| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 5621818 = | 68 (1.100) | 4 (0.070) | 4/254 | NT | 5.8% | coding (468/957 nt) | PP_4940 | glycosyltransferase |
| ? | NC_002947 | 5621863 = | 65 (1.100) | coding (423/957 nt) | PP_4940 | glycosyltransferase | |||||
GACATCGGCACTGACGAAGAAACGAATACGGTTAAGCGTGTTGCAGTAGTCCTCGCCCGACTTGGTACGGGTTACCAACAGGTTCTCGACCTGCCCCAACTCGTCCAGCAGTGCCTTGCGGCC‑GCTGTAGGCCACACTGTTGACGCTGCCGACAAAGGCCAGTTCGATATCACGCTCACGCCCTTGGTCGGCCAGCAACTGCTCGTCATAGCCCTTGGGCACGAACACCGCGTCGAAACCTTCCTGGCGCAAGCGCTCGCTGACCATGTAGCCGGAGCTGATCACCCGCGCCCA > NC_002947/5621671‑5621964 | gtgcaagtacaccggcaagttgagcgctcatttccgccagttgccatgggcgcgggtgatcagctccggcgacatggtccgcgagcgcttgcgccaggaaggtttcgccgcggtgttcgtggccaaggggtatgacgagcagttgctgg < 6:4303‑M1/1‑1 (MQ=255)gtgcaagtacaccggcaagttcagcgctcattacagccagttgccatgggcgcgggtgatcagatccggctacatggtcagctagcgcttgcgccaggaaggtttagacgcggtgttcgtgaccaaggcctattactatcagttgatgg < 7:106432‑M1/1‑1 (MQ=255) cATCGGCACTGACGAAGAAACGAATACGGTTAAGCGTGTTGCAGTAGTCCTCGCCCGACTTGGTACGGGTTACCAACAGGTTCTCGACCTGCCCCAACTCGTCCAGCAGTGCCTTGCGGCC‑GCTGTAGGCCACACTGTTGACGCTGCCg < 8:319803/149‑1 (MQ=255) caagtacaccggcaagttcagcgctcattaccgccagttgccatgggcgcgggtgatcagctccggctacatggtcagcgagcgcttgcgccaggaaggtttcgacgcggtgttcgtgcccaagggctatgacgagcagttgctgGcc > 2:12861‑M1/146‑148 (MQ=255) aTCGGCACTGACGAAGAAACGAATACGGTTAAGCGTGTTGCAGTAGTCCTCGCCCGACTTGGTACGGGTTACCAACAGGTTCTCGACCTGCCCCAACTCGTCCAGCATTGCCTTGCGGCC‑GCTGTAGGCCACACTGTTGACGCTGCCgc > 8:177171/1‑148 (MQ=255) tCGGCACTGACGAAGAAACTAATACGGTTAAGCGTGTTGCAGTAGTCCTCGCCCGACTTGGTACGGGTTACCAACAGGTTCTCGACCTGCCCCAACTCGTCCAGCAGTGCCTTGCGGCC‑GCTGTAGGCCACACTGTTGACGCTGCCTAc < 7:44420/149‑1 (MQ=255) aagtacaccggcaagttcagcgctcattaccgccagttgccatgggcgcgggtgatcagctccggctacatggtcagcgagcgcttgcgccaggaaggtttcgacgcggtgttcgtgcccaagggctatgacgagcagttgctgGCCGa > 2:200073‑M1/145‑149 (MQ=255) agtacaccggcaagttcagcgctcattaccgccagttgccatgggcgcgggtgatcagctccggctacatggtcagcgagcgcttgcgccaggaaggtttcgacgcggtgttcgtgcccaagggctatgacgagcagttgctgGCCGAc > 3:55831‑M1/144‑149 (MQ=255) gtacaccggcaagttcagcgctcattaccgccagttgccatgggcgcgggtgatcagctccggctacatggtcagcgagcgcttgcgccaggaaggtttcgacgcggtgttcgtgcccaagggctatgacgagcagttgctgGCCGAc < 6:44887‑M1/6‑1 (MQ=255) gCACTGACGAAGAAACGAATACGGTTAAGCGTGTTGCAGTAGTCCTCGCCCGACTTGGTACGGGTTACCAACAGGTTCTCGACCTGCCCCAACTCGTCCAGCAGTGCCTTGCGGCC‑GCTGTAGGCCACACTGTTGACGCTGCCGACaaa < 3:163104/149‑1 (MQ=255) cggcaagttcagcgctcattaccgccagttgccatgggcgcgggtgatcagctccggctacatggtcagcgagcgcttgcgccaggaaggtttcgacgcggtgttcgtgcccaagggctatgacgagcagttgctgGcc < 4:305510‑M1/3‑1 (MQ=255) cggcaagttcagcgctcattaccgccagttgccatgggcgcgggtgatcagctccggctacatggtcagcgagcgcttgcgccaggaaggtttcgacgcggtgttcgtgcccaagggctatgacgagcagttgctgGcc > 3:305510‑M1/137‑139 (MQ=255) cGAAGAAACGAATACGGTTAAGCGTGTTGCAGTAGTCCTCGCCCGACTTGGTACGGGTTACCAACAGGTTCTCGACCTGCCCCAACTCGTCCAGCAGTGCCTTGCGGCC‑GCTGTAGGCCACACTGTTGACGCTGCCGACAAAGGCCAGt < 8:20653/149‑1 (MQ=255) cGAAGAAACGAATACGGTTAAGCGTGTTGCAGTAGTCCTCGCCCGACTTGGTACGGGTTACCAACAGGTTCTCGACCTGCCCCAACTCGTCCAGCAGTGCCTTGCGGCC‑GCTGTAGGCCACACTGTTGACGCTGCCGACAAAGGCCAGt < 8:100423/149‑1 (MQ=255) gaagaaACGAATACGGTTAAGCGTGTTGCAGTAGTCCTCGCCCGACTTGGTACGGGTTACCAACAGGTTCTCGACCTGCCCCAACTCGTCCAGCAGTGCCTTGCGGCC‑GCTGTAGGCCACACTGTTGACGCTGCCGACAAAGGCCAGtt > 1:246163/1‑149 (MQ=255) agaaAGGAATACGGTTAAGCGTGTTGCAGTAGTCCTCGCCCCACTTGGTACGGGTTACCAACAGGTTCTCGACCTGCCCCAACTCGTCCAGCAGTGCCTTGCGGCC‑GCTGTAGGCCACACTGTTGACGCTGCCGACAAAGGCCAGTTCg < 5:327624/149‑1 (MQ=255) gaaACGAATACGGTTAAGCGTGTTGCAGTAGTCCTCGCCCGACTTGGTACGGGTTACCAACAGGTTCTCGACCTGCCCCAACTCGTCCAGCAGTGCCTTGCGGCC‑GCTGTAGGCCACACTGTTGACGCTGCCGACAAAGGCCAGTTCGa > 1:209962/1‑149 (MQ=255) agcgctcattaccgccagttgccatgggcgcgggtgatcagctccggctacatggtcagcgagcgcttgcgccaggaaggtttcgacgcggtgttcgtgcccaagggctatgacgagcagttgctgGc < 8:116953‑M1/2‑1 (MQ=255) agcgctcattaccgccagttgccatgggcgcgggtgatcagctccggctacatggtcagcgagcgcttgcgccaggaaggtttcgacgcggtgttcgtgcccaagggctatgacgagcagttgctgGc > 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gtCCTCGCCCGACTTGGTACGGGTTACCAACAGGTTCTCGACCTGCCCCAACTCGTCCAGCAGTGCCTTGCGGCC‑GCTGTAGGCCACACTGTTGACGCTGCCGACAAAGGCCAGTTCGATATCACGCTCACGCCCTTGGTCGGCCAGc < 4:181727/148‑1 (MQ=255) tCCTCGCCCGACTTGGTACGGGTTACCAACAGGTTCTCGACCTGCCCCAACTCGTCCAGCAGTGCCTTGCGGCC‑GCTGTAGGCCACACTGTTGACGCTGCCGACAAAGGCCAGTTCGATATCACGCTCACGCCCTTGGTCGGCCAGCaa < 3:254334/149‑1 (MQ=255) cTCGCCCGACTTGGTACGGGTTACCAACAGGTTCTCGACCTGCCCCAACTCGTCCAGCAGTGCCTTGCGGCC‑GCTGTAGGCCACACTGTTGACGCTGCCGACAAAGGCCAGTTCGATATCACGCTCACGCCCTTGGTCGGCCAGCAACt > 3:346011/1‑149 (MQ=255) tCGCCCGACTTGGTACGGGTTACCAACAGGTTCTCGACCTGCCCCAACTCGTCCAGCAGTGCCTTGCGGCC‑GCTGTAGGCCACACTGTTGACGCTGCCGACAAAGGCCAGTTCGATATCACGCTCACGCCCTTGGTCg > 6:193499/1‑138 (MQ=255) tCGCCCGACTTGGTACGGGTTACCAACAGGTTCTCGACCTGCCCCAACTCGTCCAGCAGTGCCTTGCGGCC‑GCTGTAGGCCACACTGTTGACGCTGCCGACAAAGGCCAGTTCGATATCACGCTCACGCCCTTGGTCg < 5:193499/138‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |