New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2657073 = | 41 (0.680) | 4 (0.070) | 4/252 | NT | 9.2% | coding (539/1341 nt) | pabB | aminodeoxychorismate synthase/para‑aminobenzoate synthase multi‑enzyme complex |
? | NC_002947 | 2657137 = | 40 (0.700) | coding (475/1341 nt) | pabB | aminodeoxychorismate synthase/para‑aminobenzoate synthase multi‑enzyme complex |
GCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGGTGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCGCTGA > NC_002947/2656928‑2657220 | gCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTc > 5:237529/1‑147 (MQ=255) gCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCa < 1:60159/149‑1 (MQ=255) gCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCGGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTc > 5:242907/1‑147 (MQ=255) ctggccgtggacgacctgggcctgccagccgcacaactgggcctgtatgcctgggcactggtcagcgatcacttgctcggcacccgccagctggtgttccaccctagcctggccggcgacgagcgcgaccgcctgatcagcctgtTc < 1:250326‑M1/2‑1 (MQ=255) ctggccgtggacgacctgggcctgccagacgcacaactgggcctgtatgcctgggcactggtcagcgatcacttgctcggcaccagccagctggtgttccaccctagcctggccggcgacgagcgcgaacgcctgatcagcctgtTc < 3:275739‑M1/2‑1 (MQ=255) ctggccgtggacgacctgggcctgccagacgcacaactgggcctgtatgcctgggcactggtcagcgatcacttgctcggcaccagccagctggtgttccaccctagcctggccggcgacgagcgcgaacgcctgatcagcctgtTCCa > 5:40799‑M1/146‑149 (MQ=255) cAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAg < 3:145956/149‑1 (MQ=255) cAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAg < 8:201935/149‑1 (MQ=255) cAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAg < 4:346994/149‑1 (MQ=255) gccgtggacgacctgtgcctgccataagcacaactgggcctgtatgcctgggcactggtcagcgatcacttgctcggcaccagccagctggtgttccaccctagcctggccggcgacgagcgcgaacgcctgatcagcctgtTCcat > 4:131031‑M1/143‑146 (MQ=255) cTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCAc > 4:317097/1‑149 (MQ=255) gcgcAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCgg > 8:138078/1‑149 (MQ=255) cctgggcctgccagacgcacaactgggcctgtatgcctgggcactggtcagcgatcacttgctcggcaccagccagctggtgttccaccctagcctggccggcgacgagcgcgaacgcctgatcagcctgtTCCAGGTCACCGGCCATc < 3:44192‑M1/18‑1 (MQ=255) ccTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGgc > 2:246421/1‑149 (MQ=255) ggTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGgcgc > 1:54086/1‑148 (MQ=255) gTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGa < 1:112242/149‑1 (MQ=255) gTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGa < 3:317097/149‑1 (MQ=255) ccGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGcc > 6:205575/1‑149 (MQ=255) cATGGATCTCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGaa < 8:307283/149‑1 (MQ=255) cATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATCTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGaa < 2:31068/149‑1 (MQ=255) tCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGcc > 7:167840/1‑149 (MQ=255) gCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCgg > 7:21430/1‑149 (MQ=255) gCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCg < 1:246421/148‑1 (MQ=255) cTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCggtg < 6:326073/149‑1 (MQ=255) gCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGtggtgg > 7:54608/1‑149 (MQ=255) aGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGC‑‑‑GTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTg < 5:372755/149‑1 (MQ=255) gTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTg < 2:53339/149‑1 (MQ=255) cgAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGGTGTc < 8:167840/149‑1 (MQ=255) cgAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGGTGTc < 5:362579/149‑1 (MQ=255) aaGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGGTGTCCTg < 6:64941/149‑1 (MQ=255) ttGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGGTGTCCTGGAACa < 3:176559/149‑1 (MQ=255) agcgatcacttgctcggcaccagccagctggtgttccaccctagcctggccggcgacgagcgcgaacgcctgatcagcctgtTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGGTGTCCTGGAAc > 4:44192‑M1/83‑148 (MQ=255) agcgatcacttgctcggcaccagccagctggtgttccaccctagcctggccggcgacgagcgcgaacgcctgatcagcctgtTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGGTGTCCTGGAACa > 1:201425‑M1/83‑149 (MQ=255) ggTGAGGTTGATCTTGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGGTGTCCTGGAACAgg < 7:212189/148‑1 (MQ=255) gTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGGTGTCCTGGAACAGGCt > 6:50934/1‑149 (MQ=255) cacttgctcggcaccagccagctggtgttccaccctagcctggccggcgacgagcgcgaacgcctgatcagcctgtTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGGTGTcctggaacccaggcc < 2:188953‑M1/73‑8 (MQ=255) aGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGGTGTCCTGGAACAGGCTGAt < 6:130325/149‑1 (MQ=255) gTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGGTGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTcgc > 7:304896/1‑149 (MQ=255) cAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGGTGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCtc < 6:114191/149‑1 (MQ=255) aGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGGTGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCtcg < 8:21430/149‑1 (MQ=255) ccGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGGTGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGcc > 2:158572/1‑149 (MQ=255) ggCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGGTGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCgg < 5:50934/149‑1 (MQ=255) gCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGGTGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGc > 4:275739/1‑149 (MQ=255) cTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGATCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGGTGTCGTGGAACAGTCTCGTCAGGCGTTCGCGCTCGTCGACGGc > 8:251422/1‑147 (MQ=255) ggATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGGTGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAgg > 1:331186/1‑149 (MQ=255) gTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGGTGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTgg < 2:54086/149‑1 (MQ=255) cTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGGTGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAacac > 5:235078/1‑147 (MQ=255) gTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCGGGTGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAgc < 6:72061/148‑1 (MQ=255) aGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGGTGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGatggctgg > 2:12803/1‑149 (MQ=255) cGGTTTTGTATTGCTCCTGCTCCAGGTGACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGGTGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGt < 8:54608/148‑1 (MQ=255) ttttGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGGTGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGcc > 3:188970/1‑148 (MQ=255) gTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGGTGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGc < 2:331186/148‑1 (MQ=255) tATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGGTGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGc > 1:65604/1‑147 (MQ=255) cTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGGTGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGAt > 5:336331/1‑149 (MQ=255) tCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGGTGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATc > 7:15576/1‑149 (MQ=255) ccGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGGTGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCg > 6:348486/1‑149 (MQ=255) cTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGGTGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCGCTGa < 2:65604/149‑1 (MQ=255) | GCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGGTGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCGCTGA > NC_002947/2656928‑2657220 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |