New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5375060 = | 45 (0.730) | 3 (0.050) | 3/252 | NT | 6.4% | coding (381/1128 nt) | dnaJ | chaperone protein DnaJ |
? | NC_002947 | 5375151 = | 45 (0.770) | coding (290/1128 nt) | dnaJ | chaperone protein DnaJ |
GCATGCGCACCTGGCCGATGCCGCCACATGTCGGGCAGGTCGACGGGGTCGAACCCTTCTTGGCACCGGAACCGTCGCAAGGCTGGCAGTTGACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGACCACCGCCACCGAAGAAGTCGCTGAACACATCGCCGAAGATGTCGGAGAAATTGGCACCACCAAAGCCGGCACCACCGCCA > NC_002947/5374915‑5375204 | aggccaacgaggcctacgaagtgctgtcagacgcgagcaagcgtgcggccttcgaccagtatggccatgcaggtgtcgacccaagcatgggtggcggtgttgccggctttggtggtgccaatttctccgacatcttcggcgatgtGTTc > 7:70820‑M1/146‑149 (MQ=255) ggccaacgaggcctacgaagtgctgtcagacgcgagcaagcgtgcggccttcgaccagtatggccatgcaggtgtcgacccaagcatgggtggcggtggtgccggctttggtggtgccaatttctccgacatcttcggcgatgtGTTCa > 7:25461‑M1/145‑149 (MQ=255) cATGCGCACCTGGCCGATGCCGCCACATGTCGGGCAGGTCGACGGGGTCGAACCCTTCTTGGCACCGGAACCGTCGCAAGGCTGGCAGTTGACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGtt < 2:109869/147‑1 (MQ=255) gcACCTGGCCGATGCCGCCACATGTCGGGCAGGTCGACGGGGTCGAACCCTTCTTGGCACCGGAACCGTCGCAAGGCTGGCAGTTGACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑c > 8:221650/1‑146 (MQ=255) gcACCTGGCCGATGCCGCCACATGTCGGGCAGGTCGACGGGGTCGAACCCTTCTTGGCACCGGAACCGTCGCAAGGCTGGCAGTTGACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑c < 7:221650/146‑1 (MQ=255) ccTGGCCGATGCCGCCACATGTCGGGCAGGTCGACGGTGTCGAACCCTTCTTGGCACCGGAACCGTCGCAAGGCTGGCAGTTGACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGTTTCAG‑CTCCAgg < 6:362224/149‑1 (MQ=255) cTGGCCGATGCCGCCACATGTCGGGCAGGTCGACGGGGTCGAACCCTTCTTGGCACCGGAACCGTCGCAAGGCTGGCAGTTGACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAggg > 1:137841/1‑149 (MQ=255) ggCCGATGCCGCCACATGTCGGGCAGGTCGACGGGGTCGAACCCTTCTTGGCACCGGAACCGTCGCAAGGCTGGCAGTTGACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGgtg > 2:177924/1‑149 (MQ=255) gCCGATGCCGCCACATGTCGGGCAGGTCGACGGGGTCGAACCCTTCTTGGCACCGGAACCGTCGCAAGGCTGGCAGTTGACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGgtgt < 6:285581/149‑1 (MQ=255) ccGATGCCGCCACATGTCGGGCAGGTCGACGGGGTCGAACCCTTCTTGGCACCGGAACCGTCGCAAGGCTGGCAGTTGACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGgtg > 6:196039/1‑147 (MQ=255) gATGCCGCCACATGTCGGGCAGGTCGACGGGGTCGAACCCTTCTTGGCACCGGAACCGTCGCAAGGCTGGCAGTTGACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAgc > 4:350489/1‑149 (MQ=255) gATGCCGCCACATGTCGGGCAGGTCGACGGGGTCGAACCCTTCTTGGCACCGGAACCGTCGCAAGGCTGGCAGTTGACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAgc < 1:63970/149‑1 (MQ=255) cgccACATGTCGGGCAGGTCGACGGGGTCGAACCCTTCTTGGCACCGGAACCGTCGCAAGGCTGGCAGTTGACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAgg < 7:58079/149‑1 (MQ=255) gccACATGTCGGGCAGGTCGACGGGGTCGAACCCTTCTTGGCACCGGAACCGTCGCAAGGCTGGCAGTTGACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCGAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGt < 5:122438/149‑1 (MQ=255) acaTGTCGGGCAGGTCGACGGGGTCGAACCCTTCTTGGCACCGGAACCGTCGCAAGGCTGGCAGTTGACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGc < 7:41674/149‑1 (MQ=255) tCGGGCAGGTCGACGGGGTCGAACCCTTCTTGGCACCGGAACCGTCGCAAGGCTGGCAGTTGACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCcg > 4:252163/1‑149 (MQ=255) ggCAGGTCGACGGGGTCGAACCCTTCTTGGCACCGGAACCGTCGCAAGGCTGGCAGTTGACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCgcgc > 1:294768/1‑149 (MQ=255) gCAGGTCGACGGGGTCGAACCCTTCTTGGCACCGGAACCGTCGCAAGGCTGGCAGTTGACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCt < 2:171804/149‑1 (MQ=255) cAGGTCGACGGGGTCGAACCCTTCTTGGCACCGGAACCGTCGCAAGGCTGGCAGTTGACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTg < 2:137841/149‑1 (MQ=255) gTCGACGGGGTCGAACCCTTCTTGGCACCGGAACCGTCGCAAGGCTGGCAGTTGACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTggg > 7:44986/1‑148 (MQ=255) tCGACGGGGTCGAACCCTTCTTGGCACCGGAACCGTCGCAAGGCTGGGAGTTGACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCCGGTCGCTGCCGCGCTGGGCa > 2:108443/1‑149 (MQ=255) ggTCGAACCCTTCTTGGCACCGGAACCGTCGCAAGGCTGGCAGTTGACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTc < 8:132709/149‑1 (MQ=255) gTCGAACCCTTCTTGGCACCGGAACCGTCGCAAGGCTGGCAGTTGACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCg > 7:40408/1‑149 (MQ=255) ttcttGGCACCGGAACCGTCGCAAGGCTGGCAGTTGACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGaccaccacc > 6:31248/1‑149 (MQ=255) gCACCGGAACCGTCGCAAGGCTGGCAGTTGACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGacc < 8:44986/149‑1 (MQ=255) gCACCGGAACCGTCGCAAGGCTGGCAGTTGACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGac < 3:252163/148‑1 (MQ=255) aCCGGAACCGTCGCAAGGCTGGCAGTTGACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGaccac > 3:100079/1‑149 (MQ=255) tcgacccaagcatgggtggcggtggtgccggctttggtggtgccaatttctccgacatcttcggcgatgtGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGAccaccgccaccg < 4:34408‑M1/76‑1 (MQ=255) gCAAGGCTGGGAGTTGACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGACCACCGCCACCgaag < 3:297767/148‑1 (MQ=255) gCAAGGCTGGCAGTTGACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGACCACCGCCACCgaag < 3:350489/148‑1 (MQ=255) aaGGCTGGCAGTTGACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGACCACCGCCACCGaagaag > 5:300290/1‑149 (MQ=255) cTGGCAGTTGACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGACCACCGCCACCGAAGAAGTCGc > 7:348893/1‑149 (MQ=255) gCAGTTGACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGACCACCGCCACCGAAGAAGTCGCt < 8:40408/147‑1 (MQ=255) gACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGACCACCGCCACCgaa > 3:347234/1‑132 (MQ=255) gACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGACCACCGCCACCgaa < 4:347234/132‑1 (MQ=255) gcggtggtgccggctttggtggtgccaatttctccgacatcttcggcgatgtGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGACCACCGCCACCGAAGAAGTCGCTGAACACATc > 3:34408‑M1/53‑148 (MQ=255) gggCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGACCACCGCCACCCAAGAAGTCGCTGAACACATCGCCg > 6:17303/1‑145 (MQ=255) cgcgGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGACCACCGCCACCGAAGAAGTCGCTGAACACATCGCCGAAGATGTCg < 5:31248/149‑1 (MQ=255) gcgGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGACCACCGCCACCGAAGAAGTCGCTGAACACATCGCCGAAGATGTCgg < 6:34934/149‑1 (MQ=255) gcgGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGACCACCGCCACCGAAGAAGTCGCTGAACACATCGCCGAAGATGTCg > 8:41721/1‑148 (MQ=255) gcgGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGACCACCGCCACCGAAGAAGTCGCTGAACACATCGCCGAAGATGTCg < 7:41721/148‑1 (MQ=255) cTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGACCACCGCCACCGAAGAAGTCGCTGAACACATCGCCGAAGATGTCGGAGAAAt < 5:196039/148‑1 (MQ=255) cTGACCGGGGTGCCACGCACCGGTTCTTCCAGGTTCAGCCAGTAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGACCACCGCCACCGAAGAAGTCGCTGAACACATCGCCGAAGATGTCGGAGAAAt < 1:131119/149‑1 (MQ=255) gccaatttctccgacatcttcggcgatgtGTTCAG‑CTCCAGGGGGTAGCGCAGGGCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGACCACCGCCACCGAAGAAGTCGCTg > 2:17005‑M1/30‑117 (MQ=255) aCCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGACCACCGCCACCGAAGAAGTCGCTGAACACATCGCCGAAGATGTCGGAGAAATTGGc < 4:100079/149‑1 (MQ=255) ccACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGACCACCGCCACCGAAGAAGTCGCTGAACACATCGCCGAAGATGTCGGAGAAATTGGCACCACCaaa < 2:356422/149‑1 (MQ=255) ccACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGACCACCGCCACCGAAGAAGTCGCTGAACACATCGCCGAAGATGTCGGAGAAATTGGCACCACCaaa < 2:126222/149‑1 (MQ=255) cACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGACCACCGCCACCGAAGAAGTCGCTGAACACATCGCCGAAGATGTCGGAGCAATTGGCACCACCAAAg > 3:250580/1‑149 (MQ=255) cACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGACCACCGCCACCGAAGAAGTCGCTGAACACATCGCCGAAGATGTCGGAGAAATTGGcaccac < 5:189603/140‑1 (MQ=255) cACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGACCACCGCCACCGAAGAAGTCGCTGAACACATCGCCGAAGATGTCGGAGAAATTGGcaccac > 6:189603/1‑140 (MQ=255) cttcCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGACCACCGCCACCGAAGAAGTCGCTGAACACATCGCCGAAGATGTCGGAGAAATTGGCACCACCAAAGCCGGcaccac < 6:300290/147‑1 (MQ=255) tcCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGACCACCGCCACCGAAGAAGTCGCTGAACACATCGCCGAAGATGTCGGAGAAATTGGCACCACCAAAGCCGGCACCACCGc > 1:7874/1‑148 (MQ=255) ccAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGACCACCGCCACCGAAGAAGTCGCTGAACACATCGCCGAAGATGTCGGAGAAATTGGcacca < 2:387360/128‑1 (MQ=255) ccAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGACCACCGCCACCGAAGAAGTCGCTGAACACATCGCCGAAGATGTCGGAGAAATTGGcacca > 1:387360/1‑128 (MQ=255) ccAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGACCACCGCCACCGAAGAAGTCGCTGAACACATCGCCGAAGATGTCGGAGAAATTGGCAGCACCAAAGCCAGCACCCCCGCCa > 2:351413/1‑149 (MQ=255) ccAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGACCACCGCCACCGAAGAAGTCGCTGAACACATCGCCGAAGATGTCGGAGAAATTGGCACCACCAAAGCCGGCACCACCGc < 2:294768/147‑1 (MQ=255) | GCATGCGCACCTGGCCGATGCCGCCACATGTCGGGCAGGTCGACGGGGTCGAACCCTTCTTGGCACCGGAACCGTCGCAAGGCTGGCAGTTGACCAGGGTGGGCACGCGGATACTGACCGTGGTGCCACGCACCGCTTCTTCCAGGTTCAG‑CTCCAGGGTGTAGCGCAGGTCGCTGCCGCGCTGGGCACCGCCTCGACCACCACCGCGACCACCGCCACCGAAGAAGTCGCTGAACACATCGCCGAAGATGTCGGAGAAATTGGCACCACCAAAGCCGGCACCACCGCCA > NC_002947/5374915‑5375204 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |