New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 875905 = | 44 (0.730) | 4 (0.070) | 4/248 | NT | 8.6% | intergenic (‑14/+73) | PP_0760/PP_mr65 | membrane protein/YybP‑YkoY |
? | NC_002947 | 875949 = | 44 (0.780) | intergenic (‑58/+29) | PP_0760/PP_mr65 | membrane protein/YybP‑YkoY |
GGGCAGCGAGAATGAGTGCGAGCAGTTGCGTCTTGTCGCCGATCTCGGCCAGGGCAACGATAGCGGTGGGGACCAACAGTGATTCCAGCATCAGGATTCCTACGGGGGCGGGTCGACACGGCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGCATGGTGGGTCGCACGCGCCATGGTCTGTGGACCAAGTATGTTGACGCGTACCGGGCGAGCTGGGTGCTCGCGG > NC_002947/875801‑876094 | gggCAGCGAGAATGAGTGCGAGCAGTTGCGTCTTGTCGCCGATCTCGGCCAGGGCAACGATAGCGGTGGGGACCAACAGTGATTCCAGCATCAGGATTCCTACGGGGGCGGGTCGACACGGCTATGACACGTACAGCCTccccgccccg < 4:54575/149‑1 (MQ=255) ggCAGCGAGAATGAGTGCGAGCAGTTGCGTCTTGTCGCCGATCACGGCCAGGGCAACGATAGCGGTGGCGACCAACAGTGATTCCAGCATCAGCATTAGTACGGGGGCGGGTCGACACGGCTATGACACGTACAGCCGCCCCGCACCgg > 6:216937/1‑149 (MQ=255) ggCAGCGAGAATGAGTGCGAGCAGTTGAGTCTTGTCGCCGATATCGGCCAGGGCAACGAAAGCGGTGTGGACAAACAGTGATTCCAGCATCAGGATTCCTACGGGGTCGGGACGACACGGATATCACCAGAACAGCCTCCACGCCCCgg > 6:222175/1‑149 (MQ=255) cacagaccatggcgcgtgcgacccaccatgcacgcctgcatggagagatccgcatagacggatcgagggtttgacaagacctatgacacgcacaccttacccGGGGCGGGTCGACACGGCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCgg > 8:152116‑M1/103‑148 (MQ=255) cAGCGAGAATGAGTGCGAGCAGTTGCGTCTTGTCGCCGATCTCTGCCAGGGCAACGATAGCGGTGGGGACCAACAGTGATTCCAGCATCAGGATTCCTACGGGGGCGGGTCGACACGGCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGt < 3:21276/149‑1 (MQ=255) aGCGAGAATGAGTGCGAGCAGTTGCGTCTTGTCGCCGATCTCGGCCAGGGCAACGATAGCGGTGGGGACCAACAGTGATTCCAGCATCAGGATTCCTACGGGGGCGGGTCGACACGGCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGt > 8:197547/1‑148 (MQ=255) tGAGTGCGAGCAGTTGCGTCTTGTCGCCGATCTCGGCCAGGGCAACGATAGCGGTGGGGACCAACAGTGATTCCAGCATCAGGATTCCTACGGGGGCGGGTCGACACGGCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGc < 7:197547/149‑1 (MQ=255) aGTGCGAGCAGTTGCGTCTTGTCGCCGATCTCGGCCAGGGCAACGATAGCGGTGGGGACCAACAGTGATTCCAGCATCAGGATTCCTACGGGGGCGGGTCGACACGGCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCgt < 1:903/149‑1 (MQ=255) aGTGCGAGCAGTTGCGTCTTGTCGCCGATCTCGGCCAGGGCAACGATAGCGGTGGGGACCAACAGTGATTCCAGCATCAGGATTCCTACGGGGGCGGGTCGACACGGCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCgt < 2:218830/149‑1 (MQ=255) cTTGTCGCCGATCTCGGCCAGGGCAACGATAGCGGTGGGGACCAACAGTGATTCCAGCATCAGGATTCCTACGGGGGCGGGTCGACACGGCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGt < 1:171053/141‑1 (MQ=255) cTTGTCGCCGATCTCGGCCAGGGCAACGATAGCGGTGGGGACCAACAGTGATTCCAGCATCAGGATTCCTACGGGGGCGGGTCGACACGGCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGt > 2:171053/1‑141 (MQ=255) ttGTCGCCGATCTCGGCCAGGGCAACGATAGCGGTGGGGACCAACAGTGATTCCAGCATCAGGATTCCTACGGGGGCGGGTCGACACGGCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCaaa > 1:2760/1‑149 (MQ=255) gCCGATCTCGGCCAGGGCAACGATAGCGGTGGGGACCAACAGTGATTCCAGCATCAGGATTCCTACGGGGGCGGGTCGACACGGCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCgt < 4:65125/126‑1 (MQ=255) gCCGATCTCGGCCAGGGCAACGATAGCGGTGGGGACCAACAGTGATTCCAGCATCAGGATTCCTACGGGGGCGGGTCGACACGGCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCgt > 3:65125/1‑126 (MQ=255) gCCGATCTCGGCCAGGGCAACGATAGCGGTGGGGACCAACAGTGATTCCAGCATCAGGATTCCTACGGGGGCGGGTCGACACGGCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCaaa < 6:228283/144‑1 (MQ=255) gCCGATCTCGGCCAGGGCAACGATAGCGGTGGGGACCAACAGTGATTCCAGCATCAGGATTCCTACGGGGGCGGGTCGACACGGCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCaaa > 5:228283/1‑144 (MQ=255) gCCGATCTCGGCCAGGGCAACGATAGCGGTGGGGACCAACAGTGATTCCAGCATCAGGATTCCTACGGGGGCGGGTCGACACGGCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTc > 2:119686/1‑149 (MQ=255) tctcGGCCAGGGCAACGATAGCGGTGGGGACCAACAGTGATTCCAGCATCAGGATTCCTACGGGGGCGGGTCGACACGGCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATcc > 1:142844/1‑149 (MQ=255) ggCCACGGCAACGCTAGCGGTGGGTACCAACCGTGATTCCCGCATCAGTCTTCCTAAGGGGGCGGGTCGACACGGCTATGACACCTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAACGGGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATcc < 4:44229/145‑1 (MQ=255) aaCGATAGCGGTGGGGACCAACAGTGATTCCAGCATCAGGATTCCTACGGGGGCGGGTCGACACGGCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGAtc > 5:190988/1‑149 (MQ=255) cAACAGTGATTCCAGCATCAGGATTCCTACGGGGGCGGGTCGACACGGCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGgtgt < 6:235824/146‑1 (MQ=255) cAACAGTGATTCCAGCATCAGGATTCCTACGGGGGCGGGTCGACACGGCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGc < 3:232586/148‑1 (MQ=255) cAACAGTGATTCCAGCATCAGGATTCCTACGGGGGCGGGTCGACACGGCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGc > 4:232586/1‑148 (MQ=255) cAACAGTGATTCCAGCATCAGGATTCCTACGGGGGCGGGTCGACACGGCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGAGt > 5:235824/1‑146 (MQ=255) aCAGTGATTCCAGCATCAGGATTCCTACGGGGGCGGGTCGACACGGCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCACGCCTGCAtg > 7:41132/1‑149 (MQ=255) tGATTCCAGCATCAGGATTCCTACGGGGGCGGGTCGACACGGCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCACGCCTGCAtggaga < 8:41132/149‑4 (MQ=255) gATTCCAGCATCAGGATTCCTACGGGGGCGGGTCGACACGGCTATGTCACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGCAtggtgg < 5:216937/148‑1 (MQ=255) gATTCCAGCATCAGGATTACTAAGGGGGCGGGGCGACACGTCTATGACACGTACAGACTCCCCGCCCCGGGTAAGGGGGGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGCAtggtgg < 5:222175/148‑1 (MQ=255) aGCATCAGGATTCCTACGGGGGCGGGTCGACACGGCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCGCTCCATGCAGGCGTGCATGGGGGGgcgccc > 8:236151/1‑147 (MQ=255) aGCATCAGGATTCCTACGGGGGCGGGTCGACACGGCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGGCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGGGCATGGTGGGTCGCAc > 8:233899/1‑149 (MQ=255) cTACGGGGGCGGGTCGACACGGCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGCATGGTGGGTCGCACGCGCCATGGTCtg > 6:370982/1‑149 (MQ=255) tACGGGGGCGGGTCGACACGGCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCACGCCTGCAtgga > 8:91783/1‑125 (MQ=255) tACGGGGGCGGGTCGACACGGCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCACGCCTGCAtgga < 7:91783/126‑2 (MQ=255) ccggggcggggaggctgtacgtgtcatagccgtgtcgacccgccccGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGCATGGTGGGTCGCACGCGCCATGGTCtgtg > 8:152116‑M2/47‑148 (MQ=255) gggggCGGGTCGACACGGCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGCATGGTGGGTCGCACGCGCCATGGTCTGTGGa > 3:208224/1‑149 (MQ=255) ggggaggctgtacgtgtcatagccgtgtcgacccgccccGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGCATGGTGGGTCGc > 2:203814‑M2/40‑124 (MQ=255) ggggaggctgtacgtgtcatagccgtgtcgacccgccccGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGCATGGTGGGTCGc < 1:203814‑M2/85‑1 (MQ=255) gACACGGCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGCATGGTGGGTCGCACGCGCCATGGTCTGTGGACCAAGTATGtt > 7:43087/1‑149 (MQ=255) catggCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGCATGGTGGGTCGCACGCGCCATGGTCTGTGGACCAAGTATGTTGa > 5:155354/4‑149 (MQ=255) acGGCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGCATGGTGGGTCGCACGCGCCATGGTCTGTGGACCAAGTATGTTGAc < 2:2760/149‑1 (MQ=255) tacgtgtcatagccgtgtcgacccgccccGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGCATGGTGGGTCGCACGCGCCATGGTCTGTGGACCAAGTATGTTGAcgc < 7:152116‑M2/120‑1 (MQ=255) ggCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGCATGGTGGGTCGCACGCGCCATGGTCTGTGGACCAAGTATGTTGAcgc > 3:300391/1‑149 (MQ=255) tATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGCATGGTGGGTCGCACGCGCCATGGTCtgtg < 1:78523/128‑1 (MQ=255) tATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGCATGGTGGGTCGCACGCGCCATGGTCtgtg > 2:78523/1‑128 (MQ=255) tATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGCATGGTGGGTCGCACGCGCCATGGTCTGTGGACCAAGTATGTTGACGCGTa > 1:91961/1‑149 (MQ=255) aTGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGCATGGTGGGTCGCACGCGCCATGGTCTGTGGACCAAGTATGTTGACGCGTAc > 2:261240/1‑149 (MQ=255) aTGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGCATGGTGGGTCGCACGCGCCATGGTCTGTGGACCAAGTATGTTGACGCGTAc > 8:58744/1‑149 (MQ=255) cacGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGCAtggtg < 6:320376/100‑1 (MQ=255) cacGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGCAtggtg > 5:320376/1‑100 (MQ=255) cacGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGCATGGTGGGTCGCACGCGCCATGGTCTGTGGACCAAGTATGTTGACGCGTACCggg < 4:208224/149‑1 (MQ=255) cGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGCATGGTGGGTCGCACGCGCCATGGTCTGTGGACCAAGTATGTTGACGCGTACCGGGCg < 4:238541/149‑1 (MQ=255) gTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGCATGGTGGGTCGCACGCGCCATGGTCTGTGGACCAAGTATGTTGACGCGTACCGGGc > 2:354119/1‑147 (MQ=255) tACAGCCTCCCCGACCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGCATGGTGGGTCGCACGCGCCATGGTCTGTGGACCAAGTATGTTGACGCGTACCGGGCGAg > 8:206322/1‑149 (MQ=255) aCAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGCATGGTGGGTCGCACGCGCCATGGTCTGTGGACCAAGTATGTTGACGCGTACCGGGCGAGc > 1:351517/1‑149 (MQ=255) gCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGCATGGTGGGTCGCACGCGCCATGGTCTGTGGACCAAGTATGTTGACGCGTACCGGGCGAGCTgg < 2:351517/149‑1 (MQ=255) ccTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGCATGGTGGGTCGCACGCGCCATGGTCTGTGGACCAAGTATGTTGACGCGTACCGGGCGAGCTggg > 2:35308/1‑149 (MQ=255) ccTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGCATGGTGGGTCGCACGCGCCATGGTCTGTGGACCAAGTATGTTGACGCGTACCGGGCGAGCTgg < 3:225127/148‑1 (MQ=255) ccTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGCATGGTGGGTCGCACGCGCCATGGTCTGTGGACCAAGTATGTTGACGCGTACCGGGCGAGCTgg > 4:225127/1‑148 (MQ=255) cgccccGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGCATGGTGGGTCGCACGCGCCATGGTCTGTGGACCAAGTATGTTGACGCGTACCGGGCGAGCTGGGTGCTcg < 7:58744‑M2/143‑1 (MQ=255) cccGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGCATGGTGGGTCGCACGCGCCATGGTCTGTGGACCAAGTATGTTGACGCGTACCGGGCGAGCTGGGTGCTCGCgg < 1:261240‑M2/146‑1 (MQ=255) | GGGCAGCGAGAATGAGTGCGAGCAGTTGCGTCTTGTCGCCGATCTCGGCCAGGGCAACGATAGCGGTGGGGACCAACAGTGATTCCAGCATCAGGATTCCTACGGGGGCGGGTCGACACGGCTATGACACGTACAGCCTCCCCGCCCCGGGTAAGGTGTGCGTGTCATAGGTCTTGTCAAACCCTCGATCCGTCTATGCGGATCTCTCCATGCAGGCGTGCATGGTGGGTCGCACGCGCCATGGTCTGTGGACCAAGTATGTTGACGCGTACCGGGCGAGCTGGGTGCTCGCGG > NC_002947/875801‑876094 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |