New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4700127 = | 65 (1.050) | 3 (0.050) | 3/246 | NT | 5.1% | coding (561/2655 nt) | kdpD | sensor protein |
? | NC_002947 | 4700178 = | 52 (0.910) | coding (510/2655 nt) | kdpD | sensor protein |
TAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCG > NC_002947/4699984‑4700275 | tAGCGGTGGGCAAGGTCGGCATCGACCGGAGCAGGGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCTTCAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTc < 1:117097/149‑1 (MQ=255) tAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCTACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTc < 1:193720/149‑1 (MQ=255) gCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGa < 8:11906/149‑1 (MQ=255) aggatgtgcaagaactcttggccgcgggcatcgacgtgtacaccacggtcaacgtccagcacctggaaagcctcaacgacaaggtccgcgacattaccggcgtgcaagtgcgcgagaccctgccggactgggtgctgcaggaaGC‑GTTc > 5:17599‑M1/144‑149 (MQ=255) cGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGag‑c < 7:304514/149‑1 (MQ=255) gatgtgcaagaactcttggccgcgggcatcgacgtgtacaccacggtcaacgtccagcacctggaaagcctcaacgacaaggtccgcgacattaccggcgtgcaagtgcgcgagaccctgccggactgggtgctgcaggaaGC‑GTTCGa > 6:41289‑M1/142‑149 (MQ=255) cAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCtctc > 2:175145/1‑149 (MQ=255) ggCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAg > 2:315264/1‑149 (MQ=255) gCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAgg < 7:260507/149‑1 (MQ=255) aTCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATATGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAgg > 7:36225/1‑147 (MQ=255) gACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTTGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGt < 3:209392/149‑1 (MQ=255) gACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGt < 7:338713/149‑1 (MQ=255) aCCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTc > 3:23274/1‑149 (MQ=255) cTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGa < 4:292921/149‑1 (MQ=255) cTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGa > 7:240463/1‑149 (MQ=255) agcagcGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGAt < 4:362129/147‑1 (MQ=255) agcagcGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGAt < 1:152359/147‑1 (MQ=255) cagcGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAg < 3:219197/148‑1 (MQ=255) cagcGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGc < 3:348657/149‑1 (MQ=255) gTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTc > 2:296458/1‑149 (MQ=255) gCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGc < 2:149700/125‑1 (MQ=255) gCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGc > 1:149700/1‑125 (MQ=255) cATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAAc < 2:195732/148‑1 (MQ=255) cATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACg > 2:129030/1‑149 (MQ=255) cATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCATTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACg > 6:82897/1‑149 (MQ=255) cacggtcaacgtccagcacctggaaagcctcaacgacaaggtccgcgacattaccggcgtgcaagtgcgcgagaccctgccggactgggtgctgcaggaaGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAAc > 4:31203‑M1/101‑149 (MQ=255) gCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTc > 2:357009/1‑149 (MQ=255) cAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATATGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCt < 8:36225/149‑1 (MQ=255) aGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTg > 3:213478/1‑149 (MQ=255) gCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTgc < 7:40489/149‑1 (MQ=255) gCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTgc < 1:357009/149‑1 (MQ=255) gCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTgc < 4:161628/149‑1 (MQ=255) gcgcAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATc > 8:12636/1‑121 (MQ=255) gcgcAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATc < 7:12636/121‑1 (MQ=255) gcAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCAcc > 2:203099/1‑149 (MQ=255) cAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAGCCTGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCAcc < 1:296458/149‑1 (MQ=255) gCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTc < 4:165964/149‑1 (MQ=255) ggTGATGTTCGTTTGCGAAAAAAACGCATCGATCGCCGACCTTGCCTTCTCGGGAACGTACACCAT‑‑GCCTTCACGCA‑GCC‑TTTCGAG‑AAGCTCTCTCGGAGGCAGGTCGATCAGCAACACCTCGAACGCATCATGCAGCACCCAGTCCg > 2:274370/1‑149 (MQ=255) ctggaaagcctcaacgacaaggtccgcgacattaccggcgtgcaagtgcgcgagaccctgccggactgggtgctgcaggaaGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGc > 7:264280‑M1/82‑132 (MQ=255) ctggaaagcctcaacgacaaggtccgcgacattaccggcgtgcaagtgcgcgagaccctgccggactgggtgctgcaggaaGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGc < 8:264280‑M1/51‑1 (MQ=255) ggttggttTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAgg < 4:23274/149‑1 (MQ=255) ggttTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGtc < 1:129030/148‑1 (MQ=255) gttTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGtctc > 7:355330/1‑149 (MQ=255) gttTGCGAAAAATAACCATAGTTGGGCGCCCTTTCCTTCTAGGGCAAGTAAAACTTTCACCTTCACGGAGGGCACCTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAgg < 1:315264/148‑1 (MQ=255) tGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTcgc < 1:203099/148‑1 (MQ=255) tGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTcgc < 4:213478/148‑1 (MQ=255) cGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCa > 5:163/1‑149 (MQ=255) gAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCAc > 4:356021/1‑149 (MQ=255) gAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCAc < 6:163/149‑1 (MQ=255) aaaaaTACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACt < 6:53098/149‑1 (MQ=255) cGCATCGATGGCCGCCATTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGc < 5:82897/149‑1 (MQ=255) gCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGcc > 6:155275/1‑149 (MQ=255) cATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCg < 1:93392/149‑1 (MQ=255) cgaccTTGCGTGCTTGGGCACGTTCACCTT‑‑GCGTTGACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCTGCTCGAACGCTTGCTGCAGCTCCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTcgc < 1:274370/146‑1 (MQ=255) gccCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GTC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTcgcg < 1:175145/149‑1 (MQ=255) gCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCGTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGGCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGAcc < 5:149771/147‑1 (MQ=255) cTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGt > 6:208601/1‑149 (MQ=255) cTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTAGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGt > 3:297514/1‑149 (MQ=255) cTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGt > 1:203005/1‑149 (MQ=255) tCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGtt > 4:9098/1‑149 (MQ=255) gggCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGa < 3:356021/149‑1 (MQ=255) ggCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAg < 5:155275/149‑1 (MQ=255) gTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCttt > 2:19719/1‑149 (MQ=255) acacCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAgggccttc > 3:155880/1‑143 (MQ=255) cacCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTcc < 4:17410/148‑1 (MQ=255) cacCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTcc < 8:355330/148‑1 (MQ=255) cTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGt > 2:36864/1‑149 (MQ=255) cTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGt > 3:179548/1‑149 (MQ=255) ttCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGAAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGATTTCCAGGTGCTGGa > 5:299341/1‑149 (MQ=255) aCGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGt > 7:25615/1‑149 (MQ=255) gggC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGAc > 1:81456/2‑149 (MQ=255) GC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCg < 8:19122‑M1/149‑1 (MQ=255) | TAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCG > NC_002947/4699984‑4700275 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |