New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1841236 | 63 (1.050) | 4 (0.070) | 4/254 | NT | 5.8% | coding (767/1029 nt) | ldhA | D‑lactate dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 1841272 | 70 (1.210) | coding (731/1029 nt) | ldhA | D‑lactate dehydrogenase |
CGTCTTGCAAGGGCAGGTCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCTGATGATGCGGGCTTCGCGCAATAGC‑TCGGGCAGGGGCAGGTAGCGGGCGCCAAGGGCC > NC_002947/1841129‑1841418 | cGTCTTGCAAGGGCAGGTCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTtgat < 7:307841‑M2/148‑5 (MQ=255) gTCTTGCAAGGGCAGGTCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTtgatc > 7:89159‑M2/1‑143 (MQ=255) gTCTTGCAAGGGCAGGTCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCa < 8:120056/149‑1 (MQ=255) gCAAGGGCAGGTCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCACAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCTGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATg > 4:94845/1‑149 (MQ=255) aaGGGCAGGTCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGTACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGgc > 6:12371/1‑149 (MQ=255) gCAGGTCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCg < 5:51305/149‑1 (MQ=255) aGGTCGTAGCGGTCCTAGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGAGGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCggg < 8:307841/149‑1 (MQ=255) gTCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCt > 2:165795/1‑149 (MQ=255) tCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTg > 4:208534/1‑149 (MQ=255) ggAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGc > 3:331102/1‑148 (MQ=255) gAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCaa < 4:164430/149‑1 (MQ=255) ggTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTgg < 8:15392/149‑1 (MQ=255) cTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGc > 5:233242/1‑147 (MQ=255) tCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAg > 2:205402/1‑149 (MQ=255) gaagaaCAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGc > 1:65815/1‑149 (MQ=255) gaagaaCAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGc > 4:372763/1‑149 (MQ=255) gaagaaCAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGc > 2:232377/1‑149 (MQ=255) gggCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCGAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCttt > 1:212394/1‑141 (MQ=255) gggCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCttt < 2:212394/141‑1 (MQ=255) gggCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGtt < 8:127695/148‑1 (MQ=255) cttcttcttCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGAt > 3:212207/1‑148 (MQ=255) cttcttcGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCa < 6:233242/147‑1 (MQ=255) ttcttcGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGt > 8:222043/1‑149 (MQ=255) ttcttcGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGt > 6:320178/1‑149 (MQ=255) cttcGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTgg > 1:373414/1‑149 (MQ=255) tAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAgt < 7:222043/149‑1 (MQ=255) tAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAgt < 5:320178/149‑1 (MQ=255) gACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAgtgt < 3:372763/149‑1 (MQ=255) gTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCt > 7:19497/1‑149 (MQ=255) cAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCg < 1:232377/148‑1 (MQ=255) agttAGCGAAGCTGGCCGCTTTTGAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTgg < 8:170060/146‑1 (MQ=255) gTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTggg > 3:138836/1‑148 (MQ=255) gTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGc < 1:205402/149‑1 (MQ=255) aGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGACAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAg > 2:51795/1‑149 (MQ=255) gCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGt > 7:350117/1‑149 (MQ=255) ccAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑g < 1:165795/149‑1 (MQ=255) cAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑g > 3:61090/1‑148 (MQ=255) aGCTGGCCGCTTTTGAGTTCGGCGCTCAGCGCCGGTGTGTCGACCATCGCACCGCGACCGGTGTTTATCAGCATGGCGCCGGGCTGCATCTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAg < 6:20856/149‑1 (MQ=255) gCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAgg < 3:208534/149‑1 (MQ=255) gCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAgg > 8:37795/1‑149 (MQ=255) cTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTAATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGc > 1:128051/1‑149 (MQ=255) gCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCtga < 4:61090/149‑1 (MQ=255) ccGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCtgat < 4:331102/149‑1 (MQ=255) cGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCtgat > 1:225436/1‑148 (MQ=255) cGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCtgat > 3:119722/1‑148 (MQ=255) cTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCTgatgat > 5:330521/1‑149 (MQ=255) ttttCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCTGatgatg > 7:309945/1‑149 (MQ=255) ttCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCTGATGATGc < 3:94845/148‑1 (MQ=255) cAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTtgatcgacgcactgaaaagcggccagcttggctacctgggcctggacgtctacgaagaagaagcccaactgttcttcgaggaccgctccgacctgccc < 4:300106‑M2/148‑99 (MQ=255) cAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTtgatcgacgcactgaaaagcggccagcttggctacctgggcctggacgtctacgaagaagaagcccaactgttcttcgaggaccgctccgacctgccc > 3:300106‑M2/1‑50 (MQ=255) cAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCTGATGATGCggg > 1:145601/1‑149 (MQ=255) cAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCTGATGATGCggg > 1:334258/1‑149 (MQ=255) gTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCAGATGATGCGGGCTTcgc > 2:113100/1‑149 (MQ=255) cGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTtgatcgacgcactgaaaagcggccagcttggctacctgggcctggacgtctacgaagaagaagcccaactgttcttcgaggaccgctccgacctgcccttgc < 1:110710‑M2/144‑103 (MQ=255) cGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTtgatcgacgcactgaaaagcggccagcttggctacctgggcctggacgtctacgaagaagaagcccaactgttcttcgaggaccgctccgacctgcccttgc > 2:110710‑M2/1‑42 (MQ=255) aTCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGTACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCTGATGATGCGGGCTTCGCGCaa < 5:12371/149‑1 (MQ=255) tCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACAGCGACCGGTGTTGATAAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATAAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCATTGGGCAGT‑GCAGGCTAATGATGCGGCGTTCGCTCaa > 6:318222/1‑148 (MQ=255) aGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCTGATGATGCGGGCTTCGCGCAATa < 8:19497/148‑1 (MQ=255) gcCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCTGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTTGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTTGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGTCGCAGGCTGATGATGCGGGCTTCGCGCAATAGc < 1:45824/148‑1 (MQ=255) gcCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGGCAGTGGGCAGT‑GCAGGCTGAGGATGCGGGCTTCGCGCAATAGC‑Tc < 5:324950/149‑1 (MQ=255) gcCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACAGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGTCTGAAACTGGGACAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGTGCAGT‑GCAGGCTGATGATGCGGGCTTCGCGCAATAGC‑ta > 2:45824/1‑148 (MQ=255) gggTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCTGATGATGCGGGCTTCGCGCAATAGC‑TCggg > 8:306836/1‑148 (MQ=255) tgtCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCTGATGATGCGGGCTTCGCGCAATAGC‑TCgggcagg < 2:334258/149‑1 (MQ=255) tgtCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCTGATGATGCGGGCTTCGCGCAATAGC‑TCgggcagg < 7:82471/149‑1 (MQ=255) tCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCTGATGATGCGGGCTTCGCGCAATAGC‑TCgggcagggg > 1:314355/1‑149 (MQ=255) aCCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCTGATGATGCGGGCTTCGCGCAATAGC‑TCgggcaggggcag > 3:234019/1‑149 (MQ=255) ccAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCTGATGATGCGGGCTTCGCGCAATAGC‑TCGggcaggggcagg < 2:145601/149‑1 (MQ=255) ccAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCTGATGATGCGGGCTTCGCGCAATAGC‑TCGggcaggggcagg < 8:350117/149‑1 (MQ=255) aCGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCTGATGATGCGGGCTTCGCGCAATAGC‑TCGGGCAGGGGCAGGTAg > 1:73986/1‑149 (MQ=255) aCGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCTGATGATGCGGGCTTCGCGCAATAGC‑TCGGGCAGGGGCAGGTAg > 3:268482/1‑149 (MQ=255) gCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCTGATGATGCGGGCTTCGCGCAATAGC‑TCGGGCAGGGGCAGGTAGCg > 2:285913/1‑149 (MQ=255) gCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGACAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCTGATGATGCGGGCTTCGCGCAATAGC‑TCGGGCAGGGGCAGGTAGCg > 1:258939/1‑149 (MQ=255) cACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCTGATGATGCGGGCTTCGCGCAATAGC‑TCGGGCAGGGGCAGGTAGCgg < 4:119722/149‑1 (MQ=255) aCCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCTGATGATGCGGGCTTCGCGCAATAGC‑TCGGGCAGGGGCAGGTAGCGGGCGCCaa < 6:330521/149‑1 (MQ=255) aCCGGTGTTCATCACCATGGAGCCGGGATGCAACTGGGACAGGCTTTGAGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCTGATGATGCGGGCTTCGCGCAATAGC‑TGGGGCAGGGGCAGGTAGCGGgcgcgat > 6:112640/1‑146 (MQ=255) cGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCTGATGATGCGGGCTTCGCGCAATAGC‑TCGGGCAGGGGCAGGTAGCGGGCGCCAAgg < 2:373414/149‑1 (MQ=255) cGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCTGATGATGCGGGCTTCGCGCAATAGC‑TCGGGCAGGGGCAGGTAGCGGGCGCCAAgg < 2:128051/149‑1 (MQ=255) ggTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCTGATGATGCGGGCTTCGCGCAATAGC‑TCGGGCAGGGGCAGGTAGCGGGCGCCAAggg < 4:138836/149‑1 (MQ=255) gtgtTGATCAGCATGGCGGCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCTGATGATGCGGGCTTCGCGCAATAGC‑TCGGGCAGGGGCAGGTAGCGGGCGCGAAGGGc < 4:212207/149‑1 (MQ=255) gtgtTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCTGATGATGCGGGCTTCGCGCAATAGC‑TCGGGCAGGGGCAGGTAGCGGGCGCCAAGGGc < 7:37795/149‑1 (MQ=255) gtgtTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCTGATGATGCGGGCTTCGCGCAATAGC‑TCGGGCAGGGGCAGGTAGCGGGCGCCAAGGGc < 5:53650/149‑1 (MQ=255) ttGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCTGATGATGCGGGCTTCGCGCAATAGCTTCGGGCAGGGGCAGGTAGCGGGCGCCAAGGGcc < 1:51795/148‑1 (MQ=255) | CGTCTTGCAAGGGCAGGTCGGAGCGGTCCTCGAAGAACAGTTGGGCTTCTTCTTCGTAGACGTCCAGGCCCAGGTAGCCAAGCTGGCCGCTTTTCAGTGCGTCGATCAGCGCCGGGGTGTCGACCAACGCACCGCGACCGGTGTTGATCAGCATGGCGCCGGGCTGCAACTGGGCCAGGCTTTGCGCGTTGATCAGGTGGCGAGTGTGCTCGGTCAGTGGGCAGT‑GCAGGCTGATGATGCGGGCTTCGCGCAATAGC‑TCGGGCAGGGGCAGGTAGCGGGCGCCAAGGGCC > NC_002947/1841129‑1841418 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |