New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1050113 = | 74 (1.160) | 9 (0.150) | 8/254 | NT | 11.8% | coding (740/1098 nt) | PP_0908 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 1050143 = | 64 (1.060) | coding (710/1098 nt) | PP_0908 | hypothetical protein |
CGCAGCTCGCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCACCAGGCTCGGTTGCATGGCGTCGAGGTTCATCTCGA > NC_002947/1049996‑1050287 | cGCAGCTCGCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑ctgctg < 4:180637/149‑1 (MQ=255) gCAGCTCGCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTg‑g < 4:217897/149‑1 (MQ=255) gCAGCTCGCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTg‑g < 4:212917/149‑1 (MQ=255) cAGCTCGCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑Gc < 7:157303/149‑1 (MQ=255) cAGCTCGCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑Gc < 8:30598/149‑1 (MQ=255) cAGCTCGCTGTGGAGGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCAGCGCCCATGAA‑CTGCTG‑Gc < 8:36618/149‑1 (MQ=255) gCTCGCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAg > 2:31287/1‑149 (MQ=255) ctggtgctgatgcagcgcgacggcaccctgctgagcaaggaaaccctggcccagcagatgaacagcgtgcgacacctggcagtggccagcgatggcaccatcgccgcctgccaGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAg > 1:78974‑M1/114‑149 (MQ=255) cTCGCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAgg > 1:246043/1‑149 (MQ=255) gCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAggcgg > 2:81575/1‑149 (MQ=255) tgtgGATGGCAACGCTTGTGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAggcggc > 6:351931/1‑148 (MQ=255) gATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCGGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATgg > 4:333106/1‑149 (MQ=255) gATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATg < 2:295311/148‑1 (MQ=255) cagcgcgacggcaccctgctgagcaaggaaaccctggcccagcagatgcacagcgtgcgacacctggcagtggccagcgatggcaccatcgccagcagctcgGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATgg > 3:94510‑M1/103‑148 (MQ=255) cagcgcgacggcaccctgctgagcaaggaaaccctggcccagcagatgaacagcgtgcgacacctggcagtggccagcgatggcaccatcgccagcagctcggcagtttcatcggcatcgcccatgaactgcTG‑GCAGGCGGCGATGGt < 8:1045‑M2/17‑1 (MQ=255) aaCGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCACTTGCCGCTCCGGTACCGCCAACGCCTAGAATTGCTCGCCCGGACGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCAt > 3:152385/1‑149 (MQ=255) cGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCTTCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCg < 1:81575/149‑1 (MQ=255) ttGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCAGGGCCCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑Gc > 3:369996/1‑126 (MQ=255) 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tATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGc > 4:318966/1‑149 (MQ=255) tATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGc > 2:291250/1‑149 (MQ=255) aTTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGc > 5:63039/1‑148 (MQ=255) aTTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGc > 3:91497/1‑148 (MQ=255) ttGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGc > 2:105476/1‑147 (MQ=255) ttGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGAACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGc > 1:31795/1‑147 (MQ=255) gggCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCGCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAg < 5:197454/148‑1 (MQ=255) ggCCATGGCTTGCAGTTGGCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGATTGGCTCGCCCGGACGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCTGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTT‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGgt < 4:152385/149‑1 (MQ=255) ggCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGgt < 2:31795/149‑1 (MQ=255) gCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGgtg < 1:31287/149‑1 (MQ=255) cATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTc > 8:12757/1‑149 (MQ=255) cTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACg > 2:262364/1‑149 (MQ=255) gTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTc < 5:351931/149‑1 (MQ=255) gTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTc < 2:293223/149‑1 (MQ=255) gCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCAt < 4:205538/114‑1 (MQ=255) gCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCAt > 3:205538/1‑114 (MQ=255) 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gTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGc > 7:194860/1‑148 (MQ=255) tACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGCTCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCAGCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCa < 3:280227/149‑1 (MQ=255) ccGGGAAGGCCTTGTATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAgg < 3:265935/149‑1 (MQ=255) ccGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAgg < 1:105476/149‑1 (MQ=255) ccGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAgg < 4:84574/149‑1 (MQ=255) ccGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAgg < 3:318966/149‑1 (MQ=255) aGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTcc < 7:243960/149‑1 (MQ=255) gCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTgg < 8:149891/135‑1 (MQ=255) gCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCtt > 5:33500/1‑149 (MQ=255) gCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCtt < 1:262364/149‑1 (MQ=255) 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ccGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCg > 8:26125/1‑149 (MQ=255) cgcTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTcgcg > 3:51225/1‑149 (MQ=255) gcTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCgcgc > 8:222285/1‑149 (MQ=255) gcTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCgcgc < 8:272717/149‑1 (MQ=255) accatcgccgcctgccaGCAGTT‑CATGGGCGATGCCGATGAAACTGCCGAGCTGCTGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTg < 8:1045‑M1/132‑1 (MQ=255) 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ctgccagcagttcatgggcgatgccgatgaaactgcTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCACCAg > 1:78974‑M2/37‑149 (MQ=255) ccagcagttcatgggcgatgccgatgaaactgcTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGt > 7:221769‑M2/34‑122 (MQ=255) ccagcagttcatgggcgatgccgatgaaactgcTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGt < 8:221769‑M2/89‑1 (MQ=255) ccagcagttcatgggcgatgccgatgaaactgcTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTCCTCACCAGGGt > 7:216001‑M2/34‑122 (MQ=255) gttcatgggcgatgccgatgaaactgcTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCACCAGGCTCGGTTg > 4:334796‑M2/28‑149 (MQ=255) tcatgggcgatgccgatgaactgcTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATc > 8:232382‑M2/25‑129 (MQ=255) cATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCACCAGGCTCGGTTGCAt < 4:91497/148‑1 (MQ=255) tCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCa < 8:372077/52‑1 (MQ=255) tCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCa > 7:372077/1‑52 (MQ=255) cATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCACCAGGCTCGGTTGCATGGCGTc > 5:261352/1‑148 (MQ=255) cATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCACCAGGCTCGGTTGCATGGCGTCg < 5:332602/149‑1 (MQ=255) tCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAg < 6:221425/83‑1 (MQ=255) tCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAg > 5:221425/1‑83 (MQ=255) ccgatgaaactgcTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCACCAGGCTCGGTTGCATGGCGTCGAgg < 3:334796‑M2/135‑1 (MQ=255) cccATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTcagca > 5:167653/1‑97 (MQ=255) cccATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTcagca < 6:167653/97‑1 (MQ=255) ccATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCACCAGGCTCGGTTGCATGGCGTCGAGGtt > 3:17310/1‑148 (MQ=255) ccATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCACCAGGCTCGGTTGCATGGCGTCGAGGTTc < 3:333106/149‑1 (MQ=255) ccATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGATCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCACCAGGCTCGGTTGCATGGCGTCGAGGtt > 8:271370/1‑148 (MQ=255) aTGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCACCAGGCTCGGTTGCATGGCGTCGAGGTTCAt > 4:177085/1‑149 (MQ=255) aactgcTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCACCAGGCTCGGTTGCATGGCGTCGAGGTTCAtctc > 3:267505‑M2/7‑149 (MQ=255) ctgcTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCACCAGGCTCGGTTGCATGGCGTCGAGGTTCATCTCGa > 8:105068‑M2/5‑149 (MQ=255) tgcTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCACCAGGCTCGGTTGCATGGCGTCGAGGTTCATCTCGa > 8:6349‑M2/4‑148 (MQ=255) | CGCAGCTCGCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAA‑CTGCTG‑GCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCACCAGGCTCGGTTGCATGGCGTCGAGGTTCATCTCGA > NC_002947/1049996‑1050287 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |