| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1880754 = | 70 (1.130) | 4 (0.070) | 4/256 | NT | 5.8% | coding (428/930 nt) | PP_1688 | LysR family transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | 1880799 = | 63 (1.060) | coding (473/930 nt) | PP_1688 | LysR family transcriptional regulator | |||||
TGCATCGCCTCGACCTCTGCCTTTGGGCGCCATGTGCTGGCGCCGTTGATACCTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTT > NC_002947/1880609‑1880901 | tgCATCGCCTCGACCTCTGCCTTTGGGCGCCATGTGCTGGCGCCGTTGATACCTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTgc < 3:190486/148‑1 (MQ=255) gcatgaagccccagcgcaagaagcggccatccaccggatagcgaaacaccaggcaacggtgcccgcgcaaggcctcgggcgtggcaggtacgccagcgctctgcaggtaaccgggtgaggcacaacaaatgaacgggatgcgggcgaTg < 1:202411‑M1/2‑1 (MQ=255) catgaagccccagcgcaagaagcggccatccaccggatagcgaaacaccaggcaacggtgcccgcgcaaggcctcgggcgtggtaggtacgccagcgctctgcaggtaaccgggtgaggcacaacaaatgaacgggatgcgggcgaTgc > 1:115900‑M1/147‑149 (MQ=255) tgaagccccagcgcaagaagcggccatccaccggatagcgaaacaccaggcaacggtgcccgcgcaaggcctcgggcgtggcaggtacgccagcgctctgcaggtaaccgggtgaggcacaacaaatgaacgggatgcgggcgaTgcgc > 4:195971‑M1/145‑149 (MQ=255) tgaagccccagcgcaagaagcggccatccaccggatagcgaaacaccaggcaacggtgcccgcgcaaggcctcgggcgtggcaggtacgccagcgctctgcaggtaaccgggtgaggcacaacaaatgaacgggatgcgggcgaTgcgc > 8:39010‑M1/145‑149 (MQ=255) ccTCGACCTCTGCCTTTGGGCGCCATGTGCTGGCGCCGTTGATACCTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGcc > 7:356051/1‑149 (MQ=255) aCCTCTGCCTTTGGGCGCCATGTGCTGGCGCCGTTGATACCTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCa < 2:367877/149‑1 (MQ=255) ctctGCCTTTGGGCGCCATGTGCTGGCGCCGTTGATACCTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGc > 6:71660/1‑149 (MQ=255) ctctGCCTTTGGGCGCCATGTGCTGGCGCCGTTGATACCTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGc > 2:202411/1‑149 (MQ=255) tctGCCTTTGGGCGCCATGTGCTGGCGCCGTTGATACCTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTCTGTGGTAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCg > 1:121607/1‑147 (MQ=255) caagaagcggccatccaccggatagcgaaacaccaggcaacggtgcccgcgcaaggcctcgggcgtggcaggtacgccagcgctctgcaggtaaccgggtgaggcacaacaaatgaacgggatgcgggcgaTGCGCATTGCCCCGCAGc < 5:4852‑M1/18‑1 (MQ=255) ccTTTGGGCGCCATGTGCTGGCGCCGTTGATACCTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGaa < 3:260851/149‑1 (MQ=255) cTTTGGGCGCCATGTGCTGGCGCCGTTGATACCTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCg > 7:282205/1‑146 (MQ=255) ggCGCCATGTGCTGGCGCCGTTGATACCTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAg < 4:367151/149‑1 (MQ=255) ggCGCCATGTGCTGGCGCCGTTGATACCTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAg < 4:320539/149‑1 (MQ=255) cATGTGCTGGCGCCGTTGATACCTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTTACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAgctgct > 1:18709/1‑149 (MQ=255) cATGTGCTGGCGCCGTTGATACCTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAgctgct > 5:39272/1‑149 (MQ=255) cATGTGCTGGCGCCGTTGATACCTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAgctgct < 5:355874/149‑1 (MQ=255) aTGTGCTGGCGCCGTTGATACCTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGctgctg < 1:365562/149‑1 (MQ=255) aTGTGCTGGCGCCGTTGATACCTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGctgctg < 7:68122/149‑1 (MQ=255) cTGGCGCCGTTGATACCTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCg > 6:96862/1‑149 (MQ=255) ccGTTGATACCTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCAt > 1:347788/1‑149 (MQ=255) cGTTGATACCTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTAAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATc > 7:245039/1‑149 (MQ=255) aaacaccaggcaacggtgcccgcgcaaggcctcgggcgtggcaggtacgccagcgctctgcaggtaaccgggtgaggcacaacaaatgaacgggatgcgggcgaTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCa < 4:256583‑M1/45‑1 (MQ=255) ttGATACCTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGc < 1:67137/149‑1 (MQ=255) gATACCTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGccc > 8:92152/1‑149 (MQ=255) accaggcaacggtgcccgcgcaaggcctcgggcgtggcaggtacgccagcgctctgcaggtaaccgggtgaggcacaacaaatgaacgggatgcgggcgaTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGc > 3:256583‑M1/101‑149 (MQ=255) aTACCTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGccc < 6:299552/148‑1 (MQ=255) aTACCTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCg > 6:236011/1‑149 (MQ=255) ccaggcaacggtgcccgcgcaaggcctcgggcgtggcaggtacgccagcgctctgcaggtaaccgggtgaggcacaacaaatgaacgggatgcgggcgaTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGcc > 6:4852‑M1/100‑149 (MQ=255) cTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATc > 4:261071/1‑149 (MQ=255) cTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATc > 1:346101/1‑149 (MQ=255) aGTGCCCGCTACCCTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCAt > 7:87410/1‑149 (MQ=255) tGCCCGCTACCCTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCAttt < 8:282205/149‑1 (MQ=255) ccGCTACCCTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATttgtt < 5:236011/149‑1 (MQ=255) cGCTACCCTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGGGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATttgttg < 6:162662/149‑1 (MQ=255) gCTACCCTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTtgttgt < 5:71660/149‑1 (MQ=255) cTACCCTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTtgtg < 2:346101/149‑1 (MQ=255) cTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGc > 3:295057/1‑125 (MQ=255) cTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGc < 4:295057/125‑1 (MQ=255) cTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCa > 1:142005/1‑149 (MQ=255) cTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCa > 3:285222/1‑149 (MQ=255) tttACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCAc > 5:65493/1‑149 (MQ=255) tACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCAcc < 1:381700/148‑1 (MQ=255) cTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCTCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCgg < 6:39272/149‑1 (MQ=255) gATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCAt < 5:24559/117‑1 (MQ=255) gATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCAt > 6:24559/1‑117 (MQ=255) gATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTAca > 1:903/1‑148 (MQ=255) tAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTg > 8:131351/1‑149 (MQ=255) gagTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGtt > 5:297515/1‑142 (MQ=255) gagTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGtt < 6:297515/142‑1 (MQ=255) gTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAgcgc > 3:244695/1‑149 (MQ=255) tAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCt > 7:120449/1‑149 (MQ=255) gACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGtt < 8:279267/108‑1 (MQ=255) gACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGtt > 7:279267/1‑108 (MQ=255) aCTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCAGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTAACCTGCAGAGCGCTGGCg > 7:139165/1‑148 (MQ=255) aTCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCTTCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTAc < 3:9189/147‑1 (MQ=255) aTCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGGTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCATCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCAGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTAc < 6:321031/147‑1 (MQ=255) aagtcgGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTg < 3:59789/147‑1 (MQ=255) gtcgGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTAcc < 8:297705/126‑1 (MQ=255) gtcgGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTAcc > 7:297705/1‑126 (MQ=255) gtcgGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCt > 4:177928/1‑146 (MQ=255) gtcgGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCt < 3:177928/146‑1 (MQ=255) gtcgGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGcc < 7:293022/149‑1 (MQ=255) gtcgGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGc < 3:261071/148‑1 (MQ=255) tcgGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCa > 6:17707/1‑149 (MQ=255) tcgGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCa > 7:143426/1‑149 (MQ=255) gggTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACg > 3:139176/1‑149 (MQ=255) tAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGccc > 3:243312/1‑148 (MQ=255) aCCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAg < 5:17707/149‑1 (MQ=255) gCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCtt > 8:142955/1‑149 (MQ=255) cccGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCtt < 7:131351/148‑1 (MQ=255) ccGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCTTTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTgc < 2:18709/149‑1 (MQ=255) ccGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCCGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGACACGCCCGCGGCCTTgc > 8:342165/1‑149 (MQ=255) ccGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAggagatg > 3:5654/1‑143 (MQ=255) aaGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCgg < 2:121607/148‑1 (MQ=255) cGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCAcc < 5:96862/149‑1 (MQ=255) aCGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGc < 7:142955/149‑1 (MQ=255) tGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACGCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTg < 6:65493/149‑1 (MQ=255) aGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGgt < 8:120449/149‑1 (MQ=255) cTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGtt < 1:313421/149‑1 (MQ=255) | TGCATCGCCTCGACCTCTGCCTTTGGGCGCCATGTGCTGGCGCCGTTGATACCTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTC‑‑‑GATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTT > NC_002947/1880609‑1880901 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |