New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5781028 = | 60 (0.970) | 4 (0.070) | 4/254 | NT | 7.2% | coding (1332/1794 nt) | cvrA | K(+)/H(+) antiporter NhaP |
? | NC_002947 | 5781123 = | 46 (0.780) | coding (1427/1794 nt) | cvrA | K(+)/H(+) antiporter NhaP |
AGGGCACCAGTCTGCCGTGGGTGGCCAAGCTGCTGAAAGTGACGGTACCGCCAGACCCGGCGCCGATCTCCCGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGCAACTGCTGCACCCGTCGGGCAGCACCGTGCTGGAGGTTGGCGACATGCTCTGCGTGATCGGCCACGAACACAACCTGCCG > NC_002947/5780880‑5781175 | agtgCACCAGTCTGCCGTGTGGGGCCAAGCTGCTGAAAGTGACGGTACCGCCAGACGCGGGGCCTATCTCCAGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCTGCGAGTGGGAGATGTTGGTCTACCGCCTGGTCGCAGAAAAATGGTGCATc < 8:130981/146‑1 (MQ=255) aGGGCACCAGTCTGCCGTGGGTGGCCAAGCTGCTGAAAGTGACGGTACCGCCAGACCCGGCGCCGATCTCCCGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATc > 8:323780/1‑149 (MQ=255) aGGGCACCAGTCTGCCGTGGGTGGCCAAGCTGCTGAAAGTGACGGTACCGCCAGACCCGGCGCCGATCTCCCGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATc < 4:206493/149‑1 (MQ=255) aGGGCACCAGTCAGCCGTTGGTGGCCAAGCTGCTGAAAGTGACGGTACCGCCAGACCCGGCGCCGATCACCCGCTCCGCCCTTCAGGTGCACATCACCAGCCAGAGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGCTCGCAGAAAAATTGTGCATc > 2:389674/1‑149 (MQ=255) acccagttcggcatcgccttcgagcacgaagtcgccgaagaagcgcaggtccaggccacgctgtggcgcctggctgaacaacttaccgagggccggcaggttgtgttcgtggccgatcacgcagagcatgtcgccaacctccagcaCgg > 4:379953‑M1/147‑149 (MQ=255) ccAGTCTGCCGTGGGTGGCCAAGCTGCTGAAAGTGACGGTACCGCCAGACCCGGCGCCGATCTCCCGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTgcc < 2:116693/149‑1 (MQ=255) cAGTCTGCCGTGGGTGGCCAAGCTGCTGAAAGTGACGGTACCGCCAGACCCGGCGCCGATCTCCCGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTgccg < 6:386696/149‑1 (MQ=255) ccGTGGGTGGCCAAGCTGCTGAAAGTGACGGTACCGCCAGACCCGGCGCCGATCTCCCGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCt < 6:280275/146‑1 (MQ=255) ccGTGGGTGGCCAAGCTGCTGAAAGTGACGGTACCGCCAGACCCGGCGCCGATCTCCCGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTgcg > 7:47919/1‑149 (MQ=255) ccGTGGGTGGCCAAGCTGCTGAAAGTGACGGTACCGCCAGACCCGGCGCCGATCTCCCGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTgc < 4:325587/148‑1 (MQ=255) gtgggtggCCAAGCTGCTGAAAGTGACGGTACCGCCAGACCCGGCGCCGATCTCCCGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGcgcg < 7:81396/149‑1 (MQ=255) ggtggCCAAGCTGCTGAAAGTGACGGTACCGCCAGACCCGGCGCCGATCTCCCGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGaa < 4:234786/148‑1 (MQ=255) acgaagtcgccgaagaagcgcaggtccaggccacgctgtggcgcctggctgaacaacttaccgagggccggcaggttgtgttcgtggccgatcacgcagagcatgtcgccaacctccagcaCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATg < 1:172689‑M1/28‑1 (MQ=255) gctgctGAAAGTGACGGTACCGCCAGACCCGGCGCCGATCTCCCGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGc < 3:337752/149‑1 (MQ=255) ctgAAAGTGACGGTACCGCCAGACCCGGCGCCGATCTCCCGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCg > 4:5166/1‑148 (MQ=255) tgAAAGTGACGGTACCGCCAGACCCGGCGCCGATCTCCCGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCg > 3:230304/1‑147 (MQ=255) aaaGTGACGGTACCGCCAGACCCGGCGCCGATCTCCCGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTTGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAgg > 6:129663/1‑149 (MQ=255) aaaGTGACGGTACCGCCAGACCCGGCGCCGATCTCCCGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTTGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAgg < 5:129663/149‑1 (MQ=255) aGTGACGGTACCGCCAGACCCGGCGCCGATCTCCCGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCa > 2:295154/1‑149 (MQ=255) gTGACGGTACCGCCAGACCCGGCGCCGATCTCCCGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAAc > 6:16986/1‑130 (MQ=255) gTGACGGTACCGCCAGACCCGGCGCCGATCTCCCGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAAc < 5:16986/130‑1 (MQ=255) gACGGTACCGCCAGACCCGGCGCCGATCTCCCGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCAcgc > 7:192259/1‑149 (MQ=255) gACGGTACCGCCAGACCCGGCGCCGATCTCCCGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCAcgc > 8:281073/1‑149 (MQ=255) aCGGTACCGCCAGACCCGGCGCCGATCTCCCGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCAcgc < 8:47919/148‑1 (MQ=255) ccAGACCCGGCGCCGATCTCCCGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCcgc < 3:5166/149‑1 (MQ=255) ccAGACCCGGCGCCGATCTCCCGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCcgc > 1:115837/1‑149 (MQ=255) cAGACCCGGCGCCGATCTCCCGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCcgcg > 3:53628/1‑149 (MQ=255) ccGGCGCCGATCTCCCGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGtt > 1:206532/1‑149 (MQ=255) cacgctgtggcgcctggctgaacaacttaccgagggccggcaggttgtgttcgtggccgatcacgcagagcatgtcgccaacctccagcaCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTcc > 7:305846‑M1/91‑149 (MQ=255) gcgcCGATCTCCCGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCg > 5:382785/1‑149 (MQ=255) cgcCGATCTCCCGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCgt < 1:166591/149‑1 (MQ=255) gcCGATCTCCCGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCgtg > 1:42490/1‑149 (MQ=255) gcCGATCTCCCGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCgtg < 8:187253/149‑1 (MQ=255) tcCCGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGc > 1:241724/1‑148 (MQ=255) cccGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTcc < 6:379414/138‑1 (MQ=255) cccGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTcc > 5:379414/1‑138 (MQ=255) cccGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGCaa > 5:366544/1‑149 (MQ=255) ccGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCgtggt < 4:230304/142‑1 (MQ=255) ccGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAg < 2:206532/145‑1 (MQ=255) ccGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAg < 2:42490/145‑1 (MQ=255) tCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGCAActgct > 6:323061/1‑149 (MQ=255) cGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGCAActgct < 7:323780/147‑1 (MQ=255) cGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGCAACtgctgc < 4:53628/149‑1 (MQ=255) cGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGCAACtgctgc < 2:388887/149‑1 (MQ=255) ccTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGCGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGAGGTGAGCAACTGCAGCAcc > 4:345177/1‑149 (MQ=255) gTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGCAACTGCTGCACCCGTCggg > 3:196082/1‑149 (MQ=255) gTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGCAACTGCTGCACCCGTCggg > 1:226347/1‑149 (MQ=255) gCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGCAACTGCTGCACCCGTCggg > 8:237460/1‑147 (MQ=255) ggccggcaggtggtgttcgtggccgatcacgcagagcatggcgccaacctccagcaCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGCAACTGCTGCACCCGTCGGGCAGCAc > 7:290465‑M1/57‑149 (MQ=255) aTCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGCAACTGCTGCACCCGTCGGGCAGCAc > 5:199779/1‑149 (MQ=255) tCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGTGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGCAACTGCTGCACCCGTCGGGCAGCAcc < 1:295154/149‑1 (MQ=255) tCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGCAACTGCTGCACCCGTCGGGCAGCAcc < 2:241724/149‑1 (MQ=255) ccAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCCTCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGCAACTGCTGCACCCGTCGGGCAGCACCGTg < 7:203916/149‑1 (MQ=255) cagggtgtgttcgtggccgatcacgcagagcatgtcgccaacctccagcaCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGCAACTGCTGCACCCGTCGGGCAGCACCGTGCt > 2:172689‑M1/51‑149 (MQ=255) ggAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGCAACTGCTGCACCCGTCGGGCAGCACCGTGCTGGAGGTTg < 7:281073/149‑1 (MQ=255) gTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGCAACTGCTGCACCCGTCGGGCAGCACCGTGCTGGAGGTTGGCGACa > 4:69083/1‑149 (MQ=255) ttCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGCAACTGCTGCACCCGTCGGGCAGCACCGTGCTGGAGGTTGGccgat > 7:211865/1‑144 (MQ=255) ttCGTCTACCGCCT‑GGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGCAACTGCTGCACCCGTCGGGCAGCACCGTGCTGGAGGTTGGCGACATg > 8:312114/1‑149 (MQ=255) ccGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGCAACTGCTGCACCCGTCGGGCAGCACCGTGCTGGAGGTTGGCGACATGCTCTg < 7:237460/147‑1 (MQ=255) ccGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGCAACTGCTGCACCCGTCGGGCAGCACCGTGCTGGAGGTTGGCGACATGCTCTGCg < 6:366544/149‑1 (MQ=255) ccGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGCAACTGCTGCACCCGTCGGGCAGCACCGTGCTGGAGGTTGGCGACATGCTCTGCg > 6:233598/1‑149 (MQ=255) ccGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGCAACTGCTGCACCCGTCGGGCAGCACCGTGCTGGAGGTTGGCGACATGCTCTGCg > 2:39307/1‑149 (MQ=255) cGCCTGGGCGCAGAAAAAGGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGCAACTGCTGCACCCGTCGGGCAGCACCGTGCTGGAGGTTGGCGACATGCTCTGCGt < 5:323061/149‑1 (MQ=255) gCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGCAACTGCTGCACCCGTCGGGCAGCACCGTGCTGGAGGTTGGCGACATGCTCTGCGTg < 2:115837/149‑1 (MQ=255) cTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGCAACTGCTGCACCCGTCGGGCAGCACCGTGCTGGAGGTTGGCGACATGCTCTGCGTGAt < 6:199779/149‑1 (MQ=255) gggCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGCAACTGCTGCACCCGTCGGGCAGCACCGTGCTGGAGGTTGGCGACATg > 6:391649/1‑136 (MQ=255) aGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGCAACTGCTGCACCCGTCGGGCAGCACCGTGCTGGAGGTTGGCGACATGCTCTGCGTGATCGGCCAc > 8:248549/1‑148 (MQ=255) aaaaTGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGCAACTGCTGCACCCGTCGGGCAGCACCGTGCTGGAGGTTGGCGACATGCTCTGCGTGATCGGCCACGAac < 6:382785/149‑1 (MQ=255) aaaTGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGCAACTGCTGCACCCGTCGGGCAGCACCGTGCTGGAGGTTGGCGACATGCTCTGCGTGATCGGCCACGAaca > 1:35007/1‑149 (MQ=255) gCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGCAACTGCTGCACCCGTCGGGCAGCACCGTGCTGGAGGTTGGCGACATGCTCTGCGTGATCGGCCACGAACACAACCTg > 5:284946/1‑149 (MQ=255) tCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGCAACTGCTGCACCCGTCGGGCAGCACCGTGCTGGAGGTTGGCGACATGCTCTGCGTGATCGGCCACGAACACAACCTGCCg < 6:13958/149‑1 (MQ=255) | AGGGCACCAGTCTGCCGTGGGTGGCCAAGCTGCTGAAAGTGACGGTACCGCCAGACCCGGCGCCGATCTCCCGCTCCGCCCTTGAGGTGCACATCACCAGCGAGTGGGAGATGTTCGTCTACCGCCTGGGCGCAGAAAAATGGTGCATCGGTGCCGCCCTGCGCGAACTGAAAATGCCCGAAGGCACGCGGATTGCCGCGCTGTTCCGTGGTGAGCAACTGCTGCACCCGTCGGGCAGCACCGTGCTGGAGGTTGGCGACATGCTCTGCGTGATCGGCCACGAACACAACCTGCCG > NC_002947/5780880‑5781175 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |