| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 319049 = | 61 (0.980) | 6 (0.100) | 5/250 | NT | 10.2% | coding (693/1815 nt) | PP_0264 | sensor histidine kinase |
| ? | NC_002947 | 319095 = | 48 (0.820) | coding (647/1815 nt) | PP_0264 | sensor histidine kinase | |||||
GAGCGATCAACCAGCGTGCGCGGGGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTT > NC_002947/318903‑319195 | gAGCGATCAACCAGCGTGCGCGGGGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTg < 8:332155/149‑1 (MQ=255)gAGCGATCAACCAGCGTGCGCGGGGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTg > 1:288899/1‑149 (MQ=255)ccgcggccgtgcgcgaccgcgagcggatcgtcggcgtgctggtggtcaaagtcgatctcgaccacaccgaaaccctgtggggccgtacgcccgagcagctgttgctgaccgatcacaatggcgtggtcatcctgacttcgcggcccgac < 3:91736‑M1/1‑1 (MQ=255) gCGATCAACCAGCGTGCGCGGGGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCGGGGTGATCCAGACCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGg‑c < 4:201356/149‑1 (MQ=255) cggccgtgcgcgaccgcgagcggatcgtcggcgtgctggtggtcaaagtcgatctcgaccacaccgaaaccctgtggggccgtacgcccgagcagctgttgctgaccgatcacaatggcgtggtcatcctgacttcgcggcccgaCTgg > 7:343130‑M1/146‑149 (MQ=255) ggccgtgcgcgaccgcgagcggatcgtcggcgtgctgggggtcaaagtcgatctcgaccacaccgaaaccctgtggggccgtacgcccgagcagctgttgctgaccgatcacaatggcgtggtcatcctgacttggcggcccgacttgc > 6:32313‑M1/145‑146 (MQ=255) cgtgcgcgaccgcgagcggatcgtcggcgtgctggtggtcaaagtcgatctcaaccacaccgaaaccctgtggggccgtacgcccgagcagctgttgctgaccgatcacaatggcgtggtcatcctgacttcgcggcccgaCTGG‑CGCt < 7:106887‑M1/8‑1 (MQ=255) aaCCAGCGTGCGCGGGGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCg < 3:340080/148‑1 (MQ=255) aaCCAGCGTGCGCGGGGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGGCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCg < 2:80236/148‑1 (MQ=255) aCCAGCGTGCGCGGGGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGc > 4:168381/1‑149 (MQ=255) gTGCGCGGGGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGt < 2:288899/149‑1 (MQ=255) gcgagcggatcgtcggcgtgctggtggtcaaagtcgatctcgaccacaccgaaaccctgtggggccgtacgcccgagcagctgttgctgaccgatcacaatggcgtggtcatcctgacttcgcggcccgaCTGG‑CGCTCGGCGTCGGt < 2:387878‑M1/18‑1 (MQ=255) gcgGGGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCg > 8:166720/1‑143 (MQ=255) gcgGGGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCg < 7:166720/143‑1 (MQ=255) ggCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGc < 3:168381/149‑1 (MQ=255) cGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCgg < 7:15996/149‑1 (MQ=255) tGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACg > 2:268974/1‑148 (MQ=255) aCTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGaa < 5:241701/149‑1 (MQ=255) gCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATTG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAgc < 1:84947/148‑1 (MQ=255) ccAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAgcgc < 3:355121/148‑1 (MQ=255) ccAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAgcgc > 5:208776/1‑148 (MQ=255) cAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAgcgc > 3:47372/1‑147 (MQ=255) cAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAgcgc > 4:85725/1‑147 (MQ=255) cAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAgcgc > 1:357177/1‑147 (MQ=255) ccAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCGCGGCGTCGGTCAGGGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTc < 1:12108/149‑1 (MQ=255) cAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCg > 8:33091/1‑149 (MQ=255) aGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCgg < 5:378397/149‑1 (MQ=255) aGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCgg > 2:101643/1‑149 (MQ=255) gTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGGCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCggg < 2:246610/149‑1 (MQ=255) tttCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGGTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGc < 2:127834/149‑1 (MQ=255) agtcgatctcgaccacaccgaaaccctgtggggccgtacgcccgagcagctgttgctgaccgatcacaatggcgtggtcatcctgacttcgcggcccgaCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCgg > 1:387878‑M1/100‑149 (MQ=255) ttCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCggg > 1:341662/1‑147 (MQ=255) cTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAgc > 3:375822/1‑134 (MQ=255) cTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAgc < 4:375822/134‑1 (MQ=255) gATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGaa < 1:278223/148‑1 (MQ=255) ctcgaccacaccgaaaccctgtggggccgtacgcccgagcagctgttgctgaccgatcacaatggcgtggtcatcctgacttcgcggcccgaCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCgg < 8:290275‑M1/50‑1 (MQ=255) ctcgaccacaccgaaaccctgtggggccgtacgcccgagcagctgttgctgaccgatcacaatggcgtggtcatcctgacttcgcggcccgaCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCgg > 7:290275‑M1/93‑142 (MQ=255) tCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAg < 1:268974/149‑1 (MQ=255) gcggggcgggGGGATCCAGGGCGGCGGGGTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCGGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGT‑TG‑ATGGCCTGGAGGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAg < 1:305219/148‑1 (MQ=255) cgGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGAt < 3:85725/149‑1 (MQ=255) gggTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGc > 6:328573/1‑88 (MQ=255) aaccctgtggggccgtacgcccgagcagctgttgctgaccgatcacaatggcgtggtcatcctgacttcgcggcccgaCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGt > 6:232887‑M1/79‑125 (MQ=255) aaccctgtggggccgtacgcccgagcagctgttgctgaccgatcacaatggcgtggtcatcctgacttcgcggcccgaCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGt < 5:232887‑M1/47‑1 (MQ=255) gATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCAt > 6:360417/1‑149 (MQ=255) aTCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCAtt > 1:266736/1‑149 (MQ=255) tCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATtg > 2:169064/1‑149 (MQ=255) tCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATtg > 3:304293/1‑149 (MQ=255) cAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TGTAAGGCCTGG‑GGATCGGCTACGTAAAGCGGCCGGGTAGCACGGAACCGCAAGACGGGCCGCGAAGTCAGAAGTACCACG‑CCATtgt > 1:310594/1‑149 (MQ=255) cAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATtgt > 3:322725/1‑148 (MQ=255) cGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTc < 4:47372/148‑1 (MQ=255) ttGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCa < 8:79520/148‑1 (MQ=255) ttGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTAGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCa > 7:79520/1‑148 (MQ=255) agaACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAg < 1:339436/143‑1 (MQ=255) agaACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAg > 2:339436/1‑143 (MQ=255) agaACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACa < 5:351832/148‑1 (MQ=255) agaACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACa < 4:322725/148‑1 (MQ=255) gaACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAgc > 5:132260/1‑149 (MQ=255) gaACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAgc > 6:159654/1‑149 (MQ=255) ccAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAgctgc > 3:70164/1‑149 (MQ=255) ccAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAgctgc < 2:266736/149‑1 (MQ=255) ccAGCGGCTCTGGGGCCAGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGTCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGCATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTAAGAAACAgctgc > 6:268349/1‑149 (MQ=255) cAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAgctgct > 6:324699/1‑149 (MQ=255) cAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGACAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAgctgct > 8:106887/1‑149 (MQ=255) gggCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACgg > 1:133925/1‑149 (MQ=255) gCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGcc > 3:16061/1‑149 (MQ=255) ccTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCCCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGccc > 2:360803/1‑149 (MQ=255) cTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGccc > 3:42863/1‑148 (MQ=255) gggCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCg < 1:101643/149‑1 (MQ=255) cTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGgtgt < 2:133925/149‑1 (MQ=255) gCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGTAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCga < 6:208776/148‑1 (MQ=255) gCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGCCCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCACCAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTGTCGGTGTGGTc > 6:126161/1‑146 (MQ=255) a‑tg‑atgGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCTAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTc > 2:189568/1‑143 (MQ=255) a‑tg‑atgGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATc < 4:304293/149‑1 (MQ=255) tg‑atgGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCg < 2:357177/149‑1 (MQ=255) ggCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACtt > 4:91736/1‑149 (MQ=255) gCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACttt < 4:42863/149‑1 (MQ=255) ccTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACttt > 8:316750/1‑148 (MQ=255) | GAGCGATCAACCAGCGTGCGCGGGGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGA‑TG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTT > NC_002947/318903‑319195 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |