New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2293084 | 56 (0.900) | 4 (0.070) | 4/252 | NT | 7.8% | coding (1479/2400 nt) | PP_2019 | RND family multidrug transporter |
? | NC_002947 | = 2293146 | 41 (0.700) | coding (1541/2400 nt) | PP_2019 | RND family multidrug transporter |
CTGTGGTACAGCCAGAACCTGAAGATCGGCGACCTCGACCAGGGCGCACCGGAGCTGCGCCCCGACTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGATGTGGACCATGGAAAACACCCCAGGCGTGCAGTCGGCGATTTCCCTGGTCACCGTTTCCAAACAGGTGATCAAGGGCATGAACGAGGGC > NC_002947/2292944‑2293231 | cTGTGGTACAGCCAGAACCTGAAGATCGGCGACCTCGACCAGGGCGCACCGGAGCTGCGCCCCGACTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGcc < 2:160679/149‑1 (MQ=255) tgGTACAGCCAGAACCTGAAGATCGGCGACCTCGACCAGGGCGCACCGGAGCTGCGCCCCGACTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGt < 6:366768/148‑1 (MQ=255) tACAGCCAGCACCTGAAGATCGGCGACCTCGACCAGGGCGCACCGGAGCTGCGCCCCGACTCGCGCTACAACCAGGACACCAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATGATGGTCAAGACGCCGTCGga < 6:276257/149‑1 (MQ=255) tACAGCCAGAACCTGAAGATCGGCGACATCGACCAGGGCGCACCGGAGCTGCGCCCCGACTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGCACAGGTACGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGACgg > 7:316599/1‑148 (MQ=255) aGCCAGAACCTGAAGATCGGCGACCTCGACCAGGGCGCACCGGAGCTGCGCCCCGACTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCTACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGaa < 7:867/149‑1 (MQ=255) aGCCAGAACCTGAAGATCGGCGACCTCGACCAGGGCGCACCGGAGCTGCGCCCCGACTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGaa < 4:252948/149‑1 (MQ=255) ccAGAACCTGAAGATCGGCGACCTCGACCAGGGCGCACCGGAGCTGCGCCCTGACTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGt > 8:9781/1‑149 (MQ=255) ccTGAAGATCGGCGACCTCGACCAGGGCGCACCGGAGCTGCGCCCCGACTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTC > 8:270098‑M1/1‑124 (MQ=255) ccTGAAGATCGGCGACCTCGACCAGGGCGCACCGGAGCTGCGCCCCGACTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTC < 7:270098‑M1/124‑1 (MQ=255) cTGAAGATCGGCGACCTCGACCAGGGCGCACCGGAGCTGCGCCCCGACTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGt > 2:45948/1‑149 (MQ=255) cTGAAGATCGGCGACCTCGACCAGGGCGCACCGGAGCTGCGCCCCGACTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGt > 1:129882/1‑149 (MQ=255) tGAAGATCGGCGACCTCGACCAGGGCGCACCGGAGCTGCGCCCCGACTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTc > 6:75338/1‑149 (MQ=255) tGAAGATCGGCGACCTCGACCAGGGCGCACCGGAGCTGCGCCCCGACTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTACGATGTGCTGGTGATCATGGTCcacatcagctcgtcgatcggcgccatg > 4:16655‑M1/1‑122 (MQ=255) gAAGATCGGCGACCTCGACCAGGGCGCACCGGAGCTGCGCCCCGACTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTc > 2:239428/1‑148 (MQ=255) aaGATCGGCGACCTCGACCAGGGCGCACCGGAGCTGCGCCCCGACTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCAGGTGATCATCGTCAAGACGCCCTCGGAGAAGTCCTCGGTcc > 1:156004/1‑148 (MQ=255) aGATCGGCGACCTCGACCAGGGCGCACCGGAGCTGCGCCCCGACTCGCGCTAGAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCAc < 4:250187/149‑1 (MQ=255) gATCGGCGACCTCGACCAGGGCGCACCGGAGCTGCGCCCCGACTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACt > 5:341388/1‑149 (MQ=255) aTCGGCGACCTCGACCAGGGCGCACCGGAGCTGCGCCCCGACTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTc < 7:192186/149‑1 (MQ=255) ggCGACCTCGACCAGGGCGCACCGGAGCTGCGCCCCGACTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGa < 3:251264/148‑1 (MQ=255) cTCGACCAGGGCGCACCGGAGCTGCGCCCCGACTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGgc > 1:117915/1‑149 (MQ=255) gACCAGGGCGCACCGGAGCTGCGCCCCGACTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGcc < 2:117915/149‑1 (MQ=255) gACCAGGGAGCACCGGAGCTGCGCCCCGACTCGCGCTACAACCAGGACATCAACTTCATCATCAGCTACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGgcg < 4:324044/147‑1 (MQ=255) agtgcgcACCGGAGCTGCGCCCCGACTCCCGCTACAACCAGTACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCTACCAGTTCCGATGTGCTGGGGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATc < 8:316599/146‑1 (MQ=255) aGGGCGCACCGGAGCTGCGCCCCGACTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATc < 3:148515/149‑1 (MQ=255) cgcACCGGAGCTGCGCCCCGACTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTc < 5:182472/124‑1 (MQ=255) cgcACCGGAGCTGCGCCCCGACTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTc > 6:182472/1‑124 (MQ=255) ccGGAGCTGCGCCCCGACTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCt < 3:358175/149‑1 (MQ=255) cGGAGCTGCGCCCCGACTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTg > 7:104195/1‑149 (MQ=255) gcgcCCCGACTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGATGTGga < 1:357636‑M2/149‑3 (MQ=255) gcgcCCCGACTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTAGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGATGTGga < 8:33965‑M2/149‑3 (MQ=255) gcCCCGACTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGATGTGgac < 1:93794‑M2/148‑4 (MQ=255) ccGACTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGAtgtg > 2:389536/1‑142 (MQ=255) ccGACTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGAtgtg < 1:389536/142‑1 (MQ=255) cGACTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGATGTGgaccatg < 1:103044‑M2/148‑8 (MQ=255) cGACTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGATGTGgaccatg < 1:165038‑M2/148‑8 (MQ=255) cTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGATGTGGACCATGGaa < 7:9781/148‑1 (MQ=255) gcgcTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCcacatcagctcgtcgatcggcgccatggtcgagtggaccgagcacttctccgacggcgtcttgaccatgatcacca < 3:16655‑M1/149‑77 (MQ=255) cTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATcgacg > 2:332679/1‑122 (MQ=255) cTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGCTGTGGACCATGGAAAACAccc > 6:319081/1‑149 (MQ=255) aCCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGATGTGGACCATGGAAAACACCCCAGGc < 5:75338/149‑1 (MQ=255) ggACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGATGTGGACCATGGAAAACACCCCAGGc < 6:71781/145‑1 (MQ=255) ggACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGATGTGGACCATGGAAAACACCCCAGGc > 5:71781/1‑145 (MQ=255) aacaacTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCAGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGCCGCCGATCGACGAGCTGATGTGGACCATGGAAAACACCCCAGGCGTGCAGTc > 3:62420/1‑149 (MQ=255) aacTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGATGTGGACCATGGAACACACCCCAGGCGTGCAGTCGGc < 1:61994/149‑1 (MQ=255) aacTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGATGTGGACCATGGAAAACACCCCAGGCGTGCAGTCGGc < 2:93794/149‑1 (MQ=255) catcaGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGATGTGGACCATGGAAAACACCCCAGGCGTGCAGTCGGCGATTTccc > 4:334693/1‑149 (MQ=255) atcaGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGATGTGGACCATGGAAAACACCCCAGGCGTGCAGTCGGCGATTTccc < 6:341388/148‑1 (MQ=255) atcaGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGATGTGGACCATGGAAAACACCCCAGGCGTGCAGTCGGCGATTTCCCt < 2:103044/149‑1 (MQ=255) atcaGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGATGTGGACCATGGAAAACACCCCAGGCGTGCAGTCGGCGATTTCCCt < 2:129882/149‑1 (MQ=255) atcaGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGATGTGGACCATGGAAAACACCCCAGGCGTGCAGTCGGCGATTTCCCt > 2:148148/1‑149 (MQ=255) atcaGCAACTACTCGACCAGTTCCGAAGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGATGTGGACCATGGAAAACACCCCAGGCGTGCAGTCGGCGATTTCCCt > 1:207485/1‑149 (MQ=255) tcaGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCcacatcagctcgtcgatcggcgccatggtcgagtggaccgagcacttctccgacggcgtcttgacc > 3:29232‑M1/1‑44 (MQ=255) tcaGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCcacatcagctcgtcgatcggcgccatggtcgagtggaccgagcacttctccgacggcgtcttgacc < 4:29232‑M1/110‑67 (MQ=255) actactCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGATGTGGACCATGGAAAACACCCCAGGCGTGCAGTCGGCGATTTCCCTGGTCAcc > 5:139072/1‑149 (MQ=255) gACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGATGTGGACCATGGAAAACACCCCAGGCGTGCAGTCGGCGATTTCCCTGGTCACCGTTTcc > 5:323997/1‑148 (MQ=255) gACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGATGTGGACCATGGAAAACACCCCAGGCGTGCAGTCGGCGATTTCCCTGGTCACCGTTTc < 2:165038/147‑1 (MQ=255) ccAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGATGTGGACCATGGAAAACACCCCAGGCGTGCAGTCGGCGATTTCCCTGGTCACCGTTTCCaaa > 2:220261/1‑149 (MQ=255) cAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGATGTGGACCATGGAAAACACCCCAGGCGTGCAGTCGGCGATTTCCCTGGTCACCGTTTCCaaa > 4:323101/1‑148 (MQ=255) gTTCCGATGTGCTGTTTATCATTGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACGATGGCGCCGATCGAGGAGGTGATGTGGACCATGGATAACACCCCAGGCGTGCAGTCGGCGATTTCCCTGGTCACCGTTTCCAAACAg < 4:62420/149‑1 (MQ=255) gTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGATGTGGACCATGGAAAACACCCCAGGCGTGCAGTCGGCGATTTCCCTGGTCACCGTTTCCAAACAg < 2:357636/149‑1 (MQ=255) gTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGATGTGGACCATGGAAAACACCCCAGGCGTGCAGTCGGCGATTTCCCTGGTCACCGTTTCCAAACAg < 1:239428/149‑1 (MQ=255) ttCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGATGTGGACCATGGAAAACACCCCAGGCGTGCAGTCGGTGATTTCCCTGGTCACCGTTTCCAAACAgg < 1:45948/149‑1 (MQ=255) gCTGGTGATCATGCTGAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGTTGTGGACCATGGAAAACACCCCAGGCGTGCAGTCGGCGATTTCCCTGGTCACCGTTTCCAACCAGGTGATGAAgg > 6:351293/1‑149 (MQ=255) tGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGATGTGgaccatgatcaccagcacatcggaactggtcgagtagttgctgatgatgaagttgttgtcctggttgtagcgc < 3:16655‑M2/149‑74 (MQ=255) gATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATcga < 4:92103/60‑1 (MQ=255) gATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATcga > 3:92103/1‑60 (MQ=255) gATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGATGTGGACCATGGAAAACACCCCAGGCGTGCAGTCGGCGATTTCCCTGGTCACCGTTTCCAAACAGGTGATCAAGGGCATg > 2:129942/1‑148 (MQ=255) cATGGTCcacatcagctcgtcgatcggcgccatggtcgagtggaccgagcacttctccgacggcgtcttgaccatgatcaccagcacatcggaactggtcgagtagttgctgatgatgaagttgttgtcctggttgtagcgcgagtcg < 1:165038‑M1/148‑142 (MQ=255) cATGGTCcacatcagctcgtcgatcggcgccatggtcgagtggaccgagcacttctccgacggcgtcttgaccatgatcaccagcacatcggaactggtcgagtagttgctgatgatgaagttgttgtcctggttgtagcgcgagtcg < 1:103044‑M1/148‑142 (MQ=255) aTGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGTGCCGATCGACGAGCTGATGTGGACCATGGAAAACACCCCAGGCGTGCAGTCGGCGATTTCCCTGGTCACCGTTTCCAAACAGGTGATCAAGGGCATGAACGa < 1:129942/149‑1 (MQ=255) tGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGATGTGGACCATGGAAAACACCCCAGGCGTGCAGTCGGCGATTTCCCTGGTCACCGTTTCCAAACAGGTGATCAAGGGCATGAACGAg < 7:33965/149‑1 (MQ=255) ggTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGATGTGgaccatgatcaccagcacatcggaactggtcgagtagttgctga < 4:29232‑M2/110‑45 (MQ=255) ggTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGATGTGgaccatgatcaccagcacatcggaactggtcgagtagttgctga > 3:29232‑M2/1‑66 (MQ=255) gTCcacatcagctcgtcgatcggcgccatggtcgagtggaccgagcacttctccgacggcgtcttgaccatgatcaccagcacatcggaactggtcgagtagttgctgatgatgaagttgttgtcctggttgtagcgcgagtcggggc < 1:93794‑M1/148‑146 (MQ=255) tCcacatcagctcgtcgatcggcgccatggtcgagtggaccgagcacttctcctacggcgtcttgaccatgatcaccagcacatcggaactggtcgagtagttgctgatgatgaagttgttgtcctggttgtagcgcgagtcggggcgc < 8:33965‑M1/149‑148 (MQ=255) tCcacatcagctcgtcgatcggcgccatggtcgagtggaccgagcacttctccgacggcgtcttgaccatgatcaccagcacatcggaactggtcgagtagttgctgatgatgaagttgttgtcctggttgtagcgcgagtcggggcgc < 1:357636‑M1/149‑148 (MQ=255) tCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGATGTGGACCATGGAAAACACCCCAGGCGTGCAGTCGGCGATTTCCCTGGTCACCGTTTCCAAACAGGTGATCAAGGGCATGAACGAggg > 8:736/1‑148 (MQ=255) | CTGTGGTACAGCCAGAACCTGAAGATCGGCGACCTCGACCAGGGCGCACCGGAGCTGCGCCCCGACTCGCGCTACAACCAGGACAACAACTTCATCATCAGCAACTACTCGACCAGTTCCGATGTGCTGGTGATCATGGTCAAGACGCCGTCGGAGAAGTGCTCGGTCCACTCGACCATGGCGCCGATCGACGAGCTGATGTGGACCATGGAAAACACCCCAGGCGTGCAGTCGGCGATTTCCCTGGTCACCGTTTCCAAACAGGTGATCAAGGGCATGAACGAGGGC > NC_002947/2292944‑2293231 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |