New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2657073 = | 41 (0.680) | 4 (0.070) | 4/252 | NT | 9.2% | coding (539/1341 nt) | pabB | aminodeoxychorismate synthase/para‑aminobenzoate synthase multi‑enzyme complex |
? | NC_002947 | 2657137 = | 40 (0.700) | coding (475/1341 nt) | pabB | aminodeoxychorismate synthase/para‑aminobenzoate synthase multi‑enzyme complex |
TTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCGCTGACCAGTGCCCAGGCATACAGGCCCAGTTGTGCGTCTGGCAGGCCCAGGTCGTCCACGGCCAG > NC_002947/2656991‑2657281 | ttGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACa < 3:176559/149‑1 (MQ=255) agcgatcacttgctcggcaccagccagctggtgttccaccctagcctggccggcgacgagcgcgaacgcctgatcagcctgtTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAAc > 4:44192‑M1/83‑148 (MQ=255) agcgatcacttgctcggcaccagccagctggtgttccaccctagcctggccggcgacgagcgcgaacgcctgatcagcctgtTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACa > 1:201425‑M1/83‑149 (MQ=255) ggTGAGGTTGATCTTGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAgg < 7:212189/148‑1 (MQ=255) gTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCt > 6:50934/1‑149 (MQ=255) cacttgctcggcaccagccagctggtgttccaccctagcctggccggcgacgagcgcgaacgcctgatcagcctgtTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTcctggaacccaggcc < 2:188953‑M1/73‑8 (MQ=255) aGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGAt < 6:130325/149‑1 (MQ=255) gTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTcgc > 7:304896/1‑149 (MQ=255) cAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCtc < 6:114191/149‑1 (MQ=255) aGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCtcg < 8:21430/149‑1 (MQ=255) ccGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGcc > 2:158572/1‑149 (MQ=255) ggCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCgg < 5:50934/149‑1 (MQ=255) gCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGc > 4:275739/1‑149 (MQ=255) cTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGATCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCGTGGAACAGTCTCGTCAGGCGTTCGCGCTCGTCGACGGc > 8:251422/1‑147 (MQ=255) ggATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAgg > 1:331186/1‑149 (MQ=255) gTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTgg < 2:54086/149‑1 (MQ=255) cTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAacac > 5:235078/1‑147 (MQ=255) gTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCGGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAgc < 6:72061/148‑1 (MQ=255) aGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGatggctgg > 2:12803/1‑149 (MQ=255) cGGTTTTGTATTGCTCCTGCTCCAGGTGACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGt < 8:54608/148‑1 (MQ=255) ttttGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGcc > 3:188970/1‑148 (MQ=255) gTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGc < 2:331186/148‑1 (MQ=255) tATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGc > 1:65604/1‑147 (MQ=255) ggcctgggttccaggacaccagcgccaccaccggcgacttccggctgctcgcgccgatggccggtgacctggaACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTg < 2:188953‑M2/76‑1 (MQ=255) cTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGAt > 5:336331/1‑149 (MQ=255) tCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATc > 7:15576/1‑149 (MQ=255) ccGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCg > 6:348486/1‑149 (MQ=255) tgttccaggacaccagcgccaccaccggcgacttccggctgctcgcgccgatggccggtgacctggaACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCGCt > 1:201425‑M2/68‑149 (MQ=255) gttccaggacaccagcgccaccaccggcgacttccggctgctcgcgccgatggccggtgacctggaACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCGCt > 4:44192‑M2/67‑148 (MQ=255) cTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCGCTGa < 2:65604/149‑1 (MQ=255) GGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGT‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCGCTGACCAGt > 5:205575‑M1/1‑149 (MQ=255) GGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCGCTGACCAGt > 1:158572‑M1/1‑149 (MQ=255) aCCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCGCTGACCAGTGcc > 1:37325/1‑148 (MQ=255) aCCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCGCTGACCAGTGcc > 6:49059/1‑148 (MQ=255) cGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCGCTGACCAGTGCCCAg < 8:304896/149‑1 (MQ=255) ggCGCGAGCAGCCTGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCGCTGACCAGTGCCCAGGCATACa < 6:237529/148‑1 (MQ=255) ggCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCGCTGACCAGTGCCCAGGCATACAg > 7:45938/1‑149 (MQ=255) ggCGCGAGCAGCCGGAAGGCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑GGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCGCTGACCAGTGCCCAGGCATACa < 6:242907/148‑1 (MQ=255) gcgcGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGGATGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGACGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCGCTGACCAGTGCCCAGGCATACAg > 1:252604/1‑149 (MQ=255) cgcgAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCGCTGACCAGTGCCCAGGCATACAGGc < 2:37325/149‑1 (MQ=255) gAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCGCTGACCAGTGCCCAGGCATACAGGcc > 6:95796/1‑147 (MQ=255) gAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCGCTGACCAGTGCCCAGGCATACAGGCCCa < 4:188970/149‑1 (MQ=255) gcCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCGCTGACCAGTGCCCAGGCATACAGGCCCAGTtgt < 8:45938/149‑1 (MQ=255) ccGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCGCTGACCAGTGCCCAGGCATACAGGCCCAGTtgtg > 6:1731/1‑149 (MQ=255) cGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCGCTGACCAGTGCCCAGGCATACAGGCCCAGTTGTGc < 8:15576/149‑1 (MQ=255) gAAGTCGCCGGTGGTGTCGCTGG‑TGTCCGTGAACAGGCTGATCTGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTTGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCGCTGACCAGTGCCCAGGCATACAGGCCCAGTTGTGCGt < 2:304182/149‑1 (MQ=255) gCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCGCTGACCAGTGCCCAGGCATACAGGCCCAGTTGTGCGTCTgg > 8:259814/1‑147 (MQ=255) gCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCGCTGACCAGTGCCCAGGCATACAGGCCCAGTTGTGCGTCTgcc > 5:207316/1‑146 (MQ=255) gtggCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCGCTGACCAGTGCCCAGGCATACAGGCCCAGTTGTGCGTCTGGCAGGCCCAg < 6:336331/149‑1 (MQ=255) gatggccggtgacctggaACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCGCTGACCAGTGCCCAGGCATACAGGCCCAGTTGTGCGTCTGGCAGGCCCAgg < 3:44192‑M2/131‑1 (MQ=255) cTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCGCTGACCAGTGCCCAGGCATACAGGCCCAGTTGTGCGTCTGGCAGGCCCAGgtcgtc < 5:95796/149‑1 (MQ=255) g‑tgtCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCGCTGACCAGTGCCCAGGCATACAGGCCCAGTTGTGCGTCTGGCAGGCCCAGGTCGTCCAc > 3:233019/1‑149 (MQ=255) atggaACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCGCTGACCAGTGCCCAGGCATACAGGCCCAGTTGTGCTTATGGCAGGCACAGGTCGTCCACGGc > 4:131031‑M2/6‑147 (MQ=255) tggaACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCGCTGACCAGTGCCCAGGCATACAGGCCCAGTTGTGCGTCTGGCAGGCCCAGGTCGTCCACGGCCAg > 5:40799‑M2/5‑149 (MQ=255) gaACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCGCTGACCAGTGCCCAGGCATACAGGCCCAGTTGTGCGTCTGGCAGGCCCAGGTCGTCCACGGCCAg < 3:275739‑M2/145‑1 (MQ=255) gaACAGGCTGATCAGGCGGTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCGGGTGCCGAGCAAGTGATCGCTGACCAGTGCCCAGGCATACAGGCCCAGTTGTGCGGCTGGCAGGCCCAGGTCGTCCACGGCCAg < 1:250326‑M2/145‑1 (MQ=255) | TTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCAGGTCACCGGCCATCGGCGCGAGCAGCCGGAAGTCGCCGGTGGTGGCGCTGG‑TGTCCTGGAACAGGCTGATCAGGCGTTCGCGCTCGTCGCCGGCCAGGCTAGGGTGGAACACCAGCTGGCTGGTGCCGAGCAAGTGATCGCTGACCAGTGCCCAGGCATACAGGCCCAGTTGTGCGTCTGGCAGGCCCAGGTCGTCCACGGCCAG > NC_002947/2656991‑2657281 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |