New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3078702 | 50 (0.790) | 3 (0.050) | 3/252 | NT | 6.4% | coding (564/1410 nt) | PP_2688 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 3078728 | 40 (0.660) | coding (538/1410 nt) | PP_2688 | hypothetical protein |
CCATTTCCCGGGCCAGGAAGGCATGCTCGAAATAGGCGCTGTTGAAACGGCCGGGCGTGAGCAGCACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCTTGCGGTCTTCGAGCATGTAGCTGACGCCGCTGGGGGTGCGCAGGTTGTCTTCCAGCACGAAGTAGCTGCCATCGCCGTCACGTACCAGATCGACACCGGCAATATGC > NC_002947/3078554‑3078849 | ccATTTCCCGGGCCAGGAAGGCATGCTCGAAATAGGCGCTGTTGAAACGGCCGGGCGTGAGCAGCACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGC > 6:161909‑M1/1‑149 (MQ=255) ccATTTCCCGGGCCAGGAAGGCATGCTCGAAATAGGCGCTGTTGAAACGGCCGGGCGTGAGCAGCACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGC > 4:3623‑M1/1‑149 (MQ=255) cATTTCCCGGGCCAGGAAGGCATGCTCGAAATAGGCGCTGTTGAAACGGCCGGGCGTGAGCAGCACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCt > 7:339358/1‑149 (MQ=255) cATTTCCCGGGCCAGGAAGGCATGCTCGAAATAGGCGCTGTTGAAACGGCCGGGCGTGAGCAGCACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCt > 6:266993/1‑149 (MQ=255) cATTTCCCGGGCCAGGAAGGCATGCTCGAAATAGGCGCTGTTGAAACGGCCGGGCGTGAGCAGCACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCt > 3:36256/1‑149 (MQ=255) aTTTCCCGGGCCAGGAAGGCATGCTCGAAATAGGCGCTGTTGAAACGGCCGGGCGTGAGCAGCACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTg < 4:182188/149‑1 (MQ=255) cccGGGCCAGGAAGGCATGCTCGAAATAGGCGCTGTTGAAACGGCCGGGCGTGAGCAGCACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGggc < 2:246339/148‑1 (MQ=255) gggCCAGGAAGGCATGCTCGAAATAGGCGCTGTTGAAACGGCCGGGCGTGAGCAGAACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGCTATTGCGCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATAGATTGG‑CGCGATGCGCTGggcgg > 1:324823/1‑149 (MQ=255) gCCAGGAAGGCATGCTCGAAATAGGCGCTGTTGAAACGGCCGGGCGTGAGCAGCACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCaaa < 1:252842/149‑1 (MQ=255) gCCAGGAAGGCATGCTCGAAATAGGCGCTGTTGAAACGGCCGGGCGTGAGCAGCACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCaaa < 3:287651/149‑1 (MQ=255) cAGGAAGGCATGCTCGAAATAGGCGCTGTTGAAACGGCCGGGCGTGAGCAGCACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACa < 3:3623/149‑1 (MQ=255) atgtaGGCATGCTCGAAATACGCGCTGGTGAAACGGCCGGGCGGGAGCATCAACGCGGTGGGGTTTGCCATTGGGCTGGCGGTACTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACa < 1:117026/145‑1 (MQ=255) gAAGGCATGCTCGAAATAGGCGCTGTTGAAACGGCCGGGCGTGAGCAGCACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGggcggc < 1:5552/141‑1 (MQ=255) gAAGGCATGCTCGAAATAGGCGCTGTTGAAACGGCCGGGCGTGAGCAGCACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGggcggc > 2:5552/1‑141 (MQ=255) ggCATGCTCGAAATAGGCGCTGTTGAAACGGCCGGGCGTGAGCAGCACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCgg < 3:208676/149‑1 (MQ=255) ggCATGCTCGAAATAGGCGCTGTTGAAACGGCCGGGCGTGAGCAGCACCGCGGTGCGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCgg < 4:261248/149‑1 (MQ=255) gCATGCTCTAAATAGGCGCTGTTGAAACGTCCGGGCGTGAGCAGCAACGCGGTTGGGTTGTCCAGTGTGCTGGCTCG‑ATTGAGC‑‑GGGTCCAGCAGCAGTTTGGGTTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCgg < 6:174720/148‑1 (MQ=255) gCATGCTCGAAATAGGCGCTGTTGAAACGGCCGGGCGTGAGCAGCACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCggg < 4:130960/149‑1 (MQ=255) gCATGCTCGAAATAGGCGCTGTTGAAACGGCCGGGCGTGAGCAGCACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCggg < 8:339358/149‑1 (MQ=255) cTCGAAATAGGCGCTGTTGAAACGGCCGGGCGTGAGAAGCACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACa > 4:374620/1‑149 (MQ=255) gAAATAGGCGCTGTTGAAACGGCCGGGCGTGAGCAGCACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGgc < 7:347805‑M2/149‑3 (MQ=255) gAAATAGGCGCTGTTGAAACGGCCGGGCGTGAGCAGCACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGgc > 5:266993‑M2/1‑147 (MQ=255) ggCGCTGTTGAAACGGCCGGGCGTGAGCAGCACCGCGGTGGGGGTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGgcgcatc > 2:127479‑M2/1‑141 (MQ=255) ccgttcttgtaacgGCCGGGCGTGAGCAGCACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGTTTGGGGTAGTGATCGATGGGCCGCGATGCGCctgttccccgaactgtttgccgcccagcgcatc < 1:75846‑M1/142‑34 (MQ=255) cgcTGTTGAAACGGCCGGGCGTGAGCAGCACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATTGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGcatcatc < 1:92262/149‑1 (MQ=255) cTGTTGAAACGGCCGGGCGTGAGCAGCACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCctgttccccgaactgtttgccgcccagcgcatcgcgcc < 5:161909‑M1/149‑39 (MQ=255) gAAACGGCCGGGCGTGAGCAGCACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCctgttccccgaactgtttgccgcccagcgcatc > 2:75846‑M1/1‑106 (MQ=255) gAAACGGCCGGGCGTGAGCAGCACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAg > 2:125758/1‑132 (MQ=255) gAAACGGCCGGGCGTGAGCAGCACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAg < 1:125758/132‑1 (MQ=255) aaCGGCCGGGCGTGAGCAGCACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCTTGCgg > 4:32326/1‑149 (MQ=255) aaCGGCCGGGCGTGAGCAGCACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCTTGCgg > 2:119991/1‑149 (MQ=255) ccGGGCGTGAGCAGCACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCTTGCGGTCTTc < 5:366055/149‑1 (MQ=255) ccGGGCGTGAGCAGCACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCTTGCGGTCTTc < 6:130441/149‑1 (MQ=255) gggCGTGAGCAGCACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCTGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGGGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCTTGCGGTCTTCGa < 5:15686/149‑1 (MQ=255) gcgcagcaCCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCTTGCGGTCTTCGAGCATGt < 1:141511/147‑1 (MQ=255) gAGCAGCACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCTTGCGGTCTTCGAGCATg > 2:21731/1‑148 (MQ=255) agcagcACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCTTGCGGTCTTCGAGCATGt < 1:328145/148‑1 (MQ=255) caCCGCGGTGGGGTTGTCAAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCATGCGGTCTTCGAGCATGTAGCTGa > 6:274298/1‑149 (MQ=255) gggTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCTTGCGGTCTTCGAGCATGTAGCTGACGCCGCTggg > 6:386650/1‑149 (MQ=255) gggTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCTTGCGGTCTTCGAGCATGTAGCTGACGCCGCTggg > 5:36027/1‑149 (MQ=255) gTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCTTGCGGTCTTCGAGCATGTAGCTGACGCCGCTggggg > 8:143484/1‑149 (MQ=255) ttGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCTTGCGGTCTTCGAGCATGTAGCTGACGCCGCTGGGGGt < 1:212458/149‑1 (MQ=255) ttGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCTTGCGGTCTTCGAGCATGTAGCTGACGCCGCTGGGGGt > 2:27439/1‑149 (MQ=255) gTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCTTGCGGACTTCGAGCATGTAGCTGACGCCGCTGGGGGt > 8:183043/1‑147 (MQ=255) gTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCTTGCGGTCTTCGAGCATGTAGCTGACGCCGCTGGGGGTGCGCAgg > 4:45733/1‑149 (MQ=255) gggCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCTTGCGGTCTTCGAGCATGTAGCTGACGCCGCTGGGGGTGCGCAGGtt < 4:36256/149‑1 (MQ=255) t‑ctTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCTTGCGGTCTTCGAGCATGTAGCTGACGCCGCTGGGGGTGCGCAGGTTGTCTTCCAg > 8:143769/1‑148 (MQ=255) ttGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCTCATCATCATCTTGCGGTCTTCGAGCATGTAGCTGACGCCGCTGGGGGTGCGCAGGTTGACTTCCAGCa > 7:5836/1‑148 (MQ=255) gAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCTTGCGGTCTTCGAGCATGTAGCTGACGCCGCTGGGGGTGCGCAGGTTGTCTTCCAGCa < 5:386650/146‑1 (MQ=255) gAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGAGCATCATCATCTTGCGGGCTTCGAGCATGTAGCTGACGCCGCTGGGGGTGCGCAGGTTGTCTTCCAGCa < 6:182845/146‑1 (MQ=255) gC‑‑GTGTCCAGCCGCAGGGTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCTTGCGGTCTTCGAGCATGTAGCTGACGCCGCTGGGGGTGCGCAGGTTGTCTTCCAGCACGAAg > 6:161176/1‑149 (MQ=255) ggtggCCAGGAGCAGGGTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGGTGGGCGGCAAAGAGTTCGGGGACCAGGCGGATCATCATCTTGCGGTCTTCGAGCATGTAGCTGACGCCGCTGGGGGTGCGCAGGTTGTCTTCCAGCACGAAGt < 3:200118/148‑1 (MQ=255) gtgtCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCTTGCGGTCTTCGAGCATGTAGCTGACGCCGCTGGGGGTGCGCAGGTTGTCTTCCAGCACGAAGTa < 3:45733/149‑1 (MQ=255) tgtCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCTTGCGGTCTTCGAGCATGTAGCTGACGCCGCTGGGGGTGCGCAGGTTGTCTTCCAGCACGAAGTAg < 1:115160/149‑1 (MQ=255) tgtCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCTTGCGGTCTTCGAGCATGTAGCTGACGCCGCTGGGGGTGCGCAGGTTGTCTTCCAGCACGAAGTAg > 2:115160/1‑149 (MQ=255) tCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCTTGCGGTCTTCGAGCATGTAGCTGACGCCGCTGGGGGTGCGCAGGTTGTCTTCCAGCACGAAGTAGCt < 6:36027/149‑1 (MQ=255) ccAGCAGCAGGTTGGTGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCTTGCGGTCTTCGAGCATGTAGCTGACGCCGCTGGGGGTGCGCAGGTTGTCTTCCAGCACGAAGTAGCTg < 3:32326/149‑1 (MQ=255) gcagcagGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCTTGCGGTCTTCGAGCATGTAGCTGACGCCGCTGGGGGTGCGCAGGTTGTCTTCCAGCACGAAGTAGCTGCCa < 1:119991/149‑1 (MQ=255) agcagGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCTTGCGGACTTCGAGCATGTAGCTGACGCCGCTGGGGGTGCGCAGGTTGTCTTCCAGCACGAAGTAGCTGCCATc < 7:183043/149‑1 (MQ=255) gcagGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCTTGCGGTCTTCTAGCATGTAGCTGACGCCGCTGGGGGTGCGCAGGTTGTCTTCCAGCACGAAGTAGCTGCCATCg < 3:374620/149‑1 (MQ=255) gcagGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCTTGCGGTCTTCGAGCATGTAGCTGACGCCGCTGGGGGTGCGCAGGTTGTCTTCCAGCACGAAGTAGCTGCCATCg < 7:143484/149‑1 (MQ=255) tCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCTTGCGGTCTTCGAGCATGTAGCTGACGCCGCTGGGGGTGCGCAGGTTGTCTTCCAGCACGAAGTAGCTGCCATCGCCGTCACGTACCAGATc < 1:27439/149‑1 (MQ=255) aTGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCTTGCGGTCTTCGAGCATGTAGCTGACGCCGCTGGGGGTGCGCAGGTTGTCTTCCAGCACGAAGTAGCTGCCATCGCCGTCACGTACCAGATCGa > 8:9967/1‑148 (MQ=255) gg‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGgcgcatcgcgcccatcgatcactaccccaacctgctgctggacacgctcaagagcgccagcccactggacaaccccaccgcggtgctgctcacgcccggccgtttcaacag < 5:161909‑M2/149‑112 (MQ=255) gATGCGCctgttccccgaactgtttgccgcccagcgcatcgcgcccatcgatcactaccccaacctgctgctggacacgctcaagagcgccagcccactggacacccccaccgcggtgctgctcacgcccggccgtttcaacagcgcc > 2:127479‑M1/1‑7 (MQ=255) gATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGgcgcatcgcggcccatcgatcactaccccaaactgctgctggacacgctcaagagcgccagcccactggacaaccccaccgcggtgctgctcacgcccggccgttacaagaacgg < 1:75846‑M2/148‑116 (MQ=255) gATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGgcgcatcgcgcccatcgatcactaccccaacctgctgctggacacgctcaagagcgccagcccactggacaaccccaccgcggtgctgctcacgcccggccgtttc > 2:75846‑M2/1‑33 (MQ=255) cgcTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCTTGCGGTCTTCGAGCATGTAGCTGACGCCGCTGGGGGTGCGCAGGTTGTCTTCCAGCACGAAGTAGCTGCCATCGCCGTCACGTACCAGATCGACACCGGCAATATg < 7:9967/149‑1 (MQ=255) gcctgttccccgaactgtttgccgcccagcgcatcgcgcccatcgatcactaccccaacctgctgctggacacgctcaagagcgccagcccactggacaaccccaccgcggtgctgctcacgcccggccgtttcaacagcgcctatttc < 7:347805‑M1/149‑148 (MQ=255) gcctgttccccgaactgtttgccgcccagcgcatcgcgcccatcgatcactaccccaacctgctgctggacacgctcaagagcgccagcccactggacaaccccaccgcggtgctgctcacgcccggccgtttcaacagcgcctatttc > 5:266993‑M1/1‑2 (MQ=255) | CCATTTCCCGGGCCAGGAAGGCATGCTCGAAATAGGCGCTGTTGAAACGGCCGGGCGTGAGCAGCACCGCGGTGGGGTTGTCCAGTGGGCTGGCGCT‑CTTGAGC‑‑GTGTCCAGCAGCAGGTTGGGGTAGTGATCGATGGG‑CGCGATGCGCTGGGCGGCAAACAGTTCGGGGAACAGGCGCATCATCATCTTGCGGTCTTCGAGCATGTAGCTGACGCCGCTGGGGGTGCGCAGGTTGTCTTCCAGCACGAAGTAGCTGCCATCGCCGTCACGTACCAGATCGACACCGGCAATATGC > NC_002947/3078554‑3078849 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |