New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 319383 = | 52 (0.840) | 4 (0.070) | 4/260 | NT | 7.7% | coding (359/1815 nt) | PP_0264 | sensor histidine kinase |
? | NC_002947 | 319427 = | 45 (0.740) | coding (315/1815 nt) | PP_0264 | sensor histidine kinase |
GAAGAAGCGGCCAAGGTGGCCGGCCATGGCTTCGTTGAAGTAAGGGCGGAAGGCGAAGTTTCGGCCGACGAAGCTGTCGTGCTTGTCCCAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGCACGCCACGCAGCGCTGGCAAGTCGCCGAGAATTTGCGGCAAGGTCTCGTAGCGGTGCAGGGTGCCGAGCA > NC_002947/319283‑319572 | gaagaaGCGGCCAAGGTGGCCGGCCATGGCTTCGTTGAAGTAAGGGCGGAAGGCGAAGTTTCGGCCGACGAAGCTGTCGTGCTTGTCCCAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCgg > 6:108669/1‑149 (MQ=255) ttgccagcgctgcgtggcgtgctggccgaccctttccgcctggaagcggtgaccaacgccaacggcctgctcaaggacatcgtgcagaagaccggtGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCAcc < 6:279301‑M1/47‑1 (MQ=255) ttgccagcgctgcgtggcgtgctggccgaccctttccgcctggaagcggtgaccaacgccaaccgcctgctcaaggacatcgtgcagaagaccggtGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCAcc > 5:279301‑M1/97‑143 (MQ=255) aagCGGCCAAGGTGGCCGGCCATGGCTTCGTTGAAGTAAGGGCGGAAGGCGAAGTTTCGGCCGACGAAGCTGTCGTGCTTGTCCCAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCg > 2:217868/1‑144 (MQ=255) aagCGGCCAAGGTGGCCGGCCATGGCTTCGTTGAAGTAAGGGCGGAAGGCGAAGTTTCGGCCGACGAAGCTGTCGTGCTTGTCCCAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCg < 1:217868/144‑1 (MQ=255) ccAAGGTGGCCGGCCATGGCTTCGTTGAAGTAAGGGCGGAAGGCGAAGTTTCGGCCGACGAAGCTGTCGTGCTTGTCCCAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCAc > 3:224325/1‑149 (MQ=255) ggTGGCCGGCCATGGCTTCGTTGAAGTAAGGGCGGAAGGCGAAGTTTCGGCCGACGAAGCTGTCGTGCTTGTCCCAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATg > 1:40033/1‑149 (MQ=255) gTGGCCGGCCATGGCTTCGTTGAAGTAAGGGCGGAAGGCGAAGTTTCGGCCGACGAAGCTGTCGTGCTTGTCCCAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGt > 2:319689/1‑149 (MQ=255) ccATGGCTTCGTTGAAGTAAGGGCGGAAGGCGAAGTTTCGGCCGACGAAGCTGTCGTGCTTGTCCCAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAg > 2:225583/1‑148 (MQ=255) ccATGGCTTCGTTGAAGTAAGGGCGGAAGGCGAAGTTTCGGCCGACGAAGCTGTCGTGCTTGTCCCAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGc < 1:225583/149‑1 (MQ=255) gTTGAAGTAAGGGCGGAAGGCGAAGTTTCGGCCGACGAAGCTGTCGTGCTTGTCCCAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTg < 1:187499/148‑1 (MQ=255) gAAGTAAGGGCGGAAGGCGAAGTTTCGGCCGACGAAGCTGTCGTGCTTGTCCCAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCg < 8:292108/148‑1 (MQ=255) aaGTAAGGGCGGAAGGCGAAGTTTCGGCCGACGAAGCTGTCGTGCTTGTCCCAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGtt > 3:15894/1‑149 (MQ=255) aaGTAAGGGCGGAAGGCGAAGTTTCGGCCGACGAAGCTGTCGTGCTTGTCCCAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGtt > 7:173763/1‑149 (MQ=255) aaGTAAGGGCGGAAGGCGAAGTTTCGGCCGACGAAGCTGTCGTGCTTGTCCCAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGtt > 6:79412/1‑149 (MQ=255) aGTAAGGGCGGAAGGCGAAGTTTCGGCCGACGAAGCTGTCGTGCTTGTCCCAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTg < 5:108669/149‑1 (MQ=255) aGTAAGGGCGGAAGGCGAAGTTTCGGCCGACGAAGCTGTCGTGCTTGTCCCAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTg < 1:2968/149‑1 (MQ=255) gTAAGGGCGGAAGGCGAAGTTTCGGCCGACGAAGCTGTCGTGCTTGTCCCAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTgg > 6:358904/1‑149 (MQ=255) ggAAGGCGAAGTTTCGGCCGACGAAGCTGTCGTGCTTGTCCCAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑Ct < 4:15894/149‑1 (MQ=255) cGAAGTTTCGGCTGACGAAGCTGTCGTGCTTGTCCCAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAgg > 4:234882/1‑149 (MQ=255) gAAGTTGCGGCCGACGAAGCTGTCGTGCGTGTCCCAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGc < 3:82298/149‑1 (MQ=255) tCGGCCGACGAAGCTGTCGTGCTTGTCCCAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGaaa < 2:40033/148‑1 (MQ=255) tCGGCCGACGAAGCTGTCGTGCTTGTCCCAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGaaa < 2:98595/148‑1 (MQ=255) ggCCGACGAAGCTGTCGTGCTTGTCCCAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAgg < 1:142016/148‑1 (MQ=255) ccGACGAAGCTGTCGTGCTTGTCCCAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTc > 2:222456/1‑149 (MQ=255) gacgaAGCTGTCGTGCTTGTCCCAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCgg > 3:369299/1‑149 (MQ=255) aGCTGTCGTGCTTGTCCCAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAg > 1:199452/1‑148 (MQ=255) gCTGTCGTGCTTGTCCCAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACGG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGca < 1:218755/149‑1 (MQ=255) gTCGTGCTTGTCCCAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGcacgc > 4:26182/1‑149 (MQ=255) gTGCTTGTCCCAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGcacgccac > 2:320576/1‑149 (MQ=255) gTGCTTGTCCCAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGcacgccac > 6:367688/1‑149 (MQ=255) ttGTCCCAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGCACGCCACGCAg < 8:173763/149‑1 (MQ=255) gTCCCAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGCACGCCACGCAgcg > 7:87466/1‑149 (MQ=255) ccAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑GTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGCACGCCACGCAGCGCTg > 5:328843/1‑149 (MQ=255) ccAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGCACGCCACGCAGCGCTg > 2:270824/1‑149 (MQ=255) ccAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGCACGCCACGCAGCGCTg > 2:214468/1‑149 (MQ=255) aGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCGTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGCACGCCACGCAGCGCTgg > 4:302091/1‑148 (MQ=255) gTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCGCCTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGCACGCCACGCAGCGCTGGc < 1:270824/149‑1 (MQ=255) ggtgccgaggtgatgtacctgatggacgtcagcggcaacaccttggcACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGCACGCCACGCAGCGCTGGCaa > 5:279301‑M2/48‑143 (MQ=255) ggtgccgaggtgatgtacctgatggacgtcagcggcaacaccttggcACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCCGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGCACGCCACGCAGCGCTGGCaa < 6:279301‑M2/96‑1 (MQ=255) ggcCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAgg > 2:339878/1‑111 (MQ=255) ggcCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAgg < 1:339878/111‑1 (MQ=255) ggcCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGCACGCCACGCAGCGCTGGCAAGTCGCCga < 7:140952/149‑1 (MQ=255) GCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGCACGCCACGCAGCGCTGGCAAGTCGcc < 1:142759‑M1/146‑1 (MQ=255) GCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGCACGCCACGCAGCGCTGGCAAGTCGcc < 5:294478‑M1/146‑1 (MQ=255) CCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTAGATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGaaa < 2:70998‑M1/107‑1 (MQ=255) CCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTAGATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGaaa > 1:70998‑M1/1‑107 (MQ=255) CAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGCACGCCACGCAGCGCTGGCAAGTCGCCGAGaa > 4:224325‑M1/1‑149 (MQ=255) CAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGCACGCCACGCAGCGCTGGCAAGTCGCCGAGaa < 2:242728‑M1/149‑1 (MQ=255) CAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGCACGCCACGCAGCGCTGGCAAGTCGCCGAGaa < 1:33608‑M1/149‑1 (MQ=255) CAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGCACGCCACGCAGCGCTGGCAAGTCGCCGAGaa < 7:211032‑M1/149‑1 (MQ=255) gaggtgatgtacctgatggacgtcagcggcaacaccttggcACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGTGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGCACGCCACGCAGCGCTGGCAAGTCGCCGAGAAt > 7:361228‑M2/42‑149 (MQ=255) gtTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGCACGCCACGCAGCGCTGGCAAGTCGCCGAGAATTTGCg > 3:269856/1‑149 (MQ=255) ttGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGCACGCCACGCAGCGCTGGCAAGTCGCCGAGAATTTGCg < 5:367688/148‑1 (MQ=255) ccGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGCACGCCACGCAGCGCTGGCAAGTCGCCGAGAATTTGCGGCaa < 4:369299/149‑1 (MQ=255) cGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGCACGCCACGCAGCGCTGGCAAGTCGCCGAGAATTTGCGGCAAg < 3:26182/149‑1 (MQ=255) gTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGCACGCCACGCAGCGCTGGCAAGTCGCCGAGAATTTGCGGCAAGGTCTCg > 4:285010/1‑148 (MQ=255) gacgtcagcggcaacaccttggcACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGTGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGCACGCCACGCAGCGCTGGCAAGTCGCCGAGAATTTGCGGCAAGGTCTCGt < 8:361228‑M2/125‑1 (MQ=255) aTCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGCACGCCACGCAGCGCTGGCAAGACGCCGAGAATTTGCGGCAAGGTCTCGTAGCg > 8:50468/1‑149 (MQ=255) ggTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGCACGCCACGCAGCGCTGGCAAGTCGCCGAGAATTTGCGGCAAGGTCTCGTAGCGGTGc < 5:79412/149‑1 (MQ=255) ggTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGCTATTGGTCTAAA‑TTTTCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGCACGCCACGCAGCGCTGGCAAGTCGCCGAGAATTTGCGGCAAGGTCTCGTAGCGGTGc < 1:320576/149‑1 (MQ=255) cATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGCACGCCACGCAGCGCTGGCAAGTCGCCGAGAATTTGCGGCAAGGTCTCGTAGCGGTGCAggg > 2:243380/1‑149 (MQ=255) ggcACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGCACGCCACGCAGCGCTGGCAAGTCGCCGAGAATTTGCGGCAAGGTCTCGTAGCGGTGCAGGGTGCCGAg > 2:354233‑M2/4‑147 (MQ=255) ggcACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGCACGCCACGCAGCGCTGGCAAGTCGCCGAGAATTTGCGGCAAGGTCTCGTAGCGGTGCAGGGTGCCGAGCa < 3:302091‑M2/146‑1 (MQ=255) ggcACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTGGGCGGTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGGCGGCCAGCACGCCACGCAGCGCTGGCAAGTCGCCGAGAATTTGCGGCAAGGTCTCGTAGCGGTGCAGGGTGCCGAGCa < 6:358382‑M2/146‑1 (MQ=255) | GAAGAAGCGGCCAAGGTGGCCGGCCATGGCTTCGTTGAAGTAAGGGCGGAAGGCGAAGTTTCGGCCGACGAAGCTGTCGTGCTTGTCCCAGTTCGAGGCGGCCAAGGTGTTGCCGCTGACGTCCATCAGGTACATCACCTCGGCACCGGTCTTCTGCACGATGTCCTTGAGCAGGCGGTTGGCGTTGGTCACCG‑CTTCCAGGCGGAAAGGGTCGGCCAGCACGCCACGCAGCGCTGGCAAGTCGCCGAGAATTTGCGGCAAGGTCTCGTAGCGGTGCAGGGTGCCGAGCA > NC_002947/319283‑319572 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |