| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4700127 = | 65 (1.050) | 3 (0.050) | 3/246 | NT | 5.1% | coding (561/2655 nt) | kdpD | sensor protein |
| ? | NC_002947 | 4700178 = | 52 (0.910) | coding (510/2655 nt) | kdpD | sensor protein | |||||
GCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAAGAGTTCTTGCACATCCT > NC_002947/4700032‑4700320 | gCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTc > 2:357009/1‑149 (MQ=255) cAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATATGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCt < 8:36225/149‑1 (MQ=255) aGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTg > 3:213478/1‑149 (MQ=255) gCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTgc < 4:161628/149‑1 (MQ=255) gCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTgc < 7:40489/149‑1 (MQ=255) gCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTgc < 1:357009/149‑1 (MQ=255) gcAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCAcc > 2:203099/1‑149 (MQ=255) cAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAGCCTGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCAcc < 1:296458/149‑1 (MQ=255) gCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTc < 4:165964/149‑1 (MQ=255) ggTGATGTTCGTTTGCGAAAAAAACGCATCGATCGCCGACCTTGCCTTCTCGGGAACGTACACCAT‑‑GCCTTCACGCA‑GCC‑TTTCGAG‑AAGCTCTCTCGGAGGCAGGTCGATCAGCAACACCTCGAACGCATCATGCAGCACCCAGTCCg > 2:274370/1‑149 (MQ=255) ggttggttTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAgg < 4:23274/149‑1 (MQ=255) ggttTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGtc < 1:129030/148‑1 (MQ=255) gttTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGtctc > 7:355330/1‑149 (MQ=255) gttTGCGAAAAATAACCATAGTTGGGCGCCCTTTCCTTCTAGGGCAAGTAAAACTTTCACCTTCACGGAGGGCACCTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAgg < 1:315264/148‑1 (MQ=255) tGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTcgc < 1:203099/148‑1 (MQ=255) tGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTcgc < 4:213478/148‑1 (MQ=255) cGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCa > 5:163/1‑149 (MQ=255) gAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCAc > 4:356021/1‑149 (MQ=255) gAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCAc < 6:163/149‑1 (MQ=255) aaaaaTACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACt < 6:53098/149‑1 (MQ=255) cGCATCGATGGCCGCCATTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGc < 5:82897/149‑1 (MQ=255) gCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGcc > 6:155275/1‑149 (MQ=255) cATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCg < 1:93392/149‑1 (MQ=255) cgaccTTGCGTGCTTGGGCACGTTCACCTT‑‑GCGTTGACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCTGCTCGAACGCTTGCTGCAGCTCCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTcgc < 1:274370/146‑1 (MQ=255) gccCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GTC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTcgcg < 1:175145/149‑1 (MQ=255) gCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCGTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGGCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGAcc < 5:149771/147‑1 (MQ=255) cTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGt > 6:208601/1‑149 (MQ=255) cTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTAGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGt > 3:297514/1‑149 (MQ=255) cTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGt > 1:203005/1‑149 (MQ=255) tCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGtt > 4:9098/1‑149 (MQ=255) gggCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGa < 3:356021/149‑1 (MQ=255) ggCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAg < 5:155275/149‑1 (MQ=255) gTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCttt > 2:19719/1‑149 (MQ=255) acacCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAgggccttc > 3:155880/1‑143 (MQ=255) cacCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTcc < 8:355330/148‑1 (MQ=255) cacCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTcc < 4:17410/148‑1 (MQ=255) cTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGt > 2:36864/1‑149 (MQ=255) cTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGt > 3:179548/1‑149 (MQ=255) ttCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGAAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGATTTCCAGGTGCTGGa > 5:299341/1‑149 (MQ=255) aCGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGt > 7:25615/1‑149 (MQ=255) gggC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGAc > 1:81456/2‑149 (MQ=255) GC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCg < 8:19122‑M1/149‑1 (MQ=255) gcgttcgagctggtgctgatcgacctgcctccgcgagagctgctcgaacgcTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAg > 7:264280‑M2/52‑132 (MQ=255) gcgttcgagctggtgctgatcgacctgcctccgcgagagctgctcgaacgcTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAg < 8:264280‑M2/81‑1 (MQ=255) GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGCCCgtg < 7:176227‑M1/149‑1 (MQ=255) gttcgagctggtgctgatcgacctgcctccgcgagagctgctcgaacgcTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCgtg > 4:31203‑M2/50‑149 (MQ=255) TTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCgtgg > 2:98308‑M1/1‑149 (MQ=255) GAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTAGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGATGACCgtggtg < 7:58828‑M1/148‑1 (MQ=255) G‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTcgc > 8:257978‑M1/1‑99 (MQ=255) G‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTcgc < 7:257978‑M1/99‑1 (MQ=255) CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTaca < 7:284839‑M1/149‑1 (MQ=255) gcgGTGGCAGGTCTCTCATCCCCCGCGCGAACCCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCTTGGTCTGGCGCACTTGCACGCCTGTATTGTCGCGGATCTTGTTGGTGAGGCTTTTCAGGTGTTGGATGTTGACTGTGGTGTAGACGTCGATg < 8:58828/149‑1 (MQ=255) gcgGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATg > 4:14666/1‑149 (MQ=255) gAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGccc < 7:19122/149‑1 (MQ=255) cAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCgg > 3:313048/1‑149 (MQ=255) aGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCTAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGc > 7:79355/1‑149 (MQ=255) aGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGc > 2:333999/1‑149 (MQ=255) aGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGc < 3:14666/149‑1 (MQ=255) gTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGcc > 6:65323/1‑148 (MQ=255) tCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCaa < 4:297514/149‑1 (MQ=255) gATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCTAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAaga < 8:79355/149‑1 (MQ=255) gATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCaa > 4:288033/1‑147 (MQ=255) gATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAaga < 4:179548/149‑1 (MQ=255) gCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAAGAGTTCt < 3:9098/149‑1 (MQ=255) cACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGtt < 2:283427/108‑1 (MQ=255) cACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGtt > 1:283427/1‑108 (MQ=255) ccAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAAGAGTTCtt > 7:29167/1‑147 (MQ=255) ccAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAAGAGTTCtt < 8:29167/147‑1 (MQ=255) ccAGCTCGAACGCTTCCTGCACCACCCAGACCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATCTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTACAGGTGCTGCACGTTGACCGAGGTGTACACCTCGATGCACGCGGCAAAGAGTTCTTg > 4:116572/1‑148 (MQ=255) cAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAaga > 6:223336/1‑140 (MQ=255) cAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAaga < 5:223336/140‑1 (MQ=255) tcgaacgcTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAAGAGTTCTTGCACATc > 6:41289‑M2/9‑149 (MQ=255) gaacgcTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAAGAGTTCTTGCACATCCt > 5:17599‑M2/7‑149 (MQ=255) | GCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTT‑‑GCCTTCACGCA‑GGC‑GTTCGAG‑CAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAAGAGTTCTTGCACATCCT > NC_002947/4700032‑4700320 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |