New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
CGCATTAAGCATTAACACATAGCCTGCGGGAGCAACTGTCTTGCTCAATTTCTAACAGCTGGCGCGATTTTGGA‑‑CTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCG‑CGTC‑GCTTGT‑TTCG‑CGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGTCATCATCCCCGTCGGGCTTCAGCCTTTCTTCTTTGGTTTCAGGTATTTCATCAACCCCTGGAACCACATCACCAGCGCCGGGTTGCCCTTGATCTGGATGTGCTTGTCCTGAATCCCTTGCATGA > NC_002947/6060357‑6060651 | cGCATTAAGCATTAACACATAGCCTGCGGGAGCAACTGTCTTGCTCAATTTCTAACAGCTGGCGCGATTTTGGA‑‑CTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCG‑CGTC‑GCTTGT‑TTCG‑CGGGCACGc < 3:227409/149‑1 (MQ=255) gcattaagcattaaCACATAGCCTGCGGGAGCAACTGTCTTGCTCAATTTCTAACAGCTGGCGCGATTTTGGA‑‑CTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCG‑CGTC‑GCTTGT‑TTCG‑CGGGCACGCc > 4:290816‑M2/1‑148 (MQ=255) ttaagcattaaCACATAGCCTGCGGGAGCAACTGTCTTGCTCAATTTCTAACAGCTGGCGCGATTTTGGA‑‑CTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCCGTGCCATGCACCC‑CGTA‑GCGTGT‑TTAG‑CGGGCACGCcccg < 4:3912‑M2/149‑5 (MQ=255) 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ccGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCG‑CGGC‑GCCTGT‑TTCG‑CGGGCACGCccgctcccacagactgattgccattaagcgggcctatcgctacagtgacggcccgttttttgttgcctcgctaacgaatcatgactcccttagaacgctat > 2:317476‑M2/1‑48 (MQ=255) cGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCG‑CGTC‑GCTTGT‑TTCG‑CGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGTCCTCATCCCCGTCGGGCTTCAGCCTTTCATCTTTGGTTTCAGGAATTTCATCAACCCCTGGAACCACATCACCAGCGCCgg > 3:282152/1‑149 (MQ=255) cGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCG‑CGTC‑GCTTGT‑TTCG‑CGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGTCATCATCCCCGTCGGGCTTCAGCCTTTCTTCTTTGGTTTCAGGTATTTCATCAACCCCTGGAACCACATCACCAGCGCCgg > 7:323356/1‑149 (MQ=255) gAAGCCGGTGCCATGCACCG‑CGTC‑GCTTGT‑TTCG‑CGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGTCATCATCCCCGTCGGGCTTCAGCCTTTCTTCTTTGGTTTCAGGTATTTCATCAACCCCTGGAACCACATCACCAGCGCCGGGTTg > 1:152133/1‑149 (MQ=255) caccccggtgCCATGCACCG‑CGGC‑GCCTGT‑TTCG‑CGGGCACGCccgctcccacagactgattgccattaagcgggcctatcgctacagtgacggcccgttttttgttgcctcgctaacgaatcatgactcccttagaacgctatcaag > 8:52161‑M2/5‑43 (MQ=255) aaagCCGGTGCCATGCACCG‑CGGCAGCCTGT‑TTCG‑CGGGCACGCccgctcccacagactgattgccattaagcgggcctatcgctacagtgacggcccgttttttgttgcctcgctaacgaatcatgactcccttagaacgctatcaag < 7:52161‑M2/148‑106 (MQ=255) gCCGGTGCCATGCACCGGCTTT‑GCCGGTGTTCG‑CGGGCACGCcgcgctcccacagactgattgccattaagcgggcctatcgctacagtgacggcccgttttttgttgcctcgctaacgaatcatgactcccttagaacgctatcaag < 1:72447‑M2/148‑107 (MQ=255) ccATGCACCG‑CGTC‑GCTTGT‑TTCG‑CGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGTCATCATCCCCGTCGGGCTTCAGCCTTTCTTCTTTGGTTTCAGGTATTTCATCAACCCCTGGAACCACATCACCAGCGCCGGGTTGCCCTTGATCt < 6:79662/149‑1 (MQ=255) cATGCACCG‑CGTC‑GCTTGT‑TTCG‑CGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGTCATCATCCCCGTCGGGCTTCAGCCTTTCTTCTTTGGTTTCAGGTATTTCATCAACCCCTGGAACCACATCACCAGCGCCGGGTTGCCCTTGATCTg < 4:363185/149‑1 (MQ=255) aTGCACCG‑CGTC‑GCTTGT‑TTCG‑CGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGTCATCATCCCCGTCGGGCTTCAGCCTTTCTTCTTTGGTTTCAGGTATTTCATCAACCCCTGGAACCACATCACCAGCGCCGGGTTGCCCTTGATCTg > 5:303152/1‑148 (MQ=255) aTGCACCG‑CGTC‑GCTTGT‑TTCG‑CGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGTCATCATCCCCGTCGGGCGTCAGCCGTTCTTCTTTGGTTTCAGGTATTTCATCACCCCCTGGAACCACATCACCAGCGCCGGGTTGCCCTTGATCTg > 5:308168/1‑148 (MQ=255) aCCG‑CGTC‑GCTTGT‑TTCG‑CGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGTCATCATCCCCGTCGGGCTTCAGCCTTTCTTCTTTGGTTTCAGGTATTTCATCAACCCCTGGAACCACATCACCAGCGCCGGGTTGCCCTTGATCTGGAtgt > 3:230231/1‑149 (MQ=255) aCCG‑CGTC‑GCTTGT‑TTCG‑CGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGTCATCATCCCCGTCGGGCTTCAGCCTTTCTTCTTTGGTTTCAGGTATTTCATCAACCCCTGGAACCACATCACCAGCGCCGGGTTGCCCTTGATCTGGAtgt < 3:97182/149‑1 (MQ=255) aCCG‑CGTC‑GCTTGT‑TTCG‑CGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGTCATCATCCCCGTCGGGCTTCAGCCTTTCTTCTTTGGTTTCAGGTATTTCATCAACCCCTGGAACCACATCACCAGCGCCGGGTTGCCCTTGATCTGGAtgt < 4:299810/149‑1 (MQ=255) cg‑cgTC‑GCTTGT‑TTCG‑CGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGTCATCATCCCCGTCGGGCTTCAGCCTTTCTTCTTTGGTTTCAGGTATTTCATCAACCCCTGGAACCACATCACCAGCGCCGGGTTGCCCTTGATCTGGATGTGc < 1:223122/149‑1 (MQ=255) cg‑cgTC‑GCTTGT‑TTCG‑CGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGTCATCATCCCCGTCGGGCTTCAGCCTTTCTTCTTTGGTTTCAGGTATTTCATCAACCCCTGGAACCACATCACCAGCGCCGGGTTGCCCTTGATCTGGATGTGc < 4:186817/149‑1 (MQ=255) cg‑cgTC‑GCTTGT‑TTCG‑CGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGTCATCATCCCCGTCGGGCTTCAGCCTTTCTTCTTTGGTTTCAGGTATTTCATCAACCCCTGGAACCACATCACCAGCGCCGGGTTGCCCTTGATCTGGATGTGc < 6:165053/149‑1 (MQ=255) cTTGT‑TTCG‑CGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGTCATCATCCCCGTCGGGCTTCAGCCTTTCTTCTTTGGTTTCAGGTATTTCATCAACCCCTGGAACCACATCACCAGCGCCGGGATGCGATTGATCTGGATGTGCTTGTCCt > 6:249908/1‑149 (MQ=255) ggtgttcg‑cgGGCACGCccgctcccacagactgattgccattaagcgggcctatcgctacagtgacggcccgttttttgttgcctcgctaacgaatcatgactcccttagaacgctatcaagcagatctgaaacgtcccgacttcttcc > 7:225549‑M2/5‑17 (MQ=255) gT‑TTCG‑CGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGTCATCATCCCCGTCGGGCTTCAGCCTTTCTTCTTTGGTTTCAGGTATTTCATCAACCCCTGGAACCACATCACCAGCGCCGGGTTGCCCTTGATCTGGATGTGCTTGTCCTg < 7:42807/147‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |