New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4848430 | 65 (1.050) | 6 (0.100) | 5/252 | NT | 8.4% | coding (519/684 nt) | PP_4263 | cytochrome biogenesis protein |
? | NC_002947 | = 4848483 | 69 (1.180) | coding (572/684 nt) | PP_4263 | cytochrome biogenesis protein |
GATTGCTGCCAGTGTCCAGCCTCCCTCGGGCATTGCTGCTGGGCGCCCTCTGGGGCTGGCTGCCGTGCGGGCTGGTGTACAGCACC‑CTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACA‑GCGCC‑GGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGGCTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCACACCAGCA > NC_002947/4848285‑4848576 | gATTGCTGCCAGTGTCCAGCCTCCCTCGGGCATTGCTGCTGGGCGCCCTCTGGGGCTGGCTGCCGTGCGGGCTGGTGTACAGCACC‑CTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACA‑GCGCC‑GGGTTGATGCTGGCGTTCggg < 6:317660/149‑1 (MQ=255) aTTGCTGCCAGTGTCCAGCCTCCCTCGGGCATTGCTGCTGGGCGCCCTCTGGGGCTGGCTGCCGTGCGGGCTGGTGTACAGCACC‑CTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACA‑GCGCC‑GGGTTGATGCTGGCGTTCgggg < 3:86007/149‑1 (MQ=255) ttGCTGCCAGTGTCCAGCCTCCCTCGGGCATTGCTGCTGGGCGCCCTCTGGGGCTGGCTGCCGTGCGGGCTGGTGTACAGCACC‑CTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACA‑GCGCC‑GGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGt < 6:74845/149‑1 (MQ=255) ctgcCAGTGTCCAGCCTCCCTGGGGCATTGCTGCTGGGCGCCCTGTGGGGCTGGCTGCCGTGGGGGCTGGTGTACAGCACC‑CTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACATCCGCC‑GGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑gg < 1:220758/149‑1 (MQ=255) ctgcCAGTGTCCAGCCTCCCTCGGGCATTGCTGCTGGGCGCCCTCTGGGGCTGGCTGCCGTGCGGGCTGGTGTACAGCACC‑CTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACA‑GCGCC‑GGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑gg < 7:235327/148‑1 (MQ=255) tgcCAGTGTCCAGCCTCCCTCGGGCATTGCTGCTGGGCGCCCTCTGGGGCTGGCTGCCGTGCGGGCTGGTGTACAGCACC‑CTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACA‑GCGCC‑GGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑ggg > 6:48136/1‑148 (MQ=255) tgcCAGTGTCCAGCCTCCCTCGGGCATTGCTGCTGGGCGCCCTCTGGGGCTGGCTGCCGTGCGGGCTGGTGTACAGCACC‑CTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACA‑GCGCC‑GGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGc > 8:210709/1‑149 (MQ=255) ccAGTGTCCAGCCTCCCTCGGGCATTGCTGCTGGGCGCCCTCTGGGGCTGGCTGCCGTGCGGGCTGGTGTACAGCACC‑CTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACA‑GCGCC‑GGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCAc > 4:295074/1‑149 (MQ=255) gtgtCCAGCCTCCCTCGGGCATTGCTGCTGGGCGCCCTCTGGGGCTGGCTGCCGTGCGGGCTGGTGTACAGCACC‑CTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACA‑GCGCC‑GGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTg < 7:210709/149‑1 (MQ=255) cAGCCTCCCTCGGGCATTGCTGCTGGGCGCCCTCTGGGGCTGGCTGCCGTGCGGGCTGGTGTACAGCACC‑CTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACA‑GCGCCAGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCg < 1:259031/149‑1 (MQ=255) cAGCCTCCCTCGGGCATTGCTGCTGGGCGCCCTCTGGGGCTGGCTGCCGTGCGGGCTGGTGTACAGCACC‑CTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACA‑GCGCC‑GGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCgg > 5:187720/1‑149 (MQ=255) ctccctcGGGCATTGCTGCTGGGCGCCCTCTGGGGCTGGCTGCCGTGCGGGCTGGTGTACAGCACC‑CTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACA‑GCGCC‑GGGTTGATGCTGGCGTTCatccgttcggcagccagcccggt > 3:240891‑M1/1‑126 (MQ=255) cctcGGGCATTGCTGCTGGGCGCCCTCTGGGGCTGGCTGCCGTGCGGGCTGGTGTACAGCACC‑CTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACA‑GCGCC‑GGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCt > 1:241820/1‑149 (MQ=255) ctcGGGCATTGCTGCTGGGCGCCCTCTGGGGCTGGCTGCCGTGCGGGCTGGTGTACAGCACC‑CTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACA‑GCGCC‑GGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTg > 4:351896/1‑149 (MQ=255) ctcGGGCATTGCTGCTGGGCGCCCTCTGGGGCTGGCTGCCGTGCGGGCTGGTGTACAGCACC‑CTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACA‑GCGCC‑GGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTg > 7:140074/1‑149 (MQ=255) ggCATTGCTGCTGGGCGCTCTCTGGGGCTGGCTGCCGTGCGGGCTGGTGTACAGCACC‑CTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACA‑GCGCC‑GGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCaa < 6:9765/149‑1 (MQ=255) gCATTGCTGCTGGGCGCCCTCTGGGGCTGGGAGCCGTGCGGGCTGGTGTACAGCACC‑CTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACA‑GCGCC‑GGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAAc > 1:34770/1‑149 (MQ=255) cATTGCTGCTGGGCGCCCTCTGGGGCTGGCTGCCGTGCGGGCTGGTGTACAGCACCATTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACA‑GCGCC‑GGGTTGTTGGTGGCGTTAaaccgttgggccgcccccccggttgccagcc > 1:107153‑M1/1‑117 (MQ=255) 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cc‑cTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACA‑GCGCC‑GGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGGCTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTg < 6:183303/149‑1 (MQ=255) c‑cTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACA‑GCGCC‑GGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGGCTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTgc < 6:165155/128‑1 (MQ=255) c‑cTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACA‑GCGCC‑GGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGGCTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTgc > 5:165155/1‑128 (MQ=255) c‑cTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACA‑GCGCC‑GGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGGCTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTgg > 2:278531/1‑149 (MQ=255) c‑cTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACA‑GCGCC‑GGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGGCTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTgg > 3:28034/1‑149 (MQ=255) 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agccagGGCAATGCCGGCTACA‑GCGCC‑GGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGGCTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGt > 3:29669/1‑149 (MQ=255) ccagGGCAATGCCGGCTACA‑GCGCC‑GGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGGCTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGa < 8:140074/149‑1 (MQ=255) ccagGGCAATGCCGGCTACA‑GCGCC‑GGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGGCTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGa < 3:82407/149‑1 (MQ=255) cagGGCAATGCCGGCTACA‑GCGCC‑GGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGGCTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGAt > 8:266639/1‑149 (MQ=255) cAATGCCGGCTACA‑GCGCC‑GGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGGCTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTAt > 1:140773/1‑149 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |