New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1880754 = | 70 (1.130) | 4 (0.070) | 4/256 | NT | 5.8% | coding (428/930 nt) | PP_1688 | LysR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 1880799 = | 63 (1.060) | coding (473/930 nt) | PP_1688 | LysR family transcriptional regulator |
CCGTTGATACCTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTCGATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTGGGGCTTCATGCGG > NC_002947/1880651‑1880947 | ccGTTGATACCTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTCGATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCAt > 1:347788/1‑149 (MQ=255) cGTTGATACCTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTCGATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTAAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATc > 7:245039/1‑149 (MQ=255) ttGATACCTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTCGATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGc < 1:67137/149‑1 (MQ=255) accaggcaacggtgcccgcgcaaggcctcgggcgtggcaggtacgccagcgctctgcaggtaaccgggtgaggcacaacaaatgaacgggatgcgggcgaTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGc > 3:256583‑M1/101‑149 (MQ=255) ccaggcaacggtgcccgcgcaaggcctcgggcgtggcaggtacgccagcgctctgcaggtaaccgggtgaggcacaacaaatgaacgggatgcgggcgaTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGcc > 6:4852‑M1/100‑149 (MQ=255) gATACCTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTCGATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGccc > 8:92152/1‑149 (MQ=255) aTACCTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTCGATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGccc < 6:299552/148‑1 (MQ=255) aTACCTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTCGATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCg > 6:236011/1‑149 (MQ=255) cTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTCGATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATc > 1:346101/1‑149 (MQ=255) cTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTCGATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATc > 4:261071/1‑149 (MQ=255) aGTGCCCGCTACCCTTTACTTTCGATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCAt > 7:87410/1‑149 (MQ=255) tGCCCGCTACCCTTTACTTTCGATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCAttt < 8:282205/149‑1 (MQ=255) ccGCTACCCTTTACTTTCGATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATttgtt < 5:236011/149‑1 (MQ=255) cGCTACCCTTTACTTTCGATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGGGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATttgttg < 6:162662/149‑1 (MQ=255) gCTACCCTTTACTTTCGATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTtgttgt < 5:71660/149‑1 (MQ=255) cTACCCTTTACTTTCGATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTtgtg < 2:346101/149‑1 (MQ=255) cTTTACTTTCGATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGc > 3:295057/1‑125 (MQ=255) cTTTACTTTCGATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGc < 4:295057/125‑1 (MQ=255) cTTTACTTTCGATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCa > 1:142005/1‑149 (MQ=255) cTTTACTTTCGATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCa > 3:285222/1‑149 (MQ=255) tttACTTTCGATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCAc > 5:65493/1‑149 (MQ=255) tACTTTCGATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCAcc < 1:381700/148‑1 (MQ=255) cTTTCGATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCTCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCgg < 6:39272/149‑1 (MQ=255) gATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCAt > 6:24559/1‑117 (MQ=255) gATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCAt < 5:24559/117‑1 (MQ=255) gATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTAca > 1:903/1‑148 (MQ=255) tAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTg > 8:131351/1‑149 (MQ=255) gagTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGtt > 5:297515/1‑142 (MQ=255) gagTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGtt < 6:297515/142‑1 (MQ=255) gTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAgcgc > 3:244695/1‑149 (MQ=255) tAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCt > 7:120449/1‑149 (MQ=255) gACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGtt < 8:279267/108‑1 (MQ=255) gACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGtt > 7:279267/1‑108 (MQ=255) aCTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCAGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTAACCTGCAGAGCGCTGGCg > 7:139165/1‑148 (MQ=255) aTCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCTTCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTAc < 3:9189/147‑1 (MQ=255) aTCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGGTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCATCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCAGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTAc < 6:321031/147‑1 (MQ=255) aagtcgGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTg < 3:59789/147‑1 (MQ=255) gtcgGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTAcc > 7:297705/1‑126 (MQ=255) gtcgGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTAcc < 8:297705/126‑1 (MQ=255) gtcgGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCt > 4:177928/1‑146 (MQ=255) gtcgGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCt < 3:177928/146‑1 (MQ=255) gtcgGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGcc < 7:293022/149‑1 (MQ=255) gtcgGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGc < 3:261071/148‑1 (MQ=255) tcgGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCa > 6:17707/1‑149 (MQ=255) tcgGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCa > 7:143426/1‑149 (MQ=255) gggTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACg > 3:139176/1‑149 (MQ=255) tAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGccc > 3:243312/1‑148 (MQ=255) aCCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAg < 5:17707/149‑1 (MQ=255) gCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCtt > 8:142955/1‑149 (MQ=255) cccGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCtt < 7:131351/148‑1 (MQ=255) ccGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCTTTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTgc < 2:18709/149‑1 (MQ=255) ccGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCCGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGACACGCCCGCGGCCTTgc > 8:342165/1‑149 (MQ=255) ccGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAggagatg > 3:5654/1‑143 (MQ=255) aaGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCgg < 2:121607/148‑1 (MQ=255) cGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCAcc < 5:96862/149‑1 (MQ=255) aCGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGc < 7:142955/149‑1 (MQ=255) tGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACGCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTg < 6:65493/149‑1 (MQ=255) ggcgatgcgccgggccagcagctggtcttcgagctgcggggcaatgcgcaTCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTgg > 6:4852‑M2/51‑149 (MQ=255) gcgatgcgccgggccagcagctggtcttcgagctgcggggcaatgcgcaTCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGgt > 3:256583‑M2/50‑149 (MQ=255) aGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGgt < 8:120449/149‑1 (MQ=255) cTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGtt < 1:313421/149‑1 (MQ=255) tgcgccgggccagcagctggtcttcgagctgcggggcaatgcgcaTCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGttt < 4:256583‑M2/104‑1 (MQ=255) GCGCATTGCACCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTc > 8:356051‑M1/1‑149 (MQ=255) CGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATGCCGTTGATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTAGCTGCCTCGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTc > 8:87410‑M1/1‑148 (MQ=255) CGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTc > 7:342165‑M1/1‑148 (MQ=255) CGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCg > 7:92152‑M1/1‑149 (MQ=255) cGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTg < 8:143426/149‑1 (MQ=255) gAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTCCCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGc < 7:126169/147‑1 (MQ=255) gAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGAt > 8:24254/1‑144 (MQ=255) gAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGAt < 7:24254/144‑1 (MQ=255) gACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGctt > 1:326374/1‑149 (MQ=255) gctgcggggcaatgcgcaTCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTg < 5:4852‑M2/131‑1 (MQ=255) gcttatgGCACGTCTCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTTTTGTGACTCACCCTGTTACCTGGATAGCGGTGGCGTACGTGCCACGCCCGATGCCTTGCGCGGGCTCCGTTTCCTGTTGTTTCGCTATCCGGTTGATGGCCGcttctttc < 8:139165/144‑3 (MQ=255) gctgctGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTgc > 5:121561/1‑149 (MQ=255) tgctgGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGct > 5:374073/1‑141 (MQ=255) tgctgGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGct < 6:374073/141‑1 (MQ=255) gCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTgggg > 8:239030/1‑149 (MQ=255) gCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTggg < 2:142005/148‑1 (MQ=255) gCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTgg < 4:139176/147‑1 (MQ=255) ccGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTGGGGCt > 4:20030/1‑149 (MQ=255) cGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTGGGGCt > 4:41492/1‑148 (MQ=255) gcgcaTCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTGGGGCTTCa > 4:195971‑M2/6‑149 (MQ=255) gcgcaTCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTGGGGCTTCa > 8:39010‑M2/6‑149 (MQ=255) gcaTCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTACCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTGGGGCTTCATg > 1:115900‑M2/4‑149 (MQ=255) caTCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTGGGGCTTCATGc < 1:202411‑M2/147‑1 (MQ=255) tCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTGGGGCTTCATGCgg < 4:244695/149‑1 (MQ=255) | CCGTTGATACCTGCTTTCAGTGCCCGCTACCCTTTACTTTCGATAGAGTTGGTAACGACTGATCGTCGGGTTAACCATGCCCGTGAAGACGTTGACGTGAGCCTGCGCATTGCCCCGCAGCTCGAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTGGGGCTTCATGCGG > NC_002947/1880651‑1880947 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |