New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2397599 = | 38 (0.630) | 5 (0.090) | 5/254 | NT | 11.7% | coding (2058/3636 nt) | PP_2100 | two‑component system sensor protein |
? | NC_002947 | 2397657 = | 39 (0.670) | coding (2000/3636 nt) | PP_2100 | two‑component system sensor protein |
TTCCAGCATGCCGATCACGGCATTCATCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTGATGGTCGCCAGGAACGTGCTCTTGGCGCGGTTGGCATCGTCGGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAGTGGTGAGCCCGCCGCCATGACTTTCTGGTAATC > NC_002947/2397452‑2397745 | ttCCAGCATGCCGATCACGGCATTCATCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTGATGGTCGCCAGGAACGTGCTCTTGGCGCGGTTGGCATCGTCGGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGa > 4:134552/1‑149 (MQ=255) ccGATCACGGCATTCATCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTGATGGTCGCCAGGAACGTGCTCTTGGCGCGGTTGGCATCGTCGGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAgccgc < 8:107959/148‑1 (MQ=255) gATCACGGCATTCATCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTGATGGTCGCCAGGAACGTGCTCTTGGCGCGGTTGGCATCGTCGGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCga < 4:352172/149‑1 (MQ=255) cATTCATCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTGATGGTCGCCAGGAACGTGCTCTTGGCGCGGTTGGCATCGTCGGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATcccc < 6:153020/149‑1 (MQ=255) aTCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTGATGGTCGCCAGGAACGTGCTCTTGGCGCGGTTGGCATCGTCGGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCAc > 7:268484/1‑149 (MQ=255) ggTGCGGATTTCGTGGCTGATGGTCGCCAGGAACGTGCTCTTGGCGCGGTTGGCATCGTCGGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTc < 4:253675/147‑1 (MQ=255) cgagcaggctcggcagatccaggcggattaccagaaagtcatggcggcgggctcaccactgatcaaggaccgtccattacggatcaagggccgggacctgaccatctaccactgGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCAcc < 5:174156‑M1/33‑1 (MQ=255) ggATTTCGTGGCTGATGGTCGCCAGGAACGTGCTCTTGGCGCGGTTGGCATCGTCGGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAgg < 5:5091/149‑1 (MQ=255) gctcggcagatccaggcggattaccagaaagtcatggcggcgggctcaccactgatcaaggaccgtccattacggatcaagggccgggacctgaccatctaccactgGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCCCCCAGGGAGTc < 6:75726‑M1/42‑1 (MQ=255) gCTGATGGTCGCCAGGAACGTGCTCTTGGCGCGGTTGGCATCGTCGGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCCCCTCACCCCGGGAGTCGCgg > 4:120267/1‑148 (MQ=255) gTCGCCAGGAACGTGCTCTTGGCGCGGTTGGCATCGTCGGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCa < 3:158067/148‑1 (MQ=255) cggattaccagaaagtcatggcggcgggctcaccactgatcaaggaccgtccattacggatcaagggccgggacctgaccatctaccactgGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATc > 6:174156‑M1/92‑149 (MQ=255) ccAGGAACGTGCTCTTGGCGCGGTTGGCATCGTCGGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATc > 8:160929/1‑149 (MQ=255) cAGGAACGTGCTCTTGGCGCGGTTGGCATCGTCGGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATc > 3:207814/1‑148 (MQ=255) cAGGAACGTGCTCTTGGCGCGGTTGGCATCGTCGGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATc > 6:106243/1‑148 (MQ=255) aGGAACGTGCTCTTGGCGCGGTTGGCATCGTCGGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCa < 1:222/149‑1 (MQ=255) ggAACGTGCTCTTGGCGCGGTTGGCATCGTCGGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAg < 3:324753/149‑1 (MQ=255) attaccagaaagttatggcggcgggctcaccactgatcaaggaccgtccattacggatcaagggccgggacctgaccatctaccactgGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAg > 7:349041‑M1/89‑149 (MQ=255) gAACGTGCTCTTGGCGCGGTTGGCATCGTCGGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGt > 1:378986/1‑149 (MQ=255) aagtcatggcggcgggctcaccactgatcaaggaccgtccattacggatcaagggccgggacctgaccatctaccactgGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATg > 5:75726‑M1/80‑149 (MQ=255) ttGGCGCGGTTGGCATCGTCGGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGt > 2:14224/1‑149 (MQ=255) accccgTTGGCATCGTCGGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAg < 1:324394/144‑1 (MQ=255) gcgtcgtcgGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGcc > 7:4465/4‑149 (MQ=255) cATCGTCGGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGccc < 1:309880/149‑1 (MQ=255) aTCGTCGGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCt < 5:15533/149‑1 (MQ=255) ccgagctctgctgCTTGGCCGGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCtt < 7:121665/141‑1 (MQ=255) tcgGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGAt < 8:4465/149‑1 (MQ=255) ggCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATc < 1:14224/148‑1 (MQ=255) ctgctgCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGt > 4:92625/1‑148 (MQ=255) tgctgcTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCAAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCTGCCCtc > 8:121665/1‑139 (MQ=255) gggctGGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTTGCGGCGTTCGCTGATGTCTATCCAGCCGACGATGATCCCCTGCACATCACCCAGGTAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATTGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTaa < 6:372831/145‑1 (MQ=255) cttctTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGTTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTaa < 6:377943/144‑1 (MQ=255) gctTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGa > 1:188925/1‑149 (MQ=255) ttGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACg < 7:160929/149‑1 (MQ=255) ggCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACg < 5:106243/147‑1 (MQ=255) gCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTc < 4:207814/149‑1 (MQ=255) ccTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTcc > 2:43210/1‑149 (MQ=255) ccTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGCCCCTTGATCCGTAATGGACGGTcc > 6:215939/1‑149 (MQ=255) tGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGGGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCtt < 2:378986/149‑1 (MQ=255) cTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAgtg > 2:332851/1‑149 (MQ=255) cTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAgtg < 1:43210/149‑1 (MQ=255) cTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCAGCACCTCCCCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAgtg < 8:268484/149‑1 (MQ=255) aGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAGTGGTGa < 3:134552/149‑1 (MQ=255) aGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAGTGGTGAGCccgc > 5:125375/1‑149 (MQ=255) aTGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACTGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAGTGGTGAGCCCGCCGCCATGACTTTCTgt < 6:125375/147‑2 (MQ=255) aTGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAGTGGTGAGCCCGCCGCCATGACTTTCTgg < 1:332851/147‑1 (MQ=255) tCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTGGATCAGTGGTGAGCCCGCCGCCATGACTTTCTGGTAATc > 5:11517/1‑149 (MQ=255) | TTCCAGCATGCCGATCACGGCATTCATCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTGATGGTCGCCAGGAACGTGCTCTTGGCGCGGTTGGCATCGTCGGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAGTGGTGAGCCCGCCGCCATGACTTTCTGGTAATC > NC_002947/2397452‑2397745 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |