New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5978356 = | 82 (1.360) | 5 (0.090) | 4/252 | NT | 6.0% | coding (761/993 nt) | PP_5241 | LuxR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 5978400 = | 78 (1.360) | coding (717/993 nt) | PP_5241 | LuxR family transcriptional regulator |
TTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCGCCCCGGCGCGCATGGCCTGGACGGTCATCGGGATGGTGC > NC_002947/5978209‑5978500 | ttCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCcg > 5:51050/1‑149 (MQ=255) tgccggctggcgctgccctggccgatcgtgttcatgactggtttcggcaccatcccgatgaccgtccaggccatgcgcgccggggcggtggaatttctgaccaagccgttcgatgaagaccagttgctgaccctgttgcagacagtgc > 6:40732‑M1/148‑148 (MQ=255) ccggctggcgctgccctggccgatcgtgttcatgactggtttcggcaccatcccgatgaccgtccaggccatgcgcgccggggcggtggaatttctgaccaagccgttcgatgaagaccagttgctgaccctgttgcagacagtgcgcg < 7:199373‑M1/4‑1 (MQ=255) atgatgTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAATCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCgcgc > 2:89593/1‑149 (MQ=255) atgatgTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCgcgc < 6:351105/149‑1 (MQ=255) tgatgTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCgcgc < 1:277897/149‑1 (MQ=255) tgatgTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCcg > 4:124050/1‑145 (MQ=255) tgatgTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCcg < 3:124050/145‑1 (MQ=255) atgTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTg > 3:81849/1‑149 (MQ=255) tgTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGc < 7:7437/149‑1 (MQ=255) gTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCgcgc > 6:217773/1‑144 (MQ=255) gTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCgcgc < 5:217773/144‑1 (MQ=255) ttcttcTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAg < 4:33472/149‑1 (MQ=255) cttcttGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGc < 6:134238/148‑1 (MQ=255) cttcttGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGc < 8:124193/148‑1 (MQ=255) cttGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGcc < 4:332611/146‑1 (MQ=255) ccctggccgatcgtgttcatgactggtttcggcaccatcccgatgaccgtccaggccatgcgcgccggggcggtggaatttctgaccaagccgttcgatgaagaccagttgctgaccctgttgcagacagtgCGCGCCTGCAGCCACtt < 6:21762‑M1/17‑1 (MQ=255) cACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTtgtg < 4:287401/147‑1 (MQ=255) cACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTtgtg > 3:287401/1‑147 (MQ=255) cACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGc > 4:9718/1‑149 (MQ=255) tGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCg > 4:303342/1‑149 (MQ=255) tcgtcACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATGTGGTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACG‑TGTCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTtgtg < 7:171364/139‑1 (MQ=255) tcgtcACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTtgtg < 7:26399/139‑1 (MQ=255) tcgtcACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTtgtg > 8:26399/1‑139 (MQ=255) tcgtcACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGcc < 5:274783/149‑1 (MQ=255) tcgtcACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGcc < 2:275331/149‑1 (MQ=255) tcgtcACCACGCTGGTGCCCATCTGACTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCTCCTACCACAAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTAACGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGAAGacacatctg > 8:171364/1‑134 (MQ=255) cACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCGAAGGCCAcaa < 3:145116/149‑3 (MQ=255) cTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGccc > 8:91020/1‑149 (MQ=255) tCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCg > 7:317600/1‑149 (MQ=255) gCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCggg > 3:211784/1‑149 (MQ=255) gCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCggg > 1:206202/1‑149 (MQ=255) cgatctgATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGgc < 3:99996/141‑1 (MQ=255) gTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCg > 7:123871/1‑132 (MQ=255) gTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCg < 8:123871/132‑1 (MQ=255) gcaccatcccgatgaccgtccaggccatgcgcgccggggcggtggaatttctgaccaagccgttcgatgaagaccagttgctgaccctgttgcagacagtgCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACt > 4:166633‑M1/102‑149 (MQ=255) gcaccatcccgatgaccgtccaggccatgcgcgccggggcggtggaatttctgaccaagccgttcgatgaagaccagttgctgaccctgttgcagacagtgCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACt > 5:21762‑M1/102‑149 (MQ=255) aTCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGCCCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGgc > 4:99996/1‑140 (MQ=255) aTCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGt > 8:3305/1‑149 (MQ=255) accatcccgatgaccgtccaggccatgcgcgccggggcggtggaatttctgaccaagccgttcgatgaagaccagttgctgaccctgttgcagacagtgCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGt > 5:48764‑M1/100‑149 (MQ=255) gCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTg > 1:272622/1‑148 (MQ=255) gCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTg > 3:259734/1‑148 (MQ=255) gCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTg > 2:87951/1‑148 (MQ=255) ccTGGCTATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCt < 6:120802/146‑1 (MQ=255) ccTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCt < 3:303342/146‑1 (MQ=255) ccTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGc < 3:9718/148‑1 (MQ=255) ccTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGc < 1:188978/148‑1 (MQ=255) ccTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGc > 4:137988/1‑148 (MQ=255) ccTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGc < 4:278556/148‑1 (MQ=255) ccTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGc < 3:137988/148‑1 (MQ=255) cTGGTGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCaa < 8:311768/149‑1 (MQ=255) ccgatgaccgtccaggccatgcgcgccggggcggtggaatttctgaccaagccgttcgatgaagaccagttgctgaccctgttgcagacagtgCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCaa > 8:62321‑M1/94‑149 (MQ=255) gCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAg > 4:184611/1‑149 (MQ=255) cGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCAGGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAgg < 1:310658/149‑1 (MQ=255) aTCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGt > 5:59764/1‑149 (MQ=255) cTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGt < 8:317600/144‑1 (MQ=255) cTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTc < 6:158951/145‑1 (MQ=255) cTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCa < 6:59764/146‑1 (MQ=255) cTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGc > 3:254768/1‑148 (MQ=255) cTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCa < 3:65926/149‑1 (MQ=255) gtgCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGc > 6:69385/1‑133 (MQ=255) gtgCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGc < 5:69385/133‑1 (MQ=255) tgCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTg > 2:47502/1‑149 (MQ=255) gACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTTGTc < 1:89593/149‑1 (MQ=255) gACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCACGCGCTGGTACATTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCCCTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTc > 7:317058/1‑149 (MQ=255) gccgccTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCAt < 2:206202/149‑1 (MQ=255) gccgccTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCAt > 1:16420/1‑149 (MQ=255) ccaGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTg > 4:9777/1‑149 (MQ=255) ccaGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTg < 2:272622/149‑1 (MQ=255) caGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCAt > 3:283031/1‑137 (MQ=255) caGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCAt < 4:283031/137‑1 (MQ=255) caGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTgg > 3:155369/1‑149 (MQ=255) caGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTgg > 8:292282/1‑149 (MQ=255) cGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGt > 4:81855/1‑147 (MQ=255) agaagaCC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAg > 5:207348/1‑148 (MQ=255) gaCC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAAtt > 6:25707/1‑149 (MQ=255) cc‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTTCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTcc < 3:234470/149‑1 (MQ=255) c‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTAAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCa > 5:151730/1‑149 (MQ=255) tGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTg < 1:33610/98‑1 (MQ=255) tGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTg > 2:33610/1‑98 (MQ=255) tGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCAc > 3:338252/1‑149 (MQ=255) tCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCACGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCGcccc > 3:113809/1‑149 (MQ=255) gCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGc < 1:84909/89‑1 (MQ=255) gCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGc > 2:84909/1‑89 (MQ=255) gCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCGCCCCGgcg < 5:25707/149‑1 (MQ=255) tGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCGCCCCGgcgcg > 7:192505/1‑149 (MQ=255) gTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCGCCCCGGCGCGCa < 7:3305/148‑1 (MQ=255) gcTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCGCCCCGGCGCGCATGGCCTg > 1:327686/1‑148 (MQ=255) cTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCGCCCCGGCGCGCATGGCCTGGa > 6:31556/1‑149 (MQ=255) gTACTTTTCCTCGACATGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCGCCCCGGCGCGCATGGCCTGGACgg > 8:199373/1‑149 (MQ=255) cTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCGCCCCGGCGCGCATGGCCTGGACGGTc < 3:81855/148‑1 (MQ=255) ttCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATTGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCGCCCCGGCGCGCATGGCCTGGACGGTCATc < 1:294176/148‑1 (MQ=255) ccTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCGCCCCGGCGCGCATGGCCTGGACGGTCATCgg < 6:207348/148‑1 (MQ=255) cTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCGCCCCGGCGCGCATGGCCTGGACGGTCATCGGGa < 1:112436/149‑1 (MQ=255) cTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCGCCCCGGCGCGCATGGCCTGGACGGTCATCGGGa < 4:211784/149‑1 (MQ=255) tacaCCTGCAGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACCGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACCGCTTGGTCACAAATTCCACCGCCCCGTCGCGCATGGCCTGGACGGTCATCagg > 4:137764/4‑147 (MQ=255) gACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCGCCCCGGCGCGCATGGCCTGGACGGTCATCGGGAt < 4:81849/147‑1 (MQ=255) ccTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCCCGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCGCCCCGGCGCGCATGGCCTGGACGGTCATCGGGATGGTg > 3:183257/1‑149 (MQ=255) ccTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCGCCCCGGCGCGCATGGCCTGGACGGTCATCGGGATGGTg < 2:16420/149‑1 (MQ=255) cTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCGCCCCGGCGCGCATGGCCTGGACGGTCATCGGGATGGTGc > 3:163495/1‑149 (MQ=255) | TTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACC‑TGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGCCCGGGCGCGCACTGTCTGCAACAGGGTCAGCAACTGGTCTTCATCGAACGGCTTGGTCAGAAATTCCACCGCCCCGGCGCGCATGGCCTGGACGGTCATCGGGATGGTGC > NC_002947/5978209‑5978500 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |