New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 594771 = | 40 (0.660) | 4 (0.070) | 4/242 | NT | 8.0% | intergenic (‑10/+117) | PP_0505/PP_0506 | hypothetical protein/ABC transporter permease |
? | NC_002947 | 594856 = | 55 (1.000) | intergenic (‑95/+32) | PP_0505/PP_0506 | hypothetical protein/ABC transporter permease |
CCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCAAGGTCCATTCATGG > NC_002947/594714‑595002 | ccATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCgg > 6:171391/1‑149 (MQ=255) agagGCAGCGCTACCAGCAACAGCAACGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTGCGCGGGCATGCCCGCGCCCACCGGGACGGCACAAGCTCCAACGCCTGCGGGGCTCCCTGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAg < 3:234824/149‑1 (MQ=255) gagGCTTCGCTACCACCAACTGCATGGCTCGCAGCATGTGCATGGCGGGCCTCTTGGGGGGCATGCCGGCTCCCACTGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGGTCCCTGTGGGTGGGGGGGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAg < 8:101047/148‑1 (MQ=255) cGCAACCAGCAACCGCAAGGCCAGCAGCATGGGCATGGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGGCCCGCTCCCACCGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGa < 7:220061/149‑1 (MQ=38) gCTACCCGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACACCCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGAt < 7:80493/149‑1 (MQ=255) agcaacagcaaGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTAc > 7:188046/1‑149 (MQ=255) gcaacagcaaGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTAcg > 4:353476/1‑149 (MQ=255) caacagcaaGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGTCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTAcgc > 5:49097/1‑149 (MQ=255) acagcaaGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTAcgc‑g > 6:383458/1‑148 (MQ=255) agcaaGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCAc > 5:342591/1‑149 (MQ=255) aaGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACt > 6:198272/1‑147 (MQ=255) cagcagCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGgt < 7:352308/149‑1 (MQ=255) cagcaTGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCATGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTa > 8:266232/1‑149 (MQ=255) agcaTGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTAt < 5:383458/149‑1 (MQ=255) caTGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGATACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATg > 1:77620/1‑148 (MQ=255) gccctgcccGCCCCCTCCGCGGGCATGCCCGCCCCCACCGGCACGCCCCACGCTCCACCCCCTGCGGGGCCCCCGGGGGGCGGGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAg < 8:162036/142‑1 (MQ=255) cATTGCCGGCCTCTTCGCTGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAgg < 4:118362/148‑1 (MQ=255) cATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAg > 7:162036/1‑147 (MQ=255) aTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGcc > 6:71393/1‑149 (MQ=255) gCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGt > 1:62207/1‑148 (MQ=255) tgtgggaGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTcagc < 7:287858‑M1/140‑1 (MQ=255) tctTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTcagccagc > 5:141554/1‑149 (MQ=255) CTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTcagccagc < 3:359920‑M1/148‑1 (MQ=255) CGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCATGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGAt > 7:266232‑M1/1‑148 (MQ=255) CGGGCATGCCGGCGCCCACAGGAACTGCACACGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGc > 1:271441‑M1/1‑149 (MQ=255) GGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCg > 7:277313‑M1/1‑149 (MQ=255) caggCCCGCGCCCACAGGTCCTGAACACGCGCAAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGt < 6:342591/146‑1 (MQ=255) CATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCgg < 2:91076‑M1/148‑1 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAg < 5:198272/148‑1 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGc > 1:299069/1‑149 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGc < 8:287858/149‑1 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGcc > 4:224027/1‑149 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGcc > 4:9290/1‑149 (MQ=255) gctcccacagggagccccgcaggctttggagcttgtgcagtacctgtgggagcgggcatgcccgcgaagCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCg > 6:238652‑M2/70‑149 (MQ=255) ccACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCAc > 8:89889/1‑149 (MQ=255) acagggagccccgcaggctttggagcttgtgcagtacctgtgggagcgggcatgcccgcgaagCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGc > 6:256473‑M2/64‑149 (MQ=255) aGGTACTCCACACGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGGGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCg < 4:146988/149‑1 (MQ=255) gggagccccgcaggctttggagcttgtgcagtacctgtgggagcgggcatgcccgcgaagCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCgg < 5:256473‑M2/89‑1 (MQ=255) tGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGc > 3:132127/1‑149 (MQ=255) gCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCt > 2:211213/1‑149 (MQ=255) cacaAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGcc > 5:104589/1‑131 (MQ=255) cacaAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGcc < 6:104589/131‑1 (MQ=255) cacaAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTg > 6:290128/1‑149 (MQ=255) cacaAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTg > 2:13749/1‑149 (MQ=255) caAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGcc > 3:250352/1‑149 (MQ=255) aaGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGTCACGCTGcc > 6:246275/1‑148 (MQ=255) aaGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGccc < 7:89889/149‑1 (MQ=255) ctttggagcttgtgcagtacctgtgggagcgggcatgcccgcgaagCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCa < 5:238652‑M2/103‑1 (MQ=255) ccAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTAt > 4:50683/1‑89 (MQ=255) ccAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTAt < 3:50683/89‑1 (MQ=255) ccAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAg < 8:188046/149‑1 (MQ=255) cAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAg > 8:183063/1‑148 (MQ=255) cAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAg > 5:108045/1‑148 (MQ=255) cTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAAcgcg > 3:360948/1‑149 (MQ=255) cTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAAcgcg < 7:183063/149‑1 (MQ=255) cTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAAcgcg < 2:62207/149‑1 (MQ=255) gCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGc > 1:21039/1‑149 (MQ=255) gCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGcccc > 1:293878/1‑147 (MQ=255) cccTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGga < 5:171391/149‑1 (MQ=255) ccTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGgat > 3:57205/1‑149 (MQ=255) tgtgGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCAGAAGTCAGAGGTGTATGTACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGCCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGgat > 1:98871/1‑148 (MQ=255) tgtgGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGgatga > 5:127167/1‑149 (MQ=255) tgtgGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGgatga > 4:332374/1‑149 (MQ=255) gAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCTGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGTCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGcc < 5:246275/149‑1 (MQ=255) aGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCa < 1:13749/149‑1 (MQ=255) gggCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGc > 7:258762/1‑148 (MQ=255) gCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCAAg < 4:250352/149‑1 (MQ=255) gTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCAAGGt < 6:108045/149‑1 (MQ=255) gcgaagCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGccccc > 2:189603‑M2/7‑123 (MQ=255) gcgaagCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGccccc < 1:189603‑M2/117‑1 (MQ=255) gcgaagCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCACCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCAAGGTCCAtt > 2:326342‑M2/7‑148 (MQ=255) aagCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCAAGGTCCATTCATg < 3:332374‑M2/146‑1 (MQ=255) agCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCAAGGTCCATTCATgg < 6:141554‑M2/147‑1 (MQ=255) | CCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGC‑GCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCAAGGTCCATTCATGG > NC_002947/594714‑595002 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |