New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5291126 = | 46 (0.760) | 4 (0.070) | 4/256 | NT | 8.2% | coding (724/882 nt) | PP_4664 | LysR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 5291174 = | 45 (0.770) | coding (772/882 nt) | PP_4664 | LysR family transcriptional regulator |
GCAAGCGCTGCACGAGGGGCAGCGCATGCAGGTTCGGGTGCGTGCGGAGGGGTTTGATGGGGTGATCCGCATGGTCGCGGGCGGGGCCGGAATCGGGGTGGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCACCTTTACCGGCTGACGCGCAAGGGCGCACACCACTGTCGAGGCAAACCGCC > NC_002947/5291026‑5291321 | gCAAGCGCTGCACGAGGGGCAGCGCATGCAGGTTCGGGTGCGTGCGGAGGGGTTTGATGGGGTGATCCGCATGGTCGCGGGCGGGGCCGGAATCGGGGTGGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACt > 7:26415/1‑149 (MQ=255) ggtggctaccagttctgcggcatagcccggcaatgccgcaaaatcccgtgcgcacaccagcaaccggcggttggcccatggctcctgcagtgccacccaGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTg > 4:103889‑M1/100‑149 (MQ=255) cAAGCGCTGCACGAGGGGCAGCGCATGCAGGTTCGGGTGCGTGCGGAGGGGTTTGATGGGGTGATCCGCATGGTCGCGGGCGGGGCCGGAATCGGGGTGGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTg > 5:218423/1‑149 (MQ=255) tggctaccagttctgcggcatagcccggcaatgccgcaaaatcccgtgcgcacaccagcaaccggcggttggcccatggctcctgcagtgccacccaGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTggg > 5:123520‑M1/98‑149 (MQ=255) aGCGCTGCACGAGGGGCAGCGCATGCAGGTTCGGGTGCGTGCGGAGGGGTTTGATGGGGTGATCCGCATGGTCGCGGGCGGGGCCGGAATCGGGGTGGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCTCTggg > 8:298386/1‑149 (MQ=255) gcgcTGCACGAGGGGCAGCGCATGCAGGTTCGGGTGCGTGCGGAGGGGTTTGATGGGGTGATCCGCATGGTCGCGGGCGGGTCCGGAATCGGGGTGGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGt < 5:284462/149‑1 (MQ=255) gcTGCACGAGGGGCAGCGCATGCAGGTTCGGGTGCGTGCGGAGGGGTTTGATGGGGTGATCCGCATGGTCGCGGGCGGGGCCGGAATCGGGGTGGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTgg > 4:128824/1‑149 (MQ=255) taccagttctgcggcatagcccggcaatgccgcaaaatcccgtgcgcacaccagcaaccggcggttggcccatggctcctgcagtgccacccaGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGt < 8:197523‑M1/53‑1 (MQ=255) taccagttctgcggcatagcccggcaatgccgcaaaatcccgtgcgcacaccagcaaccggcggttggcccatggctcctgcagtgccacccaGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGt > 7:197523‑M1/94‑146 (MQ=255) gCACGAGGGGCAGCGCATGCAGGTTCGGGTGCGTGCGGAGGGGTTTGATGGGGTGATCCGCATGGTCGCGGGCGGGGCCGGAATCGGGGTGGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCAc < 8:291270/149‑1 (MQ=255) gAGGGGCAGCGCATGCAGGTTCGGGTGCGTGCGGAGGGGTTTGATGGGGTGATCCGCATGGTCGCGGGCGGGGCCGGAATCGGGGTGGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCa < 4:45588/149‑1 (MQ=255) gggCAGCGCATGCAGGTGCGGGTGCGTGCGGAGGGGTTTGATGGGGTGATCCGCATGGTCGCGGGCGGGGCCGGAATCGGGGTGGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGa < 4:111011/149‑1 (MQ=255) gcATGCAGGTTCGGGTGCGTGCGGAGGGGTTTGATGGGGTGATCCGCATGGTCGCGGGCGGGGCCGGAATCGGGGTGGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATgg > 7:193802/1‑149 (MQ=255) gcATGCAGGTTCGGGTGCGTGCGGAGGGGTTTGATGGGGTGATCCGCATGGTCGCGGGCGGGGCCGGAATCGGGGTGGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGACACTGCAGGAGCCATgg > 5:367817/1‑149 (MQ=255) cATGCAGGTTGGGGTGGGTGCGTTTGGGTTTTAGGGGGTGATCGTCTTGTTGGCGGGGGGTGCCGGTTTGGGGTTGGTGCCTCTGGGAGCAGTACAGCGCTGGAAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGTTGTCACTGCAGGAGCCATggg < 8:216270/149‑1 (MQ=255) aGGTTCGGGTGCGTGCGGAGGGGTTTGATGGGGTGATCCGCATGGTCGCGGGCGGGGCCGGAATCGGGGTGGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAAc > 4:47408/1‑149 (MQ=255) gTTCGGGTGCGTGCGGAGGGGTTTGATGGGGTGATCCGCATGGTCGCGGGCGGGGCCGGAATCGGGGTGGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAAccg > 4:32702/1‑149 (MQ=255) gtgcgtgcGGAGGGGTTTGATGGGGTGATCCGCATGGTCGCGGGCGGGGCCGGAATCGGGGTGGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGtt > 6:299302/1‑149 (MQ=255) gtgcgGAGGGGTTTGATGGGGTGATCCGCATGGTCGCGGGCGGGGCCGGAATCGGGGTGGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTg < 8:26415/149‑1 (MQ=255) ggggTTGATGGGGTGATCCGCATGGTCGCGGGCGGGGCCGGAATCGGGGTGGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGc < 7:117402/112‑1 (MQ=255) gggTTTGATGGGGTGATCCGCATGGTCGCGGGCGGGGCCGGATTCGGGGTGGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGATGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCAGTGGGTGGCAATGc > 8:117402/1‑112 (MQ=255) ggTTTGATGGGGTGATCCGCATGGTCGCGGGCGGGGCCGGAATCGGGGTGGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCa > 6:279998/1‑149 (MQ=255) gTTTGATGGGGTGATCCGCATGGTCGCGGGCGGGGCCGTAATCGGGGGGGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCAc < 3:353731/149‑1 (MQ=255) tGGGGTGATCCGCATGGTCGCGGGCGGGGCCGGAATCGGGGTGGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGAtt > 4:172724/1‑149 (MQ=255) tGGGGTGATCCGCATGGTCGCGGGCGGGGCCGGAATCGGGGTGGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGAtt > 6:204047/1‑149 (MQ=255) gTGATCCGCATGGTCGCGGGCGGGGCCGGAATCGGGGTGGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGc > 2:364643/1‑149 (MQ=255) gCATGGTCGCGGGCGGGGCCGGAATCGGGGTGGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTg > 3:136362/1‑149 (MQ=255) gggcgggGCCGGAATCGGGGTGGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATg < 5:279998/149‑1 (MQ=255) gCCGGAATCGGGGTGGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAg > 7:28697/1‑148 (MQ=255) cGGAATCGGGGTGGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAAc < 3:128824/149‑1 (MQ=255) ggAATCGGGGTGGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACGGGGTGACACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATAGCCCGGCAATGCCGCaaaatc < 6:367817/149‑3 (MQ=255) aTCGGGGTGGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGt < 6:240460/149‑1 (MQ=255) tCGGGGTGGTGCCACTGTCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCTCTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTa < 7:298386/149‑1 (MQ=255) tCGGGGTGGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTa < 6:218423/149‑1 (MQ=255) gggTGGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGc > 8:353409/1‑148 (MQ=255) acccagtgcaacggcagcatgccttgccagcgctgtactgctgccagtggcacTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTa < 8:197523‑M2/93‑1 (MQ=255) acccagtgcaacggcagcatgccttgccagcgctgtactgctgccagtggcacTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTa > 7:197523‑M2/54‑146 (MQ=255) cccagtgcaacggcagcatgccttgccagcgctgtactgctgccagtggcacTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCa > 5:123520‑M2/53‑149 (MQ=255) tggtgCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCAcc < 3:172724/149‑1 (MQ=255) cagtgcaacggcagcatgccttgccagcgctgtactgctgccagtggcacTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCAcc > 4:103889‑M2/51‑149 (MQ=255) GTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCACCtt < 4:223381‑M1/149‑1 (MQ=255) TGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCACCtt < 8:170353‑M1/148‑1 (MQ=255) GCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCACCttt < 8:255886‑M1/148‑1 (MQ=255) CCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCGCGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCACCTTTAc < 7:333735‑M1/149‑1 (MQ=255) CCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCACCTTTAc < 4:355413‑M1/149‑1 (MQ=255) CCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCACCTTTAc > 3:223381‑M1/1‑149 (MQ=255) cACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCACCTTTAcc < 1:111791/149‑1 (MQ=255) cTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCACCTTTACCgg < 3:312815/149‑1 (MQ=255) cTGGCAGCAGGACAGCGCTGGCAAGGCTTGCTGCCGTTGCACTTGGTGGCACTGCATGAGCCATGGGCCTACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCACCTTTACCgg < 3:32702/149‑1 (MQ=255) gcagcaGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCGCGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCACCTTTACCGGc < 8:333735/147‑1 (MQ=255) gcagcaGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCACCTTTAc > 6:121207/1‑143 (MQ=255) gcagcaGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCACCTTTAc < 5:121207/143‑1 (MQ=255) gcagcaGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCACCTTTACCGGCt > 4:112393/1‑148 (MQ=255) agcagTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCACCTTTACCGGCTGAc > 3:200237/1‑149 (MQ=255) agcagTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCACCTTTACCGGCTGAc > 2:202482/1‑149 (MQ=255) cagTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCACCTTTACCGGCTGAcgc > 8:84004/1‑149 (MQ=255) cgcTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCACCTTTACCGGCTGACGCGCAAGGgc < 5:204047/149‑1 (MQ=255) gcTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCACCTTTACCGGCTGACGCGCAAGGgcg < 1:202482/149‑1 (MQ=255) gCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCACCTTTACCGGCTGACGCGCAAGGgc < 2:155652/144‑1 (MQ=255) gCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCACCTTTACCGGCTGACGCGCAAGGgc > 1:155652/1‑144 (MQ=255) gCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCACCTTTACCGGCTGACGCGCAAGGGCGca < 1:364643/147‑1 (MQ=255) aaGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCACCTTTACCGGCTGACGCGCAAGGGCGCAcacc < 4:200237/149‑1 (MQ=255) aTGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCACCTTTACCGGCTGACGCGCAAGGGCGCACACCACTGt > 3:207422/1‑149 (MQ=255) ccGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCACCTTTACCGGCTGACGCGCAAGGGCGCACACCACTGTCGAGGc < 2:351114/149‑1 (MQ=255) gTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCACCTTTa > 2:56050/1‑110 (MQ=255) gTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCACCTTTa < 1:56050/110‑1 (MQ=255) ttGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCACCTTTACCGGCTGACGCGCAAGGGCGCACACCACTGTCGAGGCaaa < 7:170353/149‑1 (MQ=255) acTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCACCTTTACCGGCTGACGCGCAAGGGCGCACACCACTGTc > 7:295769‑M2/3‑137 (MQ=255) acTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCACCTTTACCGGCTGACGCGCAAGGGCGCACACCACTGTc < 8:295769‑M2/135‑1 (MQ=255) cTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCACCTTTACCGGCTGACGCGCAAGGGCGCACACCACTGTCGAGGCAAACCGcc < 4:136362‑M2/148‑1 (MQ=255) | GCAAGCGCTGCACGAGGGGCAGCGCATGCAGGTTCGGGTGCGTGCGGAGGGGTTTGATGGGGTGATCCGCATGGTCGCGGGCGGGGCCGGAATCGGGGTGGTGCCACTGGCAGCAGTACAGCGCTGGCAAGGCATGCTGCCGTTGCACTGGGTGGCACTGCAGGAGCCATGGGCCAACCGCCGGTTGCTGGTGTGCGCACGGGATTTTGCGGCATTGCCGGGCTATGCCGCAGAACTGGTAGCCACCTTTACCGGCTGACGCGCAAGGGCGCACACCACTGTCGAGGCAAACCGCC > NC_002947/5291026‑5291321 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |