| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 3398681 | 70 (1.160) | 4 (0.070) | 4/256 | NT | 5.2% | coding (339/438 nt) | aroQ‑III | type II 3‑dehydroquinate dehydratase |
| ? | NC_002947 | = 3398709 | 77 (1.320) | coding (367/438 nt) | aroQ‑III | type II 3‑dehydroquinate dehydratase | |||||
GATCAATGCCGGTGCCTGGACCCATTACAGCTACGGCATTCGTGATGCGTTGGCCATTATCGAAGTGCCGGTGGTTGAAGTGCACATGTCCAACATTCATGCCAGGGAGCCATTCCGCCATCACTCGGTATTTGCCGAGGTGGTGCGCGGGCAGATCTGC‑‑‑‑GGGTTTGGTGTCG‑AAACCTACCTGCTGGCGCTGCGTGCGGCGATGAGCATGGTCTGAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCT > NC_002947/3398564‑3398856 | gATCAATGCAGGTGCCTGGACCCATTACAGCTAAGGCATTCGTGATGCGTTGGCCATTATCGAAGTGCCTGTGGTTGAAGTGCACATGTCCAACATTCATGGCTGGGAGCAATTCCTCCATGAGTCGGTATTTGACGAGGTGGTGCgag < 7:172059‑M2/149‑4 (MQ=255) aTCAATGCCGGTGCCTGGACCCATTACAGCTACGGCATTCGTGATGCGTTGGCCATTATCGAAGTGCCGGTGGTTGAAGTGCACATGTCCAACATTCATGCCAGGGAGCCATTCCGCCATCACTCGGTATTTGCCGAGGTGGTGCgc > 1:27262‑M2/1‑145 (MQ=255) tCAATGCCGGTGCCTGGACCCATTACAGCTACGGCATTCGTGATGCGTTGGCCATTATCGAAGTGCCGGTGGTTGAAGTGCACATGTCCAACATTCATGCCAGGGAGCCATTCCGCCATCACTCGGTATTTGCCGAGGTGGTGCGCggg < 8:299009/149‑1 (MQ=255) aTGCCGGTGCCTGGACCCATTACAGCTACGGCATTCGTGATGCGTTGGCCATTATCGAAGTGCCGGTGGTTGAAGTGCACATGTCCAACATTCATGCCAGCGAGCCATTCCGCCATCACTCGGTATTTGCCGAGGTTGTGCGCggg > 1:128764/1‑146 (MQ=255) gTGCCTGGACCCATTACAGCTACGGCATTCGTGATGCGTTGGCCATTATCGAAGTGCCGGTGGTTGAAGTGCACATGTCCAACATTCATGCCAGGGAGCCATTCCGCCATCACTCGGTATTTGCCGAGGTGGTGCGCGGGCAGATCTGc > 5:100827/1‑149 (MQ=255) cTGGACCCATTACAGCTACGGCATTCGTGATGCGTTGGCCATTATCGAAGTGCCGGTGGTTGAAGTGCACATGTCCAACATTCATGCCAGGGAGCCATTCCGCCATCACTCGGTATTTGCCGAGGTGGTGCGCGGGCAGATCTGC‑‑‑‑GGGt > 7:41658/1‑149 (MQ=255) gtcccATTCCTGCTTCGGCATTCGTGATGCGTTGGCCATTATCGAAGTGCCGGTGGTTGAAGTGCACATGTCCAACATTCATGCCAGGGAGCCATTCCGCCATCACTCGGTATTTGCCGCGGTGGTGCGCGGGCAGATCTGC‑‑‑‑GGGTTTg < 3:273073/147‑1 (MQ=255) gACCCATTACAGCTACGGCATTCGTGATGCGTTGGCCATTATCGAAGTGCCGGTGGTTGAAGTGCACATGTCCAACATTCATGCCAGGGAGCCATTCCGCCATCACTCGGTATTTGCCGAGGTGGTGCGCGGGCAGATCTGC‑‑‑‑GGGttt < 1:209033/148‑1 (MQ=255) gACCCATTACAGCTACGGCATTCGTGATGCGTTGGCCATTATCGAAGTGCCGGTGGTTGAAGTGCACATGTCCAACATTCATGCCAGGGAGCCATTCCGCCATCACTCGGTATTTGCCGAGGTGGTGCGCGGGCAGATCTGC‑‑‑‑GGGTTTg < 7:38248/149‑1 (MQ=255) cccATTACAGCTACGGCATTCGTGATGCGTTGGCCATTATCGAAGTGCCGGTGGTTGAAGTGCACATGTCCAACATTCATGCCAGGGAGCCATTCCGCCATCAGTCGGTATTTGCCGAGGTGGTGCGCGGGCAGATGTGC‑‑‑‑GGGTTTGgt > 6:216013/1‑149 (MQ=255) aTTACAGCTACGGCATTCGTGATGCGTTGGCCATTATCGAAGTGCCGGTGGTTGAAGTGCACATGTCCAACATTCATGCCAGGGAGCCATTCCGCCATCACTCGGTATTTGCCGAGGTGGTGCGCGGGCAGATCTGC‑‑‑‑GGGTTTGGTGTc < 5:132355/149‑1 (MQ=255) cAGCTACGGCATTCGTGATGCGTTGGCCAGTATCGAAGGGCCGGTGGTTGAAGTGCACATGGCCAACATTCATGCCAGGGAGCCATTCCGCCATCACTCGGTATTTGCCGAGGTGGTGCGCGGGCAGATCTGC‑‑‑‑GGGTTTGGTGTCG‑aaa < 5:290248/149‑1 (MQ=255) aGCTACGGCATTCGTGATGCGTTGGCCATTATCGAAGTGCCGGTGGTTGAAGTGCACATGTCCAACATTCATGCCAGGGAGCCATTCCGCCATCACTCGGTATTTGCCGAGGTGGTGCGCGGGCAGATCTGC‑‑‑‑GGGTTTGGTGTCG‑AAac > 6:311917/1‑149 (MQ=255) aGCTACGGCATTCGTGATGCGTTGGCCATTATCGAAGTGCCGGTGGTTGAAGTGCACATGTCCAACATTCATGCCAGGGAGCCATTCCGCCATCACTCGGTATTTGCCGAGGTGGTGCGCGGGCAGATCTGC‑‑‑‑GGGTTTGGTGTCG‑AAac < 2:297934/149‑1 (MQ=255) cTACGGCATTCGTGATGCGTTGGCCATTATCGAAGTGCCGGTGGTTGAAGTGCACATGTCCAACATTCATGCCAGGGAGCCATTCCGCCATCACTCGGTATTTGCCGAGGTGGTGCGCGGGCAGATCTGC‑‑‑‑GGGTTTGGTGTCG‑AAacc > 6:154425/1‑148 (MQ=255) tACGGCATTCGTGATGCGTTGGCCATTATCGAAGTGCCGGTGGTTGAAGTGCACATGTCCAACATTCATGCCAGGGAGCCATTCCGCCATCACTCGGTATTTGCCGAGGTGGTGCGCGGGCAGATCTGC‑‑‑‑GGGTTTGGTGTCG‑AAaccta > 2:189363/1‑149 (MQ=255) tACGGCATTCGTGATGCGTTGGCCATTATCGAAGTGCCGGTGGTTGAAGTGCACATGTCCAACATTCATGCCAGGGAGCCATTCCGCCATCACTCGGTATTTGCCGAGGTGGTGCGCGGGCAGATCTGC‑‑‑‑GGGTTTGGTGTCG‑AAaccta > 6:6032/1‑149 (MQ=255) tACGGCATTCGTGATGCGTTGGCCATTATCGAAGTGCCGGTGGTTGAAGTGCACATGTAAAACATTCATGCCAGGGAGCCATTCCGCCATAACTCGGTATTTGCCGAGGTGGTGCGCGGGCAGATCTGC‑‑‑‑GGGTTTGGTGTCG‑AAaccta > 1:108152/1‑149 (MQ=255) 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gAAGTGCCGGTGGTTGAAGTGCACATGTCCAACATTCATGCCAGGGAGCCATTCCGCCATCACTCGGTATTTGCCGAGGTGGTGCGCGGGCAGATCTGC‑‑‑‑GGGTTTGGTGTCG‑AAACCTACCTGCTGGCGCTGCGTGCGGCGATGAGCAt > 6:147311/1‑149 (MQ=255) ccGGTGGTTGAAGTGCACATGTCCAACATTCATGCCAGGGAGCCATTCCGCCATCACTCGGTATTTGCCGAGGTGGTGCGCGGGCAGATCTGC‑‑‑‑GGGTTTTGTGTCG‑AAACCTACCTGCTGGCGCTGCGTGCGGCGATGAGCATGGTCt < 2:241502/148‑1 (MQ=255) cGGTGGTTGAAGTGCACATGTCCAACATTCATGCCAGGGAGCCATTCCGCCATCACTCGGTATTTGCCGAGGTGGTGCGCGGGCAGATCTGC‑‑‑‑GGGTTTGGTGTCG‑AAACCTACCTGCTGGCGCTGCGTGCGGCGATGAGCATGGTCTGa < 6:100827/149‑1 (MQ=255) ggtTGAAGTGCACATGTCCAACATTCATGCCAGGGAGCCATTCCGCCATCACTCGGTATTTGCCGAGGTGGTGCGCGGGCAGATCTGC‑‑‑‑GGGTTTGGTGTCG‑AAACCTACCTGCTGGCGCTGCGTGCGGCGATGAGCATGGTCTGAGCAg > 2:54235/1‑149 (MQ=255) gtTGAAGTGCACATGTCCAACATTCATTCCAGGGAGCCATTCCGCCATCACTCGGTATTTGCCGAGGTGGTGCGCGGGCAGATCTTC‑‑‑‑GGGTTTGGTGTCT‑AAACCTACCTGCTGGCGCTGCGTGCGGCGATGAGCATGGTCTGAGCAg < 5:206469/148‑1 (MQ=255) 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ccGAGGTGGTGCGCGGGCAGATCTGC‑‑‑‑GGGTTTGGTGTCG‑AAACCTACCTGCTGGCGCGGCGTGCGGCGATGAGCATGGTCTGAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATgcgg < 8:41658/148‑1 (MQ=255) cGAGGTGGTGCGCGGGCAGATCTGC‑‑‑‑GGGTTTGGTGTCG‑AAACCTACCTGCTGGCGCTGCGTGCGGCGATGAGCATGGTCTGAGCAGGGCGCAgggg < 3:198541/96‑1 (MQ=255) cGAGGTGGTGCGCGGGCAGATCTGC‑‑‑‑GGGTTTGGTGTCG‑AAACCTACCTGCTGGCGCTGCGTGCGGCGATGAGCATGGTCTGAGCAGGGCGCAgggg > 4:198541/1‑96 (MQ=255) aGGTGGTGCGCGGGCAGATCTGC‑‑‑‑GGGTTTGGTGTCG‑AAACCTACCTGCTGGCGCTGCGTGCGGCGATGAGCATGGTCTGAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGAc < 7:269365/149‑1 (MQ=255) ggtgCGCGGGCAGATCTGC‑‑‑‑GGGTTTGGTGTCG‑AAACCTACCTGCTGGCGCTGCGTGCGGCGATGAGCATGGTCTGAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGgcg > 7:46314/1‑149 (MQ=255) cgcgGGCAGATCTGC‑‑‑‑GGGTTTGGTGTCG‑AAACCTACCTGCTGGCGCTGCGTGCGGCGATGAGCATGGTCTGAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCt < 4:168739/148‑1 (MQ=255) | GATCAATGCCGGTGCCTGGACCCATTACAGCTACGGCATTCGTGATGCGTTGGCCATTATCGAAGTGCCGGTGGTTGAAGTGCACATGTCCAACATTCATGCCAGGGAGCCATTCCGCCATCACTCGGTATTTGCCGAGGTGGTGCGCGGGCAGATCTGC‑‑‑‑GGGTTTGGTGTCG‑AAACCTACCTGCTGGCGCTGCGTGCGGCGATGAGCATGGTCTGAGCAGGGCGCAGGGGTCGGATCTCCGAGCGCGTCTACCCGCGAAGCAGGTGGCGCGGGGCATGCGGCGACGGCGCCT > NC_002947/3398564‑3398856 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |