New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4407585 | 58 (0.940) | 5 (0.080) | 5/254 | NT | 7.9% | coding (259/1299 nt) | PP_3889 | putative Phage integrase |
? | NC_002947 | = 4407635 | 62 (1.050) | coding (209/1299 nt) | PP_3889 | putative Phage integrase |
CGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTG‑GCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCACGGCTGCTCCAAAA > NC_002947/4407441‑4407732 | cGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTG‑GCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGGCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACcggtgcggt‑g < 8:358437/149‑1 (MQ=255) gCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTG‑GCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCTATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑gg < 7:257357/149‑1 (MQ=255) ccTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTG‑GCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGACCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGc > 3:297513/1‑149 (MQ=255) cACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCACGGGTGTGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGCCATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCggtt > 1:259203/1‑147 (MQ=255) caTGCTGCCCAATTGCTGCGTGGGTG‑GCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAgg < 1:164299/149‑1 (MQ=255) tgctgcCCAATTGCTGCGCGGGTG‑GCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGgcg < 2:260836/149‑1 (MQ=255) gctgcCCAATTGCTGCGCGGGTG‑GCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGgcgc > 4:30040/1‑149 (MQ=255) tgcCCAATTGCTGCGCGGGTG‑GCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCtggccgagctgcccgcgctgcgtcagc > 8:62609‑M1/1‑122 (MQ=255) tgcCCAATTGCTGCGCGGGTG‑GCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAgg < 1:165109/144‑1 (MQ=255) tgcCCAATTGCTGCGCGGGTG‑GCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAgg > 2:165109/1‑144 (MQ=255) tgcCCAATTGCTGCGCGGGTG‑GCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTg > 2:67710/1‑149 (MQ=255) cccAATTGCTGCGCGGGTG‑GCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGa < 7:217041/148‑1 (MQ=255) cccAATTGCTGCGCGGGTG‑GCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGAc > 3:337846/1‑149 (MQ=255) cccAACTCCTTCGCGGGTG‑GCACCCCTACGCTTGGCAGACAACGCGCGTCCATGGCGCATGCGGTCGAGATACCTGTCGAGCATTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGG‑GGCCTGGTGGCGCATCAGGCCCAGAc < 6:301741/149‑1 (MQ=255) tgcGCGGGTG‑GCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCtggccgagctgcccgcgctgcgtcagcgcctgatgcgc > 4:225981‑M1/1‑111 (MQ=255) tgcGCGGGTG‑GCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCgg > 8:8017/1‑149 (MQ=255) gcgcGGGTG‑GCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCggg > 5:297480/1‑149 (MQ=255) cgcgGGTG‑GCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCggg < 5:390869/148‑1 (MQ=255) cgcgGGTG‑GCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCgg < 1:27767/147‑1 (MQ=255) cgcgGGTG‑GCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGc < 3:30040/149‑1 (MQ=255) cgcgGGTG‑GCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGACCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCggg < 4:297513/148‑1 (MQ=255) cacgGGTG‑GCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCggg < 2:259203/146‑1 (MQ=255) g‑gCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCg < 8:295759/148‑1 (MQ=255) aGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGc > 5:107014/1‑147 (MQ=255) ccTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAg < 1:347174‑M2/148‑2 (MQ=255) ccTAACGCTTAGCAGACAACGAGCTAACATAGCTCATGCCCTCGACATACCAGTCGAGCAGATAGCCCACGCTGGCCATGCCCGACACTACAGCTGCCGT‑CCACGCGTGCCGCATCACGCGCTGACGCACCCCGGGCAGCTCCGCAAg > 8:24016/1‑148 (MQ=255) ttACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAgcac < 6:149898‑M2/149‑5 (MQ=255) tACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAgcacc < 2:179295‑M2/149‑6 (MQ=255) aCGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCtggccgagctgcccgcgctgcgtcagcgcctgatgcgccacccggccaccgcac < 5:362464‑M1/147‑55 (MQ=255) cGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCtggccgagctgcccgcgctgcgtcagcgcctgatgcgccacccggccaccgcaccg < 7:62609‑M1/148‑57 (MQ=255) cTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCtggccgagctgcccgcgctgcgtcagcgcctgatgcgccacccggccaccgcaccggta < 3:225981‑M1/149‑60 (MQ=255) gACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCt < 1:179295/149‑1 (MQ=255) aaCGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCGCGCTcca > 4:299703/1‑147 (MQ=255) aaCGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCCAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCaa < 2:330341/149‑1 (MQ=255) cGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGAGACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCAACt < 7:5406/149‑1 (MQ=255) gCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCAACTCAg < 7:128957/149‑1 (MQ=255) gCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCAACTCAg > 5:57361/1‑149 (MQ=255) gCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCAACTCAg < 2:347174/149‑1 (MQ=255) aTGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCaa < 6:274981/138‑1 (MQ=255) aTGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCaa > 5:274981/1‑138 (MQ=255) gCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGCCAGAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCCCGCTCAACTCAGGCCAGCggg > 1:320650/1‑149 (MQ=255) gCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCTGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCAACTCAGGCCAGCggg < 1:73673/149‑1 (MQ=255) cTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGCT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCATCTAAGGCCAGCGGGc > 3:223637/1‑149 (MQ=255) aTGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGAt < 4:301792/149‑1 (MQ=255) ggTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTTACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGt < 1:243769/149‑1 (MQ=255) ggTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCgg > 1:282218/1‑96 (MQ=255) ggTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCgg < 2:282218/96‑1 (MQ=255) cGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCATGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTAc < 7:24016/148‑1 (MQ=255) aCATACCAGTCGAGCAGTGGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCa < 6:131405/149‑1 (MQ=255) aTACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCAtt > 1:322270/1‑149 (MQ=255) ccAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTc < 1:67710/148‑1 (MQ=255) aGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTg > 6:30836/1‑149 (MQ=255) tCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGcc < 4:337846/149‑1 (MQ=255) gAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCcgc > 4:274851/1‑149 (MQ=255) cccACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGcc > 4:161993/1‑137 (MQ=255) cccACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGGGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGcc < 3:161993/137‑1 (MQ=255) ccACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGc > 5:204656/1‑149 (MQ=255) cACGGTGGCCATGCCCGCCACTACCGGTGCGGTGGGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGc > 1:248926/1‑149 (MQ=255) gCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTAc > 2:41293/1‑148 (MQ=255) ccATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCTTCAGGCGCTGCCGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCCCCAGGTGCCAGGTACCa > 8:143579/1‑149 (MQ=255) gCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCt > 5:173698/1‑149 (MQ=255) ccGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCa > 7:3057/1‑149 (MQ=255) ccGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCa > 8:48347/1‑149 (MQ=255) cTACGGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCACGgctg < 6:297480/149‑1 (MQ=255) tACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAgcaccggtagtgtcgggcatggccaccgtgggccaactgctcgactggtatgtcgaccgcatgagccatgatcgctcgttgtctgcaaag < 3:225981‑M2/149‑91 (MQ=255) tACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCACGgctgc > 7:319032/1‑149 (MQ=255) aCCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGcc > 1:377579/1‑113 (MQ=255) aCCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGcc < 2:377579/113‑1 (MQ=255) cggtgcggt‑gGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAgcaccggtagtgtcgggcatggccaccgtgggccaactgctcgactggtatgtcgaccgcatgagccatgatcgctcgttgtctgcaaagcg < 7:62609‑M2/148‑93 (MQ=255) cggtgcggt‑gGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTAc > 2:312714/1‑131 (MQ=255) ggTGCtggccgagctgcccgcgctgcgtcagcgcctgatgcgccacccggccaccgcaccggtagtgtcgggcatggccaccgtgggccaactgctcgactggtatgtcgaccgcatgagccatgatcgctcgttgtctgcaaagcgta < 2:179295‑M1/149‑145 (MQ=255) gtgcggt‑gGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAgcaccggtagtgtcgggcatggccaccgtgggccaactgctcgactggtatgtcgaccgcatgagccatgatcgctcgttgtctgcaaagcgt < 5:362464‑M2/147‑94 (MQ=255) gTGCtggccgagctgcccgcgctgcgtcagcgcctgatgcgccacccggccaccgcaccggtagtgtcgggcatggccaccgtgggccaactgctcgactggtatgtcgaccgcatgagccatgatcgctcgttgtctgcaaagcgtaa < 6:149898‑M1/149‑146 (MQ=255) ctggccgagctgcccgcgctgcgtcagcgcctgatgcgccacccggccaccgcaccggtagtgtcgggcatggccaccgtgggccaactgctcgactggtatgtcgaccgcatgagccatgatcgctcgttgtctgcaaagcgtaagg < 1:347174‑M1/148‑148 (MQ=255) cggt‑gGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCACGGCTGCTCCaaaa < 2:320650/148‑1 (MQ=255) | CGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTG‑GCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCACGGCTGCTCCAAAA > NC_002947/4407441‑4407732 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |