New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4848430 | 65 (1.050) | 6 (0.100) | 5/252 | NT | 8.4% | coding (519/684 nt) | PP_4263 | cytochrome biogenesis protein |
? | NC_002947 | = 4848483 | 69 (1.180) | coding (572/684 nt) | PP_4263 | cytochrome biogenesis protein |
GCTGGCTGCCGTGCGGGCTGGTGTACAGCACCCTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCACACCAGCACTGGCTGATGGGCCATTGACGGGGGCTGCAAAGCAGCCCCAATGCCCTTGATAC > NC_002947/4848339‑4848630 | gctggctgCCGTGCGGGCTGGTGTACAGCACCCTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATgaac < 4:82407‑M2/149‑5 (MQ=255) gctgCCGTGCGGGCTGGTGTACAGCACCCTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGccc < 3:351896/149‑1 (MQ=255) ccGTGCGGGCTGGTGTACAGCACCCTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGtt > 5:66506/1‑149 (MQ=255) gTGCGGGCTGGTGTACAGCACCCTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTgc < 2:206223/149‑1 (MQ=255) gTGCGGGCTGGTGTACAGCACCCTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTgc > 3:8644/1‑149 (MQ=255) tGGTGTACAGCACCCTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACg > 1:43529/1‑148 (MQ=255) gtgtACAGCACCCTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCa < 6:187720/148‑1 (MQ=255) gCACCCTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGa < 2:74808/149‑1 (MQ=255) cgtggtgctgTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGa < 8:281167/143‑1 (MQ=255) cccTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTg < 6:183303/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTgc < 6:165155/128‑1 (MQ=255) ccTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTgc > 5:165155/1‑128 (MQ=255) ccTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTgg > 3:28034/1‑149 (MQ=255) ccTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTgg > 2:278531/1‑149 (MQ=255) ctgctgTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGc < 5:48136/149‑1 (MQ=255) tgGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCg < 2:241820/148‑1 (MQ=255) cggcCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGTGGGGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGgtg > 1:111944/1‑149 (MQ=255) cagccagGGCAATGCCGGCTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTgg > 6:336424/1‑149 (MQ=255) agccagGGCAATGCCGGCTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGt < 6:239168/149‑1 (MQ=255) agccagGGCAATGCCGGCTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGt > 3:29669/1‑149 (MQ=255) ccagGGCAATGCCGGCTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGa < 3:82407/149‑1 (MQ=255) ccagGGCAATGCCGGCTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGa < 8:140074/149‑1 (MQ=255) cagGGCAATGCCGGCTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGAt > 8:266639/1‑149 (MQ=255) cAATGCCGGCTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTAt > 5:166382/1‑149 (MQ=255) cAATGCCGGCTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTAt > 1:140773/1‑149 (MQ=255) aaTGCCGGCTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTAtt > 6:169108/1‑149 (MQ=255) aTGCCGGCTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTc < 3:295074/149‑1 (MQ=255) ccGGCTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTg < 1:10706/134‑1 (MQ=255) ccGGCTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTg > 2:10706/1‑134 (MQ=255) ggCTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTAt < 2:140773/149‑1 (MQ=255) cTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCt < 6:166382/149‑1 (MQ=255) cTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCt < 5:199737/149‑1 (MQ=255) aGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCACCCGGGCTGG‑CTGCCGCACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGTTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGAc > 6:281108/1‑149 (MQ=255) gggTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATgaacgccagcatcaacccggcgctgtagccggcattgccctggctggccgcccacagcagggtgctgtacaccagccc < 2:107153‑M2/149‑79 (MQ=255) ggTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCg > 7:172698/1‑149 (MQ=255) ttGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCggg < 8:172698/149‑1 (MQ=255) tGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGc > 1:39909/1‑149 (MQ=255) gATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGc < 4:29669/148‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGc < 4:8644/148‑1 (MQ=255) tGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATgaacgccagcatcaacccggcgctgtagccggcattgccctggctggccgcccacagcagggtgctgtacaccagcccgcacgg < 5:184309‑M2/148‑85 (MQ=255) tGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCt > 4:219509/1‑121 (MQ=255) tGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCt < 3:219509/121‑1 (MQ=255) tGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATgaacgccagcatcaacccggcgctgtagccggcattgccctggctggccgcccacagcagggtgctgtacaccagcccgcacggcagc < 2:26150‑M2/149‑89 (MQ=255) tGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATgaacgccagcatcaacccggcgctgtagccggcattgccctggctggccgcccacagcagggtgctgtacaccagcccgcacggcagc < 4:240891‑M2/149‑89 (MQ=255) gCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCacac > 7:348261/1‑147 (MQ=255) gCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCacac < 4:28034/147‑1 (MQ=255) gCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCACACCa < 3:197016/149‑1 (MQ=255) gCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCACACCa < 1:368661/149‑1 (MQ=255) cGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCACACCAg < 2:111944/149‑1 (MQ=255) ttCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCACACCAGCa > 6:257657/1‑149 (MQ=255) ttCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCAAACCAGCa > 7:168129/1‑149 (MQ=255) gggT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCACACCAGCACTgg > 6:81549/1‑149 (MQ=255) gggT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCACACCAGCACTgg < 1:278531/149‑1 (MQ=255) ggT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCACACCAGCACTGGc > 8:50430/1‑149 (MQ=255) cTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGGACTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCACACCAGCACTGGCTGATGGGc > 1:29830/1‑149 (MQ=255) tGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCACACCAGCACTGGCTGATGGGCCa > 2:190481/1‑149 (MQ=255) gCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCACACCAGCACTGGCTGATGGGCCAtt > 1:373289/1‑149 (MQ=255) ccGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCACACCAGCACTGGCTGATGGGCCATTg < 7:266639/149‑1 (MQ=255) cGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCACACCAGCACTGGCTGATg < 8:154970/140‑1 (MQ=255) cGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCACACCAGCACTGGCTGATg > 7:154970/1‑140 (MQ=255) tgtTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCACACCAGCACTGGCTGATGGGCCATTGACgg < 5:81549/149‑1 (MQ=255) ttGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCACACCAGCACTGGCTGATGGGCCATTGACgggg > 8:227841/1‑149 (MQ=255) ttGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCACACCAGCACTGGCTGATGGGCCATTGACggg < 3:348894/148‑1 (MQ=255) ggcTGGCAACCGGGGGGG‑CGGCCCAACGGTTtaacgccaccaacaacccggcgctgtagccggcattgccctggctggccgcccacagcaatggtgctgtacaccagcccgcacggcagccagccccagagggcgcccagcagcaatg > 1:107153‑M2/2‑31 (MQ=255) gCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCACACCAGCACTGGCTGATGGGCCATTGACGGGGGc > 2:179934/1‑149 (MQ=255) cTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCACACCAGCACTGGCTGATGGGCCATTGACgg > 2:50210/1‑144 (MQ=255) cTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCACACCAGCACTGGCTGATGGGCCATTGACgg < 1:50210/144‑1 (MQ=255) tGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCcaca > 7:88514/1‑115 (MQ=255) tGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCcaca < 8:88514/115‑1 (MQ=255) tGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCCTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCACACCAGCACTGGCTGATGGGCCATTGACggggtcag > 4:338271/1‑145 (MQ=255) aaCCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCACACCAGCACTgg > 6:58824/1‑121 (MQ=255) aaCCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCACACCAGCACTgg < 5:58824/121‑1 (MQ=255) aaCCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCACACCAGCACTGGCTGATGGGCCATTGACGGGGGCTGCaaa < 2:373289/149‑1 (MQ=255) aCCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATgaacgccagcatcaacccggcgctgtagccggcattgccctggctggccgcccacagcagggtgctgtacaccagcccgcacggcagccagccccagagggcgcccagcagcaatgcccgagggag > 3:240891‑M2/1‑23 (MQ=255) gggCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCACACCAGCACTGGCTGATGGGCCATTGACGGGGGCTGctttgcag < 5:336424/149‑8 (MQ=255) ccGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCACACCAGCACTGGCTGATGGGCCATTGACGGGGGCTGCTTTGCAGcccccgtc < 2:29830/147‑5 (MQ=255) aaCGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCACACCAGCACTGGCTGATGGGCCATTGACGGGGGCTGCAAAGCAGCCCCAATGCCCtt > 1:54946/1‑149 (MQ=255) aCGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCACACCAGCACTGGCTGATGGGCCATTGACGGGGGCTGCAAAGCAGCCCCAATGCCCTTg < 2:54946/149‑1 (MQ=255) aTGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCACACCAGCACTGGCTGATGGGCCATTGACGGGGGCTGCAAAGCAGCCCCAATGCCCTTGATa > 4:86669/1‑148 (MQ=255) aTGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCACACCAGCACTGGCTGATGGGCCATTGACGGGGGCTGCAAAGCAGCCCCAATGCCCTTGATAc < 7:50430/149‑1 (MQ=255) | GCTGGCTGCCGTGCGGGCTGGTGTACAGCACCCTGCTGTGGGCGGCCAGCCAGGGCAATGCCGGCTACAGCGCCGGGTTGATGCTGGCGTTCGGGGT‑‑GGGCACCTGGCCGGTGTTGCTGGCAACCGGGCTGG‑CTGCCGAACGGATGAACGCCCTGTTGCGGCGACGCAGCGTGCGAGTGGCAGGCGGTGTGCTGGTGATGCTATTCGGTATCTGGACCCTGCCGGGCCCACACCAGCACTGGCTGATGGGCCATTGACGGGGGCTGCAAAGCAGCCCCAATGCCCTTGATAC > NC_002947/4848339‑4848630 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |