New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1171718 = | 42 (0.700) | 4 (0.070) | 4/248 | NT | 10.3% | coding (1335/1380 nt) | xseA | exodeoxyribonuclease 7 large subunit |
? | NC_002947 | 1171779 = | 30 (0.530) | coding (1274/1380 nt) | xseA | exodeoxyribonuclease 7 large subunit |
CAGGGAAAGGGCAAGCAGGGGCGCGAGCACGCGGGGCATGTGTCAGTCCAGTAGTGAGAGGGTGACCGGGGTCAGGTGGTTGTCTTCGACCCGCACCAGCAACTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATGCTGTATCCACGGGCCAGAGTGGCCAGCGGACTGACCACCTGCAGTGTCTGCAACTGGGCCTGGAACCGCTGGCGACGGTCCTTGAGCACCTCGCGCATGGC > NC_002947/1171631‑1171924 | cagGGAAAGGGCAAGCAGGGGCGCGAGCACGCGGGGCATGTGTCAGTCCAGTAGTGAGAGGGTGACCGGGGTCAGGTGGTTGTCTTCGACCCGCACCAGCAACTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCt < 4:37767/149‑1 (MQ=255) cagGGAAAGGGCAAGCAGGGGCGCGAGCACGCGGGGCATGTGTCAGTCCAGTAGTGAGAGGGTGACCGGGGTCAGGTGGTTGTCTTCGACCCGCACCAGCAACTCGCCGTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCt > 8:290369/1‑149 (MQ=255) caggtggtcagtccgctggccactctggcccgtggatacagcattttgctggatgagcaaggccaggccattcgcagcgccgaacaGACCCGCACCAGCAACTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCt > 6:384046‑M1/87‑148 (MQ=255) cAAGCAGGGGCGCGAGCACGCGGGGCATGTGTCAGTCCAGTAGTGAGAGGGTGACCGGGGTCAGGTGGTTGTCTTCGACCCGCACCAGCAACTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTg < 4:159867/149‑1 (MQ=255) cACGCGGGGCATGTGTCAGTCCAGTAGTGAGAGGGTGACCGGGGTCAGGTGGTTGTCTTCGACCCGCACCAGCAACTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCtt > 6:204998/1‑149 (MQ=255) aCGCGGGGCATGTGTCAGTCCAGTAGTGAGAGGGTGACCGGGGTCAGGTGGTTGTCTTCGACCCGCACCAGCAACTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTg < 8:276124/149‑1 (MQ=255) cgcgGGGCATGTGTCAGTCCAGTAGTGAGAGGGTGACCGGGGTCAGGTGGTTGTCTTCGACCCGCACCAGCAACTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGc < 6:296800/149‑1 (MQ=255) ggCATGTGGCAGTCCAGTAGGGAGAGCGTGACCGGGGTCAGGGGGTTGTCTTCGACCCGCACCAGCAACTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCGATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATc < 1:199298/149‑1 (MQ=255) gCATGTGTCAGTCCAGTAGTGAGAGGGTGACCGGGGTCAGGTGGTTGTCTTCGACCCGCACCAGCAACTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATcc < 3:271373/149‑1 (MQ=255) gCATGTGTCAGTCCAGTAGTGAGAGGGTGACCGGGGTCAGGTGGTTGTCTTCGACCCGCACCAGCAACTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATcc < 8:131247/149‑1 (MQ=255) cATGTGTCAGTCCAGTAGTGAGAGGGTGACCGGGGTCAGGTGGTTGTCTTCGACCCGCACCAGCAACTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCa < 2:277195/149‑1 (MQ=255) aTGTGTCAGTCCAGTAGTGAGAGGGTGACCGGGGTCAGGTGGTTGTCTTCGACCCGCACCAGCAACTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAAt < 3:224415/128‑1 (MQ=255) aTGTGTCAGTCCAGTAGTGAGAGGGTGACCGGGGTCAGGTGGTTGTCTTCGACCCGCACCAGCAACTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAAt > 4:224415/1‑128 (MQ=255) aGTCCAGTAGTGAGAGGGTGACCGGGGTCAGGTGGTTGTCTTCGACCCGCACCAGCAACTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAAt < 4:111228/148‑1 (MQ=255) aGTCCAGTAGTGAGAGGGTGACCGGGGTCAGGTGGTTGTCTTCGACCCGCACCAGCAACTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATg > 8:71036/1‑149 (MQ=255) tGAGAGGGTGACCGGGGTCAGGTGGTTGTCTTCGACCCGCACCAGCAACTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATGCTGTATCCAc < 5:204998/149‑1 (MQ=255) agGGTGACCGGGGTCAGGTGGTTGTCTTCGACCCGCACCAGCAACTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATGCTGTATCCACGGGc > 5:39575/1‑149 (MQ=255) ggTGACCGGGGTCAGGTGGTTGTCTTCGACCCGCACCAGCAACTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATGCTGTATCCACGGGCCa < 3:360051/149‑1 (MQ=255) cAGGTGGTTGTCTTCGACCCGCACCAGCAACTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCGGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATGCTGTATCCACGGGCCAGAGTGGCCAGCg < 7:290278/149‑1 (MQ=255) aGGTGGTTGTCTTCGACCCGCACCAGCAACTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATGCTGTATCCACGGGCCAGAGTGGCCAGCg < 3:327465/148‑1 (MQ=255) gtggtTGTCTTCGACCCGCACCAGCAACTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATGCTGTATCCACGGGCCAGAGTGGCCAGCGGAc > 4:181740/1‑149 (MQ=255) ttGTCTTCGACCCGCACCAGCAACTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATGCTGTATCCACGGGCCAGAGTGGCCAGCGGACTGac < 4:165267/149‑1 (MQ=255) tCTTCGACCCGCACCAGCAACTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATGCTGTATCCACGGGCCATAGTGGCCAGCGGACTGaccac > 1:270112/1‑149 (MQ=255) ttCGACCCGCACCAGCAACTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATGCTGTATCCACGGGCCAGAGTGGCCAGCGGACTGACCACCt > 5:378316/1‑149 (MQ=255) ttCGACCCGCACCAGCAACTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATGCTGTATCCACGGGCCAGAGTGGCCAGCGGACTGACCACCt > 8:342798/1‑149 (MQ=255) ttCGACCCGCACCAGCAACTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATGCTGTATCCACGGGCCAGAGTGGCCAGCGGACTGACCACCt > 1:13083/1‑149 (MQ=255) tCGACCCGCACCAGCAACTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATGCTGTATCCACGGGCCAGAGTGGCCAGCGGACTGACCACCTg > 6:139739/1‑149 (MQ=255) agacccgcaatggccaacgcctgaccgcccgcctgaacgaaggcgagttgctggtgcgggtcTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATGCTGTATCCACGGGCCAGAGTGGCCAGCGGACTGACCACCTg > 6:384046‑M2/63‑148 (MQ=255) acccgcaatggccaacgcctgaccgcccgcctgaacgaaggcgagttgctggtgcgggtcTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATGCTGTATCCACGGGCCAGAGTGGCCAGCGGACTGACCACCTGCAg > 6:137086‑M2/61‑149 (MQ=255) cccgcaatggccaacgcctgaccgcccgcctgaacgaaggcgagttgctggtgcgggtcTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATGCTGTATCCACGGGCCAGAGTGGCCAGCGGACTGACCACCTGCAgt > 8:352760‑M2/60‑149 (MQ=255) CCGCACCAGCAACTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATGCTGTATCCACGGGCCAGAGTGGCCAGCGGACTGACCACCTGCa < 8:300945‑M1/146‑1 (MQ=255) CCGCACCAGCAACTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATGCTGTATCCACGGGCCAGAGTGGCCAGCGGACTGACCACCTGCa > 7:300945‑M1/1‑146 (MQ=255) CCGCACCAGCAACTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATGCTGTATCCACGGGCCAGAGTGGCCAGCGGACTGACCACCTGCAgtg < 6:10448‑M1/149‑1 (MQ=255) CCGCACCAGCAACTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATGCTGTATCCACGGGCCAGAGTGGCCAGCGGACTGACCACCTGCAgtg < 5:110160‑M1/149‑1 (MQ=255) GCACCAGCAACTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATGCTg < 2:314618‑M1/104‑1 (MQ=255) ccaacgcctgaccgcccgcctgaacgaaggcgagttgctggtgcgggtcTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATGCTGTATCCACGGGCCAGAGTGGCCAGCGGACTGACCACCTGCAGTGTCTGCAACt < 5:137086‑M2/100‑1 (MQ=255) aaCTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGGCAGGCGGTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATGCTGTATCCACGGGCCAGAGTGGCCAGCGGACTGACCACCTGCAGTGTCTGCAACTg < 7:290369/149‑1 (MQ=255) gCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATGCTGTATCCACGGGCCAGAGTGGCCAGCGGACTGACCACCTGCAGTGTCTGCAACTGGGc < 7:8376/147‑1 (MQ=255) gTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTc > 1:122744/1‑42 (MQ=255) gTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTc < 2:122744/42‑1 (MQ=255) ggcgggcgGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATGCTGTATCCACGGGCCAGAGTGGCCAGCGGACTGACCACCTGCAGTGTCTGCAACTGGGCCTGGAACCGCTgg < 3:181740/149‑1 (MQ=255) ggCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATGCTGTATCCACGGGCCAGAGTGGCCAGCGGACTGACCACCTGCAGTGTCTGCAACTGGGCCTGGAACCGCTgg < 7:261160/137‑1 (MQ=255) ggCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATGCTGTATCCACGGGCCAGAGTGGCCAGCGGACTGACCACCTGCAGTGTCTGCAACTGGGCCTGGAACCGCTgg > 8:261160/1‑137 (MQ=255) cGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATGCTGTATCCACGGGCCAGAGTGGCCAGCGGACTGACCACCTGCAGTGTCTGCAACTGGGCCTGGAACCGCTGGCGACGGTCCTTGAg < 7:71036/149‑1 (MQ=255) cATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATGCTGTATCCACGGGCCAGAGTGGCCAGCGGACTGACCACCTGCAGTGTCTGCAACTGGGCCTGGAACCGCTGGCGACGGTCCTTGAGCACCTcg > 8:207068/1‑149 (MQ=255) gggtcTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATGCTGTATCCACGGGCCAGAGTGGCCAGCGGACTGACCACCTGCAGTGTCTg < 7:88273‑M2/95‑1 (MQ=255) gggtcTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATGCTGTATCCACGGGCCAGAGTGGCCAGCGGACTGACCACCTGCAGTGTCTg > 8:88273‑M2/6‑100 (MQ=255) gtcTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATGCTGTATCCACGGGCCAGAGTGGCCAGCGGACTGACCACCTGCAGTGTCTGCAACTGGGCCTGGAACCGCTGGCGACGGTCCTTGAGCACCTCGCGCATGGc > 1:276952‑M2/4‑149 (MQ=255) | CAGGGAAAGGGCAAGCAGGGGCGCGAGCACGCGGGGCATGTGTCAGTCCAGTAGTGAGAGGGTGACCGGGGTCAGGTGGTTGTCTTCGACCCGCACCAGCAACTCGCCTTCGTTCAGGCGGGCGGTCAGGCGTTGGCCATTGCGGGTCTGTTCGGCGCTGCGAATGGCCTGGCCTTGCTCATCCAGCAAAATGCTGTATCCACGGGCCAGAGTGGCCAGCGGACTGACCACCTGCAGTGTCTGCAACTGGGCCTGGAACCGCTGGCGACGGTCCTTGAGCACCTCGCGCATGGC > NC_002947/1171631‑1171924 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |