| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | = 3398709 | 77 (1.320) | coding (367/438 nt) | aroQ‑III | type II 3‑dehydroquinate dehydratase | |||||
CCTATGAGGACCGGGTGGATGCCGTGCTGATCAATGCCGGTGCCTGGACCCATTACAGCTACGGCATTCGTGATGCGTTGGCCATTATCGAAGTGCCGGTGGTTGAAGTGCACATGTCCAACATTCATGCCAGGGAGCCATTCCGCCATCACTCGGTATTTGCCGAGGTGGTGCGCGGGCAGATCTGC‑‑‑‑GGGTTTGGTGTCG‑AAACCTACCTGCTGGCGCTGCGTGCGGCGATGAGCATGGTCTGAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGC > NC_002947/3398536‑3398825 | ccTATGAGGACCGGGTGGATGCCGTGCTGATCAATGCCGGTGCCTGGACCCATTACAGCTACGGCATTCGTGATGCGTTGGCCATTATCGAAGTGCCGGTGGTTGAAGTGCACATGTCCAACATTCATGCCAGGGAGCCATTCCGCCAt > 2:257918/1‑149 (MQ=255) cTATGAGGACCGGGTGGATGCCGTGCTGATCAATGCCGGTGCCTGGACCCATTACAGCTACGGCATTCGTGATGCGTTGGCCATTATCGAAGTGCCGGTGGTTGAAGTGCACATGTCCAACATTCATGCCAGGGAGCCATTCCGCCAt > 1:134851/1‑148 (MQ=255) tGAGGACCGGGTGGATGCCGTGCTGATCAATGCCGGTGCCTGGACCCATTACAGCTACGGCATTCGTGATGCGTTGGCCATTATCGAAGTGCCGGTGGTTGAAGTGCACATGTCCAACATTCATGCCAGGGAGCCATTCCGCCATCACt > 2:5714/1‑149 (MQ=255) ggACCGGGTGGATGCCGTGCTGATCAATGCCGGTGCCTGGACCCATTACAGCTACTGCATTCGTGATGCGTTGGCCATTATCGAAGTGCCGGTGGTTGAAGTGCACATGTCCAACATTCATGCCAGGGAGCCATTCCGCCATCACTCgg 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gCCGTGCTGATCAATGCCGGTGCCTGGACCCATTACAGCTACGGCATTCGTGATGCGTTGGCCATTATCGAAGTGCCGGTGGTTGAAGTGCACATGTCCAACATTCATGCCAGGGAGCCATTCCGCCATCACTCGGTATTTGCCGAggt > 6:132355/1‑149 (MQ=255) cGTGCTGATCAATGCCGGTGCCTGGACCCATTACAGCTACGGCATTCGTGATGCGTTGGCCATTATCGAAGTGCCGGTGGTTGAAGTGCACATGTCCAACATTCATGCCAGGGAGCCATTCCGCcatcactcggcaaataccgagtgat < 5:275848‑M1/149‑26 (MQ=255) cGTGCTGATCAATGCCGGTGCCTGGACCCATTACAGCTACGGCATTCGTGATGCGTTGGCCATTATCGAAGTGCCGGTGGTTGAAGTGCACATGTCCAACATTCATGCCAGGGAGCCATTCCGCCATCACTCGGTATTTGCCGAggtgg < 2:110275/149‑1 (MQ=255) gATCAATGCCGGTGCCTGGACCCATTACAGCTACGGCATTCGTGATGCGTTGGCCATTATCGAAGTGCCGGTGGTTGAAGTGCACATGTCCAACATTCATGCCAGGGAGCCATTCCGCgcaccacctcggcaaataccgagtgatggcg > 1:87143‑M1/1‑118 (MQ=255) gATCAATGCAGGTGCCTGGACCCATTACAGCTAAGGCATTCGTGATGCGTTGGCCATTATCGAAGTGCCTGTGGTTGAAGTGCACATGTCCAACATTCATGGCTGGGAGCAATTCCTCCATGAGTCGGTATTTGACGAGGTGGTGCgag < 7:172059‑M2/149‑4 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |