New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2695284 | 57 (0.920) | 4 (0.070) | 4/256 | NT | 7.0% | coding (1575/2394 nt) | PP_2362 | usher protein |
? | NC_002947 | = 2695332 | 51 (0.860) | coding (1623/2394 nt) | PP_2362 | usher protein |
GTACGGCAGCATTGGCGCTGGCTACTTCGATGTGCGCGCCGGTGACGGTACGCGTACCCGGTTGATCAACCTGAGCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAGGCGAGACCCTGCAACGGGTCAACTACAGCCGTGCGGTGCCAGCCGGTGTCGGCGTCGGTTACAACCTGG > NC_002947/2695140‑2695432 | gTACGGCAGCATTGGCGCTGGCTACTTCGATGTGCGCGCCGGTGACGGTACGCGTACCCGGTTGATCAACCTGAGCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑Tggg < 7:268883/149‑1 (MQ=255) gTACGGCAGCATTGGCGCTGGCTACTTCGATGTGCGCGCCGGTGACGGTACGCGTACCCGGTTGATCAACCTGAGCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑Tgg > 1:242542/1‑148 (MQ=255) gTACGGCAGCATTGGCGCTGGCTACTTCGATGTGCGCGCCGGTGACGGTACGCGTACCCGGTTGATCAACCTGAGCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑Tgg < 2:242542/148‑1 (MQ=255) cGGCAGCATTGGCGCTGGCTACTTCGATGTGCGCGCCGGTGACGGTACGCGTACCCGGTTGATCAACCTGAGCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCg < 5:50662/148‑1 (MQ=255) cGGCAGCATTGGCGCTGGCTACTTCGATGTGCGCGCCGGTGACGGTACGCGTACCCGGTTGATCAACCTGAGCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTAACTATCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGAGCgg > 4:45691/1‑149 (MQ=255) cagcaTTGGCGCTGGCTACTTCGATGTGCGCGCCGGTGACGGTACGCGTACCCGGTTGATCAACCTGAGCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGc > 4:230991/1‑149 (MQ=255) aTTGGCGCTGGCTACTTCGATGTGCGCGCCGGTGACGGTACGCGTACCCGGTTGATCAACCTGAGCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGgc > 5:105693/1‑149 (MQ=255) cgcTGGCTACTTCGATGTGCGCGCCGGTGACGGTACGCGTACCCGGTTGATCAACCTGAGCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGc < 6:167714/149‑1 (MQ=255) cTGGCTACTTCGATGTGCGCGCCGGTGACGGTACGCGTACCCGGTTGATCAACCTGAGCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGTGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTg < 6:105693/149‑1 (MQ=255) cTGGCTACTTCGATGTGCGCGCCGGTGACGGTACGCGTACCCGGTTGATCAACCTGAGCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTg < 1:374117/149‑1 (MQ=255) tGGCTACTTCGATGTGCGCGCCGGTGACGGTACGCGTACCCGGTTGATCAACCTGAGCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTgg > 4:374878/1‑149 (MQ=255) cTTCGATGTGCGCGCCGGTGACGGTACGCGTACCCGGTTGATCAACCTGAGCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATc < 5:233770/148‑1 (MQ=255) ttCGATGTGCGCGCCGGTGACGGTACGCGTACCCGGTTGATCAACCTGAGCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTg > 2:265/1‑144 (MQ=255) ttCGATGTGCGCGCCGGTGACGGTACGCGTACCCGGTTGATCAACCTGAGCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATccc > 5:313268/1‑149 (MQ=255) ttCGATGTGCGCGCCGGTGACGGTACGCGTACCCGGTTGATCAACCTGAGCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATccc > 6:107687/1‑149 (MQ=255) ttCGATGTGCGCGCCGGGGACGGTACGCGTACCCGGTTGATCAACCTGAGCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTg < 1:265/144‑1 (MQ=255) aTGTGCGCGCCGGTGGCGGCACGCGTACCCGGTTGATCAACCTGAGCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGGAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTc > 6:251249/1‑149 (MQ=255) tgCGCGCCGGTGACGGTACGCGTACCCGGTTGATCAACCTGAGCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGAc < 3:101136/149‑1 (MQ=255) gcgcgcCGGTGACGGTACGCGTACCCGGTTGATCAACCTGAGCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGAcc > 4:250314/1‑149 (MQ=255) cgcgcCGGTGACGGTACGCGTACCCGGTTGATCAACCTGAGCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAg > 7:134285/1‑123 (MQ=255) cgcgcCGGTGACGGTACGCGTACCCGGTTGATCAACCTGAGCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAg < 8:134285/123‑1 (MQ=255) gcgcCGGTGACGGTACGCGTACCCGGTTGATCAACCTGATCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGTGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCt < 7:238665/148‑1 (MQ=255) gcgcCGGTGACGGTACGCGTACCCGGTTGATCAACCTGAGCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGa < 2:169144/135‑1 (MQ=255) gcgcCGGTGACGGTACGCGTACCCGGTTGATCAACCTGAGCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGa > 1:169144/1‑135 (MQ=255) gTGACGGTACGCGTACCCGGTTGATCAACCTGAGCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAGtgggcggtgcaggtcgaacgggatcaccagctgcgcctgcaccgc < 6:101210‑M1/149‑46 (MQ=255) ggTACGCGTACCCGGTTGATCAACCTGAGCTTCAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACCct < 1:152688‑M2/149‑3 (MQ=255) tACGCGTACCCGGTTGATCAACCTGAGCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACCctgg < 3:185883‑M2/149‑5 (MQ=255) gcgTACCCGGTTGATCAACCTGAGCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAGggtgccgtgcaggtcgaacgggatcaccagctgcgcctgcaccgcccactggctg < 6:167447‑M1/149‑56 (MQ=255) gcgTACCCGGTTGATCAACCTGAGCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGgcgc > 8:235433/1‑149 (MQ=255) cccGGTTGATCAACCTGAGCTAGAGCAAGCCGCTGTGGGGAAGCAGCAGTGTGTACCTATCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGat < 3:331540/148‑2 (MQ=255) ggTTGATCAACCTGAGCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATg < 4:252931/149‑1 (MQ=255) gATCAACCTGAGCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGaa < 3:250314/148‑1 (MQ=255) tCAACCTGAGCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACgc < 6:4338/149‑1 (MQ=255) aGCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATg > 3:236583/1‑148 (MQ=255) gCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCAGGGAACGCAGCAATg > 7:284021/1‑147 (MQ=255) tACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAgg > 6:92829/1‑149 (MQ=255) tACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAgg > 5:50/1‑149 (MQ=255) cAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAGGc < 8:284021/148‑1 (MQ=255) aGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAGGc > 6:325302/1‑147 (MQ=255) gggCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAGGCGAGACCCTGCAACgg < 6:313268/148‑1 (MQ=255) ggCAGGAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGAGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAGGCGAGACCCTGCAACGGGt < 3:45691/149‑1 (MQ=255) gcagcagcaGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGCCAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAAGGAAGGCGAGACCCTGCAACGGGTc > 2:37511/1‑149 (MQ=255) agcagcagTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAGGCGAGACCCTGCAACGGGTCaa > 6:120237/1‑149 (MQ=255) cagcagTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAGGCGAGACCCTGCAACGGGTCAACt < 5:251249/149‑1 (MQ=255) agcagTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAGGCGAGACCCTGCAACGGGTCAACTa < 3:198189/149‑1 (MQ=255) agTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAGGCGAGACCCTGCAACGGGTCAACTACAg > 2:228937/1‑149 (MQ=255) aCCTCTCGGCCATCCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAGGCGAGACCCTGCAACGGGTCAACTACAGCCGTGc < 3:230991/148‑1 (MQ=255) ccTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAGGCGAGACCCTGCAACGGGTCAACTACAGCCGTGCgg < 5:325302/149‑1 (MQ=255) ctctCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAGGCGAGACCCTGCAACGGGTCAACTACAGCCGTGCGGt > 5:57318/1‑149 (MQ=255) ctctCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAGGCGAGACCCTGCAACGGGTCAACTACAGCCGTGCGGt > 3:216943/1‑149 (MQ=255) ctctCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAGGCGAGACCCTGCAACGGGTCAACTACAGCCGTGCGGt < 3:374878/149‑1 (MQ=255) gCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAGGCGAGACCCTGCAACGGGTCAACTACAGCCGTGCGGTGCCAGc > 2:8163/1‑149 (MQ=255) ccAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAGggtgccgtgcaggtcgaacgggatcaccagctgcgcctgcaccgcccactgg > 5:367160‑M1/1‑26 (MQ=255) ccAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAGggtgccgtgcaggtcgaacgggatcaccagctgcgcctgcaccgcccactgg < 6:367160‑M1/78‑53 (MQ=255) ccAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAGATGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAGGCGAGACCCTGCAACGGGTCAACTACAGCCGTGCGGTGCCAGc > 1:4897/1‑149 (MQ=255) ccAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTACAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAGGCGAGACCCTGCAACGGGTCAACTACAGCCGTGCGGTGCCAGcc > 8:32573/1‑149 (MQ=255) cAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAGGCGAGACCCTGCAACGGGTCAACTACAGCCGTGCGGTGCCAGCCg < 5:120237/149‑1 (MQ=255) aaCCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAGGCGAGACCCTGCAACGGGTCAACTACAGCCGTGCGGTGCCAGCCgg > 5:371650/1‑149 (MQ=255) aaCCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAGGCGAGACCCTGCAACGGGTCAACTACAGCCGTGCGGTGCCAGCCgg < 4:236583/149‑1 (MQ=255) aCCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAGGCGAGACCCTGCAACGGGTCAACTACAGCCGTGCGGTGCCAGCCGgt > 5:368382/1‑149 (MQ=255) aCCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAGGCGAGACCCTGCAACGGGTCAACTACAGCCGTGCGGTGCCAGCCGgt < 5:107687/149‑1 (MQ=255) gTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAGGCGAGACCCTGCAACGGGTCAACTACAGCCGTGCGGTGCCAGCCGGTGTc < 6:368382/149‑1 (MQ=255) ggACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAGGCGAGACCCTGCAACGGGTCAACTACAGCCGTGCGGTGCCAGCCGgtgt > 4:229871/1‑138 (MQ=255) ggACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAGGCGAGACCCTGCAACGGGTCAACTACAGCCGTGCGGTGCCAGCCGgtgt < 3:229871/138‑1 (MQ=255) ggACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAGGCGAGACCCTGCAACGGGTCAACTACAGCCGTGCGGTGCCAGCCGGTGTCGGCGTCGGtt < 4:17186/149‑1 (MQ=255) ggACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAGGCGAGACCCTGCAACGGGTCAACTACAGCCGTGCGGTGCCAGCCGGTGTCGGCGTCGGt > 3:17186/1‑148 (MQ=255) cAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACCctggctgtcccccacttcacggttggccgagaggtacacactgctgctgccccacagcggcttgctgtagctcaggttgatcaaccgggtacgc < 6:167447‑M2/149‑95 (MQ=255) gCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAGGCGAGACCCTGCAACGGGTCAACTACAGCCGTGCGGTGCCAGCCGGTGTCGGCGTCGGTTACAAc < 6:57318/149‑1 (MQ=255) ccAGggtgccgtgcaggtcgaacgggatcaccagctgcgcctgcaccgcccactggctgtcccccacttcacggttggccgagaggtacacactgctgctgccccacagcggcttgctgtagctcaggttgatcaaccgggtacgcgta < 3:185883‑M1/149‑146 (MQ=255) ccAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACCctggctgtcccccacttcacggttgg > 5:367160‑M2/1‑52 (MQ=255) ccAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACCctggctgtcccccacttcacggttgg < 6:367160‑M2/78‑27 (MQ=255) aGggtgccgtgcaggtcgaacgggatcaccagctgcgcctgcaccgcccactggctgtcccccacttcacggttggccgagaggtacacactgctgctgccccacagcggcttgctgaagctcaggttgatcaaccgggtacgcgtacc < 1:152688‑M1/149‑148 (MQ=255) aG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACCACTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAGGCGAGACCCTGCAACGGGTCAACTACAGCCGTGCGGTGCCAGCCGGTGTCGGCGTCGGTTACAACCt > 1:290567/1‑149 (MQ=255) aG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAGGCGAGACCCTGCAACGGGTCAACTACAGCCGTGCGGTGCCAGCCGGTGTCGGCGTCGGTTACAACCTg < 6:163896/149‑1 (MQ=255) g‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAGGCGAGACCCTGCAACGGGTCAACTACAGCCGTGCGGTGCCAGCCGGTGTCGGCGTCGGTTACAACCTgg > 5:363489/1‑149 (MQ=255) | GTACGGCAGCATTGGCGCTGGCTACTTCGATGTGCGCGCCGGTGACGGTACGCGTACCCGGTTGATCAACCTGAGCTACAGCAAGCCGCTGTGGGGCAGCAGCAGTGTGTACCTCTCGGCCAACCGTGAAGTGGGGGACAGCCAG‑TGGGCGGTGCAGGCGCAGCTGGTGATCCCGTTCGACCTGCACGGCACC‑CTGGCGCTGAGCATGGAACGCAGCAATGAAGGCGAGACCCTGCAACGGGTCAACTACAGCCGTGCGGTGCCAGCCGGTGTCGGCGTCGGTTACAACCTGG > NC_002947/2695140‑2695432 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |