New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4679619 | 39 (0.650) | 4 (0.070) | 4/248 | NT | 9.3% | coding (338/447 nt) | rnhA | ribonuclease H |
? | NC_002947 | = 4679643 | 41 (0.720) | coding (314/447 nt) | rnhA | ribonuclease H |
ATTGTACCCCAGCTCAACGCTGGGCGCGCACCTCATCGACCCCACGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGTAC‑TGCGAGTCGGTGGTCAGCACCACCTCGCATTCACGCTTGAGC > NC_002947/4679497‑4679783 | aTTGTACCCCAGCTCAACGCTGGGCGCGCACCTCATCGACCCCACGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTgc > 1:130185‑M2/1‑147 (MQ=255) gcgccagcTCAACGCTGGGCGCGCACCTCATCGACCCCACGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGTCCTGCT‑CATCGAGCTGCTgccac < 6:117854‑M2/144‑6 (MQ=255) ccccAGCTCAACGCTGGGCGCGCACCTCATCGACCCCACGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTgccacaag < 5:267584‑M2/149‑9 (MQ=255) cccAGCTCAACGCTGGGCGCGCACCTCATCGACCCCACGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGt > 3:315104/1‑149 (MQ=255) cccAGCTCAACGCTGGGCGCGCACCTCATCGACCCCACGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGt > 2:207084/1‑149 (MQ=255) aaCGCTGGGCGCGCACCTCATCGACCCCACGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGttc < 1:207084/149‑1 (MQ=255) cGCTGGGCGCGCACCTCATCGACCCCACGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGttctt > 8:115911/1‑149 (MQ=255) gggCGCGCACCTCATCGACCCCACGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCAcc > 1:196530/1‑149 (MQ=255) aCCTCATCGACCCCACGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCtt > 6:123326/1‑149 (MQ=255) tCATCGACCCCACGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATCGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTggc > 7:28497/1‑149 (MQ=255) cATCGACCCCACGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGATCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTggcg > 8:266162/1‑149 (MQ=255) tCGACCCCACGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTggcggc > 4:234975/1‑149 (MQ=255) tCGACCCCACGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTggaca > 6:374148/1‑145 (MQ=255) cccACGGTTGGCCAGCTGGTCGGTGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAgctgct < 4:68473/107‑1 (MQ=255) cccACGGTTGGCCAGCTGGTCGGTGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAgctgct > 3:68473/1‑107 (MQ=255) cACGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTTTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTc > 4:267900/1‑149 (MQ=255) aCGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTc > 1:78525/1‑148 (MQ=255) ccAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGc > 7:169947/1‑149 (MQ=255) gTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCttcttc > 6:220704/1‑148 (MQ=255) gcgTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGa < 5:123326/149‑1 (MQ=255) gttGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGAccatc < 2:196530/148‑1 (MQ=255) ttGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGAccatcca > 2:178599/1‑149 (MQ=255) cGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCg > 8:850/1‑149 (MQ=255) ggggTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGt < 7:115911/149‑1 (MQ=255) gggTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGTCCTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGtt < 5:117854/149‑1 (MQ=255) ccAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGcc < 2:78525/149‑1 (MQ=255) aaTATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCt < 7:266162/149‑1 (MQ=255) tatGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTGAATCGACCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCt > 1:88487/1‑148 (MQ=255) cccACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGTAC‑TGc < 6:267584/149‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGTAC‑TGc > 6:45391/1‑148 (MQ=255) ccAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCCTTCGTTGATCCCCTTCATCACGTAC‑TGCGAGTCgg > 2:242587/1‑149 (MQ=255) ccAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGTAC‑TGCGAGTCgg > 6:298188/1‑149 (MQ=255) aGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGTAC‑TGCGAGTCggtg < 8:28497/149‑1 (MQ=255) ggTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTgccacaaggtaacctggaagtgggtgcgcggccatattggccaccccggcaacgaacgcgccgaccagctggccaaccgtggggtcgatgaggtgcgcgcccagcgttgag < 4:231469‑M2/149‑112 (MQ=255) gTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGTAC‑TGCGAGTCggtggt > 8:40050/1‑149 (MQ=255) gTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGTAC‑TGCGAGTCggtggt < 1:178599/149‑1 (MQ=255) cTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTgccacaaggtaacctggaagtgggtgcgcggccatattggccaccccggcaacgaacgcgccgaccagctggccaaccgtggggtcgatgaggtgcgcgcccagcgttgagctgggg < 8:332434‑M2/149‑118 (MQ=255) ttGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTgccacaaggtaacctggaagtgggtgcgcggccatattggccaccccggcaacgaacgcgccgaccagctggccaaccgtggggtcgatgaggtgcgcgcccagcgttgagctgggg < 8:8545‑M2/148‑118 (MQ=255) tgGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGTAC‑TGCGAGTCGGTGGTCAGcacca < 2:203516/148‑1 (MQ=255) ggTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGCTGCCCTTCATCACGTAC‑TGCGAGTCGGTGGTCAGCACCACCTCg > 6:80585/1‑149 (MQ=255) ggTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGTAC‑TGCGAGTCGGTGGTCAGCACCACCTCg > 3:324303/1‑149 (MQ=255) ccTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGTAC‑TGCGAGTCGGTGGTCAGCACCACCTCGCATTCa > 8:143441/1‑149 (MQ=255) cTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGTAC‑TGCGAGTCGGTGGTCAGCACCACCTCGCATTCAc > 6:144421/1‑149 (MQ=255) tGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCAc > 7:153193/1‑110 (MQ=255) tGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCAc < 8:153193/110‑1 (MQ=255) cT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCTTTGGTTGATGCCCTTCATCACGTACTTGCGAGTCGGTGGTCAGCACCACCTCGCATTCAc < 1:242587/147‑1 (MQ=255) aTCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGTAC‑t > 2:333669/1‑110 (MQ=255) aTCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGTAC‑t < 1:333669/110‑1 (MQ=255) aTCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGTAC‑TGCGAGTCGGTGGTCAGCACCACCTCGCATTCACGCTTGa < 5:220704/149‑1 (MQ=255) tCGAGCTGCTgccacaaggtaacctggaagtgggtgcgcggccatattggccaccccggcaacgaacgcgccgaccagctggccaaccgtggggtcgatgaggtgcgcgcccagcgttgagctggggtacaatcgcggcctttgtaacg > 7:8545‑M2/1‑10 (MQ=255) tCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGATCTTCACCGGCTCCTTCGCGGCGGTCTTCCAGCAACTCATCTTACAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGTAC‑TGCCAGTCCGTGGTCATCAACACCTCGCAATCACGCATGAg > 3:21200/1‑149 (MQ=255) gAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGTAC‑TGCGAGTCGGTGGTCAGCACCACCTCGCATTCACGCTTGAGc > 1:368060/1‑148 (MQ=255) | ATTGTACCCCAGCTCAACGCTGGGCGCGCACCTCATCGACCCCACGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCT‑CATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGTAC‑TGCGAGTCGGTGGTCAGCACCACCTCGCATTCACGCTTGAGC > NC_002947/4679497‑4679783 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |