| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1210993 = | 76 (1.230) | 4 (0.070) | 4/258 | NT | 5.0% | coding (1474/1620 nt) | PP_1060 | glutamate synthase large subunit |
| ? | NC_002947 | 1211074 = | 77 (1.280) | coding (1393/1620 nt) | PP_1060 | glutamate synthase large subunit | |||||
TCTCAGGCCGCCACTTCGCTGTGCGGCTCGAAACTGTCCGCCCGGGCCAGTTGCCACATCCGCGAATAGAACTGGCCGTTCACCTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGG > NC_002947/1210845‑1211124 | gccatcggctgcatccagtcgcaaagctgccacaccaacaaatgcccgaccggcgtggccacgcaagatccgctgcgccagcgcgcgctggtggtgcccgacaaagcccagcgggtgctgaacttccatcacaacacgttgcgtgcctt > 5:2935‑M1/149‑149 (MQ=255) atcggctgcatccagtcgcaaagctgccacaccaacaaatgcccgaccggcgtggccacgcaagatccgctgcgccagcgcgcgctggtggtgcccgacaaagcccagcgggtgctgaacttccatcacaacacgttgcgtgcctTgg < 1:219461‑M1/3‑1 (MQ=255) tcggctgcatccagtcgcaaagctgccacaccaacaaatgcccgaccggcgtggccacgcaagatccgctgcgccagcgcgcgctggtggtgcccgacaaagcccagcgggtgctgaacttccatcacaacacgttgcgtgcctTgg < 8:284790‑M1/3‑1 (MQ=255) aGGCCGCCACTTCGCTGTGCGGCTCGAAACTGTCCGCCCGGGCCAGTTGCCACATCCGCGAATAGAACTGGCCGTTCACCTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGcc > 2:387198/1‑149 (MQ=255) cgccACTTCGCTGTGAGGCTCGAAACTGTCCGCCCGGGCCAGTTGCCACATCCGCGAATAGAACTGGAAGTTAACATCGCCGGTCAGCAGATAACCTGGCATCAAGCACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGaa > 2:65421/1‑148 (MQ=255) cTTCGCTGTGCGGCTCGAAACTGTCCGCCCGGGCCAGTTGCCACATCCGCGAATAGAACTGGCCGTTCACCTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATgcgc < 7:322461/149‑1 (MQ=255) cagtcgcaaagctgccacaccaacaaatgcccgaccggcgtggccacgcaagatccgctgcgccagcgcgcgctggtggtgcccgacaaagcccagcgggtgctgaacttccatcacaacacgttgcgtgcctTGGc > 3:259511‑M1/134‑137 (MQ=255) cagtcgcaaagctgccacaccaacaaatgcccgaccggcgtggccacgcaagatccgctgcgccagcgcgcgctggtggtgcccgacaaagcccagcgggtgctgaacttccatcacaacacgttgcgtgcctTGGc < 4:259511‑M1/4‑1 (MQ=255) cGCTGTGCGGCTCGAAACTGTCCGCCCGGGCCAGTTGCCACATCCGCGAATAGAACTGGCCGTTCACCTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGcgccg > 3:353561/1‑148 (MQ=255) tgCGGCTCGAAACTGTCCGCCCGGGCCAGTTGCCACATCCGCGAATAGAACTGGCCGTTCACCTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAg < 7:198982/149‑1 (MQ=255) gAAACTGTCCGCCCGGGCCAGTTGCCACATCCGCGAATAGAACTGGCCGTTCACCTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTgg > 3:172275/1‑149 (MQ=255) gAAACTGTCCGCCCGGGCCAGTTGCCACATCCGCGAATAGAACTGGCCGTTCACCTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTg < 4:13318/148‑1 (MQ=255) gAAACTGTCCGCCCGGGCCAGTTGCCACATCCGCGAATAGAACTGGCCGTTCACCTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTg < 5:271709/148‑1 (MQ=255) gAAACTGTCCGCCCGGGCCAGTTGCCACATCCGCGAATAGAACTGGCCGTTCACCTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTg < 1:387198/148‑1 (MQ=255) aaaCTGTCCCCCCGGGCCAGTTGCCACATCCGCGAATAGAACTGGCCGTTCACCTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTACAAGAACACATGCATCTGAGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAAAGCGCCGCACCAGGTGCTTGGc > 6:303505/1‑149 (MQ=255) aaCTGTCCGCCCGGGCCAGTTGCCACATCCGCGAATAGAACTGGCCGTTCACCTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGcc > 8:324332/1‑149 (MQ=255) cccGGGCCAGTTGCCACATCCGCGAATAGAACTGGCCGTTCACCTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGtt > 5:389600/1‑147 (MQ=255) cccGGGCCAGTTGCCACATCCGCGAATAGAACTGGCCGTTCACCTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGtt < 6:389600/147‑1 (MQ=255) ggCCAGTTGCCACATCCGCGAATAGAACTGGCCGTTCACCTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCg > 7:104930/1‑149 (MQ=255) ccAGTTGCCACATCCGCGAATAGAACTGGCCGTTCACCTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGa < 7:324332/149‑1 (MQ=255) gTTGCCACATCCGCGAATAGAACTGGACGTTCACCTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACAAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGc > 5:307977/1‑149 (MQ=255) tGCCACATCCGCGAATAGAACTGGCCGTTCACCTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTc > 6:294721/1‑149 (MQ=255) gcgtggccacgcaagatccgctgcgccagcgcgcgctggtggtgcccgacaaagcccagcgggtgctgaacttccatcacaacacgttgcgtgcctTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTc < 5:316136‑M1/52‑1 (MQ=255) gCCACATCCGCGAATAGAACTGGCCGTTCACCTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCAcc > 2:248956/1‑116 (MQ=255) gCCACATCCGCGAATAGAACTGGCCGTTCACCTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCAcc < 1:248956/116‑1 (MQ=255) gCCACATCCGCGAATAGAACTGGCCGTTCACCTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTc < 6:86342/148‑1 (MQ=255) ccACATCCGCGAATAGAACTGGCCGTTCACCTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTc > 2:105409/1‑147 (MQ=255) caTCCGCGAATAGAACTGGCCGTTCACCTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGc < 4:172275/149‑1 (MQ=255) tCCGCGAATAGAACTGGCCGTTCACCTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCt > 2:81759/1‑149 (MQ=255) cgcgAATAGAACTGGCCGTTCACCTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGt < 8:238749/89‑1 (MQ=255) cgcgAATAGAACTGGCCGTTCACCTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGt > 7:238749/1‑89 (MQ=255) gcgAATAGAACTGGCCGTTCACCTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTg > 7:319637/1‑116 (MQ=255) gcgAATAGAACTGGCCGTTCACCTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTg < 8:319637/116‑1 (MQ=255) tAGAACTGGCCGTTCACCTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTc < 4:336829/134‑1 (MQ=255) tAGAACTGGCCGTTCACCTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTc > 3:336829/1‑134 (MQ=255) gAACTGGCCGTTCACCTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCa < 6:165121/149‑1 (MQ=255) cTGGCCGTTCACCTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTTGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACATCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTTTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCa < 1:65421/149‑1 (MQ=255) gggCCGGTCACCTCGCCGGTCAGCATCTCACCTGGCTTCAAGACCACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGGGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCAt < 4:233420/148‑1 (MQ=255) ttCACCTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGc > 5:301855/1‑149 (MQ=255) cagcgcgcgctggtggtgcccgacaaagcccagcgggtgctgaacttccatcacaacacgttgcgtgcctTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGc > 6:316136‑M1/71‑149 (MQ=255) agcgcgcgctggtggtgcccgacaaagcccagcgggtgctgaacttccatcacaacacgttgcgtgcctTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGcc > 6:94327‑M1/70‑149 (MQ=255) cTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCCGCATTTCTGCCAAgg > 2:259882/1‑149 (MQ=255) cTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCaa > 4:4933/1‑147 (MQ=255) cTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCaa < 3:4933/147‑1 (MQ=255) tCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCg > 4:83460/1‑109 (MQ=255) tCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCg < 3:83460/109‑1 (MQ=255) gcgctggtggtgcccgacaaagcccagcgggtgctgaacttccatcacaacacgttgcgtgcctTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGc > 8:198800‑M1/65‑149 (MQ=255) gCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGc < 4:85287/147‑1 (MQ=255) gCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCAc < 5:290278/149‑1 (MQ=255) gCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGACCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCaa > 7:346644/1‑148 (MQ=255) cccGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGTCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGc < 8:346644/146‑1 (MQ=255) ccGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACg > 6:243453/1‑149 (MQ=255) tCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAAc < 1:105409/149‑1 (MQ=255) gcagcTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACgtg < 5:294721/149‑1 (MQ=255) gcagcTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACgtg > 5:314883/1‑149 (MQ=255) cagcTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACgtgt > 4:264776/1‑149 (MQ=255) cagcTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACgtgt > 6:221959/1‑149 (MQ=255) agcTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGtgtt < 6:301855/149‑1 (MQ=255) agcTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGtgtt < 4:14642/149‑1 (MQ=255) gcTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGtgttg < 2:116596/149‑1 (MQ=255) gcTCACCTGGCTTCAAGAACAAATGCATCTGCGAGAAGAGGTTGATTTCGGTGGACGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCGAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCTACGtgttg < 5:289041/149‑1 (MQ=255) cACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATg > 1:200545/1‑97 (MQ=255) cACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATg < 2:200545/97‑1 (MQ=255) aCCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGAt < 5:157283/149‑1 (MQ=255) ttCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGAt < 3:249083/142‑1 (MQ=255) ttCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGAt > 4:249083/1‑142 (MQ=255) ttCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGtt > 6:167492/1‑149 (MQ=255) cAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGtt < 4:353561/147‑1 (MQ=255) cAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGtt < 1:81759/147‑1 (MQ=255) aaGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCa < 2:180943/148‑1 (MQ=255) aaGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGACAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAg > 4:300416/1‑149 (MQ=255) aGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAg > 1:364478/1‑148 (MQ=255) gAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCCCCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGAGGTGTGATGGAAGTTCAGCa > 4:362763/1‑149 (MQ=255) cacaTGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCAc > 8:274271/1‑147 (MQ=255) acaTGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCg > 2:253373/1‑149 (MQ=255) acaTGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCg > 2:71516/1‑149 (MQ=255) caTGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGc < 8:104930/149‑1 (MQ=255) aTGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCt > 5:148864/1‑149 (MQ=255) aTCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCt > 3:83552/1‑102 (MQ=255) aTCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCt < 4:83552/102‑1 (MQ=255) aTCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGc > 8:126218/1‑149 (MQ=255) cGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCATCACCCGCTGGGCttt < 6:314883/147‑1 (MQ=255) gagaACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTc < 5:221959/149‑1 (MQ=255) agaACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCg < 6:148864/149‑1 (MQ=255) gaACAGCTTGTTTTAGGTGGCCGAATTGCGCCGCACCTGGTGCTTGGCATCCAGTTGTGCCGTATTCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCgg < 5:303505/149‑1 (MQ=255) gaACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCgg < 5:243453/149‑1 (MQ=255) aTTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTg > 7:47549/1‑135 (MQ=255) aTTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTg < 8:47549/135‑1 (MQ=255) | TCTCAGGCCGCCACTTCGCTGTGCGGCTCGAAACTGTCCGCCCGGGCCAGTTGCCACATCCGCGAATAGAACTGGCCGTTCACCTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGG > NC_002947/1210845‑1211124 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |