New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 319049 = | 61 (0.980) | 6 (0.100) | 5/250 | NT | 10.2% | coding (693/1815 nt) | PP_0264 | sensor histidine kinase |
? | NC_002947 | 319095 = | 48 (0.820) | coding (647/1815 nt) | PP_0264 | sensor histidine kinase |
CCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGACCACCAGCACGCCGACGATCCGCTCGCGGTCGCGCACGGCCGCGG > NC_002947/318948‑319242 | ccAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCGCGGCGTCGGTCAGGGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTc < 1:12108/149‑1 (MQ=255) cAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCg > 8:33091/1‑149 (MQ=255) aGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCgg < 5:378397/149‑1 (MQ=255) aGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCgg > 2:101643/1‑149 (MQ=255) gTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGGCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCggg < 2:246610/149‑1 (MQ=255) agtcgatctcgaccacaccgaaaccctgtggggccgtacgcccgagcagctgttgctgaccgatcacaatggcgtggtcatcctgacttcgcggcccgaCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCgg > 1:387878‑M1/100‑149 (MQ=255) tttCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGGTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGc < 2:127834/149‑1 (MQ=255) ttCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCggg > 1:341662/1‑147 (MQ=255) ctcgaccacaccgaaaccctgtggggccgtacgcccgagcagctgttgctgaccgatcacaatggcgtggtcatcctgacttcgcggcccgaCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCgg < 8:290275‑M1/50‑1 (MQ=255) ctcgaccacaccgaaaccctgtggggccgtacgcccgagcagctgttgctgaccgatcacaatggcgtggtcatcctgacttcgcggcccgaCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCgg > 7:290275‑M1/93‑142 (MQ=255) gATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGaa < 1:278223/148‑1 (MQ=255) tCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAg < 1:268974/149‑1 (MQ=255) gcggggcgggGGGATCCAGGGCGGCGGGGTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCGGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGTTG‑ATGGCCTGGAGGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAg < 1:305219/148‑1 (MQ=255) cgGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGAt < 3:85725/149‑1 (MQ=255) aaccctgtggggccgtacgcccgagcagctgttgctgaccgatcacaatggcgtggtcatcctgacttcgcggcccgaCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGt > 6:232887‑M1/79‑125 (MQ=255) aaccctgtggggccgtacgcccgagcagctgttgctgaccgatcacaatggcgtggtcatcctgacttcgcggcccgaCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGt < 5:232887‑M1/47‑1 (MQ=255) gATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCAt > 6:360417/1‑149 (MQ=255) aTCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCAtt > 1:266736/1‑149 (MQ=255) tCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATtg > 2:169064/1‑149 (MQ=255) tCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATtg > 3:304293/1‑149 (MQ=255) cAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGTAAGGCCTGG‑GGATCGGCTACGTAAAGCGGCCGGGTAGCACGGAACCGCAAGACGGGCCGCGAAGTCAGAAGTACCACG‑CCATtgt > 1:310594/1‑149 (MQ=255) cAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATtgt > 3:322725/1‑148 (MQ=255) cGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTc < 4:47372/148‑1 (MQ=255) ttGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCa < 8:79520/148‑1 (MQ=255) ttGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTAGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCa > 7:79520/1‑148 (MQ=255) agaACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAg < 1:339436/143‑1 (MQ=255) agaACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAg > 2:339436/1‑143 (MQ=255) agaACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACa < 5:351832/148‑1 (MQ=255) agaACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACa < 4:322725/148‑1 (MQ=255) gaACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAgc > 6:159654/1‑149 (MQ=255) gaACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAgc > 5:132260/1‑149 (MQ=255) ccAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAgctgc > 3:70164/1‑149 (MQ=255) ccAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAgctgc < 2:266736/149‑1 (MQ=255) ccAGCGGCTCTGGGGCCAGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGTCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGCATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTAAGAAACAgctgc > 6:268349/1‑149 (MQ=255) cAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAgctgct > 6:324699/1‑149 (MQ=255) cAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGACAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAgctgct > 8:106887/1‑149 (MQ=255) gggCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACgg > 1:133925/1‑149 (MQ=255) gCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGcc > 3:16061/1‑149 (MQ=255) ccTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCCCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGccc > 2:360803/1‑149 (MQ=255) cTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGccc > 3:42863/1‑148 (MQ=255) gggCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCg < 1:101643/149‑1 (MQ=255) cTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGgtgt < 2:133925/149‑1 (MQ=255) gCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGTAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCga < 6:208776/148‑1 (MQ=255) gCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGCCCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCACCAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTGTCGGTGTGGTc > 6:126161/1‑146 (MQ=255) atg‑atgGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCTAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTc > 2:189568/1‑143 (MQ=255) atg‑atgGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATc < 4:304293/149‑1 (MQ=255) tg‑atgGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCg < 2:357177/149‑1 (MQ=255) ggCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACtt > 4:91736/1‑149 (MQ=255) ccgactggcgcttccgtgctacccgcacgctgaccgacgccgagcgccagTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCgag > 7:290275‑M2/51‑142 (MQ=255) ccgactggcgcttccgtgctacccgcacgctgaccgacgccgagcgccagTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCgag < 8:290275‑M2/92‑1 (MQ=255) ccgactggcgcttccgtgctacccgcacgctgaccgacgccgagcgccagTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACt > 1:387878‑M2/51‑149 (MQ=255) gCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACttt < 4:42863/149‑1 (MQ=255) ccTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACttt > 8:316750/1‑148 (MQ=255) actggcgcttccgtgctacccgcacgctgaccgacgccgagcgccagTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGtt < 5:232887‑M2/78‑1 (MQ=255) actggcgcttccgtgctacccgcacgctgaccgacgccgagcgccagTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGtt > 6:232887‑M2/48‑125 (MQ=255) TGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGgt > 8:126722‑M1/1‑128 (MQ=255) TGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGgt < 7:126722‑M1/128‑1 (MQ=255) TGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGac < 4:333813‑M1/149‑1 (MQ=255) G‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGa > 5:375200‑M1/1‑146 (MQ=255) G‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGa < 6:375200‑M1/146‑1 (MQ=255) CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGaccac > 2:310594‑M1/1‑149 (MQ=255) CTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGaccac < 7:6225‑M1/147‑1 (MQ=255) CTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGAccacca > 7:316750‑M1/1‑149 (MQ=255) ggTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGACCACCAGCACGCcga > 6:293353/1‑149 (MQ=255) gTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGACCACCAGCACGCcgac < 5:159654/149‑1 (MQ=255) tCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGAGCACCAGCACGCcgac > 7:44896/1‑148 (MQ=255) aGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGACCACCAGCACGCCGACGAt < 1:169064/149‑1 (MQ=255) gCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGACCACCAGCACGCCGACGATc > 7:121146/1‑149 (MQ=255) gCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCgg > 3:124731/1‑80 (MQ=255) gCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCgg < 4:124731/80‑1 (MQ=255) gggTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGACCACCAGCACGCCGACGATCCGCTcg < 4:16061/149‑1 (MQ=255) ggTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGACCACCAGCACGCCGACGATCCGCTcgc < 7:33091/149‑1 (MQ=255) accgacgccgagcgccagTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGACCACCAGCACGCCGACGATCCGCTcgc < 2:387878‑M2/130‑1 (MQ=255) aCGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGACCACCAGCACGCCGACGATCCGCTCGCGGTcgc > 2:238172/1‑149 (MQ=255) cGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACCGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGACCACCAGCACGCCGACGATCCGCTCGCGGTcgcg > 6:296383/1‑149 (MQ=255) ggAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGACCACCAGCACGCCGACGATCCGCTCGCGGTcgcg > 6:247830/1‑148 (MQ=255) aaGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCGCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGACCACCAGCACGCCGACGATCCGCTCGCGGTCGCGCAc < 5:324699/149‑1 (MQ=255) aaGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGACCACCAGCACGCCGACGATCCGCTCGCGGTCGCGCAc > 3:49822/1‑149 (MQ=255) agcgccagTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTTGAGATCGACTTTGACCACCAGCACGCCGACGATCCGCTCGCGGTCGCGCACg < 7:106887‑M2/141‑1 (MQ=255) gcaagTCGGGCCGCCAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGACCCCCAGCACGCCGACGATCCGCTCGCGGTCGCGCACGGcc > 6:32313‑M2/6‑149 (MQ=255) ccagTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGACCACCAGCACGCCGACGATCCGCTCGCGGTCGCGCACGGCcg > 7:343130‑M2/5‑149 (MQ=255) gTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGACCACCAGCACGCCGACGATCCGCTCGCGGTCGCGCACGGCCGCgg < 3:91736‑M2/148‑1 (MQ=255) | CCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATG‑ATGGCCTGG‑CGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACG‑CCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGACCACCAGCACGCCGACGATCCGCTCGCGGTCGCGCACGGCCGCGG > NC_002947/318948‑319242 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |