New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5358776 = | 71 (1.180) | 4 (0.070) | 4/252 | NT | 5.8% | intergenic (‑16/+12) | infB/nusA | translation initiation factor IF‑2/transcription termination/antitermination factor L |
? | NC_002947 | 5358816 = | 63 (1.100) | coding (1454/1482 nt) | nusA | transcription termination/antitermination factor L |
TCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACTGCTCGGCCAGGTCTTCGCGGTTAACCACGCCGCGCACCG > NC_002947/5358628‑5358918 | tCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAg > 1:205270/1‑149 (MQ=255) tCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAg > 6:248927/1‑149 (MQ=255) tgctctcccttgagggcatggacaaagacctggcggctgaactggcggtgcgcggcgtggttaaccgcgaagacctggccgagcagtcgatcgacgatctgctcgacatcgacggcatcgacgaagagcgtgccggcaagttgatcatg < 7:154358‑M1/1‑1 (MQ=255) cTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGATGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTCCTCCAGCAAAAAGCTAACAACAGGTCACACGACATCTAGGGCCAGTTCTTTCAACCTGACTTTAGTCAAGCACATCTCTCCTCAgg > 1:117991/1‑149 (MQ=255) cTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACAGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCACTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACATCTCTCCTCAGTCcg > 6:377249/1‑149 (MQ=255) cTTATCATTGTCGGTCACTACATGACAGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCAACGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCcg > 6:372134/1‑149 (MQ=255) ctctcccttgagggcatggacaaagacctggcggctgaactggcggtgcgcggcgtggttaaccgcgaagacctggccgagcagtcgatcgacgatctgctcgacatcgacggcatcgacgaagagcgtgccggcaagttgatcatGGc > 6:56446‑M1/147‑149 (MQ=255) tctcATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCcgcc > 7:343956/1‑148 (MQ=255) tctcATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCCCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCcgcg > 8:163312/1‑149 (MQ=255) tcccttgagggcatggacaaagacctggcggctgaactggcggtgcgcggcgtggttaaccgcgaagacctggccgagcagtcgatcgacgatctgctcgacatcgacggcatcgacgaagagcgtgccggcaagttgatcatGGCcgc < 8:67401‑M1/6‑1 (MQ=255) cATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCCCCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGcc > 5:15125/1‑148 (MQ=255) ttGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTaa < 7:69915/149‑1 (MQ=255) tCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTa < 5:347896/149‑1 (MQ=255) gTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTc > 2:12473/1‑149 (MQ=255) gTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTc < 5:248927/149‑1 (MQ=255) tCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGAAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTAACAGTGACTTGCGTCATTCACTTCTCTACTCAGGACGCTCCTAATTACTc > 6:112728/1‑148 (MQ=255) gcatggacaaagacctggcggctgaactggcggtgcgcggcgtggttaaccgcgaagacctggccgagcagtcgatcgacgatctgctcgacatcgacggcatcgacgaagagcgtgccggcaagttgatcatGGCCGCGCCTAATTAc < 7:279568‑M1/16‑1 (MQ=255) cTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCGGCGCCTAATTACTCGAAc > 6:261343/1‑149 (MQ=255) cTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAAc < 2:205270/149‑1 (MQ=255) ccTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAg > 6:72663/1‑149 (MQ=255) aCCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCAACGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTgg < 5:112728/148‑1 (MQ=255) ggCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTc > 2:103996/1‑149 (MQ=255) ggTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGggcgg < 4:87188/149‑1 (MQ=255) gtgCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCa > 7:36845/1‑149 (MQ=255) tgCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCAt < 3:184800/149‑1 (MQ=255) tgCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCAt > 5:29274/1‑149 (MQ=255) actggcggtgcgcggcgtggttaaccgcgaagacctggccgagcagtcgatcgacgatctgctcgacatcgacggcatcgacgaagagcgtgccggcaagttgatcatGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCa > 2:68994‑M1/109‑149 (MQ=255) ctggcggtgcgcggcgtggttaaccgcgaagacctggccgagcagtcgatcgacgatctgctcgacatcgacggcatcgacgaagagcgtgccggcaagttgatcatGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCAt > 1:190131‑M1/108‑149 (MQ=255) gcggtgcgctgcttggttaacggcgaagacctggccgagcagtcgatcgacgatctgctcgacatcgacggcatcgacgaagagcgtgccggcaagttgatcatGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGAt > 8:279568‑M1/105‑149 (MQ=255) gACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAAc < 6:85652/149‑1 (MQ=255) ccTCACGCATCTGCTGCAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGa > 6:298568/1‑138 (MQ=255) ccTCACGCATCTGCTGCAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGa < 5:298568/138‑1 (MQ=255) ccTCACGCATCTGCTGCAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCg < 5:61426/149‑1 (MQ=255) aCGCATCTGCTGCAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTgg < 1:268916/118‑1 (MQ=255) aCGCATCTGCTGCAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTgg > 2:268916/1‑118 (MQ=255) aCGCATCTGCTGCAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCAc > 5:192976/1‑149 (MQ=255) gCATCTGCTGCAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGc > 6:144001/1‑149 (MQ=255) aTCTGCTGCAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTc < 4:155837/118‑1 (MQ=255) aTCTGCTGCAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTc > 3:155837/1‑118 (MQ=255) aTCTGCTGCAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTATCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGctc > 5:354009/1‑149 (MQ=255) ctgcAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTtc < 1:208621/147‑1 (MQ=255) tACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGt > 5:255277/1‑149 (MQ=255) ggTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGggcg > 6:289143/1‑99 (MQ=255) cTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAgtc > 8:240620/1‑147 (MQ=255) cGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGAtcg < 6:192976/149‑1 (MQ=255) gACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGAtcgt < 2:269382/149‑1 (MQ=255) aCCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGAtcgtc > 3:192792/1‑149 (MQ=255) ctctTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGtcga > 6:111346/1‑149 (MQ=255) tctTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGtcgat > 4:319187/1‑149 (MQ=255) ctTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGtcgatc < 7:163312/149‑1 (MQ=255) ggCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACt > 3:336141/1‑149 (MQ=255) ccAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCACGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACTg > 8:314170/1‑148 (MQ=255) cAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACTGCt < 8:36845/149‑1 (MQ=255) ttCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACTGCTCgg > 2:353137/1‑149 (MQ=255) tttCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACTGCTCg > 2:19976/1‑145 (MQ=255) tttCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACTGCTCg < 1:19976/145‑1 (MQ=255) tCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACTGCTCGGCCa < 5:261343/147‑1 (MQ=255) agcGTGACTTGCGTCATGCTCTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGACCCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGGCGATCGACTGCTCGGCCAGGt < 5:377249/146‑1 (MQ=255) aCCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTTCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACTGCTCGGCCAGGTc > 4:317329/1‑149 (MQ=255) aCCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCTTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACTGCTCGGCCAGGt < 5:372134/148‑1 (MQ=255) aCCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACTGCTCGGCCAGGt < 5:72663/148‑1 (MQ=255) aCCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACTGCTCGGCCAGGTc > 2:169259/1‑149 (MQ=255) cGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACTGCTCGGCCAGGTCtt > 7:67401/1‑149 (MQ=255) aCTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACTGCTCGGCCAGGTCTTcgcg > 2:20615/1‑149 (MQ=255) cTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACTGCTCGGCCAGGTCTTCGCgg < 4:192792/149‑1 (MQ=255) ttGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACTGCTCGGCCAGGTCTTcgcg > 8:158789/1‑147 (MQ=255) ttGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACTGCTCGGCCAGGTCTTcgcg < 7:158789/147‑1 (MQ=255) ttGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCAGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACTGCTCGGCCAGGTCTTCGCGGt > 8:154358/1‑149 (MQ=255) gCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACTGCTCGGCCAGGTCTTCGCGGt < 5:111346/147‑1 (MQ=255) gCGTCACGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACTGCTCGGCCAGGTCTTCGCGGtt < 7:314170/148‑1 (MQ=255) cGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACTGCTCGGCCa < 6:349852/134‑1 (MQ=255) cGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACTGCTCGGCCAGGTCTTCGCGGTTa < 1:353137/148‑1 (MQ=255) aTGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGGGGCATTGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCTTCTATGCCGATGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACTGCTCGGCCAGGTCTTCGCGGTTAACCAc < 1:103996/149‑1 (MQ=255) aTGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGATAGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCAAGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACTGCTCGGCCAGGTCTTCGCGGTTAACCAc > 5:158954/1‑149 (MQ=255) cACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACTGCTCGGCCAGGTCTTCGCGGTTAACCAcgcc < 1:12473/149‑1 (MQ=255) aCTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACTGCTCGGCCAGGTCTTCGCGGTTAACCAcgccg > 3:335935/1‑149 (MQ=255) cTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACTGCTCGGCCAg > 5:234491/1‑126 (MQ=255) cTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACTGCTCGGCCAg < 6:234491/126‑1 (MQ=255) ttCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACTGCTCGGCCAGGTCTTCGCGGTTAACCACGCcgcg > 2:270775/1‑149 (MQ=255) ctcctcAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCGCGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACTGCTCGGCCAGGTCTTCGCGGTTCACCACGCCGCGCAcc > 6:325901/1‑149 (MQ=255) tcctcAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACTGCTCGGCCAGGTCTTCGCGGTTAAc > 4:229671/1‑135 (MQ=255) tcctcAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACTGCTCGGCCAGGTCTTCGCGGTTAAc < 3:229671/135‑1 (MQ=255) tcctcAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACTGCTCGGCCAGGTCTTCGCGGTTAACCACGCCGCGCACCg > 2:226477/1‑149 (MQ=255) | TCTGCTTCTCATTGTCGGTCACTACCTGACCGGCGTCGGTGTGCGGCAGACCTGCCTCACGCATCTGCTGCAGC‑AGGCGCT‑‑CTACCGGTGCCTCGACCTCTTGGGCCAGTTCTTTCACCGTGACTTGCGTCATGCACTTCTCTCCTCAGGCCGCGCCTAATTACTCGAACCAGTGGGCTCGGGCGGCCATGATCAACTTGCCGGCACGCTCTTCGTCGATGCCGTCGATGTCGAGCAGATCGTCGATCGACTGCTCGGCCAGGTCTTCGCGGTTAACCACGCCGCGCACCG > NC_002947/5358628‑5358918 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |