New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1841236 | 63 (1.050) | 4 (0.070) | 4/254 | NT | 5.8% | coding (767/1029 nt) | ldhA | D‑lactate dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 1841272 | 70 (1.210) | coding (731/1029 nt) | ldhA | D‑lactate dehydrogenase |
GATCACGTTGGGGAAGGTCAGCAGCCGAGCCAGCACATCGTCTTGCAAGGGCAGGTCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGTGCAGGCTGATGATGCGGGCTTCGCGCAATA > NC_002947/1841091‑1841383 | gatAACGTTGGGGAAGGTCAGCAGCCGAGCCAGCACATCGTCTTGCAAGGGCAGGTCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCAAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCCATCAgag > 8:185391/1‑147 (MQ=255) ggggAAGGTCAGCAGCCGAGGCAGCTCATCGTCTTGCTAGGGGAGGTCTGAGCGGTCCTCGAATAACAGTTGGTCTTCATCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCGAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGGGTCGATCAGCGCCGGGgtg < 6:25149/148‑1 (MQ=255) tCAGCAGCCGAGCCAGCACATCGTCTTGCAAGGGCAGGTCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAAc < 3:145569/149‑1 (MQ=255) cagcagCCGAGCCAGCACATCGTCTTGCAAGGGCAGGTCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACg > 8:82471/1‑149 (MQ=255) agcagcCGAGCCAGCACATCGTCTTGCAAGGGCAGGTCTGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGAAGACGTCAAGGCCCAGGTAGCAAAGCTGGCCGCATTTCAGTGCGTCGATCATCGCAGGGGTGTCTCCCAACg > 5:20856/1‑148 (MQ=255) cagcCGAGCCAGCACATCGTCTTGCAAGGGCAGGTCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGCTCAGCGCCGGGGTGTCGCCCCACGCAc > 6:324950/1‑149 (MQ=255) ccGAGCCAGCACATCGTCTTGCAAGGGCAGGTCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACcgc < 6:299707/149‑1 (MQ=255) gAGCCAGCACATCGTCTTGCAAGGGCAGGTCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGa < 7:185391/149‑1 (MQ=255) aGCCAGCACATCGTCTTGCAAGGGCAGGTCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGAc < 4:144425/149‑1 (MQ=255) cAGCACATCGTCTTGCAAGGGCAGGTCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTGTCAGTGCGTCGATCAGCGCCgg > 7:188172/1‑123 (MQ=255) cAGCACATCGTCTTGCAAGGGCAGGTCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTGTCAGTGCGTCGATCAGCGCCgg < 8:188172/123‑1 (MQ=255) aGCACATCGTCTTGCAAGGGCAGGTCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGgt < 8:342343/149‑1 (MQ=255) aGCACATCGTCTTGCAAGGGCAGGTCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGgt > 3:164430/1‑149 (MQ=255) cGTCTTGCAAGGGCAGGTCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTtgat < 7:307841‑M2/148‑5 (MQ=255) gTCTTGCAAGGGCAGGTCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTtgatc > 7:89159‑M2/1‑143 (MQ=255) gTCTTGCAAGGGCAGGTCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCa < 8:120056/149‑1 (MQ=255) gCAAGGGCAGGTCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAacaccggtcgcggtgcgttggtcgacaccccggcgctgatcg < 1:110710‑M1/144‑43 (MQ=255) gCAAGGGCAGGTCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAacaccggtcgcggtgcgttggtcgacaccccggcgctgatcg > 2:110710‑M1/1‑102 (MQ=255) gCAAGGGCAGGTCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCACAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCTGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATg > 4:94845/1‑149 (MQ=255) aaGGGCAGGTCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGTACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGgc > 6:12371/1‑149 (MQ=255) gggCAGGTCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAacaccggtcgcggtgcgttggtcgacaccccggcgctgatcgacgcactg < 4:300106‑M1/148‑51 (MQ=255) gggCAGGTCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAacaccggtcgcggtgcgttggtcgacaccccggcgctgatcgacgcactg > 3:300106‑M1/1‑98 (MQ=255) gCAGGTCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCg < 5:51305/149‑1 (MQ=255) aGGTCGTAGCGGTCCTAGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGAGGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCggg < 8:307841/149‑1 (MQ=255) gTCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCt > 2:165795/1‑149 (MQ=255) tCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTg > 4:208534/1‑149 (MQ=255) ggAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGc > 3:331102/1‑148 (MQ=255) gAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCaa < 4:164430/149‑1 (MQ=255) ggTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTgg < 8:15392/149‑1 (MQ=255) gTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCg > 8:240410/1‑115 (MQ=255) gTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCg < 7:240410/115‑1 (MQ=255) cTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGc > 5:233242/1‑147 (MQ=255) tCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAg > 2:205402/1‑149 (MQ=255) gaagaaCAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGc > 1:65815/1‑149 (MQ=255) gaagaaCAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGc > 2:232377/1‑149 (MQ=255) gaagaaCAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGc > 4:372763/1‑149 (MQ=255) gggCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCGAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCttt > 1:212394/1‑141 (MQ=255) gggCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCttt < 2:212394/141‑1 (MQ=255) gggCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGtt < 8:127695/148‑1 (MQ=255) cttcttcttCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGAt > 3:212207/1‑148 (MQ=255) cttcttcGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCa < 6:233242/147‑1 (MQ=255) ttcttcGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGt > 6:320178/1‑149 (MQ=255) ttcttcGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGt > 8:222043/1‑149 (MQ=255) cttcGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTgg > 1:373414/1‑149 (MQ=255) tAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAgt < 7:222043/149‑1 (MQ=255) tAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAgt < 5:320178/149‑1 (MQ=255) gACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAgtgt < 3:372763/149‑1 (MQ=255) gTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCt > 7:19497/1‑149 (MQ=255) cAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCg < 1:232377/148‑1 (MQ=255) agttAGCGAAGCTGGCCGCTTTTGAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTgg < 8:170060/146‑1 (MQ=255) gTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTggg > 3:138836/1‑148 (MQ=255) gTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGc < 1:205402/149‑1 (MQ=255) aGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGACAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAg > 2:51795/1‑149 (MQ=255) gCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGt > 7:350117/1‑149 (MQ=255) ccAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGTg < 1:165795/149‑1 (MQ=255) cAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGTg > 3:61090/1‑148 (MQ=255) aGCTGGCCGCTTTTGAGTTCGGCGCTCAGCGCCGGTGTGTCGACCATCGCACCGCGACCGGTGTTTATCAGCATGGCGCCGGGCTGCATCTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGTGCAg < 6:20856/149‑1 (MQ=255) gCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGTGCAgg > 8:37795/1‑149 (MQ=255) gCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGTGCAgg < 3:208534/149‑1 (MQ=255) cTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTAATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGTGCAGGc > 1:128051/1‑149 (MQ=255) gCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGTGCAGGCtga < 4:61090/149‑1 (MQ=255) ccGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGTGCAGGCtgat < 4:331102/149‑1 (MQ=255) cGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGTGCAGGCtgat > 1:225436/1‑148 (MQ=255) cGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGTGCAGGCtgat > 3:119722/1‑148 (MQ=255) cTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGTGCAGGCTgatgat > 5:330521/1‑149 (MQ=255) ttttCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGTGCAGGCTGatgatg > 7:309945/1‑149 (MQ=255) ttCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGTGCAGGCTGATGATGc < 3:94845/148‑1 (MQ=255) cAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTtgatcgacgcactgaaaagcggccagcttggctacctgggcctggacgtctacgaagaagaagcccaactgttcttcgaggaccgctccgacctgccc > 3:300106‑M2/1‑50 (MQ=255) cAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTtgatcgacgcactgaaaagcggccagcttggctacctgggcctggacgtctacgaagaagaagcccaactgttcttcgaggaccgctccgacctgccc < 4:300106‑M2/148‑99 (MQ=255) cAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGTGCAGGCTGATGATGCggg > 1:334258/1‑149 (MQ=255) cAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGTGCAGGCTGATGATGCggg > 1:145601/1‑149 (MQ=255) gTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGTGCAGGCAGATGATGCGGGCTTcgc > 2:113100/1‑149 (MQ=255) cGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTtgatcgacgcactgaaaagcggccagcttggctacctgggcctggacgtctacgaagaagaagcccaactgttcttcgaggaccgctccgacctgcccttgc > 2:110710‑M2/1‑42 (MQ=255) cGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTtgatcgacgcactgaaaagcggccagcttggctacctgggcctggacgtctacgaagaagaagcccaactgttcttcgaggaccgctccgacctgcccttgc < 1:110710‑M2/144‑103 (MQ=255) gATCAacaccggtcgcggtgcgttggtcgacaccccggcgctgatcgacgcactgaaaagcggccagcttggctacctgggcctggacgtctacgaagaagaagcccaactgttcttcgaggaccgctccgacctgcccttgcaagac > 7:89159‑M1/1‑5 (MQ=255) aTCAacaccggtcgcggtgcgttggtcgacaccccggcgctgatcgacgcactgaaaagcggccagcttggctacctgggcctggacgtctacgaagaagaagcccaactgttcttcgaggaccgctccgacctgcccttgcaagacg < 7:307841‑M1/148‑145 (MQ=255) aTCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGTACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGTGCAGGCTGATGATGCGGGCTTCGCGCaa < 5:12371/149‑1 (MQ=255) tCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACAGCGACCGGTGTTGATAAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATAAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCATTGGGCAGTGCAGGCTAATGATGCGGCGTTCGCTCaa > 6:318222/1‑148 (MQ=255) aGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGTGCAGGCTGATGATGCGGGCTTCGCGCAATa < 8:19497/148‑1 (MQ=255) | GATCACGTTGGGGAAGGTCAGCAGCCGAGCCAGCACATCGTCTTGCAAGGGCAGGTCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGTGCAGGCTGATGATGCGGGCTTCGCGCAATA > NC_002947/1841091‑1841383 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |