New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1050113 = | 74 (1.160) | 9 (0.150) | 8/254 | NT | 11.8% | coding (740/1098 nt) | PP_0908 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 1050143 = | 64 (1.060) | coding (710/1098 nt) | PP_0908 | hypothetical protein |
GTTGGCCCGCGGTGCCGTCAGCGCCACCAGCCGCAGCTCGCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATG‑GCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCACCAGG > NC_002947/1049965‑1050256 | gTTGGCCCGCGGTGCCGTCAGCGCCACCAGCCGCAGCTCGCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATG‑GCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCgg < 4:329792/149‑1 (MQ=255) tcgagatgaacctcgacgccatgcaaccgagcctggtgctgatgcagcgcgacggcaccctgctgagcaaggaaaccctggcccagcagatgaacagcgtgcgacacctggcagtggccagcgatggcaccatcgccgcctgccagcag > 8:105068‑M1/146‑149 (MQ=255) tcgagatgaacctcgacgccatgcaaccgagcctggtgctgatgcagcgcgacggcaccctgctgagcaaggaaaccctggcccagcagatgaacagcgtgcgacacctggcagtggccagcgatggcaccatcgccgcctgccagca > 8:6349‑M1/146‑148 (MQ=255) gCCCGCGGTGCCGTCAGCGCCACCAGCCGCAGCTCGCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATG‑GCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGt > 4:176072/1‑149 (MQ=255) gCCCGCGGTGCCGTCAGCGCCACCAGCCGCAGCTCGCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATG‑GCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGt > 1:63382/1‑149 (MQ=255) cccGCGGTGCCGTCAGCGCCACCAGCCGCATCTCTCTGTGGATTGCAACGCTTGCTGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATG‑GCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGtt < 8:373393/149‑1 (MQ=255) gagatgaacctcgacgccatgcaaccgagcctggtgctgatgcagcgcgacggcaccctgctgagcaaggaaaccctggcccagcagatgaacagcgtgcgacacctggcagtggccagcgatggcaccatcgccgcctgccaGCAGtt > 3:267505‑M1/144‑149 (MQ=255) cgcgGTGCCGTCAGCGCCACCAGCCGCAGCTCGCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATG‑GCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGtggg > 5:192337/1‑146 (MQ=255) gTGGCGTGAGCGCCACCATCCGCATCACGGTGTGGATGGCAACGGTTGGGGGGTATTGGGCCATGGCTTGGATTTGGCGCTGCGGTTCCGGGAATGGCTTGTATGTGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATc < 1:74552/149‑1 (MQ=255) cctcgacgccatgcaaccgagcctggtgctgatgcagcgcgacggcaccctgctgagcaaggaaaccctggcccagcagatgaacagcgtgcgacacctggcagtggccagcgatggcaccatcgccgcctgccaGCAGTTTCATCgg < 3:334796‑M1/13‑1 (MQ=255) ccGTCAGCGCCACCAGCCGCAGCTCGCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATG‑GCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCa < 7:361200/149‑1 (MQ=255) gTCAGCGCCACCAGCCGCAGCTCGCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATG‑GCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATc > 3:2925/1‑149 (MQ=255) gTCAGCGCCACCAGCCGCAGCTCGCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATG‑GCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATc < 3:108152/149‑1 (MQ=255) cAGCGCCACCAGCCGCAGCTCGCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATG‑GCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGc < 4:225445/149‑1 (MQ=255) cgcCACCAGCCGCAGCTCGCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATG‑GCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCa < 2:326743/149‑1 (MQ=255) gcCACCAGCCGCAGCTCGCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATG‑GCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCAt > 7:243724/1‑149 (MQ=255) ccaccaGCCGCAGCTCGCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATG‑GCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATg < 2:63382/149‑1 (MQ=255) caaccgagcctggtgctgatgcagcgcgacggcaccctgctgagcaaggaaaccctggcccagcagatgaacagcgtgcgacacctggcagtggccagcgatggcaccatcgccgcctgccaGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑c > 4:334796‑M1/123‑149 (MQ=255) 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gCAGCTCGCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATG‑GCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTg‑g < 4:212917/149‑1 (MQ=255) gCAGCTCGCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATG‑GCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTg‑g < 4:217897/149‑1 (MQ=255) cAGCTCGCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATG‑GCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑Gc < 8:30598/149‑1 (MQ=255) cAGCTCGCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATG‑GCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑Gc < 7:157303/149‑1 (MQ=255) cAGCTCGCTGTGGAGGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATG‑GCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCAGCGCCCATGAA‑CTGCTG‑Gc < 8:36618/149‑1 (MQ=255) gCTCGCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATG‑GCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAg > 2:31287/1‑149 (MQ=255) ctggtgctgatgcagcgcgacggcaccctgctgagcaaggaaaccctggcccagcagatgaacagcgtgcgacacctggcagtggccagcgatggcaccatcgccgcctgccaGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAg > 1:78974‑M1/114‑149 (MQ=255) cTCGCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATG‑GCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAgg > 1:246043/1‑149 (MQ=255) gCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATG‑GCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAggcgg > 2:81575/1‑149 (MQ=255) tgtgGATGGCAACGCTTGTGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATG‑GCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAggcggc > 6:351931/1‑148 (MQ=255) gatgcagcgcgacggcaccctgctgagcaaggaaaccctggcccagcagatgaacagcgtgcgacacctggcagtggccagcgatggcaccatcgccgcctgccaGCAGTT‑CATCGGCATCGCCCATGa > 8:232382‑M1/106‑129 (MQ=255) gATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATG‑GCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCGGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATgg > 4:333106/1‑149 (MQ=255) gATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATG‑GCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATg < 2:295311/148‑1 (MQ=255) cagcgcgacggcaccctgctgagcaaggaaaccctggcccagcagatgcacagcgtgcgacacctggcagtggccagcgatggcaccatcgccagcagctcgGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATgg > 3:94510‑M1/103‑148 (MQ=255) aaCGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCACTTGCCGCTCCGGTACCGCCAACGCCTAGAATT‑GCTCGCCCGGACGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCAt > 3:152385/1‑149 (MQ=255) 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gCCTTGAATG‑GCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCtt > 5:33500/1‑149 (MQ=255) gCCTTGAATG‑GCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCtt < 1:262364/149‑1 (MQ=255) cTTGAATG‑GCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGc > 6:211937/1‑149 (MQ=255) cTTGAATG‑GCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGc > 7:272717/1‑149 (MQ=255) tG‑GCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTcagca < 3:88589/149‑1 (MQ=255) gCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGt < 3:176072/147‑1 (MQ=255) gCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTCCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTCCTCAGCAGGGTGc > 8:149255/1‑149 (MQ=255) ccGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCg > 8:26125/1‑149 (MQ=255) cgcTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTcgcg > 3:51225/1‑149 (MQ=255) gcTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCgcgc < 8:272717/149‑1 (MQ=255) gcTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCgcgc > 8:222285/1‑149 (MQ=255) accatcgccgcctgccaGCAGTT‑CATGGGCGATGCCGATGAAACTGCCGAGCTGCTGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTg < 8:1045‑M1/132‑1 (MQ=255) gATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCa > 6:332602/1‑149 (MQ=255) aTCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCa < 4:51225/148‑1 (MQ=255) cagcagCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCa < 5:211937/149‑1 (MQ=255) gcTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCACCAgg < 8:243724/149‑1 (MQ=255) | GTTGGCCCGCGGTGCCGTCAGCGCCACCAGCCGCAGCTCGCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATG‑GCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCACCAGG > NC_002947/1049965‑1050256 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |