New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4407585 | 58 (0.940) | 5 (0.080) | 5/254 | NT | 7.9% | coding (259/1299 nt) | PP_3889 | putative Phage integrase |
? | NC_002947 | = 4407635 | 62 (1.050) | coding (209/1299 nt) | PP_3889 | putative Phage integrase |
CCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCACGGCTGCTCCAAAAGCGCAGGTACAGGCCGGGGTGACGCGGGTCACGCAGGTCGCGCACCGA > NC_002947/4407489‑4407780 | ccTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAg < 1:347174‑M2/148‑2 (MQ=255) ccTAACGCTTAGCAGACAACGAGCTAACATAGCTCATGCCCTCGACATACCAGTCGAGCAGATAGCCCACGCTGGCCATGCCCGACACTACAGCTGCCGT‑CCACGCGTGCCGCATCACGCGCTGACGCACCCCGGGCAGCTCCGCAAg > 8:24016/1‑148 (MQ=255) ttACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAgcac < 6:149898‑M2/149‑5 (MQ=255) tACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAgcacc < 2:179295‑M2/149‑6 (MQ=255) gACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCt < 1:179295/149‑1 (MQ=255) aaCGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCGC‑GCTcca > 4:299703/1‑147 (MQ=255) aaCGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCCAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCaa < 2:330341/149‑1 (MQ=255) cGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGAGACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACt < 7:5406/149‑1 (MQ=255) gCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAg > 5:57361/1‑149 (MQ=255) gCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAg < 7:128957/149‑1 (MQ=255) gCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAg < 2:347174/149‑1 (MQ=255) aTGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCaa > 5:274981/1‑138 (MQ=255) aTGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCaa < 6:274981/138‑1 (MQ=255) gCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGCCAGAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCCC‑GCTCAACTCAGGCCAGCggg > 1:320650/1‑149 (MQ=255) gCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCTGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCggg < 1:73673/149‑1 (MQ=255) cTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGCT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCATCTAAGGCCAGCGGGc > 3:223637/1‑149 (MQ=255) aTGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGAt < 4:301792/149‑1 (MQ=255) ggTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTTACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGt < 1:243769/149‑1 (MQ=255) cGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCATGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTAc < 7:24016/148‑1 (MQ=255) aCATACCAGTCGAGCAGTGGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCa < 6:131405/149‑1 (MQ=255) aTACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCAtt > 1:322270/1‑149 (MQ=255) ccAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTc < 1:67710/148‑1 (MQ=255) aGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTg > 6:30836/1‑149 (MQ=255) tCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGcc < 4:337846/149‑1 (MQ=255) gAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCcgc > 4:274851/1‑149 (MQ=255) cccACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGcc > 4:161993/1‑137 (MQ=255) cccACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGGGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGcc < 3:161993/137‑1 (MQ=255) ccACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGc > 5:204656/1‑149 (MQ=255) cACGGTGGCCATGCCCGCCACTACCGGTGCGGTGGGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGc > 1:248926/1‑149 (MQ=255) gCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTAc > 2:41293/1‑148 (MQ=255) ccATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCTTCAGGCGCTGCCGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCCCCAGGTGCCAGGTACCa > 8:143579/1‑149 (MQ=255) gCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCt > 5:173698/1‑149 (MQ=255) ccGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCa > 8:48347/1‑149 (MQ=255) ccGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCa > 7:3057/1‑149 (MQ=255) cTACGGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCACGgctg < 6:297480/149‑1 (MQ=255) tACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAgcaccggtagtgtcgggcatggccaccgtgggccaactgctcgactggtatgtcgaccgcatgagccatgatcgctcgttgtctgcaaag < 3:225981‑M2/149‑91 (MQ=255) tACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCACGgctgc > 7:319032/1‑149 (MQ=255) aCCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGcc < 2:377579/113‑1 (MQ=255) aCCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGcc > 1:377579/1‑113 (MQ=255) cggtgcggt‑gGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAgcaccggtagtgtcgggcatggccaccgtgggccaactgctcgactggtatgtcgaccgcatgagccatgatcgctcgttgtctgcaaagcg < 7:62609‑M2/148‑93 (MQ=255) cggtgcggt‑gGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTAc > 2:312714/1‑131 (MQ=255) gtgcggt‑gGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAgcaccggtagtgtcgggcatggccaccgtgggccaactgctcgactggtatgtcgaccgcatgagccatgatcgctcgttgtctgcaaagcgt < 5:362464‑M2/147‑94 (MQ=255) cggt‑gGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCACGGCTGCTCCaaaa < 2:320650/148‑1 (MQ=255) t‑gGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTAGCACGCTCACGGCTGCTCCAAAAgcgc < 2:322270/149‑1 (MQ=255) gCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCATGTACCACGCTCACGGCTGCTCCAAAAGCGCAg > 6:309584/1‑149 (MQ=255) gCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCACGGCTGCTCCAAAAGCGCAg < 6:107014/149‑1 (MQ=255) ccGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGACCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCACGGCTGCTCCAAAAGCGCAgg < 5:88153/149‑1 (MQ=255) tGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCACGGCTGCTCCAAAAGCGCAGGTACAg < 5:30836/149‑1 (MQ=255) gcgcATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAgcaccggtagtgtcgggcatggccaccgtgggccaactgctcgactggtatgtcgaccgcatgagccatgatcgctcgttgtctgcaaagcgtaaggctgccacccgcgca > 4:225981‑M2/1‑38 (MQ=255) gcgcATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCACGGCTGCTCCAAAAGCGCAGGTACAGGc > 8:119008/1‑149 (MQ=255) gcctCAGGCGCGGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCACGCCAGCGGGCGATCGGTACGCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCACGGCTGCTCCAAAAGCGCAGGTACAGGCCg < 8:144264/146‑1 (MQ=255) tCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCACGGCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCACGGCTGCTCCaaaa > 1:281391/1‑131 (MQ=255) tCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCACGGCTGCTCCaaaa < 2:281391/130‑1 (MQ=255) aGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCACGGCTGCTCCAAAAGCGCAGGTACAGGCCGGGGt > 3:63488/1‑148 (MQ=255) gcgcTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCACGGCTGCTCCAAAAGCGCAGGTACAGGCCGGGGTGAc > 1:14595/1‑149 (MQ=255) gcTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAgcaccggtagtgtcgggcatggccaccgtgggccaactgctcgactggtatgtcgaccgcatgagccatgatcgctcgttgtctgcaaagcgtaaggctgccacccgcgcagcaattgggca > 8:62609‑M2/1‑27 (MQ=255) gcTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCACGGCTGCTCCAAAAGCGCAGGTACAGGCCGGGGTGAcgc < 7:119008/149‑1 (MQ=255) gcTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCACGGCTGCTCCAAAAGCGCAGGTACAGGCCGGCGTGAccc > 1:326968/1‑147 (MQ=255) aCGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCACGGCTGCTCCAAAAGCGCAGGTACAGGCCGGGGTGACGCgg < 8:3057/147‑1 (MQ=255) aCGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCACGGCTGCTCCAAAAGCGCAGGTACAGGCCGGGGTGACGCGGGt < 8:319032/149‑1 (MQ=255) gCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCa > 6:194579/1‑104 (MQ=255) gCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCa < 5:194579/104‑1 (MQ=255) aGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCACGGCTGCTCCAAAAGCGCAGGTACAGGCCGGGGTGACGCGGGTCACg > 3:162274/1‑149 (MQ=255) gcgGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCACGGCTGCTCCAAAAGCGCAGGTACAGGCCGGCGTGACCCGCGTCAccccg < 2:326968/149‑5 (MQ=255) ggCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCACGGCTGCTCCAAAAGCGCAGGTACAGGCCGGGGTGACGCGGGTCACGCAGGTc < 7:48347/149‑1 (MQ=255) gCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCACGGCTGCTCCAAAAGCGCAGGTACAGGCCGGGGTGACGCGGGTCACGCAGGTcg < 6:57361/149‑1 (MQ=255) gCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCACGGCTGCTCCAAAAGCGCAGGTACAGGCCGGGGTGACGCGGGTCACGCAGGTcg > 2:369313/1‑149 (MQ=255) gCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCACGGCTGCTCCAAAAGCGCAGGTACAGGCCGGGGTGACGCGGGTCACGCAGGTcgcg > 7:306647/1‑148 (MQ=255) gCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCACGGCTGCTCCAAAAGCGCAGGTACAGGCCGGGGTGACGCGGGTCACGCAGGTcgcg > 5:206490/1‑148 (MQ=255) cTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCACGGCTGCTCCAAAAGCGCAGGTACAGGCCGGGGTGACGCGGGTCACGCAGGTcgc > 7:189376/1‑146 (MQ=255) cTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCACGGCTGCTCCAAAAGCGCAGGTACAGGCCGGGGTGACGCGGGTCACGCAGGTcgc < 8:189376/146‑1 (MQ=255) gCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCACGGCTGCTCCAAAAGCGCAGGTACAGGCCGGGGTGACGCGGGTCACGCAGGTCGCGCACCGa > 4:232813/1‑149 (MQ=255) | CCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGT‑GGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTCGGCCAGCACCGCCGCCAC‑GCTCAACTCAGGCCAGCGGGCGATCGGTACCCATTTCTTGCCGCGCACCAGGTGCCAGGTACCACGCTCACGGCTGCTCCAAAAGCGCAGGTACAGGCCGGGGTGACGCGGGTCACGCAGGTCGCGCACCGA > NC_002947/4407489‑4407780 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |