New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 1210993 = | 76 (1.230) | 4 (0.070) | 4/258 | NT | 5.0% | coding (1474/1620 nt) | PP_1060 | glutamate synthase large subunit |
? | NC_002947 | 1211074 = | 77 (1.280) | coding (1393/1620 nt) | PP_1060 | glutamate synthase large subunit |
CTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGC > NC_002947/1210928‑1211221 | cTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCCGCATTTCTGCCAAgg > 2:259882/1‑149 (MQ=255) cTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCaa > 4:4933/1‑147 (MQ=255) cTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCaa < 3:4933/147‑1 (MQ=255) gcgctggtggtgcccgacaaagcccagcgggtgctgaacttccatcacaacacgttgcgtgcctTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGc > 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tCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAAc < 1:105409/149‑1 (MQ=255) gcagcTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACgtg < 5:294721/149‑1 (MQ=255) gcagcTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACgtg > 5:314883/1‑149 (MQ=255) cagcTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACgtgt > 4:264776/1‑149 (MQ=255) cagcTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACgtgt > 6:221959/1‑149 (MQ=255) 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cAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTgg > 5:295349/1‑148 (MQ=255) cAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGc < 1:385302/149‑1 (MQ=255) cAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGc < 2:320644/149‑1 (MQ=255) aGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCa < 4:203709/149‑1 (MQ=255) gCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGc < 2:92413/149‑1 (MQ=255) cTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCtt > 5:163816/1‑149 (MQ=255) ccgccgccAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCttt < 8:118275/147‑1 (MQ=255) ccgccgccAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCttt < 6:295349/147‑1 (MQ=255) cgccgccAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCg < 6:51383/149‑1 (MQ=255) cgccAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACt < 3:297683/149‑1 (MQ=255) gccAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGgt < 3:373177/131‑1 (MQ=255) gccAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGgt > 4:373177/1‑131 (MQ=255) cAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGa > 7:39488/1‑149 (MQ=255) cAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTGGGCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGGGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGa < 2:364478/149‑1 (MQ=255) ttCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGc > 8:176799/1‑149 (MQ=255) gccaAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTg > 3:259511‑M2/5‑137 (MQ=255) gccaAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTg < 4:259511‑M2/133‑1 (MQ=255) ccaAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGa < 8:284790‑M2/144‑1 (MQ=255) ccaAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGAt < 1:219461‑M2/145‑1 (MQ=255) aAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGc > 5:2935‑M2/2‑149 (MQ=255) | CTCGCCGGTCAGCAGCTCACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCCAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGC > NC_002947/1210928‑1211221 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |