| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1844137 | 0 (0.000) | 52 (0.720) | 44/270 | 0.6 | 62.6% | coding (657/2754 nt) | gacS | sensor protein GacS |
| ? | NC_002947 | 2177702 = | 62 (0.860) | intergenic (+103/‑63) | PP_5485/PP_1931 | GNAT family acetyltransferase/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
ACTCGGTGTCACCACAGGTAACTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACTACGTCACCGATGAAAAC > NC_002947/2177556‑2177848 | aCTCGGTGTCACCACAGGTAACTCGCCTCCACGGACGGCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTcc < 5:51827/147‑1 (MQ=255) tgtCACCACAGGTAACTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACtg < 6:317583/147‑1 (MQ=255) tCACCACAGGTAACTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACtgtg‑t > 1:126481/1‑148 (MQ=255) tggtttccaggttctggcgcacgtcttcggtggcctggtcgatgctgtgttgcagttcttcgtgggcattctgcagggtttcggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACtgtg‑t < 3:380118‑M2/10‑1 (MQ=255) caccacAGGTAACTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACtgtg‑t > 1:259984/1‑147 (MQ=255) ccacAGGTAACTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGa > 2:191076/1‑147 (MQ=255) cacaGGTAACTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGa > 5:232211/1‑146 (MQ=255) acaGGTAACTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGaaa > 5:26772/1‑147 (MQ=255) tccaggttctggcgcacgtcttcggtggcctggtcgatgctgtgttgcagttcttcgtgggcattctgcagggtttcggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACtg > 8:194131‑M2/133‑139 (MQ=255) tccaggttctggcgcacgtcttcggtggcctggtcgatgctgtgttgcagttcttcgtgggcattctgcagggtttcggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACtg < 7:194131‑M2/7‑1 (MQ=255) tccaggttctggcgcacgtcttcggtggcctggtcgatgctgtgttgcagttcttcgtgggcattctgcagggtttcggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACTGTG‑TGaaaa > 4:341653‑M2/133‑147 (MQ=255) tccaggttctggcgcacgtcttcggtggcctggtcgatgctgtgttgcagttcttcgtgggcattctgcagggtttcggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACTGTG‑TGAAAAc > 7:86979‑M2/133‑148 (MQ=255) ggTAACTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGc > 2:237182/1‑148 (MQ=255) tAACTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTcc < 4:223283/129‑1 (MQ=255) tAACTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTcc > 3:223283/1‑129 (MQ=255) ttctggcgcacgtcttcggtggcctggtcgatgctgtgttgcagttcttcgtgggcattctgcagggtttcggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACTGTG‑TGAAAACGCCcg > 6:19139‑M2/127‑147 (MQ=255) tctggcgcacgtcttcggtggcctggtcgatgctgtgttgcagttcttcgtgggcattctgcagggtttcggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACTGTG‑TGAAAACGCCcgc < 3:341653‑M2/22‑1 (MQ=255) ccTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGt < 4:216643/146‑1 (MQ=255) ccTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACAAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGtt > 3:36340/1‑147 (MQ=255) cacgtcttcggtggcctggtcgatgctgtgttgcagttcttcgtgggcattctgcagggtttcggccatgcggtggatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCt < 2:211260‑M2/30‑1 (MQ=255) acgtcttcggtggcctggtcgatgctgtgttgcagttcttcgtgggcattctgcagggtttcggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCt < 3:193129‑M2/30‑1 (MQ=255) aCGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTc < 5:408816/145‑1 (MQ=255) tcttcggttgcctggtcgatgctgtgttgcagttcttcgtgggcattctgcagggtttcggccatgcggttgatgccgggggccagttcgtccagctaatggctgcccatggtcCAGACGGTG‑TGAAAACTCAAGCGGGTGTCTAAc > 4:176921‑M2/115‑147 (MQ=255) cggtggcctggtcgatgctgtgttgcagttcttcgtgggcattctgcagggtttcggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTc > 3:154263‑M2/111‑147 (MQ=255) tCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTGTTGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCt < 1:38268/148‑1 (MQ=255) ggtggcctggtcgatgctgtgttgcagttcttcgtgggcattctgcagggtttcggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACTGTG‑TGaaaa < 7:291799‑M2/15‑1 (MQ=255) tggcctggtcgatgctgtgttgcagttcttcgtgggcattctgcagggtttcggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTgg < 5:19139‑M2/40‑1 (MQ=255) gTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTc < 3:338010/143‑1 (MQ=255) gTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGACCGCGGTTGTCTAACCTTc > 4:338010/1‑143 (MQ=255) gttcgttcTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTGGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCGAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTACCCTTCTGGtcgtcg > 7:99035/1‑148 (MQ=255) tcgatgctgtgttgcagttcttcgtgggcattctgcagggtttcggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACTGTG‑TGAAAACTCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGa > 1:348668‑M2/100‑148 (MQ=255) gttcTCAGGTGTCCCAGGCACGAGTCCTGCGCCCCCCGACAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGCG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGa < 6:41905/147‑1 (MQ=255) tctcAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCg > 7:142623/1‑148 (MQ=255) atgctgtgttgcagttcttcgtgggcattctgcagggtttcggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGAcc < 3:216682‑M2/51‑1 (MQ=255) tgtgttgcagttcttcgtgggcattctgcagggtttcggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAAc < 5:173225‑M2/33‑1 (MQ=255) tgtgttgcagttcttcgtgggcattctgcagggtttcggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAAc > 6:173225‑M2/93‑125 (MQ=255) gtgttgcagttcttcgtgggcattctgcagggtttcggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTg > 4:105658‑M2/92‑145 (MQ=255) ggTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTgggg > 7:353565/1‑148 (MQ=255) ggTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTggg > 7:109268/1‑147 (MQ=255) gcagttcttcgtgggcattctgcagggtttcggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACaa > 6:160081‑M2/87‑147 (MQ=255) cccAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACaa < 6:232211/147‑1 (MQ=255) cccAGGAACAAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACaa < 4:36340/147‑1 (MQ=255) ccAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAAt < 8:109268/147‑1 (MQ=255) tcttcgtgggcattctgcagggtttcggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACtg > 2:166175‑M2/82‑88 (MQ=255) tcttcgtgggcattctgcagggtttcggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACtg < 1:166175‑M2/7‑1 (MQ=255) gAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGTACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACGTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTGGTGACCGTGGGGACAATCATGa < 7:133459/148‑1 (MQ=255) gAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGa < 8:353565/148‑1 (MQ=255) aaCGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCt < 3:269602/118‑1 (MQ=255) aaCGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCt > 4:269602/1‑118 (MQ=255) aaCGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTggg < 2:351122/136‑1 (MQ=255) aaCGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTggg > 1:351122/1‑136 (MQ=255) aaCGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGACGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGaa < 1:237182/148‑1 (MQ=255) ttcgtgggcattctgcagggtttcggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGa < 4:154263‑M2/67‑1 (MQ=255) gggggcattctggagtgtttcggccatggggttgatgccgttggccagttcgtccagctcatggctgccgatgggcCAGACTGTG‑GGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGGCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGa < 2:348668‑M2/72‑1 (MQ=255) gcgcCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGt < 5:74604/123‑1 (MQ=255) gcgcCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTggg < 5:409410/126‑1 (MQ=255) gcgcCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACCCCCGCGGTTTTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTggt > 6:409410/1‑125 (MQ=255) attctgcagggtttcggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCAt > 6:360530‑M2/71‑147 (MQ=255) cccGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGt < 8:258737/148‑1 (MQ=255) cagggtttcggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAgg > 5:313305‑M2/65‑147 (MQ=255) cagggtttcggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGt > 2:391028‑M2/65‑148 (MQ=255) agggtttcggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGa > 3:331821‑M2/64‑143 (MQ=255) agggtttcggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGa < 4:331821‑M2/80‑1 (MQ=255) gggtttcggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAgg > 6:79235‑M2/63‑145 (MQ=255) gAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAATGTGAg < 8:142623/148‑1 (MQ=255) aaaGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCTAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTC‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGAGACAGTGGGGACAATCATGAAGAGATTCATCGAAGGTGAgg > 8:211789/1‑148 (MQ=255) cggccatgcggttgattcagtgggacagttcttccagctcatggctgcccatggtcCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGGCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTc < 7:265782‑M2/91‑1 (MQ=255) ggccatgcggttgatgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTc > 4:324679‑M2/56‑146 (MQ=255) cGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGaa < 5:152697/146‑1 (MQ=255) gAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAAc > 3:26218/1‑146 (MQ=255) ccTGAATCGACCTCGTGTTCTTAGACACCTCGTACGGCTGCAACTCGTCCAGACTGTG‑TTAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAg < 2:126481/147‑1 (MQ=255) cTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAgg > 1:392662/1‑148 (MQ=255) cGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACAt > 1:227015/1‑148 (MQ=255) atgccgtgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTAc < 5:79235‑M2/104‑1 (MQ=255) gACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACAt > 3:60277/1‑147 (MQ=255) ccTCGTTTTCGTAGACACCTGGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATtgc < 7:363247/148‑1 (MQ=255) tgggccagttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATtgctgc < 1:391028‑M2/112‑1 (MQ=255) cGTAGACACCTCGAACGGATGCAAAGGGTCCAAACTCTC‑TGAAAAAGCCCGCGGTAGTCTAACCTTCAGGACATCGTGACCGTCCCTTCAAACATTAAACGATTCATAGAAGCAGAAGCACGAACGCAGGTTACATTGCTTCAGGact > 8:80369/1‑146 (MQ=255) agttcgtccagctcatggctgcccatggtcCAGACTTTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCGTCTGGTAGTAGTGACAGTGGGGACAATCATGCAGCGAGTCATCGAAGGTGACGCTCGAACGCCGGTTACATTGCTGCCGGAg > 6:46893‑M2/31‑147 (MQ=255) gTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTg > 6:228506/1‑83 (MQ=255) gTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTg < 5:228506/83‑1 (MQ=255) cacCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTg > 1:115799/1‑147 (MQ=255) ccTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGgac > 8:35049/1‑148 (MQ=255) cagctcatggctgccgttggtgCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATGGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGga < 7:172850‑M2/125‑1 (MQ=255) agctcatggctgcccatggtcCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGgac > 8:398267‑M2/22‑147 (MQ=255) agctcatggctgcccatggtcCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGga < 6:313305‑M2/125‑1 (MQ=255) ctcatggctgcccatggtcCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGgacgac < 2:268810‑M2/129‑1 (MQ=255) tcatggctgacaatggtcCAGACTGTG‑TGAAAACGACCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGgacgac > 8:40575‑M2/19‑147 (MQ=255) catggctgcccagggtcCCGACTGTG‑GCAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACTa < 1:182619‑M2/131‑1 (MQ=255) aaCGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGTGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCTAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACTa < 2:392662/148‑1 (MQ=255) aaCGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACTa < 2:259984/148‑1 (MQ=255) aaCGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACTa > 8:289073/1‑148 (MQ=255) tggctgcccatggtcCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTAGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGAAGACTACg > 1:57423‑M2/16‑148 (MQ=255) gCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACTACGTc < 2:227015/148‑1 (MQ=255) gcccatggtcCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACTACGTCAc > 5:84672‑M2/11‑147 (MQ=255) cAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAAt > 5:183896/1‑71 (MQ=255) cAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAAt < 6:183896/71‑1 (MQ=255) ccatggtcCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACTACGTCAc < 6:84672‑M2/137‑1 (MQ=255) tcCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACTACGTCACCGATGaaaa > 8:80075‑M2/3‑148 (MQ=255) cAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACTACGTCACCGATGAAAAc > 3:163353/1‑147 (MQ=255) | ACTCGGTGTCACCACAGGTAACTCGCCTCCACGGACGTCAGTGAGTTCGTTCTCAGGTGTCCCAGGAACGAGTCCTGCGCCCCCCGAAAGATGTCGAACTGAATCGACCTCGTTTTCGTAGACACCTCGAACGGCTGCAAAGGGTCCAGACTGTG‑TGAAAACGCCCGCGGTTGTCTAACCTTCTGGTCGTCGTGACCGTGGGGACAATCATGAAGCGATTCATCGAAGGTGAGGCTCGAACGCAGGTTACATTGCTGCCGGAGTGCCTGGACGACTACGTCACCGATGAAAAC > NC_002947/2177556‑2177848 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |