New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5621818 = | 68 (1.100) | 4 (0.070) | 4/254 | NT | 5.8% | coding (468/957 nt) | PP_4940 | glycosyltransferase |
? | NC_002947 | 5621863 = | 65 (1.100) | coding (423/957 nt) | PP_4940 | glycosyltransferase |
GTAGTCCTCGCCCGACTTGGTACGGGTTACCAACAGGTTCTCGACCTGCCCCAACTCGTCCAGCAGTGCCTTGCGGCC‑GCTGTAGGCCACACTGTTGACGCTGCCGACAAAGGCCAGTTCGATATCACGCTCACGCCCTTGGTCGGCCAGCAACTGCTCGTCATAGCCCTTGGGCACGAACACCGCGTCGAAACCTTCCTGGCGCAAGCGCTCGCTGACCATGTAGCCGGAGCTGATCACCCGCGCCCATGGCAACTGGCGGTAATGAGCGCTGAACTTGCCGGTGTACTTGCAC > NC_002947/5621716‑5622010 | gtagtCCTCGCCCGACTTGGTACGGGCTACCAACAGGTTCTCGACCTGCCCCAACTCGTCCAGCAGTGCCTTGCGGCC‑GCTGTAGGCCACACTGTTGACGCTGACGACAAAGGCCAGTTCGATATCACGCTCACGCCCTTGGTCGGCCa > 2:330263/1‑149 (MQ=255) tgggcgcgggtgatcagctccggctacatggtcagcgagcgcttgcgccaggaaggtttcgacgcggtgttcgtgcccaagggctatgacgagcagttgctgGCCGACAAAGGCCAGTTCGATATCACGCTCACGCCCTTGGTCGGCCa > 4:170567‑M1/103‑149 (MQ=255) tgccTCGCCGGACTTGGTACGGGTTACCAACAGGTTCTCGACCTGCCCCAACTCGTCCAGCAGTGCCTTGCGGCC‑GCTGTAGGCCACACTGTTGACGCTGCCGACAAAGGCCAGTTCGATATCACGCTCACGCCCTTGGTCGGCCAGc < 7:145470/146‑1 (MQ=255) gtCCTCGCCCGACTTGGTACGGGTTACCAACAGGTTCTCGACCTGCCCCAACTCGTCCAGCAGTGCCTTGCGGCC‑GCTGTAGGCCACACTGTTGACGCTGCCGACAAAGGCCAGTTCGATATCACGCTCACGCCCTTGGTCGGCCAGc < 4:181727/148‑1 (MQ=255) tCCTCGCCCGACTTGGTACGGGTTACCAACAGGTTCTCGACCTGCCCCAACTCGTCCAGCAGTGCCTTGCGGCC‑GCTGTAGGCCACACTGTTGACGCTGCCGACAAAGGCCAGTTCGATATCACGCTCACGCCCTTGGTCGGCCAGCaa < 3:254334/149‑1 (MQ=255) cTCGCCCGACTTGGTACGGGTTACCAACAGGTTCTCGACCTGCCCCAACTCGTCCAGCAGTGCCTTGCGGCC‑GCTGTAGGCCACACTGTTGACGCTGCCGACAAAGGCCAGTTCGATATCACGCTCACGCCCTTGGTCGGCCAGCAACt > 3:346011/1‑149 (MQ=255) tCGCCCGACTTGGTACGGGTTACCAACAGGTTCTCGACCTGCCCCAACTCGTCCAGCAGTGCCTTGCGGCC‑GCTGTAGGCCACACTGTTGACGCTGCCGACAAAGGCCAGTTCGATATCACGCTCACGCCCTTGGTCGGCCAGCAACTg > 4:249057/1‑149 (MQ=255) cccGACTTGGTACGGGTTACCAACAGGTTCTCGACCTGCCCCAACTCGTCCAGCAGTGCCTTGCGGCC‑GCTGTAGGCCACACTGTTGACGCTGCCGACAAAGGCCAGTTCGATATCACGCTCACGCCCTTGGTCGGCCAGCAACTGCTc < 3:227488/149‑1 (MQ=255) gTACGGGTTACCAACAGGTTCTCGACCTGCCCCAACTCGTCCAGCAGTGCCTTGCGGCC‑GCTGTAGGCCACACTGTTGACGCTGCCGACAAAGGCCAGTTCGATATCACGCTCACGCCCTTGGTCGGCCAGCAACTGc > 8:6211/1‑138 (MQ=255) gTACGGGTTACCAACAGGTTCTCGACCTGCCCCAACTCGTCCAGCAGTGCCTTGCGGCC‑GCTGTAGGCCACACTGTTGACGCTGCCGACAAAGGCCAGTTCGATATCACGCTCACGCCCTTGGTCGGCCAGCAACTGc < 7:6211/138‑1 (MQ=255) ggTTACCAACAGGTTCTCGACCTGCCCCAACTCGTCCAGCAGTGCCTTGCGGCC‑GCTGTAGGCCACACTGTTGACGCTGCCGACAAAGGCCAGTTCGATATCACGCTCACGCCCTTGGTCGGCCAGCAACTGCTCGTCATAGCCCTTgg < 4:109756/149‑1 (MQ=255) ggTTACCAACAGGTTCTCGACCTGCCCCAACTCGTCCAGCAGTGCCTTGCCGCC‑GCTGTAGCCCACACTGTTGACGCTGACGCCAAACGCCAGGTCGAAATCACCCACACGCCCTTGGTCGGACAGCAACTCCTCGTCAAAGCCCttag > 8:96942/1‑147 (MQ=255) gTTACCAACAGGTTCTCGACCTGCCCCAACTCGTCCAGCAGTGCCTTGCGGCCAGCTGTAGGCCACACTGTTGACGCTGCCGACAAAGGCCAGTTCGATATCACGCTCACGCCCTTGGTCGGCCAGCAACTGCTCGTCATAGCCCTTgg > 1:101793/1‑149 (MQ=255) 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ggTCGGCCAGCAACTGCTCGTCATAGCCCTTGGGCACGAACCCCGCGTCGAAACCTTCCTGGCGCAAGCGCTCGCTGACCATGTAGCCGGAGCTGATCACCCGCGCCCATGGCAACTGGCGGTAATGAGCGCTGAACTTGCCGGTGTa < 7:177171/148‑1 (MQ=255) ggTCGGCCAGCAACTGCTCGTCATAGCCCTTGGGCACGAACACCGCGTCGAAACCTTCCTGGCGCAAGCGCTCGCTGACCATGTAGCCGGAGCTGATCACCCGCGCCCATGGCAACTGGCg < 7:12239/121‑1 (MQ=255) ggTCGGCCAGCAACTGCTCGTCATAGCCCTTGGGCACGAACACCGCGTCGAAACCTTCCTGGCGCAAGCGCTCGCTGACCATGTAGCCGGAGCTGATCACCCGCGCCCATGGCAACTGGCg > 8:12239/1‑121 (MQ=255) ggTCGGCCAGCAACTGCTCGTCATAGCCCTTGGGCACGAACACCGCGTCGAAACCTTCCTGGCGCAAGCGCTCGCTGACCATGTAGCCGGAGCTGATCACCCGCGCCCATGGCAACTGGCGGTAATGAGCGCTGAACTTGCCGgtgt < 1:234173/147‑1 (MQ=255) gtcggcCAGCAACTGCTCGTCATAGCCCTTGGGCACGAACACCGCGTCGAAACCTTCCTGGCGCAAGCGCTCGCTGACCATGTAGCCGGAGCTGATCACCCGCGCCCATGGCAACTGGCGGTAATGAGCGCTGAACTTGCCGGTGTAc < 6:44887‑M2/142‑1 (MQ=255) gtcggcCAGCAACTGCTCGTCATAGCCCTTGGGCACGAACACCGCGTCGAAACCTTCCTGGCGCAAGCGCTCGCTGACCATGTAGCCGGAGCTGATCACCCGCGCCCATGGCAACTGGCGGTAATGAGCGCTGAACTTGCCGGTGTACt > 3:55831‑M2/7‑149 (MQ=255) tcggcCAGCAACTGCTCGTCATAGCCCTTGGGCACGAACACCGCGTCGAAACCTTCCTGGCGCAAGCGCTCGCTGACCATGTAGCCGGAGCTGATCACCCGCGCCCATGGCAACTGGCGGTAATGAGCGCTGAACTTGCCGGTGTACtt > 2:200073‑M2/6‑149 (MQ=255) ggcCAGCAACTGCTCGTCATAGCCCTTGGGCACGAACACCGCGTCGAAACCTTCCTGGCGCAAGCGCTCGCTGACCATGTAGCCGGAGCTGATCACCCGCGCCCATGGCAACTGGCGGTAATGAGCGCTGAACTTGCCg < 4:305510‑M2/136‑1 (MQ=255) ggcCAGCAACTGCTCGTCATAGCCCTTGGGCACGAACACCGCGTCGAAACCTTCCTGGCGCAAGCGCTCGCTGACCATGTAGCCGGAGCTGATCACCCGCGCCCATGGCAACTGGCGGTAATGAGCGCTGAACTTGCCg > 3:305510‑M2/4‑139 (MQ=255) ggcCAGCAACTGCTCGTCATAGCCCTTGGGCACGAACACCGCGTCGAAACCTTCCTGGCGCAAGCGCTCGCTGACCATGTAGCCGGAGCTGATCACCCGCGCCCATGGCAACTGGCGGTAATGAGCGCTGAACTTGCCGGTGTACTTg > 2:12861‑M2/4‑148 (MQ=255) gcCAGCAACTGCTCGTCATAGCCCTTGGGCACGAACACCGCGTCGAAACCTTCCTGGCGCAAGCGCTCGCTGACCATGTAGCCGGAGCTGATCACCCGCGCCCATGGCAACTGGCGGTAATGAGCGCt < 8:116953‑M2/126‑1 (MQ=255) gcCAGCAACTGCTCGTCATAGCCCTTGGGCACGAACACCGCGTCGAAACCTTCCTGGCGCAAGCGCTCGCTGACCATGTAGCCGGAGCTGATCACCCGCGCCCATGGCAACTGGCGGTAATGAGCGCt > 7:116953‑M2/3‑128 (MQ=255) cCATCAACTGATAGTAATAGGCCTTGGTCACGAACACCGCGTCTAAACCTTCCTGGCGCAAGCGCTAGCTGACCATGTAGCCGGATCTGATCACCCGCGCCCATGGCAACTGGCTGTAATGAGCGCTGAACTTGCCGGTGTACTTGCAc < 7:106432‑M2/148‑1 (MQ=255) cCAGCAACTGCTCGTCATACCCCTTGGCCACGAACACCGCGGCGAAACCTTCCTGGCGCAAGCGCTCGCGGACCATGTCGCCGGAGCTGATCACCCGCGCCCATGGCAACTGGCGGAAATGAGCGCTCAACTTGCCGGTGTACTTGCAc < 6:4303‑M2/148‑1 (MQ=255) | GTAGTCCTCGCCCGACTTGGTACGGGTTACCAACAGGTTCTCGACCTGCCCCAACTCGTCCAGCAGTGCCTTGCGGCC‑GCTGTAGGCCACACTGTTGACGCTGCCGACAAAGGCCAGTTCGATATCACGCTCACGCCCTTGGTCGGCCAGCAACTGCTCGTCATAGCCCTTGGGCACGAACACCGCGTCGAAACCTTCCTGGCGCAAGCGCTCGCTGACCATGTAGCCGGAGCTGATCACCCGCGCCCATGGCAACTGGCGGTAATGAGCGCTGAACTTGCCGGTGTACTTGCAC > NC_002947/5621716‑5622010 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |