New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5269810 | 61 (0.980) | 4 (0.070) | 4/260 | NT | 7.1% | coding (529/1371 nt) | radA | DNA repair enzyme |
? | NC_002947 | = 5269874 | 45 (0.740) | coding (465/1371 nt) | radA | DNA repair enzyme |
GCCAGCGAGCCCTCCTTGGTCACGTGGCCGACCAGGAAGATTGCCGTACCGCTTTGCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCTGCTGCTGCGACTCCT > NC_002947/5269665‑5269956 | gccagcGAGCCCTCCTTGGTCACGTGGCCGACCAGGAAGATTGCCGTACCGCTTTGCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGAt > 8:227845/1‑149 (MQ=255) gAGCCCTCCTTGGTCACGTGGCCGACCAGGAAGATTGCCGTACCGCTTTGCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTc < 6:314793/149‑1 (MQ=255) cctcctTGGTCACGTGGCCGACCAGGAAGATTGCCGTACCGCTTTGCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGAt > 2:202639/1‑148 (MQ=255) tcctTGGTCACGTGGCCGACCAGGAAGATTGCCGTACCGCTTTGCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCAc > 7:27587/1‑149 (MQ=255) cctTGGTCACGTGGCCGACCAGGAAGATTGCCGTACCGCTTTGCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCAc > 5:170101/1‑148 (MQ=255) ctTGGTCACGTGGCCGACCAGGAAGATTGCCGTACCGCTTTGCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCAc < 6:201084/147‑1 (MQ=255) ctTGGTCACGTGGCCGACCAGGAAGATTGCCGTACCGCTTTGCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCa > 7:170211/1‑149 (MQ=255) ggTCACGTGGCCGACCAGGAAGATTGCCGTACCGCTTTGCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCAtt < 6:131826/148‑1 (MQ=255) ggTCACGTGGCCGACCAGGAAGATTGCCGTACCGCTTTGCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTa > 3:273393/1‑149 (MQ=255) gTCACGTGGCCGACCAGGAAGATTGCCGTACCGCTTTGCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTa < 6:85893/148‑1 (MQ=255) aCGTGGCCGACCAGGAAGATTGCCGTACCGCTTTGCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCcg > 3:40280/1‑149 (MQ=255) cGTGGCCGACCAGGAAGATTGCCGTACCGCTTTGCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCcgc < 8:170211/149‑1 (MQ=255) ggCCGACCAGGAAGATTGCCGTACCGCTTTGCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGc > 1:8457/1‑149 (MQ=255) gCCGACCAGGAAGATTGCCGTACCGCTTTGCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGc < 4:356751/148‑1 (MQ=255) gCCGACCAGGAAGATTGCCGTACCGATTTGCTTGGAATAGCGCACCAGCAAAGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCCCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCCGTGAAAATGGTCTGGATCTAGTCGATCACCATTACCCGCGGCt > 6:47531/1‑149 (MQ=255) cAGGAAGATTGCCGTACCGCTTTGCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGa < 8:32304/149‑1 (MQ=255) cAGGAAGATTGCCGTACCGCTTTGCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGa > 1:35141/1‑149 (MQ=255) ggAAGATTGCCGTACCGCTTTGCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGAcc < 8:85621/149‑1 (MQ=255) gAAGATTGCCGTACCGCTTTGCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGAccc > 1:231598/1‑149 (MQ=255) ccGTACCGCTTTGCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTg < 1:202639/149‑1 (MQ=255) cGTACCGCTTTGCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTgg < 1:84300/149‑1 (MQ=255) cGTACCGCTTTGCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTgg < 1:7113/149‑1 (MQ=255) cGCTTTGCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAAt > 5:73794/1‑148 (MQ=255) cGCTTTGCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATg < 1:73388/149‑1 (MQ=255) gCTTTGCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGa < 8:287310/149‑1 (MQ=255) gCTTTGCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGCATCGAGTCCATCACCATTACCCGCGGCTTCTCTACCCGCGCCGTGGCAAtc > 4:12969/1‑147 (MQ=255) tGCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATc < 6:278360/147‑1 (MQ=255) tGCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATc < 8:48337/147‑1 (MQ=255) gCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGt < 7:271467/148‑1 (MQ=255) ttGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGcatcgagacgatcattgccacggcgcgggtcgagaagccgcgggtaatggtgatcgactc > 5:113551‑M1/1‑89 (MQ=255) ttGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGtctc > 8:47590/1‑149 (MQ=255) gCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTGGCGGACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAATTGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGa < 7:340914/148‑1 (MQ=255) aTAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGAAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCAATACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATg > 4:347353/1‑148 (MQ=255) tAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGcatcgagacgatcattgccacggcgcgggtcgagaagccgcgggtaatggtgatcgactcgatc > 1:197305‑M1/1‑83 (MQ=255) gctccAGGAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTTGGCCTCGCCGCCCGGGGCGGATTGCAAGTGCTCGTTGATATTGGTCTGGATCGAGTGGATCACGATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCTTCTCGATGGAGGtt < 8:79254/146‑1 (MQ=255) aCCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGcatcgagacgatcattgccacggcgcgggtcgagaagccgcgggtaatggtgatcgactcgatccagaccat < 6:113551‑M1/149‑73 (MQ=255) ccAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCg < 4:40280/149‑1 (MQ=255) cAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCgg < 4:197974/149‑1 (MQ=255) cAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCgg < 6:73794/149‑1 (MQ=255) aGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGcatcgagacgatcattgccacggcgcgggtcgagaagccgcgggtaatggtgatcgactcgatccagaccatttt < 2:197305‑M1/149‑76 (MQ=255) gCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCAc > 7:33274/1‑149 (MQ=255) tgtgCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCt > 7:153824/1‑149 (MQ=255) tgCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGTTTTCGGTCATCACCtt < 2:390079/148‑1 (MQ=255) gCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGa < 4:19661/149‑1 (MQ=255) 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aCCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTg < 4:273393/149‑1 (MQ=255) ccTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTgg < 2:231598/149‑1 (MQ=255) gCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAg < 8:27587/149‑1 (MQ=255) ccACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAgg < 7:227845/149‑1 (MQ=255) cACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGc < 8:153824/149‑1 (MQ=255) 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aaaaTGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGcagaccattttcaccgagcagttgcaatcggccccgggcggcgtggcccaggtgcgcgaaagcacagcgttgct < 2:197305‑M2/149‑75 (MQ=255) aaTGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGCCCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCtgctgctgc > 7:121451/1‑148 (MQ=255) aTGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGcagaccattttcaccgagcagttgcaatcggccccgggcggcgtggcccaggtgcgcgaaagcacagcgttgctggt < 6:113551‑M2/149‑78 (MQ=255) gTCTGGCTCGAGGCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCTGCTGCTGCGActc < 4:267316/149‑1 (MQ=255) cTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCtgctgctgc < 7:28971/142‑1 (MQ=255) cTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGAAGCAGGATTCGGTCATCACCTTGAGTTCGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCacctgcacctgc > 8:28971/1‑142 (MQ=255) cTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGACGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCTGCTGCTGCGActcct > 5:34309/1‑149 (MQ=255) | GCCAGCGAGCCCTCCTTGGTCACGTGGCCGACCAGGAAGATTGCCGTACCGCTTTGCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCTGCTGCTGCGACTCCT > NC_002947/5269665‑5269956 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |