New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2397599 = | 38 (0.630) | 5 (0.090) | 5/254 | NT | 11.7% | coding (2058/3636 nt) | PP_2100 | two‑component system sensor protein |
? | NC_002947 | 2397657 = | 39 (0.670) | coding (2000/3636 nt) | PP_2100 | two‑component system sensor protein |
AGGAACGTGCTCTTGGCGCGGTTGGCATCGTCGGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAGTGGTGAGCCCGCCGCCATGACTTTCTGGTAATCCGCCTGGATCTGCCGAGCCTGCTCGGAATCGGCAAACAGGCTGTCCTTGAGT > NC_002947/2397510‑2397797 | aGGAACGTGCTCTTGGCGCGGTTGGCATCGTCGGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCa < 1:222/149‑1 (MQ=255) ggAACGTGCTCTTGGCGCGGTTGGCATCGTCGGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAg < 3:324753/149‑1 (MQ=255) attaccagaaagttatggcggcgggctcaccactgatcaaggaccgtccattacggatcaagggccgggacctgaccatctaccactgGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAg > 7:349041‑M1/89‑149 (MQ=255) gAACGTGCTCTTGGCGCGGTTGGCATCGTCGGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGt > 1:378986/1‑149 (MQ=255) aagtcatggcggcgggctcaccactgatcaaggaccgtccattacggatcaagggccgggacctgaccatctaccactgGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATg > 5:75726‑M1/80‑149 (MQ=255) ttGGCGCGGTTGGCATCGTCGGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGt > 2:14224/1‑149 (MQ=255) accccgTTGGCATCGTCGGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAg < 1:324394/144‑1 (MQ=255) gcgtcgtcgGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGcc > 7:4465/4‑149 (MQ=255) cATCGTCGGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGccc < 1:309880/149‑1 (MQ=255) aTCGTCGGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCt < 5:15533/149‑1 (MQ=255) ccgagctctgctgCTTGGCCGGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCtt < 7:121665/141‑1 (MQ=255) tcgGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGAt < 8:4465/149‑1 (MQ=255) ggCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATc < 1:14224/148‑1 (MQ=255) ctgctgCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGt > 4:92625/1‑148 (MQ=255) tgctgcTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCAAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCTGCCCtc > 8:121665/1‑139 (MQ=255) gggctGGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTTGCGGCGTTCGCTGATGTCTATCCAGCCGACGATGATCCCCTGCACATCACCCAGGTAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATTGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTaa < 6:372831/145‑1 (MQ=255) cttctTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGTTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTaa < 6:377943/144‑1 (MQ=255) gctTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGa > 1:188925/1‑149 (MQ=255) ttGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACg < 7:160929/149‑1 (MQ=255) ggCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACg < 5:106243/147‑1 (MQ=255) gCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTc < 4:207814/149‑1 (MQ=255) ccTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTcc > 2:43210/1‑149 (MQ=255) ccTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGCCCCTTGATCCGTAATGGACGGTcc > 6:215939/1‑149 (MQ=255) tGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGGGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCtt < 2:378986/149‑1 (MQ=255) cTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAgtg > 2:332851/1‑149 (MQ=255) cTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAgtg < 1:43210/149‑1 (MQ=255) cTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCAGCACCTCCCCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAgtg < 8:268484/149‑1 (MQ=255) aGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAGTGGTGa < 3:134552/149‑1 (MQ=255) aGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAGTGGTGAGCccgc > 5:125375/1‑149 (MQ=255) catctaccactggatcctgccgtaccgcgactccctgggtgaggtgcaggggatcatcggcggctggatcCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAGTGGTGAGCCCGCCGCCATGACtt > 5:75726‑M2/71‑149 (MQ=255) aTGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACTGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAGTGGTGAGCCCGCCGCCATGACTTTCTgt < 6:125375/147‑2 (MQ=255) aTGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAGTGGTGAGCCCGCCGCCATGACTTTCTgg < 1:332851/147‑1 (MQ=255) ctggatcctgccgtaccgcgactccctgggtgaggtgcaggggatcatcggcggctggatcCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAGTGGTGAGCCCGCCGCCATAACTTTCTGGTAAt > 7:349041‑M2/62‑149 (MQ=255) tCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTGGATCAGTGGTGAGCCCGCCGCCATGACTTTCTGGTAATc > 5:11517/1‑149 (MQ=255) gatcctgccgtaccgcgactccctgggtgaggtgcaggggatcatcggcggctggatcCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAGTGGTGAGCCCGCCGCCATGACTTTCTGGTAATCCg > 6:174156‑M2/59‑149 (MQ=255) CCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAGTGGTGAGCCCGCCGCCATGACTTTCTGGTAATCCGCCt < 5:352169‑M1/149‑1 (MQ=255) aGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAGTGGTGAGCCCGCCGCCATGACTTTCTGGTAATCCGCCTg > 1:369371/1‑148 (MQ=255) gactccctgggggaggtgcaggggatcatcggcggctggatcCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAGTGGTGAGCCCGCCGCCATGACTTTCTGGTAATCCGCCTGGATCTGCCGAGc < 6:75726‑M2/107‑1 (MQ=255) cTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAGTGGTGAGCCCGCCGCCATGACTTTCTGGTAATCCGCCTGGATCTGCCGAGCCTGCt > 1:191366/1‑149 (MQ=255) cACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAGTGGTGAGCCCGCCGCCATGACTTTCTGGTAATCCGCCTGGATCTGCCGAGCCTGCTc < 3:92625/147‑1 (MQ=255) ggtgaggtgcaggggatcatcggcggctggatcCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAGTGGTGAGCCCGCCGCCATGACTTTCTGGTAATCCGCCTGGATCTGCCGAGCCTGCTCg < 5:174156‑M2/114‑1 (MQ=255) cTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAGTGGTGAGCCCGCCGCCATGACTTTCTGGTAATCCGCCTGGATCTGCCGAGCCTGCTCGGAAt > 2:155146/1‑149 (MQ=255) cTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAGTGGTGAGCCCGCCGCCATGACTTTCTGGTAATCCGCCTGGATCTGCCGAGCCTGCTCGGAAt > 3:278076/1‑149 (MQ=255) cTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGGCAGGTCCCGGCCCGTGAGCCGTAATGGACGGTCCTGGATCAGTGGTGAGCCCGCCGCCAGGACTTTCTGGTAATCCGCCGGGCTAGGCAGCGCCTGCTCGGCAt > 8:317955/1‑149 (MQ=255) acACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAGTGGTGAGCCCGCCGCCATGACTTTCTGGTAATCCGCCTGGATCTGCCGAGCCTGCTCGGAATc < 1:239448/148‑1 (MQ=255) aCCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAGTGGTGAGCCCGCCGCCATGACTTTCTGGTAATCCGCCTGGATCTGCCGAGCCTGCTCGGaa < 2:352415/145‑1 (MQ=255) aCCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAGTGGTGAGCCCGCCGCCATGACTTTCTGGTAATCCGCCTGGATCTGCCGAGCCTGCTCGGaa > 1:352415/1‑145 (MQ=255) aCCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAGTGGTGAGCCCGCCGCCATGACTTTCTGGTAATCCGCCTGGATCTGCCGAGCCTGCTCGGAATc < 4:278076/147‑1 (MQ=255) gcgGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAGTGGTGAGCCCGCCGCCATGACTTTCTGGTAATCCGCCTGGATCTGCCGAGCCTGCTCGGAATCGGCAAACAGGCTGt > 3:212788/1‑149 (MQ=255) tACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAGTGGTGAGCCCGCCGCCATGACTTTCTGGTAATCCGCCTGGATCTGCCGAGCCTGCTCGGAATCGGCAAACAGGCTGTCCtt < 5:215939/149‑1 (MQ=255) cGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAGTGTTGAGCCCGCCGCCATGACTTTCTGGTAATCCGCCTGGATCTGCCGAGCCTGCTCGGAATCGGCAAACAGGCTGTCCTTGa < 6:352169/149‑1 (MQ=255) cGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAGTGGTGAGCCCGCCGCCATGACTTTCTGGTAATCCGCCTGGATCTGCCGAGCCTGCTCGGAATCGGCAAACAGGCTGTCCTTGa < 6:11517/149‑1 (MQ=255) gCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAGTGGTGAGCCCGCCGCCATGACTTTCTGGTAATCCGCCTGGATCTGCCGAGCCTGCTCGGAATCGGCAAACAGGCTGTCCTTGAGt > 5:163392/1‑149 (MQ=255) | AGGAACGTGCTCTTGGCGCGGTTGGCATCGTCGGCCTGCTGCTTGGCCTGGCGCAGCTCCAGGACCAGTTGGCGGCGTTCGCTGATGTCGATCCAGCCGCCGATGATCCCCTGCACCTCACCCAGGGAGTCGCGGTACGGCAGGATCCAGTGGTAGATGGTCAGGTCCCGGCCCTTGATCCGTAATGGACGGTCCTTGATCAGTGGTGAGCCCGCCGCCATGACTTTCTGGTAATCCGCCTGGATCTGCCGAGCCTGCTCGGAATCGGCAAACAGGCTGTCCTTGAGT > NC_002947/2397510‑2397797 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |