New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2731942 = | 47 (0.760) | 3 (0.050) | 3/252 | NT | 6.2% | coding (1279/2361 nt) | polB | DNA polymerase II |
? | NC_002947 | 2731986 = | 47 (0.800) | coding (1323/2361 nt) | polB | DNA polymerase II |
TACATTCCACAGATGCACCGCCTTGGCTTTGTCGCGCCCAGCCTTGGCAGCCGGCCGGACGAAGCCAGCCC‑CGGCGGGTTTGTCATGGATTCGCGGCCAGGGCTTTACGACTCGGTGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGACGACGCACATTCGGTCGAGGGCTTTCGCGGTGGGCGGTTTTCACGCACACAGCACTGCCTGCCAGCCATCGTCGAACGGGTGTGG > NC_002947/2731795‑2732088 | tACATTCCACAGATGCACCGCCTTGGCTTTGTCGCGCCCAGCCTTGGCAGCCGGCCGGACGAAGCCAGCCC‑CGGCGGGTTTGTCATGGATTCGCGGCCAGGGCTTTACGACTCGGTGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTACCCGt < 8:316706/148‑1 (MQ=255) cagcggcgcattgccctcgcgcttggccgcttccctgccctgccacacccgttcgacgatggctggcaggcagtgctgtgtgcgtgaaaaccgcccaccgcgaaagccctcgaccgaatgtgcgtcgtcaggctggcgtaggcctTCGa < 3:343482‑M1/4‑1 (MQ=255) cggcgcattgccctcgcgcttggccgcttccctgccctgccacacccgttcgacgatggctggcaggcagtgctgtgtgcgtgaaaaccgctcccaccgcgaaagccctcgaccgaatgtgcgtcgtcaggctggcgtaggcctTCGat > 1:301501‑M1/145‑149 (MQ=255) ccACAGATGCACCGCCTTGGCTTTGTCGCGCCCAGCCTTGGCAGCCGGCCGGACGAAGCCAGCCCTAGGCGCGTTTGTCATGGATTCGCGGCCAGGGCTTTACTACTCGGTGCTGGTGCAGGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGatca > 1:310164/1‑149 (MQ=255) ccACAGATGCACCGCCTTGGCTTTGTCGCGCCCAGCCTTGGCAGCCGGCCGGACGAAGCCAGCCC‑CGGCGGGTTTGTCATGGATTCGCGGCCAGGGCTTTACGACTCGGTGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGatca < 7:45924/148‑1 (MQ=255) cacaGATGCACCGCCTTGGCTTTGTCGCGCCCAGCCTTGGCAGCCGGCCGGACGAAGCCAGCCC‑CGGCGGGTTTGTCATGGATTCGCGGCCAGGGCTTTACGACTCGGTGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGatcatc < 7:9955/149‑1 (MQ=255) gATGCACCGCCTTGGCTTTGTCGCGCCCAGCCTTCGCAGCCGGCCGGACGAAGCCAGCCC‑CGGCGGGTTTGTCATGGATTCGCGGCCAGGGCTTTACGACTCGGTGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGa < 1:243816/149‑1 (MQ=255) cACCGCCTTGGCTTTGTCTCGCCCAGCCTTGGCAGCCGGCCGGACGAAGCCAGCCC‑CGGCGGGTGTGTCATGGATTCGCGGCCAGGGCTTTACGACTCGCTGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTCCCCGTCGATCAGCCGGACCtt > 5:15865/1‑149 (MQ=255) ggCTTTGTCGCGCCCAGCCTTGGCAGCCGGCCGGACGAAGCCAGCCC‑CGGCGGGTTTGTCATGGATTCGCGGCCAGGGCTTTACGACTCGGTGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATc < 1:143369/147‑1 (MQ=255) gcgcCCTGCCTTGGCAGCGGTCCGGAGGAAGCCAGCCC‑CGGCGGGTTTGTCATGGATTTGCGGGCAGGGCTTTACGACTCGGGGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCg < 1:313289/148‑1 (MQ=255) gcgcCCAGCCTTGGCAGCCGGCCGGACGAAGCCAGCCC‑CGGCGGGTTTGTCATGGATTCGCGGCCAGGGCTTTACGACTCGGTGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCgg < 1:108205/149‑1 (MQ=255) cgcCCAGCCTTGGCAGCCGGCCGGACGAAGCCAGCCC‑CGGCGGGTTTGTCATGGATTCGCGGCCAGGGCTTTACGACTCGGTGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCggg < 2:178419/149‑1 (MQ=255) gcCCAGCCTTGGCAGCCGGCCGGACGAAGCCAGCCC‑CGGCGGGTTTGTCATGGATTCGCGGCCAGGGCTTTACGACTCGGTGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCgggcgggc < 3:151485/149‑1 (MQ=255) cccAGCCTTGGCAGCCGGCCGGACGAAGCCAGCCC‑CGGCGGGTTTGTCATGGATTCGCGGCCAGGGCTTTACGACTCGGTGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCt < 4:117763/149‑1 (MQ=255) aGCCTTGGCAGCCGGCCGGACGAAGCCAGCCC‑CGGCGGGTTTGTCATGGATTCGCGGCCAGGGCTTTACGACTCGGTGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATc < 4:71332/132‑1 (MQ=255) aGCCTTGGCAGCCGGCCGGACGAAGCCAGCCC‑CGGCGGGTTTGTCATGGATTCGCGGCCAGGGCTTTACGACTCGGTGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATc > 3:71332/1‑132 (MQ=255) gCCTTGGCAGCCGGCCGGACGAAGCCAGCCC‑CGGCGGGTTTGTCATGGATTCGCGGCCAGGGCTTTACGACTCGGTGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATc > 4:337199/1‑149 (MQ=255) ggCAGCCGGCCGGACGAAGCCAGCCC‑CGGCGGGTTTGTCATGGATTCGCGGCCAGGGCTTTACGACTCGGTGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGaa < 1:225815/147‑1 (MQ=255) acacccgttcgacgatggctggcaggcagtgctgtgtgcgtgaaaaccgccccccgcgaaagccctcgaccgaatgtgcgtcgtcaggctggcgtaggcctTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGAtcgaactc < 6:114425‑M1/48‑4 (MQ=255) ccggACGAAGCCAGCCC‑CGGCGGGTTTGTCATGGATTCGCGGCCAGGGCTTTACGACTCGGTGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCa < 3:10407/149‑1 (MQ=255) gacgatggctggcaggcagtgctgtgtgcgtgaaaaccgcccaccggcgaaagccctcgaccgaatgtgcgtcgtcaggctggcgtaggcctTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGa < 1:86023‑M1/44‑1 (MQ=255) gacgatggctggcaggcagtgctgtgtgcgtgaaaaccgcccaccgcgaaagccctcgaccgaatgtgcgtcgtcaggctggcgtaggcctTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGa > 2:86023‑M1/92‑135 (MQ=255) gAAGCCAGCCC‑CGGCGGGTTTGTCATGGATTCGCGGCCAGGGCTTTACGACTCGGTGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTga > 4:256674/1‑149 (MQ=255) cagccC‑CGGCGGGTTTGTCATGGATTCGCGGCCAGGGCTTTACGCCTCGGTGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCGACGCCAGCCTGacgacg > 4:36001/1‑149 (MQ=255) cagccC‑CGGCGGGTTTGTCATGGATTCGCGGCCAGGGCTTTACGACTCGGTGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGCCCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGacgacg > 2:135568/1‑149 (MQ=255) cagccC‑CGGCGGGTTTGTCATGGATTCGCGGCCAGGGCTTTACGACTCGGTGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGacgacg < 3:50362/149‑1 (MQ=255) agccC‑CGGCGGGTTTGTCATGGATTCGCGGCCAGGGCTTTACGACTCGGTGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGacgacg > 2:363727/1‑148 (MQ=255) ggTTTGTCATGGATTCGCGGCCAGGGCTTTACGACTCGGTGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGACGACGCACATTCGGTc > 6:115418/1‑149 (MQ=255) tCATGGATTCGCGGCCAGGGCTTTACGACTCGGTGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGACGACGCACATTCGGTCGAGGGc > 5:369851/1‑149 (MQ=255) aTGGATTCGCGGCCAGGGCTTTACGACTCGGTGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGACGACGCACATTCgg > 8:198856/1‑139 (MQ=255) aTGGATTCGCGGCCAGGGCTTTACGACTCGGTGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGACGACGCACATTCgg < 7:198856/139‑1 (MQ=255) ccAGGGCTTTACGACTCGGTGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGACGACGCACATTCGGTCGAGGGCTTTCGCGGTg < 1:339287/145‑1 (MQ=255) ccAGGGCTTTACGACTCGGTGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGACGACGCACATTCGGTCGAGGGCTTTCGCGGTg > 2:339287/1‑145 (MQ=255) ctgtACGACGCGGTGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGCTCCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATGGAAGGCCTACGCCAGCCTGACGACGCACATTCGGGCGAGGGCTTTCGCGGTGGGCGGTTTTc < 2:310164/146‑1 (MQ=255) tttACGACTCGGTGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGACGACGCACATTCGGTCGAGGGCTTTCGCGGTGGGCGGTTTTCa > 2:359678/1‑149 (MQ=255) taggtcTCGGTTCTGGTGCTGGACTAGAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGTCCCGGTCGGGCTTATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGACGACGCAGATTCGGTCGAGGGCTTTCGCGGTGGGCGGTTTTc < 1:346671/141‑1 (MQ=255) tACGACTCGGTGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGACGACGCACATTCGGTCGAGGGCTTTCGCGGTGGGCGGTTTTCa < 1:363727/147‑1 (MQ=255) tACGACTCGGTGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGACGACGCACATTCGGTCGAGGGCTTTCGCGGTGGGCGGTTTTCACg > 3:52376/1‑149 (MQ=255) aCGACTCGGTGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGACGACGCACATTCGGTCGAGGGCTTTCGCGGTGGGCGGTTTTCACg < 3:337199/148‑1 (MQ=255) gtgctggtgctgGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGACGACGCACATTCGGTCGAGGGCTTTCGCGGTGGGCGGTTTTCACGCACACAGCa > 3:336374/1‑149 (MQ=255) gctggtgctggACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGACGACGCACATTCGGTCGAGGGCTTTCGCGGTGGGCGGTTTTCACGCACACAGCAct > 4:244492/1‑149 (MQ=255) ggACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGACGACGCACATTCGGTCGAGGGCTTTCGCGGTGGGCGGTTTTCACGCACACAGCACTGCCTgccag > 5:157650/1‑149 (MQ=255) tACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGACGACGCACATTCGGTCGAGGGCTTTCGCGGTGGGCGGTTTTCACGCACACAGCACTGCCTGCCAGCCAt > 5:179282/1‑149 (MQ=255) tACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGACGACGCACATTCGGTCGAGGGCTTTCGCGGTGGGCGGTTTTCACGCACACAGCACTGCCTGCCAGCCAt > 4:343482/1‑149 (MQ=255) tACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGACGACGCACATTCGGTCGAGGGCTTTCGCGGTGGGCGGTTTTCACGCACACAGCACTGCCTGCCAGCCAt > 6:68617/1‑149 (MQ=255) tACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGACGACGCACATTCGGTCGAGGGCTGTCGCGGTGGGCGGTTTTCACGCCCACAGCACTGCCTGCCAGCCAt > 8:129235/1‑149 (MQ=255) catctccTGTACCCGGCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGACGACGCACATTCGGTCGAGGGCTTTCGCGGTGGGCGGTTTTCACGCACACAGCACTGCCTGCCAGCCAtcgt < 1:292589/144‑1 (MQ=255) aaGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGACGACGCACATTCGGTCGAGGGCTTTCGCGGTGGGCGGTTTTCACGCACACAGCACTGCCTGCCAGCCAtcgt < 6:157650/149‑1 (MQ=255) gagCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGACGACGCACATTCGGTCGAGGGCTTTCGCGGTGGGCGGTTTTCACGCACACAGCACTGCCTGCCAGCCAtcgtc > 3:344022/1‑148 (MQ=255) cTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGACGACGCACATTCGGTCGAGGGCTTTCGCGGTGGGCGGTTTTCACGCACACAGCACTGCCTGCCAGCCATCGTCGAACg > 7:239855/1‑149 (MQ=255) tGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGACGACGCACATTCGGTCGAGGGCTTTCGCgg > 4:124693/1‑100 (MQ=255) tGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGACGACGCACATTCGGTCGAGGGCTTTCGCgg < 3:124693/100‑1 (MQ=255) tACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGACGACGCACATTCGGTCGAGGGCTTTCGCGGTGGGCGGTTTTCACGCACACAGCACTGCCTGCCAGCCATCGTCGAACggg < 4:52376/148‑1 (MQ=255) cccGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGACGACGCACATTCGGTCGAGGGCTTTCGCGGTGGGCGGTTTTCACGCACACAGCACTGCCTGCCAGCCATCGTCGAACGGgtg < 5:115418/148‑1 (MQ=255) ccGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGACGACGCACATTCGGTCGAGGGCTTTCGCGGTGGGCGGTTTTCACGCACACAGCACTGCCTGCCAGCCATCGTCGAACGGGtgtg > 8:6819/1‑149 (MQ=255) gTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGACGACGCACATTCGGTCGAGGGCTTTCGCGGTGGGCGGTTTTCACGCACACAGCACTGCCTGCCAGCCATCGTCGAACGGgtgt > 1:383455/1‑146 (MQ=255) gTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGACGACGCACATTCGGTCGAGGGCTTTCGCGGTGGGCGGTTTTCACGCACACAGCACTGCCTGCCAGCCATCGTCGAACGGgtgt < 2:383455/146‑1 (MQ=255) gTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGACGACGCACATTCGGTCGAGGGCTTTCGCGGTGGGCGGTTTTCACGCACACAGCACTGCCTGCCAGCCATCGTCGAACGGGTGTgg > 3:163509/1‑148 (MQ=255) | TACATTCCACAGATGCACCGCCTTGGCTTTGTCGCGCCCAGCCTTGGCAGCCGGCCGGACGAAGCCAGCCC‑CGGCGGGTTTGTCATGGATTCGCGGCCAGGGCTTTACGACTCGGTGCTGGTGCTGGACTACAAGAGCCTGTACCCGTCGATCATCCGGACCTTTCTCATCGACCCGGTCGGGCTGATCGAAGGCCTACGCCAGCCTGACGACGCACATTCGGTCGAGGGCTTTCGCGGTGGGCGGTTTTCACGCACACAGCACTGCCTGCCAGCCATCGTCGAACGGGTGTGG > NC_002947/2731795‑2732088 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |