New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 478258 = | 38 (0.630) | 3 (0.050) | 3/260 | NT | 7.7% | intergenic (+6/+104) | PP_0393/cca | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase/multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase |
? | NC_002947 | 478359 = | 35 (0.590) | intergenic (+107/+3) | PP_0393/cca | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase/multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase |
TGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCTACGA‑CGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCTCGCAGGTAATCG > NC_002947/478223‑478503 | tGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTGGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCTACGA‑CGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCgcgc < 6:343303/149‑1 (MQ=255) gcgcGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCTACGA‑CGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGACGGTAGGTCTAACCGCGCTg > 1:242846/1‑149 (MQ=255) gctgTTCACGCCCGCTTGAGCCTTTAGCGGCCTCTTCGCGGTTAACCCC‑GCTCCTACGA‑GGGGCTGAGCCCAACCTTTGATGTGTCCCCCCTGATGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCt < 2:242846/145‑1 (MQ=37) gCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCTACGA‑CGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCttt > 5:172200/1‑149 (MQ=255) tttacGGCCTGTTGGCGGGTAAACCC‑TCTCCAACCA‑CGGGCTTACCCCAACCTCTTATGTGTGCCCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGTATGTCTAACCGCGCTTGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCtt < 2:242263/145‑1 (MQ=37) ATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCGACGAGCGGGCTGAGCCCAAACTATGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTATGCGACGAGCGGTTTCAGCCGTTCACCttt < 1:242263‑M1/149‑1 (MQ=255) ggCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCTACGA‑CGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGt < 6:172200/149‑1 (MQ=255) ctTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCTACGA‑CGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTc > 6:105178/1‑149 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCC‑GCTCCTACGA‑CCGGCGGAGCCCCACCTGAGATGTGTGCCCCCGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTTGGTCTAAACCCGCGGGTAAGCCTCGAGCGCGTTCAGCCGGTCACCTTTGAGTGCTTCg > 4:144441/1‑149 (MQ=37) cgcgGGTAAACCC‑GCTCCTACGA‑CGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGcc > 6:194982/1‑149 (MQ=255) gcgGGTAAACCC‑GCTCCTACGA‑CGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAg < 8:109608/139‑1 (MQ=255) gcgGGTAAACCC‑GCTCCTACGA‑CGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAg > 7:109608/1‑139 (MQ=255) gggTAAACCC‑GCTCCTACGA‑CGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAg > 6:152827/1‑149 (MQ=255) gTAAACCCGGCTCCTCGGA‑AGGGCTTAGCCCAACCTCTGTTGGGTGCCCCCTGTTGTCGG‑GGGTTAACCGGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGTTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGt < 8:206116/149‑1 (MQ=255) ccgctcctacagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgataGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGAc > 7:118624‑M2/79‑149 (MQ=255) gctcctacagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgataGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCg > 3:341752‑M2/77‑149 (MQ=255) cTACGA‑CGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGt > 7:118290/1‑147 (MQ=255) cga‑cgGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGcc > 5:39146/1‑149 (MQ=255) ggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgataGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCt < 4:341752‑M2/85‑1 (MQ=255) ctcaccccAACCTCTGATGTGTCCCCCCTTTAGCAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTg < 3:144441/144‑1 (MQ=255) cccAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCAcc > 1:328152/1‑148 (MQ=255) cccAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCAcc > 8:280963/1‑148 (MQ=255) ccAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCAGGTAGGTCAAACCGCGCTCGTAAGCCTCGAGCGCTATCAGCCGATCACCTATGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGCGAGGTCAGCCCGTCATCCACCaa > 8:71720/1‑149 (MQ=37) cAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAAc < 2:328152/149‑1 (MQ=255) cAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAAc > 6:208201/1‑149 (MQ=255) tctGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCt > 1:22488/1‑149 (MQ=255) tGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTc > 7:44166/1‑148 (MQ=255) cccccTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCttt > 4:148658/1‑87 (MQ=255) cccccTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCttt < 3:148658/87‑1 (MQ=255) gTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTcgcg > 5:205033/1‑149 (MQ=255) gAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGcgccgc > 1:301146/1‑149 (MQ=255) ccGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCtt > 4:144867/1‑116 (MQ=255) ccGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCtt < 3:144867/116‑1 (MQ=255) ccGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGcc < 5:208201/149‑1 (MQ=255) ccGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGCCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGATCGCGCCGCCGCTGCTgcgc > 6:51090/1‑148 (MQ=255) cgcgAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTc > 8:221434/1‑129 (MQ=255) cgAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTg < 5:96363/101‑1 (MQ=255) cgAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTg > 6:96363/1‑101 (MQ=255) gAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCTCGc < 8:118290/149‑1 (MQ=255) ggTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGTCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCTCGCAGGTAATCg < 5:51090/149‑1 (MQ=255) ggTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCTCGCAGGTAATCg < 6:205033/149‑1 (MQ=255) | TGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCC‑GCTCCTACGA‑CGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCTCGCAGGTAATCG > NC_002947/478223‑478503 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |