAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAacgcctggaagacattgccagtggcgaaggcgaccttacccgtcgcctggactacgcccaccaggatgaactgggccagctcaccggctggttcaaccgtt < 3:213945‑M2/135‑102 (MQ=255) cAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAGGCCTATCAGCAGGCTGGTGAGGTTGGCGTTCTGGTTATGGGCATCAAGGCGCTGGTTGAgg < 2:321959/148‑1 (MQ=255) ggCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAGGCCTATCAGCAGGCTGGTGAGGTTGGCGTTCTGGTTATGGGCATCAAGGCGCTGGTTGAGGGc > 6:322837/1‑148 (MQ=255) ctttacccggacaatcctggccgttgctgcacgcctggaagacattgccagtggcgaaggcgaccttacccgtcgcctggactacgcccaccaggatgaactgggccagctcaccggctggttcaaccgtttcctcgacaagttgcaac < 6:185821‑M1/147‑147 (MQ=255) gTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAGGCCTATCAGCAGGCTGGTGAGGTTGGCGTTCTGGTTATGGGCATCAAGGCGCTGGTTGAGGGCGa > 3:251497/1‑147 (MQ=255) gTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAGGCCTATCAGCAGGCTGGTGAGGTTGGCGTTCTGGTTATGGGCATCAAGGCGCTGGTTGAGGGCGAca < 6:288085/149‑1 (MQ=255) | CGAGCCTTTGACCTGGGCAATGACCGGTTGCAACTTGTCGAGGAAACGGTTGAACCAGCCGGTGAGCTGGCCCAGTTCATCCTGGTGGGCGTAGTCCAGGCGACGGGTAAGGTCGCCTTCGCCACTGGCAATGTCTTCCAGGCGTGCAGCCACGGCCAGGATTGGCCGGGTAACGCCGCGCGCGGTCAGCCACACCAGCAGCAA‑ACCGGCGATAGCCGTGCCAAGGCCTATCAGCAGGCTGGTGAGGTTGGCGTTCTGGTTATGGGCATCAAGGCGCTGGTTGAGGGCGACA > NC_002947/1404434‑1404725 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |